MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_021172	TAA	2	6	839300	839305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575872
17503	NC_021172	CGG	2	6	839309	839314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575872
17504	NC_021172	CG	3	6	839352	839357	0 %	0 %	50 %	50 %	488575872
17505	NC_021172	CAA	2	6	839477	839482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575872
17506	NC_021172	ACG	2	6	839695	839700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575872
17507	NC_021172	CTA	2	6	839729	839734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575872
17508	NC_021172	GACC	2	8	839759	839766	25 %	0 %	25 %	50 %	488575872
17509	NC_021172	GGC	2	6	839789	839794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575872
17510	NC_021172	GAT	2	6	839832	839837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575872
17511	NC_021172	AGC	2	6	839872	839877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575872
17512	NC_021172	ATGC	2	8	839893	839900	25 %	25 %	25 %	25 %	488575872
17513	NC_021172	TGA	2	6	839924	839929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575872
17514	NC_021172	CAG	2	6	839934	839939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575872
17515	NC_021172	AAGGC	2	10	839950	839959	40 %	0 %	40 %	20 %	488575872
17516	NC_021172	CTT	2	6	839984	839989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575872
17517	NC_021172	TCC	2	6	839998	840003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575872
17518	NC_021172	CTT	2	6	840047	840052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575872
17519	NC_021172	GAA	2	6	840137	840142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575872
17520	NC_021172	CGT	2	6	840146	840151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575872
17521	NC_021172	GAT	2	6	840314	840319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575872
17522	NC_021172	CGC	2	6	840344	840349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575872
17523	NC_021172	GAC	2	6	840450	840455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575872
17524	NC_021172	ATC	2	6	840571	840576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575873
17525	NC_021172	TCAAC	2	10	840583	840592	40 %	20 %	0 %	40 %	488575873
17526	NC_021172	TTC	2	6	840605	840610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575873
17527	NC_021172	GCG	2	6	840769	840774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575873
17528	NC_021172	ATC	2	6	840878	840883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17529	NC_021172	GCT	2	6	840905	840910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17530	NC_021172	AGA	2	6	840913	840918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17531	NC_021172	TTTG	2	8	840990	840997	0 %	75 %	25 %	0 %	488575874
17532	NC_021172	ACC	2	6	841108	841113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575874
17533	NC_021172	TCTGC	2	10	841140	841149	0 %	40 %	20 %	40 %	488575874
17534	NC_021172	GCGCTT	2	12	841198	841209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575874
17535	NC_021172	TCC	2	6	841211	841216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575874
17536	NC_021172	TCG	2	6	841221	841226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575874
17537	NC_021172	ATC	2	6	841261	841266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575874
17538	NC_021172	AAGTAA	2	12	841303	841314	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	488575874
17539	NC_021172	AGG	2	6	841316	841321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575874
17540	NC_021172	GCA	2	6	841415	841420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575874
17541	NC_021172	CGA	2	6	841506	841511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575874
17542	NC_021172	GGC	2	6	841534	841539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575874
17543	NC_021172	ACGCGA	2	12	841667	841678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575874
17544	NC_021172	TCT	2	6	841730	841735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575874
17545	NC_021172	CGC	2	6	841741	841746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575874
17546	NC_021172	CTCGC	2	10	841765	841774	0 %	20 %	20 %	60 %	488575874
17547	NC_021172	TTG	2	6	841799	841804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575874
17548	NC_021172	GCG	2	6	841871	841876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575874
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17550	NC_021172	GCCA	2	8	842011	842018	25 %	0 %	25 %	50 %	488575874
17551	NC_021172	GCA	2	6	842031	842036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575874
17552	NC_021172	CTT	2	6	842094	842099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575874
17553	NC_021172	ATC	2	6	842168	842173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575874
17554	NC_021172	CCT	2	6	842199	842204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575874
17555	NC_021172	CGC	2	6	842245	842250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575874
17556	NC_021172	GGA	2	6	842319	842324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575874
17557	NC_021172	GTC	2	6	842396	842401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575874
17558	NC_021172	GCG	2	6	842413	842418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575874
17559	NC_021172	AAG	2	6	842419	842424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575874
17560	NC_021172	GAG	2	6	842505	842510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575874
17561	NC_021172	TAG	2	6	842521	842526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575874
17562	NC_021172	CG	3	6	842547	842552	0 %	0 %	50 %	50 %	488575874
17563	NC_021172	CCG	2	6	842558	842563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575874
17564	NC_021172	ATA	2	6	842581	842586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575874
17565	NC_021172	CGTG	2	8	842664	842671	0 %	25 %	50 %	25 %	488575874
17566	NC_021172	CGG	2	6	842672	842677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575874
17567	NC_021172	TCG	2	6	842681	842686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575874
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17569	NC_021172	TCAA	2	8	842723	842730	50 %	25 %	0 %	25 %	488575874
17570	NC_021172	CCGC	2	8	842810	842817	0 %	0 %	25 %	75 %	488575874
17571	NC_021172	TGC	2	6	842926	842931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575874
17572	NC_021172	CGT	2	6	842985	842990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575874
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17574	NC_021172	TTG	2	6	843038	843043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575874
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17577	NC_021172	CG	3	6	843126	843131	0 %	0 %	50 %	50 %	488575874
17578	NC_021172	GAG	2	6	843157	843162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575874
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17587	NC_021172	GAG	2	6	843811	843816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17588	NC_021172	GTG	2	6	843830	843835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17589	NC_021172	AGCG	2	8	843842	843849	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17590	NC_021172	GATG	2	8	843867	843874	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17591	NC_021172	CGA	2	6	843887	843892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17593	NC_021172	TCG	2	6	844017	844022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575875
