MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16746	NC_021172	CTT	2	6	801142	801147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16747	NC_021172	TAA	2	6	801221	801226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16748	NC_021172	TAA	2	6	801228	801233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16749	NC_021172	ATC	2	6	801327	801332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16750	NC_021172	CA	3	6	801368	801373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16751	NC_021172	CAA	2	6	801409	801414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16752	NC_021172	TTTG	2	8	801470	801477	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16753	NC_021172	TCA	2	6	801514	801519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16755	NC_021172	GCA	2	6	801673	801678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16757	NC_021172	TG	3	6	801772	801777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16758	NC_021172	ATC	2	6	801878	801883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575831
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16762	NC_021172	TCA	2	6	802154	802159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16767	NC_021172	TTC	2	6	802631	802636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16770	NC_021172	TTGC	2	8	802757	802764	0 %	50 %	25 %	25 %	488575832
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16867	NC_021172	CGGT	2	8	808113	808120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16868	NC_021172	CGG	2	6	808281	808286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575842
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16871	NC_021172	CGG	2	6	808421	808426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575842
16872	NC_021172	CCT	2	6	808473	808478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575842
16873	NC_021172	TTCC	2	8	808531	808538	0 %	50 %	0 %	50 %	488575842
16874	NC_021172	CGAA	2	8	808624	808631	50 %	0 %	25 %	25 %	488575842
16875	NC_021172	TCC	2	6	808686	808691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575842
16876	NC_021172	CGT	2	6	808721	808726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575842
16877	NC_021172	CGA	2	6	808735	808740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575842
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16879	NC_021172	GTGC	2	8	808771	808778	0 %	25 %	50 %	25 %	488575842
16880	NC_021172	GCC	2	6	808910	808915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575842
16881	NC_021172	CCG	2	6	808947	808952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575842
16882	NC_021172	CG	3	6	808989	808994	0 %	0 %	50 %	50 %	488575842
16883	NC_021172	GGCC	2	8	809080	809087	0 %	0 %	50 %	50 %	488575842
16884	NC_021172	GGC	2	6	809128	809133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575842
16885	NC_021172	CGC	2	6	809137	809142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575842
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16888	NC_021172	CCG	2	6	809184	809189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575842
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16890	NC_021172	CGG	2	6	809236	809241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575842
16891	NC_021172	CCG	2	6	809269	809274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575842
16892	NC_021172	GCC	2	6	809351	809356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575842
16893	NC_021172	GA	3	6	809405	809410	50 %	0 %	50 %	0 %	488575842
16894	NC_021172	GCC	2	6	809412	809417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575842
16895	NC_021172	ACT	2	6	809499	809504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16896	NC_021172	CAA	2	6	809518	809523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16897	NC_021172	ACG	2	6	809525	809530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16898	NC_021172	CA	3	6	809535	809540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16899	NC_021172	CGC	2	6	809660	809665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575843
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16903	NC_021172	GAA	2	6	809878	809883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575843
16904	NC_021172	GC	3	6	809892	809897	0 %	0 %	50 %	50 %	488575843
16905	NC_021172	CTT	2	6	809917	809922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575843
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16907	NC_021172	GGT	2	6	809965	809970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575843
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16910	NC_021172	GTC	2	6	810023	810028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575843
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16912	NC_021172	GGT	2	6	810110	810115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16913	NC_021172	GGGC	2	8	810163	810170	0 %	0 %	75 %	25 %	488575844
16914	NC_021172	CAT	2	6	810245	810250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575844
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16916	NC_021172	AGC	2	6	810329	810334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575844
16917	NC_021172	CAT	2	6	810337	810342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575844
16918	NC_021172	AG	4	8	810538	810545	50 %	0 %	50 %	0 %	488575844
16919	NC_021172	GAT	2	6	810563	810568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575844
16920	NC_021172	TCT	2	6	810687	810692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575844
16921	NC_021172	CGC	2	6	810710	810715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575844
16922	NC_021172	GAT	2	6	810743	810748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575844
16923	NC_021172	CTCAT	2	10	810798	810807	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16924	NC_021172	ACGCT	2	10	810844	810853	20 %	20 %	20 %	40 %	488575845
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16927	NC_021172	CAA	2	6	810941	810946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575845
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16932	NC_021172	CG	3	6	811072	811077	0 %	0 %	50 %	50 %	488575845
16933	NC_021172	CCA	2	6	811094	811099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575845
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16937	NC_021172	CGC	2	6	811302	811307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575845
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16940	NC_021172	CTT	2	6	811447	811452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16941	NC_021172	TA	4	8	811462	811469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16942	NC_021172	CGC	2	6	811492	811497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16943	NC_021172	GAT	2	6	811560	811565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16944	NC_021172	TCA	2	6	811568	811573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16945	NC_021172	CGGC	2	8	811660	811667	0 %	0 %	50 %	50 %	488575846
16946	NC_021172	GC	3	6	811709	811714	0 %	0 %	50 %	50 %	488575846
16947	NC_021172	AAG	2	6	811806	811811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575846
16948	NC_021172	CGC	2	6	811842	811847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16949	NC_021172	TGCCC	2	10	811921	811930	0 %	20 %	20 %	60 %	488575847
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16960	NC_021172	GCG	2	6	812508	812513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575847
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16962	NC_021172	CGT	2	6	812837	812842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575847
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16967	NC_021172	CAA	2	6	813219	813224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16968	NC_021172	GCG	2	6	813259	813264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16969	NC_021172	GT	3	6	813313	813318	0 %	50 %	50 %	0 %	488575848
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16973	NC_021172	ATG	2	6	813465	813470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575848
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16980	NC_021172	TCG	2	6	813896	813901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16981	NC_021172	CGG	2	6	813923	813928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16982	NC_021172	TCC	2	6	813992	813997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16983	NC_021172	ATCG	2	8	814056	814063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16984	NC_021172	ATC	2	6	814152	814157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16985	NC_021172	CTT	2	6	814278	814283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16986	NC_021172	TAATC	2	10	814309	814318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16987	NC_021172	TGGAA	2	10	814375	814384	40 %	20 %	40 %	0 %	488575849
16988	NC_021172	GGC	2	6	814439	814444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575849
16989	NC_021172	CGGC	2	8	814459	814466	0 %	0 %	50 %	50 %	488575849
16990	NC_021172	TC	3	6	814512	814517	0 %	50 %	0 %	50 %	488575849
16991	NC_021172	GC	3	6	814581	814586	0 %	0 %	50 %	50 %	488575849
16992	NC_021172	ATC	2	6	814623	814628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575849
16993	NC_021172	TCG	2	6	814636	814641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575849
16994	NC_021172	TGA	2	6	814675	814680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575849
16995	NC_021172	CG	3	6	814743	814748	0 %	0 %	50 %	50 %	488575849
16996	NC_021172	GC	3	6	814776	814781	0 %	0 %	50 %	50 %	488575849
16997	NC_021172	CCA	2	6	814814	814819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575849
16998	NC_021172	GCC	2	6	814872	814877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575849
16999	NC_021172	GCCGAT	2	12	814929	814940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488575849
17000	NC_021172	CGT	2	6	814943	814948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575849

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