MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_021521	A	7	7	1544917	1544923	100 %	0 %	0 %	0 %	514060233
30502	NC_021521	CTTC	2	8	1544999	1545006	0 %	50 %	0 %	50 %	514060233
30503	NC_021521	GAAC	2	8	1545046	1545053	50 %	0 %	25 %	25 %	514060233
30504	NC_021521	TAA	2	6	1545062	1545067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060233
30505	NC_021521	CATCAG	2	12	1545068	1545079	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514060233
30506	NC_021521	TTA	2	6	1545115	1545120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060233
30507	NC_021521	TAT	2	6	1545206	1545211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060233
30508	NC_021521	GAT	2	6	1545236	1545241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060233
30509	NC_021521	TAA	2	6	1545320	1545325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060233
30510	NC_021521	CAT	2	6	1545356	1545361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060233
30511	NC_021521	AT	3	6	1545360	1545365	50 %	50 %	0 %	0 %	514060233
30512	NC_021521	TGA	2	6	1545382	1545387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060233
30513	NC_021521	TATT	2	8	1545409	1545416	25 %	75 %	0 %	0 %	514060233
30514	NC_021521	TAA	2	6	1545563	1545568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060233
30515	NC_021521	CCG	2	6	1545578	1545583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514060233
30516	NC_021521	TCT	2	6	1545640	1545645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060233
30517	NC_021521	CAG	2	6	1545695	1545700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060233
30518	NC_021521	CAA	2	6	1545734	1545739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060233
30519	NC_021521	CTG	2	6	1545750	1545755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060233
30520	NC_021521	TA	3	6	1545766	1545771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30521	NC_021521	ATTTG	2	10	1545894	1545903	20 %	60 %	20 %	0 %	514060234
30522	NC_021521	AGA	2	6	1545917	1545922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060234
30523	NC_021521	TTAT	2	8	1545954	1545961	25 %	75 %	0 %	0 %	514060234
30524	NC_021521	TTG	2	6	1545971	1545976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060234
30525	NC_021521	CTT	2	6	1546079	1546084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060234
30526	NC_021521	TAA	2	6	1546108	1546113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060234
30527	NC_021521	ATT	2	6	1546125	1546130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060234
30528	NC_021521	TTA	2	6	1546177	1546182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060234
30529	NC_021521	ATT	2	6	1546205	1546210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060234
30530	NC_021521	T	8	8	1546234	1546241	0 %	100 %	0 %	0 %	514060234
30531	NC_021521	ATC	2	6	1546343	1546348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060234
30532	NC_021521	TTA	2	6	1546470	1546475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30533	NC_021521	TAC	2	6	1546476	1546481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060235
30534	NC_021521	AT	3	6	1546486	1546491	50 %	50 %	0 %	0 %	514060235
30535	NC_021521	TTTC	2	8	1546495	1546502	0 %	75 %	0 %	25 %	514060235
30536	NC_021521	CAA	2	6	1546513	1546518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060235
30537	NC_021521	ACA	2	6	1546560	1546565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060235
30538	NC_021521	TCA	2	6	1546578	1546583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060235
30539	NC_021521	TTG	2	6	1546647	1546652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060235
30540	NC_021521	GCAATA	2	12	1546653	1546664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514060235
30541	NC_021521	GCT	2	6	1546680	1546685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060235
30542	NC_021521	TTA	2	6	1546779	1546784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060235
30543	NC_021521	AAT	2	6	1546800	1546805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060235
30544	NC_021521	ATA	2	6	1546931	1546936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060235
30545	NC_021521	TAT	2	6	1547095	1547100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060235
30546	NC_021521	TCA	2	6	1547157	1547162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060235
30547	NC_021521	A	6	6	1547229	1547234	100 %	0 %	0 %	0 %	514060235
30548	NC_021521	CTG	2	6	1547290	1547295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060235
30549	NC_021521	AGC	2	6	1547318	1547323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514060235
30550	NC_021521	T	7	7	1547397	1547403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30551	NC_021521	T	7	7	1547411	1547417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30552	NC_021521	ATAA	2	8	1547419	1547426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30553	NC_021521	A	6	6	1547431	1547436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30554	NC_021521	ATG	2	6	1547532	1547537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30555	NC_021521	ACTAG	2	10	1547563	1547572	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30556	NC_021521	A	6	6	1547579	1547584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30557	NC_021521	T	6	6	1547649	1547654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30558	NC_021521	CTA	2	6	1547668	1547673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30559	NC_021521	A	6	6	1547721	1547726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30560	NC_021521	T	6	6	1547732	1547737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30561	NC_021521	CATT	2	8	1547747	1547754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30562	NC_021521	A	7	7	1547793	1547799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30563	NC_021521	ACA	2	6	1547808	1547813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30564	NC_021521	TTAC	2	8	1548182	1548189	25 %	50 %	0 %	25 %	514060236
