MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_021521	ACT	2	6	1648664	1648669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060313
32502	NC_021521	A	7	7	1648721	1648727	100 %	0 %	0 %	0 %	514060313
32503	NC_021521	TGG	2	6	1648769	1648774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060313
32504	NC_021521	TGC	2	6	1648781	1648786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060313
32505	NC_021521	TGG	2	6	1648812	1648817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060313
32506	NC_021521	TAAT	2	8	1648864	1648871	50 %	50 %	0 %	0 %	514060313
32507	NC_021521	CCAA	2	8	1648878	1648885	50 %	0 %	0 %	50 %	514060313
32508	NC_021521	CAA	2	6	1648966	1648971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060313
32509	NC_021521	CAA	2	6	1649002	1649007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060313
32510	NC_021521	A	6	6	1649030	1649035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32511	NC_021521	AAG	2	6	1649041	1649046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32512	NC_021521	TTCATT	2	12	1649116	1649127	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32513	NC_021521	T	6	6	1649156	1649161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32514	NC_021521	TTA	2	6	1649177	1649182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060314
32515	NC_021521	CGTG	2	8	1649370	1649377	0 %	25 %	50 %	25 %	514060314
32516	NC_021521	AGC	2	6	1649391	1649396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060314
32517	NC_021521	CAA	2	6	1649508	1649513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060314
32518	NC_021521	GCG	2	6	1649659	1649664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060314
32519	NC_021521	TAA	2	6	1649743	1649748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060315
32520	NC_021521	CAC	2	6	1649796	1649801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060315
32521	NC_021521	CAT	2	6	1649857	1649862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060315
32522	NC_021521	CAACC	2	10	1649874	1649883	40 %	0 %	0 %	60 %	514060315
32523	NC_021521	CTG	2	6	1649910	1649915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060315
32524	NC_021521	TACCG	2	10	1649944	1649953	20 %	20 %	20 %	40 %	514060315
32525	NC_021521	TTTC	2	8	1650054	1650061	0 %	75 %	0 %	25 %	514060315
32526	NC_021521	T	6	6	1650073	1650078	0 %	100 %	0 %	0 %	514060315
32527	NC_021521	TTCA	2	8	1650181	1650188	25 %	50 %	0 %	25 %	514060315
32528	NC_021521	ACC	2	6	1650236	1650241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060315
32529	NC_021521	TAA	2	6	1650271	1650276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060315
32530	NC_021521	TA	3	6	1650403	1650408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32531	NC_021521	CATT	2	8	1650438	1650445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32532	NC_021521	CTG	2	6	1650456	1650461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32533	NC_021521	ACA	2	6	1650551	1650556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32534	NC_021521	ACC	2	6	1650774	1650779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32535	NC_021521	AAGT	2	8	1650837	1650844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32536	NC_021521	ATC	2	6	1650919	1650924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32537	NC_021521	CTG	2	6	1650989	1650994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32538	NC_021521	T	6	6	1650996	1651001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32539	NC_021521	GGC	2	6	1651051	1651056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32540	NC_021521	CTT	2	6	1651175	1651180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32541	NC_021521	AAT	2	6	1651203	1651208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32542	NC_021521	TTG	2	6	1651261	1651266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32543	NC_021521	AT	3	6	1651270	1651275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32544	NC_021521	AGA	2	6	1651293	1651298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32545	NC_021521	TC	3	6	1651334	1651339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32546	NC_021521	TCA	2	6	1651348	1651353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32547	NC_021521	CAC	2	6	1651401	1651406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32548	NC_021521	AGAT	2	8	1651466	1651473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32549	NC_021521	TG	3	6	1651517	1651522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32550	NC_021521	CCA	2	6	1651530	1651535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32551	NC_021521	CCA	2	6	1651539	1651544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32552	NC_021521	GA	3	6	1651562	1651567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32553	NC_021521	TGG	2	6	1651593	1651598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32554	NC_021521	AACC	2	8	1651615	1651622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32555	NC_021521	GAA	2	6	1651657	1651662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32556	NC_021521	TGA	2	6	1651694	1651699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32557	NC_021521	TGA	2	6	1651724	1651729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32558	NC_021521	GA	3	6	1651791	1651796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32559	NC_021521	TTC	2	6	1651842	1651847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32560	NC_021521	AATA	2	8	1651908	1651915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32561	NC_021521	GGTGCA	2	12	1651981	1651992	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32562	NC_021521	AGAAA	2	10	1652002	1652011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32563	NC_021521	ATT	2	6	1652082	1652087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32564	NC_021521	ATTT	2	8	1652144	1652151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32565	NC_021521	TA	3	6	1652162	1652167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32566	NC_021521	ACA	2	6	1652171	1652176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32568	NC_021521	ATA	2	6	1652307	1652312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32569	NC_021521	ACA	2	6	1652317	1652322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32570	NC_021521	ACA	2	6	1652336	1652341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060316
