MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_021521	ATA	2	6	1595568	1595573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060279
31503	NC_021521	A	7	7	1595586	1595592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31504	NC_021521	T	6	6	1595696	1595701	0 %	100 %	0 %	0 %	514060280
31505	NC_021521	CCT	2	6	1595704	1595709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514060280
31506	NC_021521	ATT	2	6	1595775	1595780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060280
31507	NC_021521	ATG	2	6	1595805	1595810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060280
31508	NC_021521	T	6	6	1595862	1595867	0 %	100 %	0 %	0 %	514060280
31509	NC_021521	TAA	2	6	1595880	1595885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060280
31510	NC_021521	ACC	2	6	1595893	1595898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060280
31511	NC_021521	AAT	2	6	1595940	1595945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060280
31512	NC_021521	T	6	6	1596221	1596226	0 %	100 %	0 %	0 %	514060280
31513	NC_021521	TTG	2	6	1596243	1596248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060280
31514	NC_021521	TTG	2	6	1596255	1596260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060280
31515	NC_021521	TTC	2	6	1596279	1596284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060280
31516	NC_021521	TAA	2	6	1596300	1596305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060280
31517	NC_021521	GAT	2	6	1596452	1596457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060280
31518	NC_021521	TCGACT	2	12	1596532	1596543	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	514060280
31519	NC_021521	ATC	2	6	1596597	1596602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060280
31520	NC_021521	TCT	3	9	1596670	1596678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060280
31521	NC_021521	CTT	2	6	1596695	1596700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060280
31522	NC_021521	TCA	2	6	1596712	1596717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060280
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31529	NC_021521	TCA	2	6	1597054	1597059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060280
31530	NC_021521	TAG	2	6	1597097	1597102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060280
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31532	NC_021521	ATT	2	6	1597290	1597295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060280
31533	NC_021521	TA	3	6	1597348	1597353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31534	NC_021521	TAAA	2	8	1597376	1597383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31535	NC_021521	AT	3	6	1597437	1597442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31536	NC_021521	AT	3	6	1597468	1597473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31537	NC_021521	TTG	2	6	1597509	1597514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31538	NC_021521	TTC	2	6	1597581	1597586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31539	NC_021521	CCA	2	6	1597594	1597599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31540	NC_021521	TTTC	2	8	1597621	1597628	0 %	75 %	0 %	25 %	514060281
31541	NC_021521	T	6	6	1597639	1597644	0 %	100 %	0 %	0 %	514060281
31542	NC_021521	CAA	2	6	1597704	1597709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060281
31543	NC_021521	CGCC	2	8	1597961	1597968	0 %	0 %	25 %	75 %	514060281
31544	NC_021521	TCA	2	6	1598029	1598034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060281
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31553	NC_021521	CGC	2	6	1598448	1598453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060281
31554	NC_021521	T	6	6	1598481	1598486	0 %	100 %	0 %	0 %	514060281
31555	NC_021521	GCTTG	2	10	1598701	1598710	0 %	40 %	40 %	20 %	514060281
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31562	NC_021521	TTCAC	2	10	1599394	1599403	20 %	40 %	0 %	40 %	514060281
31563	NC_021521	CG	3	6	1599530	1599535	0 %	0 %	50 %	50 %	514060281
31564	NC_021521	GCC	2	6	1599686	1599691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060281
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31568	NC_021521	TA	3	6	1599898	1599903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31569	NC_021521	ACA	3	9	1599913	1599921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31570	NC_021521	ATAG	2	8	1600025	1600032	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31571	NC_021521	T	6	6	1600036	1600041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31572	NC_021521	TTA	2	6	1600051	1600056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060282
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31580	NC_021521	TGTTT	2	10	1600311	1600320	0 %	80 %	20 %	0 %	514060282
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31584	NC_021521	CGGCT	2	10	1600559	1600568	0 %	20 %	40 %	40 %	514060282
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31587	NC_021521	TGA	2	6	1600742	1600747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060282
31588	NC_021521	ATG	2	6	1600862	1600867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060282
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31601	NC_021521	CTTG	2	8	1601671	1601678	0 %	50 %	25 %	25 %	514060282
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31605	NC_021521	TTGG	2	8	1601831	1601838	0 %	50 %	50 %	0 %	514060282
31606	NC_021521	GAGG	2	8	1601848	1601855	25 %	0 %	75 %	0 %	514060282
31607	NC_021521	ATA	2	6	1601934	1601939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060282
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31610	NC_021521	TTCTAT	2	12	1601973	1601984	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31611	NC_021521	TTA	2	6	1601987	1601992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31612	NC_021521	A	7	7	1602087	1602093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31613	NC_021521	CGGT	2	8	1602103	1602110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31614	NC_021521	A	6	6	1602116	1602121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31615	NC_021521	T	6	6	1602155	1602160	0 %	100 %	0 %	0 %	514060283
31616	NC_021521	AGC	2	6	1602167	1602172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060283
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31855	NC_021521	GGT	2	6	1614964	1614969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514060293
31856	NC_021521	TCAA	2	8	1614984	1614991	50 %	25 %	0 %	25 %	514060293
31857	NC_021521	AATC	2	8	1614994	1615001	50 %	25 %	0 %	25 %	514060293
31858	NC_021521	AAAG	2	8	1615098	1615105	75 %	0 %	25 %	0 %	514060293
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31870	NC_021521	GTT	2	6	1615900	1615905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060293
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31873	NC_021521	GAT	2	6	1616034	1616039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31874	NC_021521	A	6	6	1616078	1616083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31875	NC_021521	ATT	2	6	1616117	1616122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060294
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31915	NC_021521	TTAA	2	8	1617784	1617791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31916	NC_021521	TATT	2	8	1617827	1617834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31917	NC_021521	TCCC	2	8	1617872	1617879	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31918	NC_021521	A	7	7	1617965	1617971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31925	NC_021521	TCT	2	6	1618156	1618161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31926	NC_021521	T	6	6	1618161	1618166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31927	NC_021521	TAGT	2	8	1618253	1618260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31928	NC_021521	TTG	2	6	1618261	1618266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31930	NC_021521	CT	3	6	1618286	1618291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31931	NC_021521	AC	3	6	1618377	1618382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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31940	NC_021521	GCTT	2	8	1618880	1618887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31941	NC_021521	CTC	2	6	1618940	1618945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31955	NC_021521	TC	3	6	1619702	1619707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31956	NC_021521	CTAAC	2	10	1619776	1619785	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31957	NC_021521	TGT	2	6	1620140	1620145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31959	NC_021521	CTTT	2	8	1620252	1620259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31960	NC_021521	ATG	2	6	1620262	1620267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31962	NC_021521	GTT	2	6	1620358	1620363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31963	NC_021521	CACC	2	8	1620387	1620394	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31964	NC_021521	GT	3	6	1620395	1620400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31965	NC_021521	TCGGT	2	10	1620603	1620612	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31966	NC_021521	GCC	2	6	1620689	1620694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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31968	NC_021521	GGA	2	6	1620917	1620922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31969	NC_021521	C	6	6	1620927	1620932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31970	NC_021521	TTG	2	6	1620967	1620972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31971	NC_021521	TTC	2	6	1621043	1621048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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