30565	NC_021521	TGC	2	6	1548230	1548235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060236
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30568	NC_021521	TGC	2	6	1548332	1548337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060236
30569	NC_021521	CGG	2	6	1548350	1548355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514060236
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30571	NC_021521	GAA	2	6	1548465	1548470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514060236
30572	NC_021521	TTA	2	6	1548514	1548519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060236
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30574	NC_021521	TATTC	2	10	1548718	1548727	20 %	60 %	0 %	20 %	514060236
30575	NC_021521	GA	3	6	1548850	1548855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30576	NC_021521	GAT	2	6	1548989	1548994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060237
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30578	NC_021521	TGA	2	6	1549120	1549125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060237
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30582	NC_021521	CAAAA	2	10	1549393	1549402	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30583	NC_021521	A	7	7	1549399	1549405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30588	NC_021521	TGA	2	6	1549573	1549578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30589	NC_021521	TC	3	6	1549580	1549585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30590	NC_021521	TCT	2	6	1549588	1549593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30591	NC_021521	T	7	7	1549593	1549599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30592	NC_021521	CT	3	6	1549736	1549741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30593	NC_021521	CT	3	6	1549744	1549749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30594	NC_021521	AC	3	6	1549835	1549840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30595	NC_021521	CGT	2	6	1549853	1549858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30597	NC_021521	AC	3	6	1549876	1549881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30598	NC_021521	TG	3	6	1549886	1549891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30599	NC_021521	AGC	2	6	1550030	1550035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30601	NC_021521	TGA	2	6	1550164	1550169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30602	NC_021521	CCG	2	6	1550192	1550197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30603	NC_021521	ACC	2	6	1550279	1550284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30604	NC_021521	TGTC	2	8	1550320	1550327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30605	NC_021521	GCTT	2	8	1550338	1550345	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30606	NC_021521	CTC	2	6	1550398	1550403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30607	NC_021521	GAG	2	6	1550417	1550422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30608	NC_021521	CCA	2	6	1550442	1550447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30609	NC_021521	GGT	2	6	1550502	1550507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30610	NC_021521	CTT	2	6	1550544	1550549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30611	NC_021521	ATTTCA	2	12	1550658	1550669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30612	NC_021521	CAT	2	6	1550697	1550702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30613	NC_021521	GCC	2	6	1550772	1550777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30614	NC_021521	GGCA	2	8	1550843	1550850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30615	NC_021521	TAA	2	6	1550897	1550902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30616	NC_021521	CAGC	2	8	1550910	1550917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30617	NC_021521	TC	3	6	1551025	1551030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30618	NC_021521	ACC	2	6	1551055	1551060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30619	NC_021521	TCA	2	6	1551154	1551159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30620	NC_021521	TC	3	6	1551160	1551165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30621	NC_021521	CTAAC	2	10	1551234	1551243	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30622	NC_021521	TGT	2	6	1551598	1551603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30623	NC_021521	CGACT	2	10	1551686	1551695	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30624	NC_021521	CTTT	2	8	1551710	1551717	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30625	NC_021521	ATG	2	6	1551720	1551725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30627	NC_021521	GTT	2	6	1551816	1551821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30628	NC_021521	CACC	2	8	1551845	1551852	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30629	NC_021521	GT	3	6	1551853	1551858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30630	NC_021521	TCGGT	2	10	1552061	1552070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30631	NC_021521	GCC	2	6	1552147	1552152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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30732	NC_021521	ACA	2	6	1556732	1556737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30745	NC_021521	TCT	2	6	1557167	1557172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060240
