MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 45676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021521	GAT	3	9	514992	515000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059252
10002	NC_021521	ACA	2	6	515047	515052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059252
10003	NC_021521	GCAA	2	8	515069	515076	50 %	0 %	25 %	25 %	514059252
10004	NC_021521	TTAT	2	8	515160	515167	25 %	75 %	0 %	0 %	514059252
10005	NC_021521	AAC	2	6	515188	515193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059252
10006	NC_021521	AAT	2	6	515226	515231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059252
10007	NC_021521	AAC	2	6	515314	515319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_021521	TTGC	2	8	515340	515347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10009	NC_021521	CCG	2	6	515428	515433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_021521	T	6	6	515501	515506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_021521	T	6	6	515515	515520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021521	GTTC	2	8	515593	515600	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10013	NC_021521	T	6	6	515675	515680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_021521	GAT	2	6	515797	515802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059253
10015	NC_021521	A	8	8	515831	515838	100 %	0 %	0 %	0 %	514059253
10016	NC_021521	A	6	6	515914	515919	100 %	0 %	0 %	0 %	514059253
10017	NC_021521	CAAG	2	8	515933	515940	50 %	0 %	25 %	25 %	514059253
10018	NC_021521	GCTT	2	8	515961	515968	0 %	50 %	25 %	25 %	514059253
10019	NC_021521	GCA	2	6	516028	516033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514059253
10020	NC_021521	T	6	6	516043	516048	0 %	100 %	0 %	0 %	514059253
10021	NC_021521	TG	4	8	516052	516059	0 %	50 %	50 %	0 %	514059253
10022	NC_021521	GAA	2	6	516101	516106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059253
10023	NC_021521	GAA	2	6	516115	516120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059253
10024	NC_021521	GAA	2	6	516173	516178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059253
10025	NC_021521	TTG	2	6	516191	516196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059253
10026	NC_021521	GAT	2	6	516323	516328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059253
10027	NC_021521	TTG	2	6	516330	516335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059253
10028	NC_021521	A	6	6	516346	516351	100 %	0 %	0 %	0 %	514059253
10029	NC_021521	TGA	2	6	516514	516519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059253
10030	NC_021521	TAT	2	6	516535	516540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059253
10031	NC_021521	GCAA	2	8	516750	516757	50 %	0 %	25 %	25 %	514059253
10032	NC_021521	GTG	2	6	516815	516820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514059253
10033	NC_021521	GAA	2	6	516899	516904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059253
10034	NC_021521	AGCA	2	8	516909	516916	50 %	0 %	25 %	25 %	514059253
10035	NC_021521	ATT	2	6	516933	516938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059253
10036	NC_021521	ATG	2	6	516953	516958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059253
10037	NC_021521	ACA	2	6	517036	517041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059254
10038	NC_021521	TGTGG	2	10	517113	517122	0 %	40 %	60 %	0 %	514059254
10039	NC_021521	AT	3	6	517195	517200	50 %	50 %	0 %	0 %	514059254
10040	NC_021521	A	7	7	517214	517220	100 %	0 %	0 %	0 %	514059254
10041	NC_021521	GTT	2	6	517262	517267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059254
10042	NC_021521	TGAT	2	8	517344	517351	25 %	50 %	25 %	0 %	514059254
10043	NC_021521	GAA	2	6	517451	517456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059254
10044	NC_021521	TTG	2	6	517467	517472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059254
10045	NC_021521	ACT	2	6	517564	517569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059254
10046	NC_021521	AG	3	6	517570	517575	50 %	0 %	50 %	0 %	514059254
10047	NC_021521	AAAG	2	8	517577	517584	75 %	0 %	25 %	0 %	514059254
10048	NC_021521	ATC	2	6	517645	517650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059254
10049	NC_021521	ACA	2	6	517651	517656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059254
10050	NC_021521	GAA	2	6	517664	517669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059254
10051	NC_021521	GA	3	6	517684	517689	50 %	0 %	50 %	0 %	514059254
10052	NC_021521	AAAT	2	8	517728	517735	75 %	25 %	0 %	0 %	514059254
10053	NC_021521	AAT	2	6	517870	517875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059254
10054	NC_021521	AGA	2	6	517897	517902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059254
10055	NC_021521	TAA	2	6	517918	517923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059254
10056	NC_021521	AAT	2	6	517938	517943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514059254
10057	NC_021521	T	6	6	517969	517974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_021521	A	6	6	518018	518023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_021521	A	6	6	518105	518110	100 %	0 %	0 %	0 %	514059255
10060	NC_021521	ACCCA	2	10	518123	518132	40 %	0 %	0 %	60 %	514059255
10061	NC_021521	ACC	2	6	518134	518139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059255
10062	NC_021521	ATTG	2	8	518151	518158	25 %	50 %	25 %	0 %	514059255
10063	NC_021521	CAC	2	6	518196	518201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059255
10064	NC_021521	A	6	6	518242	518247	100 %	0 %	0 %	0 %	514059255
10065	NC_021521	AAC	2	6	518333	518338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514059256
10066	NC_021521	ACT	2	6	518376	518381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059256
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10068	NC_021521	TCA	2	6	518429	518434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059256
10069	NC_021521	ACCAA	2	10	518502	518511	60 %	0 %	0 %	40 %	514059256
10070	NC_021521	AAG	2	6	518555	518560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059256
