MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021521	A	6	6	688424	688429	100 %	0 %	0 %	0 %	514059413
13502	NC_021521	TAC	2	6	688530	688535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059413
13503	NC_021521	TGATT	2	10	688581	688590	20 %	60 %	20 %	0 %	514059413
13504	NC_021521	ATG	2	6	688630	688635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059413
13505	NC_021521	ATTG	2	8	688638	688645	25 %	50 %	25 %	0 %	514059413
13506	NC_021521	AAGGTA	2	12	688666	688677	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	514059413
13507	NC_021521	AGAA	2	8	688700	688707	75 %	0 %	25 %	0 %	514059413
13508	NC_021521	GTG	2	6	688784	688789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059414
13509	NC_021521	T	6	6	688839	688844	0 %	100 %	0 %	0 %	514059414
13510	NC_021521	AAT	2	6	688966	688971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059414
13511	NC_021521	AG	3	6	689093	689098	50 %	0 %	50 %	0 %	514059414
13512	NC_021521	AGA	2	6	689196	689201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059414
13513	NC_021521	AAG	2	6	689208	689213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059414
13514	NC_021521	GAT	2	6	689340	689345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059414
13515	NC_021521	CAA	2	6	689383	689388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059414
13516	NC_021521	TTTG	2	8	689420	689427	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_021521	GTT	2	6	689447	689452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_021521	GATG	2	8	689470	689477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_021521	TTTTA	2	10	689489	689498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_021521	AAG	2	6	689502	689507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_021521	ATTA	2	8	689508	689515	50 %	50 %	0 %	0 %	514059415
13522	NC_021521	GAA	2	6	689542	689547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059415
13523	NC_021521	CTG	2	6	689660	689665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059415
13524	NC_021521	TGT	2	6	689712	689717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059415
13525	NC_021521	AGA	2	6	689739	689744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059415
13526	NC_021521	GAA	2	6	689821	689826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059415
13527	NC_021521	GTT	2	6	689836	689841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059415
13528	NC_021521	GTAAA	2	10	689855	689864	60 %	20 %	20 %	0 %	514059415
13529	NC_021521	TGT	2	6	690009	690014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059415
13530	NC_021521	TCG	2	6	690021	690026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059415
13531	NC_021521	ACA	2	6	690040	690045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059415
13532	NC_021521	CTG	2	6	690050	690055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059415
13533	NC_021521	GAA	2	6	690061	690066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059415
13534	NC_021521	GAA	2	6	690111	690116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059415
13535	NC_021521	TTA	2	6	690163	690168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059415
13536	NC_021521	GTT	2	6	690214	690219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059415
13537	NC_021521	AAG	2	6	690230	690235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059415
13538	NC_021521	ACC	2	6	690332	690337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059415
13539	NC_021521	TAAC	2	8	690365	690372	50 %	25 %	0 %	25 %	514059415
13540	NC_021521	TGGAC	2	10	690440	690449	20 %	20 %	40 %	20 %	514059415
13541	NC_021521	TGA	2	6	690519	690524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059415
13542	NC_021521	CGT	3	9	690529	690537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059415
13543	NC_021521	CAA	2	6	690597	690602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059415
13544	NC_021521	ATCAA	2	10	690625	690634	60 %	20 %	0 %	20 %	514059415
13545	NC_021521	TGGC	2	8	690713	690720	0 %	25 %	50 %	25 %	514059415
13546	NC_021521	GAA	2	6	690721	690726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059415
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13550	NC_021521	AGA	2	6	690978	690983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059415
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13552	NC_021521	CAG	2	6	691097	691102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059415
13553	NC_021521	AAG	3	9	691124	691132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059415
13554	NC_021521	AGC	2	6	691164	691169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059415
13555	NC_021521	CT	3	6	691187	691192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13556	NC_021521	CT	3	6	691292	691297	0 %	50 %	0 %	50 %	514059416
13557	NC_021521	TGA	2	6	691313	691318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059416
13558	NC_021521	T	7	7	691561	691567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_021521	TAA	2	6	691579	691584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_021521	AT	3	6	691603	691608	50 %	50 %	0 %	0 %	514059417
13561	NC_021521	CAT	2	6	691615	691620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059417
13562	NC_021521	TGCT	2	8	691626	691633	0 %	50 %	25 %	25 %	514059417
13563	NC_021521	TTG	2	6	691641	691646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059417
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13565	NC_021521	CAT	2	6	691693	691698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059417
13566	NC_021521	TTG	2	6	691728	691733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059417
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13575	NC_021521	TAA	2	6	691974	691979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059418
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13577	NC_021521	CAG	2	6	692029	692034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059418
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13581	NC_021521	A	6	6	692377	692382	100 %	0 %	0 %	0 %	514059418
13582	NC_021521	A	6	6	692399	692404	100 %	0 %	0 %	0 %	514059418
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13589	NC_021521	TTTA	2	8	692863	692870	25 %	75 %	0 %	0 %	514059418
13590	NC_021521	GGA	2	6	692889	692894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059418
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13592	NC_021521	ACA	2	6	693095	693100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059419
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13603	NC_021521	AAG	2	6	693566	693571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059419
13604	NC_021521	CGT	2	6	693658	693663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059419
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13606	NC_021521	GTC	2	6	693716	693721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059419
13607	NC_021521	AATC	2	8	693766	693773	50 %	25 %	0 %	25 %	514059419
13608	NC_021521	TAA	2	6	693781	693786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059419
13609	NC_021521	AAGGG	2	10	693927	693936	40 %	0 %	60 %	0 %	514059420
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13612	NC_021521	AAGC	2	8	694196	694203	50 %	0 %	25 %	25 %	514059421
13613	NC_021521	TTG	2	6	694214	694219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059421
13614	NC_021521	AGCA	2	8	694257	694264	50 %	0 %	25 %	25 %	514059421
13615	NC_021521	TAC	2	6	694331	694336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059421
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13617	NC_021521	AGTG	2	8	694587	694594	25 %	25 %	50 %	0 %	514059421
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13620	NC_021521	GTA	2	6	694847	694852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059421
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13622	NC_021521	GAG	2	6	694877	694882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13746	NC_021521	TGCG	2	8	701048	701055	0 %	25 %	50 %	25 %	514059423
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13988	NC_021521	GCT	2	6	713360	713365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059435
13989	NC_021521	TCA	2	6	713366	713371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059435
13990	NC_021521	ATC	2	6	713411	713416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059435
13991	NC_021521	GA	3	6	713526	713531	50 %	0 %	50 %	0 %	514059435
13992	NC_021521	CCACGA	2	12	713567	713578	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	514059435
13993	NC_021521	C	6	6	713661	713666	0 %	0 %	0 %	100 %	514059435
13994	NC_021521	TAAC	2	8	713718	713725	50 %	25 %	0 %	25 %	514059435
13995	NC_021521	GAAA	2	8	713739	713746	75 %	0 %	25 %	0 %	514059435
13996	NC_021521	TTG	2	6	713800	713805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059435
13997	NC_021521	CTT	2	6	713850	713855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059435
13998	NC_021521	TGCC	2	8	713862	713869	0 %	25 %	25 %	50 %	514059435
13999	NC_021521	GCT	2	6	713905	713910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059435
14000	NC_021521	GA	3	6	713977	713982	50 %	0 %	50 %	0 %	514059435

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