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17602	NC_021172	GAG	2	6	844502	844507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575875
17603	NC_021172	ATG	2	6	844508	844513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575875
17604	NC_021172	GC	3	6	844517	844522	0 %	0 %	50 %	50 %	488575875
17605	NC_021172	CGCGAG	2	12	844535	844546	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488575875
17606	NC_021172	AAG	3	9	844667	844675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575875
17607	NC_021172	CGA	2	6	844711	844716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575875
17608	NC_021172	CAG	2	6	844748	844753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575875
17609	NC_021172	ATC	2	6	844787	844792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575875
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17612	NC_021172	CTT	2	6	844843	844848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575875
17613	NC_021172	GAGC	2	8	845023	845030	25 %	0 %	50 %	25 %	488575875
17614	NC_021172	GTC	2	6	845054	845059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575875
17615	NC_021172	TCG	2	6	845151	845156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575875
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17741	NC_021172	TGA	2	6	850123	850128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575883
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17743	NC_021172	GGC	2	6	850181	850186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575883
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17745	NC_021172	CCG	2	6	850267	850272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575883
17746	NC_021172	TCG	2	6	850296	850301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575883
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17748	NC_021172	GCC	2	6	850449	850454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575883
17749	NC_021172	GACG	2	8	850502	850509	25 %	0 %	50 %	25 %	488575883
17750	NC_021172	GCC	3	9	850515	850523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575883
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17753	NC_021172	CGA	2	6	850678	850683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575883
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17763	NC_021172	TGCG	2	8	851018	851025	0 %	25 %	50 %	25 %	488575884
17764	NC_021172	GGCA	2	8	851044	851051	25 %	0 %	50 %	25 %	488575884
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17770	NC_021172	GCT	2	6	851266	851271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575885
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17772	NC_021172	CG	3	6	851348	851353	0 %	0 %	50 %	50 %	488575885
17773	NC_021172	GAC	2	6	851363	851368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575885
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17803	NC_021172	TCG	2	6	852164	852169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575885
17804	NC_021172	CCG	2	6	852203	852208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575885
17805	NC_021172	AGC	2	6	852224	852229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575885
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17812	NC_021172	CGA	2	6	852517	852522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575886
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17828	NC_021172	CTTG	2	8	853177	853184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17829	NC_021172	GGC	2	6	853226	853231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17830	NC_021172	ACG	2	6	853233	853238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17837	NC_021172	CCG	2	6	853389	853394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17838	NC_021172	TCG	2	6	853473	853478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575888
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17842	NC_021172	GAC	2	6	853797	853802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575889
17843	NC_021172	ATGT	2	8	853847	853854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17844	NC_021172	GTT	2	6	853907	853912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17845	NC_021172	AGG	2	6	853980	853985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17846	NC_021172	CAT	2	6	854065	854070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575890
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17848	NC_021172	CGA	2	6	854104	854109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575890
17849	NC_021172	GCT	2	6	854140	854145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575890
17850	NC_021172	GTG	2	6	854153	854158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575890
17851	NC_021172	AGC	2	6	854241	854246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575890
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17853	NC_021172	CGA	2	6	854379	854384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575891
17854	NC_021172	GCAA	2	8	854394	854401	50 %	0 %	25 %	25 %	488575891
17855	NC_021172	GC	3	6	854445	854450	0 %	0 %	50 %	50 %	488575891
17856	NC_021172	CA	3	6	854504	854509	50 %	0 %	0 %	50 %	488575891
17857	NC_021172	AGC	2	6	854545	854550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575891
17858	NC_021172	CGT	2	6	854608	854613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575891
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17860	NC_021172	ACGA	2	8	854703	854710	50 %	0 %	25 %	25 %	488575891
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17981	NC_021172	CTC	2	6	859865	859870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17982	NC_021172	GTG	2	6	859898	859903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17983	NC_021172	TCGC	2	8	859943	859950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17984	NC_021172	AAG	2	6	859964	859969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17985	NC_021172	ATTA	2	8	860013	860020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17986	NC_021172	CGG	2	6	860129	860134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17987	NC_021172	GAC	2	6	860155	860160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17988	NC_021172	CTG	2	6	860194	860199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17989	NC_021172	GCG	2	6	860372	860377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575901
17990	NC_021172	TGA	2	6	860425	860430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575901
17991	NC_021172	CAT	2	6	860433	860438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575901
17992	NC_021172	CGG	2	6	860452	860457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575901
17993	NC_021172	CG	3	6	860461	860466	0 %	0 %	50 %	50 %	488575901
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17998	NC_021172	CTT	2	6	860743	860748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575901
17999	NC_021172	GC	3	6	860802	860807	0 %	0 %	50 %	50 %	488575901
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