32571	NC_021521	GAA	2	6	1652353	1652358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060316
32572	NC_021521	GAC	2	6	1652440	1652445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060316
32573	NC_021521	TTA	2	6	1652455	1652460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060316
32574	NC_021521	ATTG	2	8	1652502	1652509	25 %	50 %	25 %	0 %	514060316
32575	NC_021521	A	6	6	1652547	1652552	100 %	0 %	0 %	0 %	514060316
32576	NC_021521	ATG	2	6	1652588	1652593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060316
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32581	NC_021521	GCTT	2	8	1652972	1652979	0 %	50 %	25 %	25 %	514060316
32582	NC_021521	CTA	2	6	1652991	1652996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060316
32583	NC_021521	TAACT	2	10	1653072	1653081	40 %	40 %	0 %	20 %	514060316
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32590	NC_021521	AG	3	6	1653580	1653585	50 %	0 %	50 %	0 %	514060316
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32598	NC_021521	ATAA	2	8	1653986	1653993	75 %	25 %	0 %	0 %	514060317
32599	NC_021521	A	6	6	1654054	1654059	100 %	0 %	0 %	0 %	514060317
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32601	NC_021521	A	6	6	1654223	1654228	100 %	0 %	0 %	0 %	514060317
32602	NC_021521	GCAA	2	8	1654277	1654284	50 %	0 %	25 %	25 %	514060317
32603	NC_021521	GAC	2	6	1654298	1654303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060317
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32605	NC_021521	GCCA	2	8	1654360	1654367	25 %	0 %	25 %	50 %	514060317
32606	NC_021521	AAG	2	6	1654466	1654471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060317
32607	NC_021521	CAT	2	6	1654510	1654515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060317
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32609	NC_021521	TTG	2	6	1654627	1654632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060317
32610	NC_021521	A	6	6	1654642	1654647	100 %	0 %	0 %	0 %	514060317
32611	NC_021521	ACG	2	6	1654687	1654692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060317
32612	NC_021521	AGT	3	9	1654697	1654705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060317
32613	NC_021521	AT	3	6	1654771	1654776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32614	NC_021521	T	6	6	1654791	1654796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32615	NC_021521	TAT	2	6	1654808	1654813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32617	NC_021521	ATC	2	6	1654850	1654855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32618	NC_021521	ATT	2	6	1654856	1654861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32619	NC_021521	TCAC	2	8	1654879	1654886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32620	NC_021521	ATA	2	6	1654887	1654892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32621	NC_021521	TTC	2	6	1654947	1654952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32622	NC_021521	CA	3	6	1655029	1655034	50 %	0 %	0 %	50 %	514060318
32623	NC_021521	ATC	2	6	1655040	1655045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060318
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32685	NC_021521	TAAT	2	8	1658496	1658503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32686	NC_021521	T	6	6	1658518	1658523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32726	NC_021521	CAAAA	2	10	1660759	1660768	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32727	NC_021521	TTA	2	6	1660789	1660794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32729	NC_021521	CT	3	6	1660846	1660851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32730	NC_021521	T	7	7	1660851	1660857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32731	NC_021521	ATG	2	6	1660861	1660866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32732	NC_021521	ATT	2	6	1660936	1660941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32733	NC_021521	CGT	2	6	1660989	1660994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32737	NC_021521	TGA	2	6	1661139	1661144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32738	NC_021521	ATT	2	6	1661272	1661277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32739	NC_021521	GTT	2	6	1661287	1661292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32740	NC_021521	TGT	2	6	1661406	1661411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32741	NC_021521	TCT	2	6	1661479	1661484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32742	NC_021521	GAA	2	6	1661539	1661544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32744	NC_021521	A	6	6	1661703	1661708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32983	NC_021521	CAA	2	6	1674371	1674376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060332
32984	NC_021521	TCT	2	6	1674384	1674389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060332
32985	NC_021521	CTG	2	6	1674463	1674468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060332
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32990	NC_021521	T	7	7	1674925	1674931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32991	NC_021521	ATC	2	6	1674973	1674978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32995	NC_021521	TGCC	2	8	1675144	1675151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32996	NC_021521	ACGAA	2	10	1675251	1675260	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32997	NC_021521	GGTC	2	8	1675325	1675332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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32999	NC_021521	ATTG	2	8	1675385	1675392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33000	NC_021521	TCT	2	6	1675396	1675401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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