10071	NC_021521	CTGA	2	8	518617	518624	25 %	25 %	25 %	25 %	514059256
10072	NC_021521	GAA	2	6	518662	518667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059256
10073	NC_021521	AGAC	2	8	518678	518685	50 %	0 %	25 %	25 %	514059256
10074	NC_021521	TTG	2	6	518713	518718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059257
10075	NC_021521	GCAAA	2	10	518791	518800	60 %	0 %	20 %	20 %	514059257
10076	NC_021521	GAT	2	6	518883	518888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059257
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10078	NC_021521	AT	3	6	519169	519174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_021521	CGA	2	6	519175	519180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_021521	TGG	2	6	519235	519240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_021521	AAAAC	2	10	519244	519253	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10082	NC_021521	AATC	2	8	519348	519355	50 %	25 %	0 %	25 %	514059258
10083	NC_021521	T	7	7	519483	519489	0 %	100 %	0 %	0 %	514059258
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10085	NC_021521	TCTA	2	8	519528	519535	25 %	50 %	0 %	25 %	514059258
10086	NC_021521	AGCA	2	8	519755	519762	50 %	0 %	25 %	25 %	514059258
10087	NC_021521	AGG	2	6	519852	519857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	514059258
10088	NC_021521	A	6	6	519972	519977	100 %	0 %	0 %	0 %	514059259
10089	NC_021521	CGC	2	6	520009	520014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	514059259
10090	NC_021521	GAT	2	6	520052	520057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059259
10091	NC_021521	TTA	2	6	520110	520115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514059260
10092	NC_021521	CACG	2	8	520134	520141	25 %	0 %	25 %	50 %	514059260
10093	NC_021521	TGAT	2	8	520294	520301	25 %	50 %	25 %	0 %	514059260
10094	NC_021521	A	6	6	520342	520347	100 %	0 %	0 %	0 %	514059261
10095	NC_021521	CCA	2	6	520433	520438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059261
10096	NC_021521	TGA	2	6	520468	520473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059261
10097	NC_021521	TCA	2	6	520537	520542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059261
10098	NC_021521	ATC	2	6	520571	520576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059261
10099	NC_021521	TCAT	2	8	520668	520675	25 %	50 %	0 %	25 %	514059261
10100	NC_021521	AT	3	6	520717	520722	50 %	50 %	0 %	0 %	514059261
10101	NC_021521	GAT	2	6	520781	520786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059261
10102	NC_021521	GTA	2	6	520937	520942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059261
10103	NC_021521	GGGA	2	8	521049	521056	25 %	0 %	75 %	0 %	514059261
10104	NC_021521	ACT	2	6	521090	521095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059261
10105	NC_021521	ACCT	2	8	521099	521106	25 %	25 %	0 %	50 %	514059261
10106	NC_021521	GATAC	2	10	521274	521283	40 %	20 %	20 %	20 %	514059261
10107	NC_021521	AG	3	6	521296	521301	50 %	0 %	50 %	0 %	514059261
10108	NC_021521	ATG	2	6	521345	521350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059261
10109	NC_021521	CAT	2	6	521389	521394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059261
10110	NC_021521	ACC	3	9	521447	521455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514059261
10111	NC_021521	TAG	2	6	521467	521472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059261
10112	NC_021521	TAAT	2	8	521529	521536	50 %	50 %	0 %	0 %	514059261
10113	NC_021521	TGA	2	6	521572	521577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514059261
10114	NC_021521	TTTA	2	8	521626	521633	25 %	75 %	0 %	0 %	514059261
10115	NC_021521	CGG	2	6	521665	521670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514059261
10116	NC_021521	AG	3	6	521675	521680	50 %	0 %	50 %	0 %	514059261
10117	NC_021521	TTG	2	6	521783	521788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514059261
10118	NC_021521	TCAT	2	8	521818	521825	25 %	50 %	0 %	25 %	514059261
10119	NC_021521	AGCA	2	8	521867	521874	50 %	0 %	25 %	25 %	514059261
10120	NC_021521	TAC	2	6	522105	522110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059261
10121	NC_021521	AATG	2	8	522119	522126	50 %	25 %	25 %	0 %	514059261
10122	NC_021521	AT	3	6	522132	522137	50 %	50 %	0 %	0 %	514059261
10123	NC_021521	AAG	2	6	522153	522158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514059261
10124	NC_021521	GGCT	2	8	522185	522192	0 %	25 %	50 %	25 %	514059261
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10132	NC_021521	T	8	8	522619	522626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_021521	T	6	6	522638	522643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10140	NC_021521	ACT	2	6	522847	522852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10142	NC_021521	ACT	2	6	522919	522924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10145	NC_021521	T	7	7	522948	522954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_021521	GGTGG	2	10	522972	522981	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
10147	NC_021521	ATA	2	6	522999	523004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10386	NC_021521	TG	3	6	532074	532079	0 %	50 %	50 %	0 %	514059268
10387	NC_021521	TA	4	8	532090	532097	50 %	50 %	0 %	0 %	514059268
10388	NC_021521	ACT	2	6	532119	532124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059268
10389	NC_021521	TA	3	6	532132	532137	50 %	50 %	0 %	0 %	514059268
10390	NC_021521	TGG	2	6	532220	532225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10393	NC_021521	ACTC	2	8	532488	532495	25 %	25 %	0 %	50 %	514059269
10394	NC_021521	CAT	2	6	532506	532511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514059269
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10494	NC_021521	TCA	2	6	537355	537360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10499	NC_021521	TCC	2	6	537694	537699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514059277
10500	NC_021521	TTTAGG	2	12	537702	537713	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	514059277

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