MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021521	CCG	2	6	714008	714013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059435
14002	NC_021521	AGA	2	6	714031	714036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059435
14003	NC_021521	GAT	2	6	714042	714047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059435
14004	NC_021521	ATT	2	6	714068	714073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059435
14005	NC_021521	T	6	6	714083	714088	0 %	100 %	0 %	0 %	514059436
14006	NC_021521	ATC	2	6	714102	714107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059436
14007	NC_021521	CTT	2	6	714158	714163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059436
14008	NC_021521	AATGT	2	10	714191	714200	40 %	40 %	20 %	0 %	514059436
14009	NC_021521	CTT	2	6	714257	714262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059436
14010	NC_021521	CGA	2	6	714266	714271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059436
14011	NC_021521	GAC	2	6	714275	714280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059436
14012	NC_021521	AG	3	6	714339	714344	50 %	0 %	50 %	0 %	514059436
14013	NC_021521	CCG	2	6	714443	714448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059436
14014	NC_021521	CTG	2	6	714512	714517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059436
14015	NC_021521	AT	3	6	714544	714549	50 %	50 %	0 %	0 %	514059436
14016	NC_021521	TTA	2	6	714586	714591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059437
14017	NC_021521	CCG	2	6	714600	714605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059437
14018	NC_021521	TTG	2	6	714607	714612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059437
14019	NC_021521	GGT	2	6	714652	714657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059437
14020	NC_021521	TAA	2	6	714699	714704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059437
14021	NC_021521	TCA	2	6	714764	714769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059437
14022	NC_021521	CTT	2	6	714827	714832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059437
14023	NC_021521	TCA	2	6	714836	714841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059437
14024	NC_021521	TGT	2	6	714965	714970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059437
14025	NC_021521	TTG	2	6	715012	715017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059437
14026	NC_021521	TGG	2	6	715057	715062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059438
14027	NC_021521	AAAG	2	8	715063	715070	75 %	0 %	25 %	0 %	514059438
14028	NC_021521	CAG	2	6	715095	715100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059438
14029	NC_021521	TAATGC	2	12	715150	715161	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514059438
14030	NC_021521	TTG	2	6	715166	715171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059438
14031	NC_021521	TTA	2	6	715300	715305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_021521	AGC	2	6	715464	715469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059439
14033	NC_021521	T	7	7	715549	715555	0 %	100 %	0 %	0 %	514059439
14034	NC_021521	AGA	2	6	715594	715599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059439
14035	NC_021521	TGG	2	6	715684	715689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059439
14036	NC_021521	ATC	2	6	715702	715707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059439
14037	NC_021521	CTTG	2	8	715766	715773	0 %	50 %	25 %	25 %	514059439
14038	NC_021521	ATT	2	6	715831	715836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059439
14039	NC_021521	ATG	2	6	715856	715861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_021521	ATA	2	6	715877	715882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_021521	AC	3	6	715892	715897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14042	NC_021521	GT	3	6	715901	715906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_021521	C	6	6	715919	715924	0 %	0 %	0 %	100 %	514059440
14044	NC_021521	ATT	2	6	715937	715942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059440
14045	NC_021521	AAT	2	6	715969	715974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059440
14046	NC_021521	TTG	2	6	716027	716032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059440
14047	NC_021521	CTT	2	6	716068	716073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059440
14048	NC_021521	AACA	2	8	716079	716086	75 %	0 %	0 %	25 %	514059440
14049	NC_021521	CTT	2	6	716245	716250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059440
14050	NC_021521	TCA	2	6	716407	716412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059440
14051	NC_021521	T	6	6	716432	716437	0 %	100 %	0 %	0 %	514059440
14052	NC_021521	TTG	2	6	716564	716569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059440
14053	NC_021521	A	6	6	716664	716669	100 %	0 %	0 %	0 %	514059440
14054	NC_021521	CCA	2	6	716691	716696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059440
14055	NC_021521	GACA	2	8	716759	716766	50 %	0 %	25 %	25 %	514059440
14056	NC_021521	GTTT	2	8	716772	716779	0 %	75 %	25 %	0 %	514059440
14057	NC_021521	CGG	2	6	716786	716791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059440
