MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021521	AAT	2	6	563071	563076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059304
11002	NC_021521	GCA	2	6	563121	563126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059304
11003	NC_021521	ACC	2	6	563139	563144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059304
11004	NC_021521	TGT	2	6	563221	563226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059304
11005	NC_021521	AGGCT	2	10	563266	563275	20 %	20 %	40 %	20 %	514059304
11006	NC_021521	ACGCA	2	10	563300	563309	40 %	0 %	20 %	40 %	514059304
11007	NC_021521	GAT	2	6	563398	563403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059304
11008	NC_021521	TGC	2	6	563472	563477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059304
11009	NC_021521	CAA	2	6	563491	563496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059304
11010	NC_021521	TAT	2	6	563497	563502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059304
11011	NC_021521	T	7	7	563567	563573	0 %	100 %	0 %	0 %	514059304
11012	NC_021521	TAA	2	6	563597	563602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_021521	TAA	2	6	563634	563639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_021521	ATT	2	6	563673	563678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_021521	CAA	2	6	563760	563765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059305
11016	NC_021521	GCT	2	6	563766	563771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059305
11017	NC_021521	CCAA	2	8	563842	563849	50 %	0 %	0 %	50 %	514059305
11018	NC_021521	TTTTAC	2	12	563883	563894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	514059305
11019	NC_021521	AT	3	6	563967	563972	50 %	50 %	0 %	0 %	514059305
11020	NC_021521	GCT	2	6	563993	563998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059305
11021	NC_021521	CGT	2	6	564082	564087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059305
11022	NC_021521	GTTT	2	8	564145	564152	0 %	75 %	25 %	0 %	514059305
11023	NC_021521	TTG	2	6	564226	564231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059305
11024	NC_021521	TGA	2	6	564254	564259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059305
11025	NC_021521	GTT	2	6	564264	564269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059305
11026	NC_021521	GACTAA	2	12	564279	564290	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	514059305
11027	NC_021521	AGT	2	6	564314	564319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059305
11028	NC_021521	AGC	2	6	564343	564348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059305
11029	NC_021521	CAT	2	6	564358	564363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059305
11030	NC_021521	ATC	2	6	564427	564432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059305
11031	NC_021521	AAT	2	6	564433	564438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059305
11032	NC_021521	T	6	6	564478	564483	0 %	100 %	0 %	0 %	514059305
11033	NC_021521	CT	4	8	564543	564550	0 %	50 %	0 %	50 %	514059305
11034	NC_021521	GAA	2	6	564563	564568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059305
11035	NC_021521	ATAA	2	8	564593	564600	75 %	25 %	0 %	0 %	514059305
11036	NC_021521	A	6	6	564651	564656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_021521	AAC	2	6	564730	564735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059306
11038	NC_021521	CCA	2	6	564765	564770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059306
11039	NC_021521	CTT	2	6	564781	564786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059306
11040	NC_021521	CGC	2	6	564817	564822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059306
11041	NC_021521	AAGC	2	8	564904	564911	50 %	0 %	25 %	25 %	514059306
11042	NC_021521	GAC	2	6	564952	564957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059306
11043	NC_021521	CAA	2	6	565000	565005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059306
11044	NC_021521	GAA	2	6	565060	565065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059306
11045	NC_021521	T	6	6	565093	565098	0 %	100 %	0 %	0 %	514059306
11046	NC_021521	CAC	2	6	565099	565104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059306
11047	NC_021521	TGA	2	6	565176	565181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059306
11048	NC_021521	CAC	2	6	565232	565237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059306
11049	NC_021521	GCC	2	6	565245	565250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059306
11050	NC_021521	CTT	2	6	565270	565275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059306
11051	NC_021521	GAC	2	6	565282	565287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059306
11052	NC_021521	CAT	2	6	565342	565347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059306
11053	NC_021521	CTT	2	6	565351	565356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059306
11054	NC_021521	TCA	2	6	565491	565496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059306
11055	NC_021521	GCT	2	6	565701	565706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059306
11056	NC_021521	CTT	2	6	565747	565752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059306
11057	NC_021521	AAT	2	6	565767	565772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059306
11058	NC_021521	TGA	2	6	565776	565781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059306
11059	NC_021521	CAT	3	9	565885	565893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059306
11060	NC_021521	ACA	2	6	565995	566000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059306
11061	NC_021521	CGAAC	2	10	566033	566042	40 %	0 %	20 %	40 %	514059306
11062	NC_021521	ACATC	2	10	566056	566065	40 %	20 %	0 %	40 %	514059306
11063	NC_021521	ATT	2	6	566087	566092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059306
11064	NC_021521	CAT	3	9	566111	566119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059306
11065	NC_021521	TAA	2	6	566149	566154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059307
11066	NC_021521	TCA	2	6	566158	566163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059307
11067	NC_021521	CGTTTA	2	12	566166	566177	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	514059307
11068	NC_021521	ATTT	2	8	566197	566204	25 %	75 %	0 %	0 %	514059307
11069	NC_021521	GTT	2	6	566222	566227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059307
11070	NC_021521	CTT	2	6	566230	566235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059307
11071	NC_021521	AAC	2	6	566238	566243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059307
11072	NC_021521	AC	3	6	566242	566247	50 %	0 %	0 %	50 %	514059307
