MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021172	GAGT	2	8	690044	690051	25 %	25 %	50 %	0 %	488575721
14502	NC_021172	ATA	2	6	690074	690079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575721
14503	NC_021172	GTC	2	6	690172	690177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575721
14504	NC_021172	TTG	2	6	690247	690252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575721
14505	NC_021172	CAT	2	6	690267	690272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575721
14506	NC_021172	TCT	2	6	690350	690355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575721
14507	NC_021172	ATA	2	6	690405	690410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575721
14508	NC_021172	TTCG	2	8	690444	690451	0 %	50 %	25 %	25 %	488575721
14509	NC_021172	ATG	2	6	690461	690466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575721
14510	NC_021172	GGT	2	6	690475	690480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575721
14511	NC_021172	CTT	2	6	690503	690508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575721
14512	NC_021172	TGG	2	6	690560	690565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575721
14513	NC_021172	GCT	2	6	690568	690573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575721
14514	NC_021172	AAG	2	6	690598	690603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575721
14515	NC_021172	CGA	2	6	690645	690650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575721
14516	NC_021172	CTG	2	6	690659	690664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575721
14517	NC_021172	TGT	2	6	690670	690675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575721
14518	NC_021172	GCGT	2	8	690698	690705	0 %	25 %	50 %	25 %	488575721
14519	NC_021172	AG	3	6	690711	690716	50 %	0 %	50 %	0 %	488575721
14520	NC_021172	CCG	2	6	690722	690727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575721
14521	NC_021172	TTCAG	2	10	690794	690803	20 %	40 %	20 %	20 %	488575722
14522	NC_021172	TCGC	2	8	690816	690823	0 %	25 %	25 %	50 %	488575722
14523	NC_021172	GCG	2	6	690882	690887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575722
14524	NC_021172	GTT	2	6	690899	690904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575722
14525	NC_021172	CTT	2	6	691176	691181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575723
14526	NC_021172	GCAAG	2	10	691212	691221	40 %	0 %	40 %	20 %	488575723
14527	NC_021172	TCGT	2	8	691258	691265	0 %	50 %	25 %	25 %	488575724
14528	NC_021172	CAG	2	6	691269	691274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575724
14529	NC_021172	CT	3	6	691276	691281	0 %	50 %	0 %	50 %	488575724
14530	NC_021172	TGCG	2	8	691310	691317	0 %	25 %	50 %	25 %	488575724
14531	NC_021172	CAG	2	6	691488	691493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575724
14532	NC_021172	GGC	2	6	691524	691529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575724
14533	NC_021172	GAA	2	6	691599	691604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575724
14534	NC_021172	CGAC	2	8	691607	691614	25 %	0 %	25 %	50 %	488575724
14535	NC_021172	GGA	2	6	691616	691621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575724
14536	NC_021172	TGG	2	6	691692	691697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_021172	TGC	2	6	691702	691707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14538	NC_021172	GCCTT	2	10	691743	691752	0 %	40 %	20 %	40 %	488575725
14539	NC_021172	GCCG	2	8	691786	691793	0 %	0 %	50 %	50 %	488575725
14540	NC_021172	TCA	2	6	691822	691827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575725
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14543	NC_021172	AAG	2	6	691872	691877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575725
14544	NC_021172	GGAT	2	8	691955	691962	25 %	25 %	50 %	0 %	488575725
14545	NC_021172	CGT	2	6	692111	692116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575725
14546	NC_021172	TGC	2	6	692121	692126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575725
14547	NC_021172	TCG	2	6	692157	692162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575725
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14549	NC_021172	CCTG	2	8	692277	692284	0 %	25 %	25 %	50 %	488575725
14550	NC_021172	AAC	2	6	692292	692297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575725
14551	NC_021172	CGG	2	6	692362	692367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575725
14552	NC_021172	CAA	2	6	692371	692376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575725
14553	NC_021172	TTG	2	6	692471	692476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575725
14554	NC_021172	ACT	2	6	692480	692485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575725
14555	NC_021172	TGC	2	6	692502	692507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575725
14556	NC_021172	CG	3	6	692568	692573	0 %	0 %	50 %	50 %	488575725
14557	NC_021172	AG	3	6	692631	692636	50 %	0 %	50 %	0 %	488575725
14558	NC_021172	ATC	2	6	692742	692747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575725