14058	NC_021521	GAGAG	2	10	716956	716965	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_021521	AATC	2	8	716990	716997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_021521	GTA	2	6	717068	717073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_021521	GTT	2	6	717097	717102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_021521	TTAA	2	8	717113	717120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_021521	ATG	2	6	717172	717177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_021521	TTTA	2	8	717201	717208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_021521	CA	3	6	717234	717239	50 %	0 %	0 %	50 %	514059441
14066	NC_021521	GGT	2	6	717267	717272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059441
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14070	NC_021521	ATT	2	6	717394	717399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059442
14071	NC_021521	A	7	7	717452	717458	100 %	0 %	0 %	0 %	514059442
14072	NC_021521	ACA	2	6	717488	717493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059442
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14077	NC_021521	AAAT	2	8	717669	717676	75 %	25 %	0 %	0 %	514059443
14078	NC_021521	AAG	2	6	717712	717717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059443
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14080	NC_021521	AGA	2	6	717749	717754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059443
14081	NC_021521	ATTG	2	8	717800	717807	25 %	50 %	25 %	0 %	514059443
14082	NC_021521	AGG	2	6	717880	717885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059443
14083	NC_021521	TAT	2	6	717911	717916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059443
14084	NC_021521	TAA	2	6	717947	717952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059443
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14086	NC_021521	AGTAT	2	10	718031	718040	40 %	40 %	20 %	0 %	514059443
14087	NC_021521	T	6	6	718055	718060	0 %	100 %	0 %	0 %	514059444
14088	NC_021521	CAA	2	6	718104	718109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059444
14089	NC_021521	GGT	2	6	718184	718189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059444
14090	NC_021521	AAC	2	6	718200	718205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059444
14091	NC_021521	CAA	2	6	718213	718218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059444
14092	NC_021521	AT	3	6	718271	718276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_021521	TCT	2	6	718316	718321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059445
14094	NC_021521	T	6	6	718321	718326	0 %	100 %	0 %	0 %	514059445
14095	NC_021521	TCC	2	6	718502	718507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514059445
14096	NC_021521	ATT	2	6	718533	718538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059445
14097	NC_021521	TTTG	2	8	718614	718621	0 %	75 %	25 %	0 %	514059445
14098	NC_021521	TGGGC	2	10	718654	718663	0 %	20 %	60 %	20 %	514059445
14099	NC_021521	CCG	2	6	718720	718725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059446
14100	NC_021521	CAGG	2	8	718841	718848	25 %	0 %	50 %	25 %	514059446
14101	NC_021521	GTT	2	6	718924	718929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059446
14102	NC_021521	TTA	2	6	718951	718956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059446
14103	NC_021521	CATA	2	8	719022	719029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14104	NC_021521	GAA	2	6	719051	719056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_021521	A	6	6	719131	719136	100 %	0 %	0 %	0 %	514059447
14106	NC_021521	TGG	2	6	719149	719154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059447
14107	NC_021521	TAT	2	6	719192	719197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059447
14108	NC_021521	TTA	2	6	719261	719266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059447
14109	NC_021521	ATT	2	6	719279	719284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059447
14110	NC_021521	CTG	2	6	719362	719367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059447
14111	NC_021521	G	6	6	719367	719372	0 %	0 %	100 %	0 %	514059447
14112	NC_021521	GCCA	2	8	719391	719398	25 %	0 %	25 %	50 %	514059447
14113	NC_021521	CAG	2	6	719467	719472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059447
14114	NC_021521	ACT	2	6	719546	719551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059447
14115	NC_021521	CGTT	2	8	719693	719700	0 %	50 %	25 %	25 %	514059447
14116	NC_021521	GCG	2	6	719718	719723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059447
14117	NC_021521	CTG	2	6	719749	719754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059447
14118	NC_021521	GAA	2	6	719769	719774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059447
14119	NC_021521	CAA	2	6	719806	719811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059447
14120	NC_021521	ATC	2	6	719864	719869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059447
14121	NC_021521	ATG	2	6	720050	720055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059448
14122	NC_021521	A	6	6	720121	720126	100 %	0 %	0 %	0 %	514059448
14123	NC_021521	GGT	2	6	720147	720152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059448
14124	NC_021521	TTAA	2	8	720160	720167	50 %	50 %	0 %	0 %	514059448
14125	NC_021521	TGG	2	6	720221	720226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059448
14126	NC_021521	A	6	6	720316	720321	100 %	0 %	0 %	0 %	514059448
