MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19003	NC_021172	GTC	2	6	909567	909572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575958
19004	NC_021172	GCG	2	6	909615	909620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575958
19005	NC_021172	CGGA	2	8	909631	909638	25 %	0 %	50 %	25 %	488575958
19006	NC_021172	CGGT	2	8	909655	909662	0 %	25 %	50 %	25 %	488575958
19007	NC_021172	GC	3	6	909664	909669	0 %	0 %	50 %	50 %	488575958
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19009	NC_021172	GACC	2	8	909708	909715	25 %	0 %	25 %	50 %	488575958
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19012	NC_021172	GC	3	6	909770	909775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19017	NC_021172	CCG	2	6	910098	910103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575959
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19122	NC_021172	CGA	2	6	914860	914865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575964
19123	NC_021172	TCA	2	6	914877	914882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575964
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19125	NC_021172	GCT	2	6	914994	914999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575965
19126	NC_021172	GCC	2	6	915024	915029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575965
19127	NC_021172	TGC	2	6	915067	915072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575965
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19130	NC_021172	GCT	2	6	915249	915254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575965
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19132	NC_021172	GGC	2	6	915478	915483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575966
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19136	NC_021172	TGCA	2	8	915625	915632	25 %	25 %	25 %	25 %	488575966
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19145	NC_021172	ATG	2	6	915905	915910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575967
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19151	NC_021172	GCG	2	6	916024	916029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575968
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19157	NC_021172	CGG	2	6	916188	916193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575968
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19161	NC_021172	GC	5	10	916586	916595	0 %	0 %	50 %	50 %	488575968
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19194	NC_021172	GCGG	2	8	917989	917996	0 %	0 %	75 %	25 %	488575968
19195	NC_021172	CG	4	8	918003	918010	0 %	0 %	50 %	50 %	488575968
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19202	NC_021172	CCT	2	6	918350	918355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575969
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19224	NC_021172	T	6	6	919384	919389	0 %	100 %	0 %	0 %	488575970
19225	NC_021172	CGC	2	6	919444	919449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575970
19226	NC_021172	CG	3	6	919484	919489	0 %	0 %	50 %	50 %	488575970
19227	NC_021172	ATG	2	6	919490	919495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575970
19228	NC_021172	ATG	2	6	919511	919516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19229	NC_021172	TCA	2	6	919545	919550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19230	NC_021172	TCGTGC	2	12	919551	919562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19231	NC_021172	GCT	2	6	919565	919570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19232	NC_021172	GCG	2	6	919571	919576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19233	NC_021172	TCT	2	6	919590	919595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19234	NC_021172	CAC	2	6	919606	919611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19235	NC_021172	CGC	2	6	919626	919631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19236	NC_021172	AGC	2	6	919663	919668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575971
19237	NC_021172	GTC	2	6	919684	919689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575971
19238	NC_021172	CAT	2	6	919716	919721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575971
19239	NC_021172	AGG	2	6	919768	919773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575971
19240	NC_021172	GAT	2	6	919851	919856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575971
19241	NC_021172	GC	3	6	920003	920008	0 %	0 %	50 %	50 %	488575971
19242	NC_021172	GAT	2	6	920010	920015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575971
19243	NC_021172	TG	3	6	920044	920049	0 %	50 %	50 %	0 %	488575971
19244	NC_021172	GGC	2	6	920081	920086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575971
19245	NC_021172	ACCG	2	8	920103	920110	25 %	0 %	25 %	50 %	488575971
19246	NC_021172	GAC	2	6	920117	920122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575971
19247	NC_021172	ACC	2	6	920138	920143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575971
19248	NC_021172	CGA	2	6	920147	920152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575971
19249	NC_021172	ATG	2	6	920191	920196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575971
19250	NC_021172	TGC	2	6	920300	920305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575971
19251	NC_021172	ATG	2	6	920370	920375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575972
19252	NC_021172	TCT	2	6	920401	920406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575972
19253	NC_021172	GTG	2	6	920456	920461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575972
19254	NC_021172	CTG	2	6	920489	920494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575972
19255	NC_021172	GAGC	2	8	920584	920591	25 %	0 %	50 %	25 %	488575972
