MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021521	GTG	2	6	51941	51946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058811
1002	NC_021521	TGT	2	6	52009	52014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058811
1003	NC_021521	ATG	2	6	52016	52021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058811
1004	NC_021521	A	6	6	52101	52106	100 %	0 %	0 %	0 %	514058811
1005	NC_021521	TTA	2	6	52125	52130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058811
1006	NC_021521	TCA	3	9	52135	52143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058811
1007	NC_021521	G	6	6	52314	52319	0 %	0 %	100 %	0 %	514058811
1008	NC_021521	TTA	2	6	52331	52336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058811
1009	NC_021521	AACGGG	2	12	52342	52353	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	514058811
1010	NC_021521	GCTAAC	2	12	52354	52365	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	514058811
1011	NC_021521	TCGC	2	8	52389	52396	0 %	25 %	25 %	50 %	514058811
1012	NC_021521	GGTTTT	2	12	52493	52504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058811
1013	NC_021521	AGT	2	6	52517	52522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058811
1014	NC_021521	GTG	2	6	52590	52595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021521	TAT	2	6	52603	52608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021521	T	7	7	52672	52678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021521	A	7	7	52691	52697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021521	A	6	6	52712	52717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021521	T	6	6	52744	52749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021521	TTACCA	2	12	52876	52887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058812
1021	NC_021521	TTA	2	6	52908	52913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058812
1022	NC_021521	GTA	2	6	52918	52923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058812
1023	NC_021521	TGC	2	6	52946	52951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058812
1024	NC_021521	AGT	2	6	53103	53108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058812
1025	NC_021521	ATC	2	6	53120	53125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058812
1026	NC_021521	GTG	2	6	53170	53175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058812
1027	NC_021521	TTA	2	6	53183	53188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058812
1028	NC_021521	GAT	2	6	53420	53425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058812
1029	NC_021521	TAAA	2	8	53494	53501	75 %	25 %	0 %	0 %	514058812
1030	NC_021521	ATT	2	6	53502	53507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058812
1031	NC_021521	TGGC	2	8	53533	53540	0 %	25 %	50 %	25 %	514058812
1032	NC_021521	ATT	2	6	53555	53560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058812
1033	NC_021521	ATT	2	6	53709	53714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058812
1034	NC_021521	ATT	2	6	53736	53741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058812
1035	NC_021521	CTT	2	6	53834	53839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514058812
1036	NC_021521	GAT	2	6	54041	54046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058812
1037	NC_021521	AGC	2	6	54130	54135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058812
1038	NC_021521	GTG	2	6	54175	54180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058812
1039	NC_021521	TAA	2	6	54231	54236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021521	TAT	2	6	54298	54303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021521	TAT	2	6	54462	54467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021521	T	7	7	54486	54492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021521	ATG	2	6	54514	54519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021521	TTC	2	6	54533	54538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_021521	TTTGCA	2	12	54580	54591	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1046	NC_021521	T	6	6	54644	54649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021521	TAT	2	6	54663	54668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021521	CAA	3	9	54679	54687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_021521	AAG	2	6	54733	54738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021521	TTG	2	6	54754	54759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021521	CGGT	2	8	54808	54815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_021521	TGA	2	6	54865	54870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021521	ACCA	2	8	54879	54886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_021521	TTCA	2	8	54890	54897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_021521	A	6	6	54899	54904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021521	TGA	2	6	54913	54918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058813
1057	NC_021521	CCA	2	6	54965	54970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514058813
1058	NC_021521	A	6	6	55061	55066	100 %	0 %	0 %	0 %	514058813
1059	NC_021521	TGA	2	6	55110	55115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021521	TGA	2	6	55200	55205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021521	GATT	2	8	55227	55234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021521	AT	3	6	55245	55250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021521	TTAA	2	8	55266	55273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021521	T	7	7	55297	55303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021521	ATC	2	6	55354	55359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058814
1066	NC_021521	GAC	2	6	55401	55406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058814
1067	NC_021521	GAA	2	6	55566	55571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058814
