MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_021521	ATG	2	6	1622260	1622265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32002	NC_021521	TCC	2	6	1622286	1622291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32003	NC_021521	CAA	2	6	1622338	1622343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32004	NC_021521	GAC	2	6	1622399	1622404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32005	NC_021521	GCA	2	6	1622411	1622416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32006	NC_021521	CTT	2	6	1622459	1622464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32007	NC_021521	TTC	2	6	1622487	1622492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32008	NC_021521	GCCTTC	2	12	1622731	1622742	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32009	NC_021521	TCC	2	6	1622748	1622753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32010	NC_021521	CCCT	2	8	1622793	1622800	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32011	NC_021521	GCT	2	6	1622938	1622943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32012	NC_021521	CTT	2	6	1622963	1622968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32013	NC_021521	TCA	2	6	1623015	1623020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32014	NC_021521	CTT	2	6	1623047	1623052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32015	NC_021521	C	6	6	1623082	1623087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32016	NC_021521	CTG	2	6	1623106	1623111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32017	NC_021521	TCG	2	6	1623181	1623186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32018	NC_021521	CCA	2	6	1623205	1623210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32019	NC_021521	CGT	2	6	1623306	1623311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32020	NC_021521	AAAG	2	8	1623370	1623377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32021	NC_021521	TCC	2	6	1623384	1623389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32022	NC_021521	GCC	2	6	1623422	1623427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32023	NC_021521	A	6	6	1623567	1623572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32024	NC_021521	TCAA	2	8	1623588	1623595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32025	NC_021521	CA	3	6	1623604	1623609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32026	NC_021521	GTT	2	6	1623623	1623628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32027	NC_021521	A	6	6	1623637	1623642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32028	NC_021521	ACG	2	6	1623645	1623650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32029	NC_021521	CGT	2	6	1623682	1623687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32030	NC_021521	TG	3	6	1623688	1623693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32031	NC_021521	T	6	6	1623732	1623737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32032	NC_021521	A	6	6	1623740	1623745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32033	NC_021521	A	7	7	1623750	1623756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32034	NC_021521	CAT	2	6	1623836	1623841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32035	NC_021521	AT	3	6	1623846	1623851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32036	NC_021521	TTA	2	6	1623866	1623871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32037	NC_021521	CCA	2	6	1624255	1624260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32038	NC_021521	TGCT	2	8	1624396	1624403	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32039	NC_021521	TTG	2	6	1624470	1624475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32040	NC_021521	ACC	2	6	1624495	1624500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32041	NC_021521	A	6	6	1624503	1624508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32042	NC_021521	A	6	6	1624522	1624527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32043	NC_021521	ATTGC	2	10	1624555	1624564	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32044	NC_021521	CAG	2	6	1624572	1624577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32045	NC_021521	TCA	2	6	1624588	1624593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32046	NC_021521	A	6	6	1624615	1624620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32047	NC_021521	ATA	2	6	1624645	1624650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32048	NC_021521	CCG	2	6	1624707	1624712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32049	NC_021521	AGC	2	6	1624762	1624767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32050	NC_021521	GAT	2	6	1624792	1624797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32051	NC_021521	TGC	2	6	1624935	1624940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32052	NC_021521	ACAG	2	8	1625029	1625036	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32053	NC_021521	ATTTA	2	10	1625038	1625047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32054	NC_021521	TGT	2	6	1625070	1625075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32055	NC_021521	CAT	2	6	1625093	1625098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32056	NC_021521	TCAA	2	8	1625101	1625108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32057	NC_021521	A	6	6	1625107	1625112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32058	NC_021521	GGT	2	6	1625278	1625283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060295
32059	NC_021521	GCA	2	6	1625314	1625319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060295
32060	NC_021521	TCTT	2	8	1625365	1625372	0 %	75 %	0 %	25 %	514060295
32061	NC_021521	T	7	7	1625391	1625397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32062	NC_021521	GCG	2	6	1625406	1625411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32063	NC_021521	T	7	7	1625455	1625461	0 %	100 %	0 %	0 %	514060296
32064	NC_021521	TGA	2	6	1625468	1625473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060296
32065	NC_021521	GAA	2	6	1625508	1625513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060296
32066	NC_021521	GCGTG	2	10	1625541	1625550	0 %	20 %	60 %	20 %	514060296
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32068	NC_021521	GTTT	2	8	1625665	1625672	0 %	75 %	25 %	0 %	514060296
32069	NC_021521	CGC	2	6	1625679	1625684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060296