19256	NC_021172	CCT	2	6	920602	920607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575972
19257	NC_021172	GGC	2	6	920619	920624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575972
19258	NC_021172	CGC	2	6	920629	920634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575972
19259	NC_021172	GCGCGA	2	12	920822	920833	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488575973
19260	NC_021172	GCG	3	9	920856	920864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575973
19261	NC_021172	CCT	2	6	920894	920899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575973
19262	NC_021172	CG	4	8	920920	920927	0 %	0 %	50 %	50 %	488575973
19263	NC_021172	TCCGC	2	10	920987	920996	0 %	20 %	20 %	60 %	488575973
19264	NC_021172	GGC	2	6	921040	921045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575973
19265	NC_021172	GCC	2	6	921061	921066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575973
19266	NC_021172	ATG	2	6	921079	921084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575973
19267	NC_021172	TGC	2	6	921115	921120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19268	NC_021172	GCC	2	6	921126	921131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575974
19269	NC_021172	GCA	3	9	921138	921146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19270	NC_021172	ACG	2	6	921158	921163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19271	NC_021172	GCC	2	6	921224	921229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575974
19272	NC_021172	TTG	2	6	921281	921286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575974
19273	NC_021172	ATCGC	2	10	921308	921317	20 %	20 %	20 %	40 %	488575974
19274	NC_021172	CGC	2	6	921333	921338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575974
19275	NC_021172	CCG	2	6	921354	921359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575974
19276	NC_021172	CCG	2	6	921489	921494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575974
19277	NC_021172	GCG	2	6	921545	921550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575974
19278	NC_021172	CAG	2	6	921583	921588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19279	NC_021172	CTGCGG	2	12	921624	921635	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	488575974
19280	NC_021172	GAG	2	6	921673	921678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575974
19281	NC_021172	GGC	2	6	921813	921818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575974
19282	NC_021172	GC	4	8	921908	921915	0 %	0 %	50 %	50 %	488575974
19283	NC_021172	CGG	2	6	921945	921950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575974
19284	NC_021172	CCG	2	6	922002	922007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575974
19285	NC_021172	GGC	3	9	922108	922116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575974
19286	NC_021172	AGC	2	6	922226	922231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19287	NC_021172	CCA	2	6	922248	922253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575974
19288	NC_021172	GGC	2	6	922316	922321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575974
19289	NC_021172	TTC	2	6	922322	922327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575974
19290	NC_021172	GAT	2	6	922351	922356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575974
19291	NC_021172	ACA	2	6	922362	922367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575974
19292	NC_021172	GC	3	6	922374	922379	0 %	0 %	50 %	50 %	488575974
19293	NC_021172	CGT	2	6	922387	922392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19294	NC_021172	CCG	2	6	922427	922432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575974
19295	NC_021172	TTC	2	6	922451	922456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575974
19296	NC_021172	CAGG	2	8	922461	922468	25 %	0 %	50 %	25 %	488575974
19297	NC_021172	CAG	2	6	922480	922485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19298	NC_021172	GACAAC	2	12	922552	922563	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	488575974
19299	NC_021172	CAACCG	2	12	922569	922580	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	488575974
19300	NC_021172	CGC	2	6	922660	922665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575974
19301	NC_021172	CAC	2	6	922723	922728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575974
19302	NC_021172	GCA	2	6	922730	922735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19303	NC_021172	CGTGC	2	10	922753	922762	0 %	20 %	40 %	40 %	488575974
19304	NC_021172	CGAG	2	8	922812	922819	25 %	0 %	50 %	25 %	488575974
19305	NC_021172	GGC	2	6	922864	922869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575974
19306	NC_021172	GC	4	8	922879	922886	0 %	0 %	50 %	50 %	488575974
19307	NC_021172	ATG	2	6	922889	922894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575974
19308	NC_021172	AAGC	2	8	922914	922921	50 %	0 %	25 %	25 %	488575974
19309	NC_021172	AGC	2	6	922961	922966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19310	NC_021172	AGC	2	6	922984	922989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19311	NC_021172	GCG	2	6	923017	923022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575974
19312	NC_021172	TGA	2	6	923034	923039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575974
19313	NC_021172	CGG	2	6	923100	923105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575974
19314	NC_021172	GCC	2	6	923117	923122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575974
19315	NC_021172	GACG	2	8	923146	923153	25 %	0 %	50 %	25 %	488575974
19316	NC_021172	TCGC	2	8	923159	923166	0 %	25 %	25 %	50 %	488575974
19317	NC_021172	CG	3	6	923274	923279	0 %	0 %	50 %	50 %	488575974