14127	NC_021521	ATT	2	6	720548	720553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059448
14128	NC_021521	AAGATG	2	12	720641	720652	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514059448
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14131	NC_021521	GGC	2	6	720936	720941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059448
14132	NC_021521	ATC	2	6	720950	720955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059448
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14136	NC_021521	TTG	2	6	721196	721201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059448
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14143	NC_021521	A	6	6	721429	721434	100 %	0 %	0 %	0 %	514059448
14144	NC_021521	TAT	2	6	721482	721487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059448
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14147	NC_021521	A	6	6	721639	721644	100 %	0 %	0 %	0 %	514059448
14148	NC_021521	CAA	2	6	721657	721662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059448
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14152	NC_021521	ATTTT	2	10	721904	721913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14153	NC_021521	TTAA	2	8	721938	721945	50 %	50 %	0 %	0 %	514059449
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14162	NC_021521	AAT	2	6	722363	722368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14163	NC_021521	T	6	6	722394	722399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14164	NC_021521	A	6	6	722405	722410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14165	NC_021521	TA	3	6	722466	722471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14166	NC_021521	T	6	6	722494	722499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14167	NC_021521	CAT	2	6	722574	722579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059450
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14189	NC_021521	T	6	6	723627	723632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14190	NC_021521	ATA	2	6	723674	723679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14193	NC_021521	TGA	2	6	723817	723822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14212	NC_021521	A	6	6	724852	724857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14213	NC_021521	GTA	2	6	724914	724919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059454
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14219	NC_021521	TAG	2	6	725268	725273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14221	NC_021521	CGGT	2	8	725347	725354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14222	NC_021521	GTT	2	6	725384	725389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059455
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14233	NC_021521	GTT	2	6	725989	725994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059455
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14236	NC_021521	TAGT	2	8	726181	726188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14237	NC_021521	TAG	2	6	726202	726207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14238	NC_021521	GCG	2	6	726237	726242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14239	NC_021521	TAT	2	6	726261	726266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14240	NC_021521	TC	3	6	726274	726279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14241	NC_021521	A	7	7	726338	726344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14242	NC_021521	CCG	2	6	726369	726374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14243	NC_021521	TAG	2	6	726381	726386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_021521	AAATT	2	10	726422	726431	60 %	40 %	0 %	0 %	514059456
14245	NC_021521	TCA	2	6	726486	726491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059456
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14247	NC_021521	AAT	2	6	726519	726524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059456
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14249	NC_021521	CTG	2	6	726640	726645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059456
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14252	NC_021521	TTGA	2	8	726792	726799	25 %	50 %	25 %	0 %	514059456
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14255	NC_021521	AGCC	2	8	726909	726916	25 %	0 %	25 %	50 %	514059456
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14280	NC_021521	TAA	2	6	728239	728244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14348	NC_021521	TCAA	2	8	731751	731758	50 %	25 %	0 %	25 %	514059465
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14369	NC_021521	GCCATT	2	12	732810	732821	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	514059466
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14494	NC_021521	ACT	2	6	739124	739129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059475
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14496	NC_021521	GGT	2	6	739274	739279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059475
14497	NC_021521	A	6	6	739326	739331	100 %	0 %	0 %	0 %	514059475
14498	NC_021521	A	6	6	739349	739354	100 %	0 %	0 %	0 %	514059475
14499	NC_021521	AAG	2	6	739428	739433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059475
14500	NC_021521	CT	3	6	739446	739451	0 %	50 %	0 %	50 %	514059475

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