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32071	NC_021521	ATTTGG	2	12	1625791	1625802	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	514060296
32072	NC_021521	TTTG	2	8	1625827	1625834	0 %	75 %	25 %	0 %	514060296
32073	NC_021521	TCA	2	6	1625837	1625842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060296
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32076	NC_021521	TGTT	2	8	1626061	1626068	0 %	75 %	25 %	0 %	514060296
32077	NC_021521	GGT	2	6	1626072	1626077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060296
32078	NC_021521	CAA	2	6	1626123	1626128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060296
32079	NC_021521	GAT	2	6	1626144	1626149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060296
32080	NC_021521	CTG	2	6	1626202	1626207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060296
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32083	NC_021521	TGA	2	6	1626422	1626427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060296
32084	NC_021521	AAAC	2	8	1626473	1626480	75 %	0 %	0 %	25 %	514060296
32085	NC_021521	TGA	2	6	1626542	1626547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060296
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32087	NC_021521	TGA	2	6	1626656	1626661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060296
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32091	NC_021521	TGA	2	6	1626947	1626952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060296
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32099	NC_021521	TGGCAA	2	12	1627285	1627296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	514060296
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32102	NC_021521	TGGT	2	8	1627393	1627400	0 %	50 %	50 %	0 %	514060296
32103	NC_021521	TCA	2	6	1627414	1627419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060296
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32107	NC_021521	GGT	2	6	1628019	1628024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060296
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32110	NC_021521	TGG	2	6	1628365	1628370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060296
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32112	NC_021521	GTTTCG	2	12	1628464	1628475	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	514060296
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32231	NC_021521	AAAT	2	8	1633972	1633979	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32232	NC_021521	TAA	2	6	1633988	1633993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32233	NC_021521	G	6	6	1634000	1634005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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32239	NC_021521	C	6	6	1634205	1634210	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32240	NC_021521	AACC	2	8	1634216	1634223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32241	NC_021521	TTCG	2	8	1634235	1634242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32242	NC_021521	CAA	2	6	1634317	1634322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32245	NC_021521	TTA	2	6	1634403	1634408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32246	NC_021521	TTA	2	6	1634439	1634444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060300
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32327	NC_021521	AATA	2	8	1638891	1638898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32367	NC_021521	CAA	2	6	1640932	1640937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060307
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32401	NC_021521	TGT	2	6	1643164	1643169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32404	NC_021521	GAAA	2	8	1643302	1643309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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32407	NC_021521	ATA	2	6	1643387	1643392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32437	NC_021521	CA	3	6	1645141	1645146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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32441	NC_021521	GAAG	2	8	1645379	1645386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32442	NC_021521	TCCT	2	8	1645465	1645472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32443	NC_021521	TA	3	6	1645518	1645523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32474	NC_021521	GCCAA	2	10	1647046	1647055	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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32477	NC_021521	T	6	6	1647167	1647172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32478	NC_021521	TGAT	2	8	1647209	1647216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32479	NC_021521	GATT	2	8	1647237	1647244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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32483	NC_021521	CTT	2	6	1647415	1647420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32484	NC_021521	A	6	6	1647524	1647529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32485	NC_021521	GA	3	6	1647591	1647596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32486	NC_021521	A	6	6	1647685	1647690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32487	NC_021521	TTA	2	6	1647779	1647784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32488	NC_021521	GATT	2	8	1647902	1647909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32489	NC_021521	CTG	2	6	1647932	1647937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32490	NC_021521	GTT	2	6	1648024	1648029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32491	NC_021521	TTA	2	6	1648124	1648129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32492	NC_021521	GAC	2	6	1648167	1648172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32493	NC_021521	ATC	2	6	1648187	1648192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32494	NC_021521	ACG	2	6	1648230	1648235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32495	NC_021521	ATT	2	6	1648303	1648308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060313
32496	NC_021521	CTT	2	6	1648327	1648332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060313
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32499	NC_021521	TTTG	2	8	1648615	1648622	0 %	75 %	25 %	0 %	514060313
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