MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori UM066

Total Repeats: 34669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021218	GTT	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021218	CTT	2	6	166	171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021218	CTT	2	6	199	204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021218	AAT	2	6	206	211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021218	TCT	2	6	273	278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021218	ATTC	2	8	280	287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021218	T	6	6	370	375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021218	CAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021218	TCA	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021218	AAT	2	6	564	569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021218	CTCTTT	2	12	755	766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021218	GTTC	2	8	769	776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021218	TTCT	2	8	782	789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021218	TCA	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021218	CT	3	6	834	839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021218	TG	3	6	960	965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021218	AAT	2	6	988	993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021218	T	6	6	1005	1010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021218	CATAG	2	10	1013	1022	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021218	TCAA	2	8	1059	1066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021218	T	6	6	1127	1132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021218	TCA	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021218	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021218	CTT	2	6	1233	1238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021218	CAC	3	9	1241	1249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021218	ATC	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021218	CAC	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021218	ATC	2	6	1460	1465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021218	CTTT	2	8	1482	1489	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021218	TAA	2	6	1606	1611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021218	TTG	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021218	T	6	6	1660	1665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021218	CT	3	6	1819	1824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021218	T	6	6	1832	1837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021218	T	7	7	1884	1890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021218	CTT	3	9	1906	1914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021218	AAT	2	6	1947	1952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021218	TTG	2	6	1989	1994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021218	TTGA	2	8	2003	2010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021218	CT	3	6	2018	2023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021218	GTG	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021218	CAA	2	6	2050	2055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021218	AC	3	6	2222	2227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021218	TGG	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021218	TGG	2	6	2286	2291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021218	CAT	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021218	TTG	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021218	TTC	2	6	2380	2385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021218	CTT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021218	TTC	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021218	TTGCT	2	10	2454	2463	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021218	TCA	2	6	2466	2471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021218	T	6	6	2486	2491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021218	TTG	2	6	2535	2540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021218	TTTA	2	8	2549	2556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021218	TCT	2	6	2682	2687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021218	CTA	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021218	TGAT	2	8	2892	2899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021218	CTT	2	6	2902	2907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021218	CTT	2	6	2911	2916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021218	TTTTC	2	10	2921	2930	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021218	AAT	2	6	2944	2949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021218	TGAT	2	8	3087	3094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021218	ATA	2	6	3126	3131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021218	T	6	6	3137	3142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021218	A	6	6	3161	3166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021218	T	6	6	3176	3181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021218	AGCTTG	2	12	3182	3193	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021218	TCA	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021218	ATT	2	6	3524	3529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021218	C	6	6	3571	3576	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_021218	T	6	6	3802	3807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021218	GTG	2	6	3839	3844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021218	ATTC	2	8	3853	3860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021218	ATT	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021218	TGA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021218	T	6	6	3964	3969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021218	GTT	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021218	TCA	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021218	ATA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021218	TCA	2	6	4161	4166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021218	T	6	6	4172	4177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021218	A	6	6	4178	4183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021218	A	6	6	4251	4256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021218	TC	3	6	4278	4283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021218	CCAT	2	8	4299	4306	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021218	CAC	2	6	4319	4324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021218	CAT	2	6	4339	4344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021218	AGG	2	6	4442	4447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021218	TGG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021218	GTA	2	6	4721	4726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021218	TTC	2	6	4796	4801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021218	ACCC	2	8	4834	4841	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_021218	CTT	2	6	4873	4878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021218	TAA	2	6	4887	4892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021218	ATTA	2	8	4979	4986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021218	CTT	2	6	4990	4995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021218	TGGT	2	8	5032	5039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021218	TG	3	6	5082	5087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021218	TCTTGC	2	12	5088	5099	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021218	CT	3	6	5151	5156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021218	T	6	6	5261	5266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021218	T	6	6	5294	5299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021218	GTT	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021218	GTT	2	6	5450	5455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021218	CT	4	8	5506	5513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021218	TTC	2	6	5525	5530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021218	ATG	2	6	5567	5572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021218	TGAT	2	8	5600	5607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021218	CT	3	6	5649	5654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021218	AAT	2	6	5769	5774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021218	AG	4	8	5834	5841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021218	TGA	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021218	CT	3	6	5905	5910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021218	CTT	2	6	5940	5945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021218	TC	5	10	6042	6051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021218	CTC	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_021218	TCC	2	6	6107	6112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_021218	CT	3	6	6116	6121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021218	AATA	2	8	6128	6135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021218	TTC	2	6	6158	6163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021218	TCC	2	6	6194	6199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_021218	TTCT	2	8	6271	6278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021218	TTG	2	6	6302	6307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021218	ATT	3	9	6341	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021218	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021218	AAT	2	6	6362	6367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021218	GTTATT	2	12	6413	6424	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021218	TGC	2	6	6438	6443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021218	TTCA	2	8	6476	6483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021218	TTG	2	6	6528	6533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021218	CAATT	2	10	6617	6626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021218	TTC	2	6	6641	6646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021218	AAT	2	6	6673	6678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021218	TTC	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021218	TAAAA	2	10	6722	6731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021218	ATT	2	6	6734	6739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021218	TTA	2	6	6759	6764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021218	ATC	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021218	AAT	3	9	6865	6873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021218	CTT	2	6	6916	6921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021218	T	6	6	6941	6946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021218	CTT	2	6	6949	6954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021218	TTGT	2	8	6987	6994	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021218	ATT	2	6	7053	7058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021218	TTCT	2	8	7084	7091	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021218	CTT	2	6	7093	7098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021218	TGG	2	6	7176	7181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021218	TTC	2	6	7214	7219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021218	A	7	7	7258	7264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021218	ATCA	2	8	7283	7290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_021218	CTTT	2	8	7353	7360	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_021218	TCT	2	6	7389	7394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_021218	TAT	2	6	7399	7404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021218	TA	3	6	7408	7413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021218	TTC	2	6	7538	7543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_021218	TTGT	2	8	7551	7558	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021218	CTTT	2	8	7612	7619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_021218	T	7	7	7617	7623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_021218	GAAA	2	8	8907	8914	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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