MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_021521	GTT	2	6	917042	917047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059663
18003	NC_021521	CGT	2	6	917178	917183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059663
18004	NC_021521	TAA	2	6	917217	917222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059663
18005	NC_021521	GTG	2	6	917240	917245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059663
18006	NC_021521	T	7	7	917322	917328	0 %	100 %	0 %	0 %	514059663
18007	NC_021521	CAC	2	6	917377	917382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059663
18008	NC_021521	TGG	2	6	917491	917496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059663
18009	NC_021521	TTC	2	6	917503	917508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059663
18010	NC_021521	CAT	3	9	917526	917534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059663
18011	NC_021521	TA	3	6	917587	917592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_021521	TTCT	2	8	917600	917607	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18013	NC_021521	AAT	2	6	917697	917702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059664
18014	NC_021521	TTC	2	6	917709	917714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059664
18015	NC_021521	AAT	2	6	917724	917729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059664
18016	NC_021521	TCA	2	6	917872	917877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059664
18017	NC_021521	AT	3	6	917905	917910	50 %	50 %	0 %	0 %	514059664
18018	NC_021521	CTCG	2	8	917923	917930	0 %	25 %	25 %	50 %	514059664
18019	NC_021521	ACCG	2	8	918186	918193	25 %	0 %	25 %	50 %	514059664
18020	NC_021521	CAT	2	6	918249	918254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059664
18021	NC_021521	TGG	3	9	918306	918314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059664
18022	NC_021521	TGC	2	6	918372	918377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059664
18023	NC_021521	ACT	2	6	918426	918431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059664
18024	NC_021521	TCC	2	6	918457	918462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514059664
18025	NC_021521	CAACG	2	10	918469	918478	40 %	0 %	20 %	40 %	514059664
18026	NC_021521	T	6	6	918489	918494	0 %	100 %	0 %	0 %	514059664
18027	NC_021521	CAC	2	6	918504	918509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059664
18028	NC_021521	ATC	2	6	918619	918624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059664
18029	NC_021521	CCGA	2	8	918634	918641	25 %	0 %	25 %	50 %	514059664
18030	NC_021521	C	6	6	918649	918654	0 %	0 %	0 %	100 %	514059664
18031	NC_021521	ACA	2	6	918850	918855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059664
18032	NC_021521	CGC	2	6	918921	918926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059664
18033	NC_021521	CTG	2	6	918935	918940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059664
18034	NC_021521	CAC	2	6	918963	918968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059664
18035	NC_021521	TTC	2	6	919074	919079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059664
18036	NC_021521	GTC	2	6	919090	919095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059664
18037	NC_021521	AATC	2	8	919100	919107	50 %	25 %	0 %	25 %	514059664
18038	NC_021521	AAC	2	6	919153	919158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059664
18039	NC_021521	CTT	2	6	919203	919208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059664
18040	NC_021521	CTG	2	6	919223	919228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059664
18041	NC_021521	TGC	2	6	919230	919235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059664
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18043	NC_021521	GCC	2	6	919318	919323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059664
18044	NC_021521	CCA	2	6	919328	919333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059664
18045	NC_021521	TTC	2	6	919392	919397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059664
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18047	NC_021521	TTC	2	6	919611	919616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059664
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18052	NC_021521	TTTA	2	8	920097	920104	25 %	75 %	0 %	0 %	514059664
18053	NC_021521	CAA	2	6	920205	920210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059664
18054	NC_021521	CTAAT	2	10	920213	920222	40 %	40 %	0 %	20 %	514059664
18055	NC_021521	ATCA	2	8	920247	920254	50 %	25 %	0 %	25 %	514059664
18056	NC_021521	TAGT	2	8	920281	920288	25 %	50 %	25 %	0 %	514059665
18057	NC_021521	CTT	2	6	920297	920302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059665
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18060	NC_021521	CGT	2	6	920352	920357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059665
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18069	NC_021521	A	6	6	920823	920828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18070	NC_021521	AAT	2	6	920830	920835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_021521	ATC	3	9	920843	920851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18072	NC_021521	TACA	2	8	920852	920859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18073	NC_021521	ACG	2	6	920935	920940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059666
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18077	NC_021521	TC	3	6	921169	921174	0 %	50 %	0 %	50 %	514059666
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18079	NC_021521	TCT	2	6	921377	921382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059666
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18089	NC_021521	CT	3	6	921789	921794	0 %	50 %	0 %	50 %	514059667
18090	NC_021521	TAAA	2	8	922016	922023	75 %	25 %	0 %	0 %	514059667
18091	NC_021521	TGG	2	6	922050	922055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059667
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18093	NC_021521	TCT	2	6	922083	922088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059667
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18097	NC_021521	TGG	2	6	922374	922379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059667
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18105	NC_021521	CTT	2	6	922717	922722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059667
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18112	NC_021521	CAAT	2	8	923254	923261	50 %	25 %	0 %	25 %	514059667
18113	NC_021521	CTG	2	6	923285	923290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059667
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18122	NC_021521	ATC	2	6	923790	923795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059667
18123	NC_021521	ATA	2	6	923828	923833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059667
18124	NC_021521	TCC	2	6	923835	923840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514059667
18125	NC_021521	CGA	2	6	924050	924055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059667
18126	NC_021521	C	7	7	924071	924077	0 %	0 %	0 %	100 %	514059667
18127	NC_021521	TACCCA	2	12	924082	924093	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	514059667
18128	NC_021521	TCAT	2	8	924123	924130	25 %	50 %	0 %	25 %	514059667
18129	NC_021521	CA	3	6	924148	924153	50 %	0 %	0 %	50 %	514059667