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14560	NC_021172	CGG	2	6	692821	692826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575725
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14562	NC_021172	TGC	2	6	692992	692997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575725
14563	NC_021172	CGA	2	6	693010	693015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575725
14564	NC_021172	GGT	2	6	693037	693042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575725
14565	NC_021172	CGCCC	2	10	693102	693111	0 %	0 %	20 %	80 %	488575725
14566	NC_021172	CGG	2	6	693142	693147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575725
14567	NC_021172	CAACG	2	10	693255	693264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14568	NC_021172	CG	3	6	693268	693273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14569	NC_021172	GC	3	6	693293	693298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14570	NC_021172	CGAT	2	8	693403	693410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14571	NC_021172	CGGT	2	8	693439	693446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14572	NC_021172	GCT	2	6	693476	693481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14573	NC_021172	CCG	2	6	693574	693579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14574	NC_021172	GTCA	2	8	693594	693601	25 %	25 %	25 %	25 %	488575726
14575	NC_021172	AGT	2	6	693606	693611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575726
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14580	NC_021172	GAA	2	6	693906	693911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_021172	CCA	2	6	693940	693945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14582	NC_021172	T	6	6	694015	694020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_021172	CGA	2	6	694097	694102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575727
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14587	NC_021172	CGCC	2	8	694310	694317	0 %	0 %	25 %	75 %	488575727
14588	NC_021172	GAT	2	6	694369	694374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575727
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14591	NC_021172	ATA	2	6	694428	694433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575727
14592	NC_021172	CATT	2	8	694517	694524	25 %	50 %	0 %	25 %	488575727
14593	NC_021172	AC	3	6	694670	694675	50 %	0 %	0 %	50 %	488575727
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14597	NC_021172	CGT	2	6	695183	695188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_021172	GCGCT	2	10	695200	695209	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14599	NC_021172	GC	4	8	695318	695325	0 %	0 %	50 %	50 %	488575728
14600	NC_021172	TC	3	6	695328	695333	0 %	50 %	0 %	50 %	488575728
14601	NC_021172	GGC	2	6	695334	695339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575728
14602	NC_021172	CG	3	6	695360	695365	0 %	0 %	50 %	50 %	488575728
14603	NC_021172	GC	3	6	695459	695464	0 %	0 %	50 %	50 %	488575728
14604	NC_021172	CG	3	6	695486	695491	0 %	0 %	50 %	50 %	488575728
14605	NC_021172	TCC	2	6	695610	695615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575728
14606	NC_021172	TCG	2	6	695623	695628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575728
14607	NC_021172	CCGCT	2	10	695643	695652	0 %	20 %	20 %	60 %	488575728
14608	NC_021172	ATG	2	6	695659	695664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575728
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14611	NC_021172	GCC	2	6	695853	695858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575728
14612	NC_021172	CTGC	2	8	695942	695949	0 %	25 %	25 %	50 %	488575728
14613	NC_021172	CG	3	6	695967	695972	0 %	0 %	50 %	50 %	488575728
14614	NC_021172	TCC	2	6	695980	695985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575728
14615	NC_021172	CAT	2	6	696033	696038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575728
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14617	NC_021172	GC	3	6	696132	696137	0 %	0 %	50 %	50 %	488575728
14618	NC_021172	GCG	2	6	696139	696144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575728
14619	NC_021172	AATA	2	8	696215	696222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_021172	TCTA	2	8	696243	696250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14621	NC_021172	GCA	2	6	696320	696325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575729
14622	NC_021172	TTTGC	2	10	696370	696379	0 %	60 %	20 %	20 %	488575729
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14624	NC_021172	TGC	2	6	696504	696509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575729
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14732	NC_021172	CGAG	2	8	701456	701463	25 %	0 %	50 %	25 %	488575732
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14736	NC_021172	GA	3	6	701719	701724	50 %	0 %	50 %	0 %	488575732
14737	NC_021172	GCT	2	6	701750	701755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575732