30746	NC_021521	TCA	2	6	1557183	1557188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060240
30747	NC_021521	GTC	2	6	1557211	1557216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060240
30748	NC_021521	CAC	2	6	1557316	1557321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060240
30749	NC_021521	ATA	2	6	1557335	1557340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060240
30750	NC_021521	TGAA	2	8	1557368	1557375	50 %	25 %	25 %	0 %	514060240
30751	NC_021521	TAA	2	6	1557379	1557384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060240
30752	NC_021521	TGC	2	6	1557463	1557468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060240
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30762	NC_021521	CTG	2	6	1558005	1558010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514060240
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30766	NC_021521	TTGAGC	2	12	1558285	1558296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	514060240
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30769	NC_021521	T	7	7	1558520	1558526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30770	NC_021521	CTT	2	6	1558549	1558554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30772	NC_021521	CAAA	2	8	1558575	1558582	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30773	NC_021521	TGA	2	6	1558620	1558625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30775	NC_021521	CTT	2	6	1558647	1558652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30776	NC_021521	T	6	6	1558651	1558656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30777	NC_021521	ACG	2	6	1558712	1558717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30779	NC_021521	AC	3	6	1558745	1558750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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30784	NC_021521	A	6	6	1558869	1558874	100 %	0 %	0 %	0 %	514060241
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30786	NC_021521	A	6	6	1558924	1558929	100 %	0 %	0 %	0 %	514060241
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30803	NC_021521	TA	3	6	1559823	1559828	50 %	50 %	0 %	0 %	514060243
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30814	NC_021521	GTA	2	6	1560353	1560358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060244
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30817	NC_021521	GA	3	6	1560574	1560579	50 %	0 %	50 %	0 %	514060244
30818	NC_021521	CAC	2	6	1560646	1560651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060244
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30826	NC_021521	GTT	2	6	1561410	1561415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514060245
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30837	NC_021521	TGA	2	6	1562104	1562109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514060245
30838	NC_021521	AT	3	6	1562146	1562151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30839	NC_021521	TA	3	6	1562155	1562160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30840	NC_021521	TAT	2	6	1562209	1562214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30841	NC_021521	CTA	2	6	1562223	1562228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30842	NC_021521	CTA	2	6	1562235	1562240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30843	NC_021521	GTTCA	2	10	1562251	1562260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30844	NC_021521	A	6	6	1562278	1562283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30845	NC_021521	ATT	2	6	1562302	1562307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30846	NC_021521	T	6	6	1562310	1562315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30847	NC_021521	ATG	2	6	1562320	1562325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30848	NC_021521	TAA	2	6	1562326	1562331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30849	NC_021521	TAA	2	6	1562360	1562365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30850	NC_021521	AATT	2	8	1562379	1562386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30851	NC_021521	AGA	2	6	1562438	1562443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30852	NC_021521	ATCT	2	8	1562475	1562482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30853	NC_021521	TCT	2	6	1562542	1562547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514060246
30854	NC_021521	TCA	2	6	1562555	1562560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514060246
30855	NC_021521	ACA	2	6	1562578	1562583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514060246
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30858	NC_021521	AAT	2	6	1562862	1562867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514060246
30859	NC_021521	ATT	2	6	1562883	1562888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514060246
30860	NC_021521	CCA	3	9	1563094	1563102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060246
30861	NC_021521	CCA	2	6	1563202	1563207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514060246
30862	NC_021521	ATTG	2	8	1563283	1563290	25 %	50 %	25 %	0 %	514060246
30863	NC_021521	TACC	2	8	1563305	1563312	25 %	25 %	0 %	50 %	514060246
30864	NC_021521	T	6	6	1563348	1563353	0 %	100 %	0 %	0 %	514060246
30865	NC_021521	ATA	2	6	1563486	1563491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30867	NC_021521	TTAT	2	8	1563582	1563589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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