18130	NC_021521	CTG	2	6	924224	924229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059667
18131	NC_021521	TTC	3	9	924311	924319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059667
18132	NC_021521	CCAA	2	8	924394	924401	50 %	0 %	0 %	50 %	514059667
18133	NC_021521	AAT	2	6	924408	924413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059667
18134	NC_021521	GTT	2	6	924418	924423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059667
18135	NC_021521	G	6	6	924484	924489	0 %	0 %	100 %	0 %	514059667
18136	NC_021521	ATTTC	2	10	924538	924547	20 %	60 %	0 %	20 %	514059667
18137	NC_021521	GGT	2	6	924593	924598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18138	NC_021521	AT	3	6	924674	924679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18139	NC_021521	ACAT	2	8	924690	924697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18140	NC_021521	TTC	2	6	924701	924706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18141	NC_021521	ATT	2	6	924707	924712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18142	NC_021521	T	6	6	924711	924716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18143	NC_021521	CA	3	6	924818	924823	50 %	0 %	0 %	50 %	514059668
18144	NC_021521	TCA	2	6	924831	924836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059668
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18146	NC_021521	TC	3	6	924939	924944	0 %	50 %	0 %	50 %	514059668
18147	NC_021521	TGT	2	6	924948	924953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059668
18148	NC_021521	TCA	2	6	925055	925060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059668
18149	NC_021521	GCTGAT	2	12	925089	925100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	514059668
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18152	NC_021521	TG	3	6	925149	925154	0 %	50 %	50 %	0 %	514059668
18153	NC_021521	ATT	2	6	925165	925170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059668
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18156	NC_021521	TC	3	6	925364	925369	0 %	50 %	0 %	50 %	514059669
18157	NC_021521	CGT	2	6	925388	925393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059669
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18163	NC_021521	TAA	2	6	925812	925817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18164	NC_021521	A	7	7	925858	925864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18165	NC_021521	A	7	7	925957	925963	100 %	0 %	0 %	0 %	514059670
18166	NC_021521	GTTT	2	8	926062	926069	0 %	75 %	25 %	0 %	514059670
18167	NC_021521	GAA	2	6	926242	926247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059670
18168	NC_021521	GCTC	2	8	926297	926304	0 %	25 %	25 %	50 %	514059670
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18175	NC_021521	GAT	2	6	926815	926820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059670
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18178	NC_021521	T	7	7	926914	926920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18179	NC_021521	AT	3	6	926926	926931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18180	NC_021521	CTA	2	6	926954	926959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18182	NC_021521	TCA	2	6	926988	926993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18186	NC_021521	T	6	6	927117	927122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18187	NC_021521	AAT	2	6	927137	927142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18188	NC_021521	T	7	7	927150	927156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18189	NC_021521	TTA	2	6	927182	927187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059671
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18218	NC_021521	C	6	6	928565	928570	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18219	NC_021521	T	7	7	928571	928577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18220	NC_021521	G	8	8	928582	928589	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18221	NC_021521	TC	3	6	928615	928620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18222	NC_021521	AG	3	6	928650	928655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18232	NC_021521	TG	3	6	929452	929457	0 %	50 %	50 %	0 %	514059672
18233	NC_021521	T	6	6	929502	929507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18234	NC_021521	TTG	2	6	929586	929591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059673
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18236	NC_021521	CAT	2	6	929741	929746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059673
18237	NC_021521	AC	3	6	929855	929860	50 %	0 %	0 %	50 %	514059673
18238	NC_021521	AAAG	2	8	929876	929883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18239	NC_021521	ATA	2	6	929886	929891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18240	NC_021521	T	7	7	929901	929907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18241	NC_021521	AAT	2	6	929919	929924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18242	NC_021521	TAAA	2	8	929948	929955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18243	NC_021521	ATTT	2	8	929968	929975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18244	NC_021521	T	7	7	929998	930004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18245	NC_021521	GTC	2	6	930023	930028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18247	NC_021521	AGA	2	6	930165	930170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059674
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18249	NC_021521	TC	3	6	930302	930307	0 %	50 %	0 %	50 %	514059674
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18354	NC_021521	ATCT	2	8	934859	934866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18355	NC_021521	AAG	2	6	934868	934873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18356	NC_021521	A	6	6	934882	934887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18357	NC_021521	AGAA	2	8	934908	934915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18358	NC_021521	A	6	6	934914	934919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18359	NC_021521	TGA	2	6	934937	934942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18360	NC_021521	ATA	3	9	934984	934992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18361	NC_021521	ATTA	2	8	934995	935002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18362	NC_021521	GCA	2	6	935046	935051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18364	NC_021521	AAAAC	2	10	935156	935165	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18365	NC_021521	A	6	6	935188	935193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18366	NC_021521	T	6	6	935283	935288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18367	NC_021521	AT	3	6	935314	935319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18368	NC_021521	A	6	6	935332	935337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18369	NC_021521	TGG	2	6	935338	935343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18370	NC_021521	ATT	2	6	935474	935479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18371	NC_021521	AGC	2	6	935540	935545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18373	NC_021521	TTAT	2	8	935708	935715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18493	NC_021521	A	6	6	941643	941648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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