MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021521	TTA	2	6	662797	662802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_021521	TAA	2	6	662900	662905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_021521	AAC	2	6	662922	662927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_021521	ATG	2	6	662929	662934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_021521	TGA	2	6	662990	662995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_021521	TCG	3	9	663197	663205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_021521	TA	4	8	663252	663259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_021521	AT	3	6	663270	663275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_021521	T	7	7	663479	663485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_021521	AAT	2	6	663486	663491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_021521	CAG	2	6	663588	663593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_021521	A	7	7	663641	663647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_021521	A	6	6	663665	663670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_021521	AAT	2	6	663723	663728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_021521	TA	3	6	663883	663888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_021521	TAT	2	6	663894	663899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_021521	CAAGCA	2	12	663915	663926	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_021521	CAA	2	6	664039	664044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_021521	TTTAGG	2	12	664106	664117	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_021521	GCA	2	6	664136	664141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_021521	ATT	2	6	664144	664149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_021521	TTTA	2	8	664154	664161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_021521	TAC	2	6	664223	664228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_021521	T	6	6	664233	664238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_021521	AAG	2	6	664255	664260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_021521	TCT	2	6	664347	664352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_021521	TTCA	2	8	664378	664385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13028	NC_021521	ATA	2	6	664474	664479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_021521	GCAA	2	8	664506	664513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13030	NC_021521	TA	3	6	664518	664523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_021521	TAT	2	6	664577	664582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_021521	AAT	2	6	664599	664604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_021521	A	7	7	664644	664650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_021521	TTG	3	9	664686	664694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_021521	CTA	2	6	664767	664772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_021521	A	6	6	664846	664851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021521	TTC	2	6	664856	664861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_021521	T	6	6	664892	664897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_021521	TGA	2	6	664906	664911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_021521	AATC	2	8	664920	664927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13041	NC_021521	AGT	2	6	664948	664953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_021521	TGA	2	6	664963	664968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_021521	TAA	2	6	664971	664976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059396
13044	NC_021521	ATT	2	6	665047	665052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
13045	NC_021521	ATT	2	6	665060	665065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
13046	NC_021521	TAT	2	6	665149	665154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
13047	NC_021521	ATTT	2	8	665183	665190	25 %	75 %	0 %	0 %	514059396
13048	NC_021521	T	7	7	665188	665194	0 %	100 %	0 %	0 %	514059396
13049	NC_021521	AAC	2	6	665301	665306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059396
13050	NC_021521	TTCT	2	8	665323	665330	0 %	75 %	0 %	25 %	514059396
13051	NC_021521	T	6	6	665352	665357	0 %	100 %	0 %	0 %	514059396
13052	NC_021521	AATT	2	8	665478	665485	50 %	50 %	0 %	0 %	514059396
13053	NC_021521	TTAC	2	8	665526	665533	25 %	50 %	0 %	25 %	514059396
13054	NC_021521	AATG	2	8	665609	665616	50 %	25 %	25 %	0 %	514059396
13055	NC_021521	TAT	2	6	665623	665628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
13056	NC_021521	A	7	7	665679	665685	100 %	0 %	0 %	0 %	514059396
13057	NC_021521	TTA	2	6	665771	665776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
13058	NC_021521	CAA	2	6	665795	665800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059396
13059	NC_021521	AG	3	6	665801	665806	50 %	0 %	50 %	0 %	514059396
13060	NC_021521	ATT	2	6	665861	665866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
13061	NC_021521	A	6	6	665874	665879	100 %	0 %	0 %	0 %	514059396
13062	NC_021521	CGC	2	6	665888	665893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059396
13063	NC_021521	GCAGA	2	10	665966	665975	40 %	0 %	40 %	20 %	514059396
13064	NC_021521	A	7	7	665975	665981	100 %	0 %	0 %	0 %	514059396
13065	NC_021521	GAT	2	6	666002	666007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059396
13066	NC_021521	AAT	2	6	666071	666076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059396
13067	NC_021521	GA	3	6	666102	666107	50 %	0 %	50 %	0 %	514059396
13068	NC_021521	GATCAT	2	12	666131	666142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	514059396
13069	NC_021521	AGC	2	6	666189	666194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059396
13070	NC_021521	ATCA	2	8	666216	666223	50 %	25 %	0 %	25 %	514059396
13071	NC_021521	TGA	2	6	666364	666369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059396
13072	NC_021521	AAG	2	6	666384	666389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059396
13073	NC_021521	AATA	2	8	666394	666401	75 %	25 %	0 %	0 %	514059396
13074	NC_021521	GTC	2	6	666449	666454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059396
13075	NC_021521	ATGTTG	2	12	666486	666497	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	514059396
13076	NC_021521	TTA	2	6	666554	666559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
13077	NC_021521	TAC	2	6	666577	666582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059396
13078	NC_021521	TTA	2	6	666647	666652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
13079	NC_021521	CAA	2	6	666698	666703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059396
13080	NC_021521	GAT	2	6	666710	666715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059396