19318	NC_021172	CGT	2	6	923283	923288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19319	NC_021172	GC	4	8	923294	923301	0 %	0 %	50 %	50 %	488575974
19320	NC_021172	ACC	2	6	923465	923470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575974
19321	NC_021172	CAG	3	9	923481	923489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575974
19322	NC_021172	GC	3	6	923499	923504	0 %	0 %	50 %	50 %	488575974
19323	NC_021172	CGG	2	6	923554	923559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575975
19324	NC_021172	TCC	2	6	923580	923585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575975
19325	NC_021172	CAC	2	6	923603	923608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575975
19326	NC_021172	GCC	2	6	923615	923620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575975
19327	NC_021172	GA	3	6	923661	923666	50 %	0 %	50 %	0 %	488575975
19328	NC_021172	GAA	2	6	923850	923855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19329	NC_021172	ATG	2	6	923928	923933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575976
19330	NC_021172	AGC	2	6	924019	924024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575976
19331	NC_021172	GCCGAA	2	12	924026	924037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575976
19332	NC_021172	TTCA	2	8	924087	924094	25 %	50 %	0 %	25 %	488575976
19333	NC_021172	CG	3	6	924189	924194	0 %	0 %	50 %	50 %	488575976
19334	NC_021172	AGG	2	6	924208	924213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575976
19335	NC_021172	CGC	2	6	924237	924242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575976
19336	NC_021172	CGA	2	6	924323	924328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575976
19337	NC_021172	CAC	2	6	924349	924354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575976
19338	NC_021172	CCGAG	2	10	924355	924364	20 %	0 %	40 %	40 %	488575976
19339	NC_021172	GC	4	8	924498	924505	0 %	0 %	50 %	50 %	488575977
19340	NC_021172	CGAA	2	8	924603	924610	50 %	0 %	25 %	25 %	488575977
19341	NC_021172	CGT	2	6	924649	924654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575977
19342	NC_021172	CTGG	2	8	924705	924712	0 %	25 %	50 %	25 %	488575978
19343	NC_021172	CGC	2	6	924731	924736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575978
19344	NC_021172	CGT	2	6	924807	924812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575978
19345	NC_021172	CGG	2	6	924825	924830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575978
19346	NC_021172	CG	3	6	924836	924841	0 %	0 %	50 %	50 %	488575978
19347	NC_021172	CAT	2	6	924957	924962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575978
19348	NC_021172	CCT	2	6	925008	925013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575978
19349	NC_021172	TTC	2	6	925054	925059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575978
19350	NC_021172	CGC	2	6	925073	925078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575978
19351	NC_021172	CGG	2	6	925103	925108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575978
19352	NC_021172	GCC	2	6	925183	925188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575978
19353	NC_021172	GCT	3	9	925221	925229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575978
19354	NC_021172	CG	4	8	925242	925249	0 %	0 %	50 %	50 %	488575978
19355	NC_021172	GC	3	6	925250	925255	0 %	0 %	50 %	50 %	488575978
19356	NC_021172	CTC	2	6	925261	925266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575978
19357	NC_021172	GCC	2	6	925273	925278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575978
19358	NC_021172	CG	3	6	925301	925306	0 %	0 %	50 %	50 %	488575978
19359	NC_021172	ATG	2	6	925309	925314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575978
19360	NC_021172	CGG	2	6	925322	925327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575978
19361	NC_021172	GCG	2	6	925340	925345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575978
19362	NC_021172	TGC	2	6	925346	925351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575978
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19364	NC_021172	GCC	2	6	925407	925412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575978
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19480	NC_021172	CGG	2	6	930469	930474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575982
19481	NC_021172	GCC	2	6	930549	930554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575982
19482	NC_021172	ATC	2	6	930571	930576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575982
19483	NC_021172	GTG	2	6	930606	930611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575982
19484	NC_021172	CGGCG	2	10	930715	930724	0 %	0 %	60 %	40 %	488575982
19485	NC_021172	GAG	2	6	930813	930818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575982
19486	NC_021172	ATC	2	6	930819	930824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575982
19487	NC_021172	GCCT	2	8	930853	930860	0 %	25 %	25 %	50 %	488575982
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19491	NC_021172	GCG	2	6	931086	931091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575983
19492	NC_021172	CGG	2	6	931207	931212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575983
19493	NC_021172	GCC	2	6	931386	931391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575983
19494	NC_021172	CCG	2	6	931426	931431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575983
19495	NC_021172	TCT	2	6	931470	931475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575983
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19499	NC_021172	CTG	2	6	931784	931789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575983
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