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14739	NC_021172	CGG	2	6	702162	702167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14741	NC_021172	GGA	2	6	702214	702219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14742	NC_021172	GCT	2	6	702254	702259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575733
14743	NC_021172	CAA	2	6	702319	702324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575733
14744	NC_021172	TGC	2	6	702435	702440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575733
14745	NC_021172	CGC	2	6	702456	702461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575733
14746	NC_021172	ATGTA	2	10	702474	702483	40 %	40 %	20 %	0 %	488575733
14747	NC_021172	CGA	2	6	702529	702534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575733
14748	NC_021172	AGA	2	6	702537	702542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575733
14749	NC_021172	GCA	2	6	702646	702651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575733
14750	NC_021172	CGT	2	6	702664	702669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575733
14751	NC_021172	AGGAA	2	10	702688	702697	60 %	0 %	40 %	0 %	488575733
14752	NC_021172	TCA	2	6	702774	702779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575733
14753	NC_021172	AAG	2	6	702845	702850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575733
14754	NC_021172	GC	3	6	702856	702861	0 %	0 %	50 %	50 %	488575733
14755	NC_021172	ACA	2	6	702908	702913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575733
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14759	NC_021172	CGAT	2	8	703098	703105	25 %	25 %	25 %	25 %	488575733
14760	NC_021172	ATC	2	6	703124	703129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575733
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14762	NC_021172	CGA	2	6	703183	703188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575733
14763	NC_021172	TCG	2	6	703221	703226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575733
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14772	NC_021172	CAT	2	6	703846	703851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575733
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14775	NC_021172	GCT	2	6	703937	703942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575733
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14782	NC_021172	GT	3	6	704143	704148	0 %	50 %	50 %	0 %	488575734
14783	NC_021172	TGG	2	6	704159	704164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575734
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14791	NC_021172	GCTG	2	8	704794	704801	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14792	NC_021172	TG	3	6	704800	704805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14793	NC_021172	AGC	2	6	704813	704818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14797	NC_021172	CGT	2	6	704868	704873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14798	NC_021172	TG	3	6	704897	704902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14799	NC_021172	GC	3	6	705042	705047	0 %	0 %	50 %	50 %	488575735
14800	NC_021172	GAA	2	6	705160	705165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575735
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14804	NC_021172	GC	5	10	705416	705425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14805	NC_021172	TCAT	2	8	705478	705485	25 %	50 %	0 %	25 %	488575736
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14850	NC_021172	TGCC	2	8	707677	707684	0 %	25 %	25 %	50 %	488575738
14851	NC_021172	GCG	2	6	707716	707721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575738
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14857	NC_021172	G	7	7	708062	708068	0 %	0 %	100 %	0 %	488575738
14858	NC_021172	TCG	2	6	708106	708111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575738
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14861	NC_021172	GCCG	2	8	708251	708258	0 %	0 %	50 %	50 %	488575738
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14983	NC_021172	TTC	2	6	713603	713608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575740
14984	NC_021172	CGC	2	6	713727	713732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575740
14985	NC_021172	AGAGT	2	10	713771	713780	40 %	20 %	40 %	0 %	488575740
14986	NC_021172	GTTG	2	8	713808	713815	0 %	50 %	50 %	0 %	488575740
14987	NC_021172	TTGC	2	8	714010	714017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14988	NC_021172	CATCT	2	10	714019	714028	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14989	NC_021172	CGCA	2	8	714083	714090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14990	NC_021172	GT	3	6	714100	714105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14991	NC_021172	TC	3	6	714145	714150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14992	NC_021172	CAT	2	6	714164	714169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14993	NC_021172	AAT	2	6	714199	714204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14994	NC_021172	GC	4	8	714285	714292	0 %	0 %	50 %	50 %	488575741
14995	NC_021172	TTG	2	6	714303	714308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575741
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