13081	NC_021521	TGA	2	6	666772	666777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059396
13082	NC_021521	GTTG	2	8	666862	666869	0 %	50 %	50 %	0 %	514059396
13083	NC_021521	ATT	2	6	666930	666935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
13084	NC_021521	ATT	2	6	666951	666956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059396
13085	NC_021521	ACA	2	6	667060	667065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059396
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13088	NC_021521	AAAT	2	8	667273	667280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_021521	AT	3	6	667445	667450	50 %	50 %	0 %	0 %	514059397
13090	NC_021521	AAG	2	6	667471	667476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059397
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13092	NC_021521	A	6	6	667534	667539	100 %	0 %	0 %	0 %	514059397
13093	NC_021521	TCGGT	2	10	667549	667558	0 %	40 %	40 %	20 %	514059397
13094	NC_021521	TGG	2	6	667606	667611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059397
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13096	NC_021521	TAA	2	6	667785	667790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_021521	CTA	2	6	667820	667825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_021521	TGC	2	6	667929	667934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_021521	A	6	6	667937	667942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_021521	GTT	2	6	667990	667995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_021521	CAA	2	6	668190	668195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_021521	A	6	6	668194	668199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_021521	CAAA	2	8	668200	668207	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13104	NC_021521	TAA	2	6	668234	668239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_021521	AGA	2	6	668276	668281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_021521	GAA	2	6	668369	668374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_021521	CTA	2	6	668417	668422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_021521	TGA	2	6	668426	668431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_021521	ACA	2	6	668432	668437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_021521	CGG	2	6	668507	668512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_021521	TGA	2	6	668537	668542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_021521	GAAAC	2	10	668676	668685	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13113	NC_021521	A	6	6	668722	668727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_021521	AAG	2	6	668767	668772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_021521	A	6	6	668808	668813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_021521	ATT	2	6	668834	668839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_021521	GTGAA	2	10	668854	668863	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_021521	GGT	2	6	668865	668870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_021521	CCA	2	6	668903	668908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13120	NC_021521	TAT	2	6	668969	668974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_021521	TCAA	2	8	668997	669004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13122	NC_021521	TGT	2	6	669107	669112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_021521	AAG	2	6	669121	669126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_021521	GTT	2	6	669168	669173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_021521	GGT	2	6	669210	669215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13127	NC_021521	GGT	2	6	669273	669278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_021521	A	6	6	669297	669302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_021521	A	6	6	669348	669353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_021521	GAA	2	6	669360	669365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_021521	GAT	2	6	669402	669407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13133	NC_021521	TAA	2	6	669445	669450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13134	NC_021521	T	6	6	669482	669487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13135	NC_021521	TAA	2	6	669492	669497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13136	NC_021521	GCAAT	2	10	669508	669517	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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13139	NC_021521	ATACA	2	10	669713	669722	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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13142	NC_021521	CTG	2	6	669801	669806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13146	NC_021521	GAAA	2	8	670006	670013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13241	NC_021521	TA	3	6	674975	674980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13242	NC_021521	TATT	2	8	674999	675006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13245	NC_021521	C	7	7	675125	675131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13246	NC_021521	C	6	6	675135	675140	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13247	NC_021521	G	6	6	675150	675155	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13248	NC_021521	AACTTT	2	12	675193	675204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	514059401
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13254	NC_021521	GCG	2	6	675920	675925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059401
13255	NC_021521	CAA	2	6	676022	676027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059401
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13280	NC_021521	AC	3	6	677054	677059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13281	NC_021521	GT	3	6	677063	677068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13282	NC_021521	AATTA	2	10	677081	677090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13283	NC_021521	ACCC	2	8	677101	677108	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13284	NC_021521	TTAACC	2	12	677123	677134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13348	NC_021521	ATG	2	6	680360	680365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13370	NC_021521	A	7	7	681552	681558	100 %	0 %	0 %	0 %	514059408
13371	NC_021521	AAC	2	6	681607	681612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059408
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13494	NC_021521	AC	3	6	687677	687682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13495	NC_021521	GT	3	6	687686	687691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_021521	A	7	7	687724	687730	100 %	0 %	0 %	0 %	514059413
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