11073	NC_021521	AAT	2	6	566261	566266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059307
11074	NC_021521	CGG	2	6	566354	566359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059307
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11077	NC_021521	TGA	2	6	566421	566426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059307
11078	NC_021521	GTC	2	6	566466	566471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059307
11079	NC_021521	TCG	2	6	566479	566484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059307
11080	NC_021521	CTT	2	6	566497	566502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059307
11081	NC_021521	GCAGA	2	10	566539	566548	40 %	0 %	40 %	20 %	514059307
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11083	NC_021521	ATCG	2	8	566729	566736	25 %	25 %	25 %	25 %	514059307
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11088	NC_021521	TCG	2	6	567009	567014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059307
11089	NC_021521	CTT	2	6	567016	567021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059307
11090	NC_021521	TAA	2	6	567047	567052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059307
11091	NC_021521	TCT	2	6	567060	567065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059307
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11100	NC_021521	CAA	2	6	567631	567636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059307
11101	NC_021521	ATA	2	6	567731	567736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_021521	TGA	2	6	567746	567751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_021521	AG	3	6	567752	567757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_021521	TTC	2	6	567790	567795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059308
11105	NC_021521	T	6	6	567842	567847	0 %	100 %	0 %	0 %	514059308
11106	NC_021521	TAA	2	6	567880	567885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059308
11107	NC_021521	TTG	2	6	567940	567945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059308
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11109	NC_021521	TTG	2	6	568027	568032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059308
11110	NC_021521	CAAA	2	8	568043	568050	75 %	0 %	0 %	25 %	514059308
11111	NC_021521	CCT	2	6	568062	568067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514059308
11112	NC_021521	TTTC	2	8	568077	568084	0 %	75 %	0 %	25 %	514059308
11113	NC_021521	CTG	2	6	568092	568097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059308
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11115	NC_021521	CTG	2	6	568120	568125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	514059308
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11118	NC_021521	ATCA	2	8	568213	568220	50 %	25 %	0 %	25 %	514059308
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11120	NC_021521	ATA	2	6	568424	568429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059308
11121	NC_021521	T	6	6	568430	568435	0 %	100 %	0 %	0 %	514059308
11122	NC_021521	ATTA	2	8	568444	568451	50 %	50 %	0 %	0 %	514059308
11123	NC_021521	TAA	2	6	568492	568497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059308
11124	NC_021521	A	6	6	568496	568501	100 %	0 %	0 %	0 %	514059308
11125	NC_021521	T	6	6	568507	568512	0 %	100 %	0 %	0 %	514059308
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11133	NC_021521	AGC	2	6	568777	568782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059308
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11140	NC_021521	A	6	6	569110	569115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11145	NC_021521	A	6	6	569262	569267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11146	NC_021521	GGA	2	6	569360	569365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11152	NC_021521	TCG	2	6	569755	569760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11153	NC_021521	TGG	2	6	569775	569780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11162	NC_021521	GTT	2	6	570169	570174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11173	NC_021521	TGG	2	6	570525	570530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11225	NC_021521	ATA	2	6	572618	572623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059312
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11233	NC_021521	TGA	2	6	572961	572966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059312
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11238	NC_021521	ATG	2	6	573226	573231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059312
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11241	NC_021521	CA	3	6	573397	573402	50 %	0 %	0 %	50 %	514059312
11242	NC_021521	TTAAA	2	10	573452	573461	60 %	40 %	0 %	0 %	514059312
11243	NC_021521	AATG	2	8	573555	573562	50 %	25 %	25 %	0 %	514059312
11244	NC_021521	AG	3	6	573709	573714	50 %	0 %	50 %	0 %	514059312
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11246	NC_021521	TAT	2	6	573748	573753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11372	NC_021521	T	6	6	578754	578759	0 %	100 %	0 %	0 %	514059317
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11375	NC_021521	AT	3	6	578963	578968	50 %	50 %	0 %	0 %	514059317
11376	NC_021521	TAA	2	6	579214	579219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059317
11377	NC_021521	T	6	6	579233	579238	0 %	100 %	0 %	0 %	514059317
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11390	NC_021521	TTC	2	6	579884	579889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514059317
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11435	NC_021521	AT	3	6	581767	581772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11451	NC_021521	T	6	6	582657	582662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11452	NC_021521	CAA	2	6	582669	582674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11482	NC_021521	TTA	2	6	584292	584297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11483	NC_021521	TAT	2	6	584341	584346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059321
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11495	NC_021521	GAA	2	6	584943	584948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059322
11496	NC_021521	CAATG	2	10	584959	584968	40 %	20 %	20 %	20 %	514059322
11497	NC_021521	GTTC	2	8	584982	584989	0 %	50 %	25 %	25 %	514059322
11498	NC_021521	AATC	2	8	585026	585033	50 %	25 %	0 %	25 %	514059322
11499	NC_021521	GGAC	2	8	585104	585111	25 %	0 %	50 %	25 %	514059323
11500	NC_021521	AAAG	2	8	585114	585121	75 %	0 %	25 %	0 %	514059323

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