1068	NC_021521	CAAT	2	8	55691	55698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_021521	ATT	2	6	55796	55801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021521	A	6	6	55862	55867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021521	C	6	6	56066	56071	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1072	NC_021521	ATG	2	6	56089	56094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021521	A	6	6	56226	56231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021521	ATT	2	6	56301	56306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021521	AGC	2	6	56339	56344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_021521	CAA	2	6	56352	56357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_021521	AAC	2	6	56401	56406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_021521	ATTTAG	2	12	56536	56547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021521	GTG	2	6	56553	56558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021521	GA	3	6	56649	56654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021521	ATT	2	6	56689	56694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021521	A	6	6	56773	56778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021521	T	7	7	56824	56830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021521	GAA	2	6	56973	56978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058815
1085	NC_021521	ATT	2	6	57000	57005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058815
1086	NC_021521	A	6	6	57084	57089	100 %	0 %	0 %	0 %	514058815
1087	NC_021521	TTAA	2	8	57183	57190	50 %	50 %	0 %	0 %	514058815
1088	NC_021521	ATT	2	6	57248	57253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058815
1089	NC_021521	AAC	2	6	57359	57364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058815
1090	NC_021521	ACGG	2	8	57429	57436	25 %	0 %	50 %	25 %	514058815
1091	NC_021521	AATGC	2	10	57456	57465	40 %	20 %	20 %	20 %	514058815
1092	NC_021521	GTG	2	6	57565	57570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058815
1093	NC_021521	AGCA	2	8	57613	57620	50 %	0 %	25 %	25 %	514058815
1094	NC_021521	TAA	2	6	57677	57682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514058815
1095	NC_021521	CCG	2	6	57689	57694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514058815
1096	NC_021521	TGG	2	6	57703	57708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058815
1097	NC_021521	ACA	2	6	57722	57727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058815
1098	NC_021521	CAAT	2	8	57740	57747	50 %	25 %	0 %	25 %	514058815
1099	NC_021521	TAT	2	6	57749	57754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058815
1100	NC_021521	CAAT	2	8	57788	57795	50 %	25 %	0 %	25 %	514058815
1101	NC_021521	ATTG	2	8	57852	57859	25 %	50 %	25 %	0 %	514058815
1102	NC_021521	TTA	2	6	57876	57881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058815
1103	NC_021521	AGT	2	6	57907	57912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058815
1104	NC_021521	GATC	2	8	57942	57949	25 %	25 %	25 %	25 %	514058816
1105	NC_021521	ATT	2	6	57972	57977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058816
1106	NC_021521	TGG	2	6	57995	58000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058816
1107	NC_021521	AAG	2	6	58085	58090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514058816
1108	NC_021521	CTG	2	6	58109	58114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058816
1109	NC_021521	TTGA	2	8	58117	58124	25 %	50 %	25 %	0 %	514058816
1110	NC_021521	CGT	2	6	58135	58140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058816
1111	NC_021521	GTT	2	6	58216	58221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058816
1112	NC_021521	GTG	2	6	58345	58350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514058816
1113	NC_021521	TG	3	6	58354	58359	0 %	50 %	50 %	0 %	514058816
1114	NC_021521	GAAC	2	8	58407	58414	50 %	0 %	25 %	25 %	514058816
1115	NC_021521	GAT	2	6	58416	58421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058816
1116	NC_021521	CGT	2	6	58488	58493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058816
1117	NC_021521	TTG	2	6	58551	58556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058816
1118	NC_021521	GCT	2	6	58587	58592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058816
1119	NC_021521	CAA	2	6	58717	58722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058816
1120	NC_021521	GAT	2	6	58782	58787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514058816
1121	NC_021521	GTC	2	6	58790	58795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514058816
1122	NC_021521	ATT	2	6	58828	58833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058816
1123	NC_021521	ACA	2	6	58872	58877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514058816
1124	NC_021521	TTG	2	6	58953	58958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514058816
1125	NC_021521	ATT	2	6	58967	58972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058816
1126	NC_021521	AG	3	6	58989	58994	50 %	0 %	50 %	0 %	514058816
1127	NC_021521	TTTAC	2	10	59038	59047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1128	NC_021521	TAA	2	6	59084	59089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021521	AAT	2	6	59106	59111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021521	TATG	2	8	59112	59119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021521	CT	3	6	59135	59140	0 %	50 %	0 %	50 %	514058817
1132	NC_021521	ATT	2	6	59183	59188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514058817
1133	NC_021521	TCA	2	6	59377	59382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058817
1134	NC_021521	ATC	2	6	59454	59459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058817
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1137	NC_021521	TCA	2	6	59593	59598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058817
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1143	NC_021521	TAC	2	6	59963	59968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514058817
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1145	NC_021521	T	7	7	60073	60079	0 %	100 %	0 %	0 %	514058817
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1154	NC_021521	AAAG	2	8	60690	60697	75 %	0 %	25 %	0 %	514058818
1155	NC_021521	GCA	2	6	60741	60746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514058818
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1163	NC_021521	TTTA	2	8	61274	61281	25 %	75 %	0 %	0 %	514058818
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