MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021172	GCG	2	6	665002	665007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575697
14002	NC_021172	CGA	2	6	665118	665123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575697
14003	NC_021172	GCG	2	6	665134	665139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575697
14004	NC_021172	GAA	2	6	665143	665148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575697
14005	NC_021172	CAG	2	6	665205	665210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_021172	TCT	2	6	665241	665246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_021172	T	6	6	665351	665356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_021172	GCGA	2	8	665411	665418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14009	NC_021172	GAT	3	9	665428	665436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575698
14010	NC_021172	GAT	2	6	665464	665469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575698
14011	NC_021172	GTC	3	9	665479	665487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575698
14012	NC_021172	AGG	2	6	665489	665494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575698
14013	NC_021172	TCACT	2	10	665532	665541	20 %	40 %	0 %	40 %	488575698
14014	NC_021172	GGT	2	6	665625	665630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575698
14015	NC_021172	CGAA	2	8	665641	665648	50 %	0 %	25 %	25 %	488575698
14016	NC_021172	CGT	2	6	665665	665670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575698
14017	NC_021172	GCC	2	6	665692	665697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575698
14018	NC_021172	CGTT	2	8	665765	665772	0 %	50 %	25 %	25 %	488575698
14019	NC_021172	CTT	2	6	665833	665838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575698
14020	NC_021172	CG	3	6	665848	665853	0 %	0 %	50 %	50 %	488575698
14021	NC_021172	CG	3	6	665940	665945	0 %	0 %	50 %	50 %	488575698
14022	NC_021172	GAC	2	6	665975	665980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575698
14023	NC_021172	CGA	2	6	666061	666066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575698
14024	NC_021172	GGA	2	6	666112	666117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575698
14025	NC_021172	CCG	3	9	666161	666169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575698
14026	NC_021172	TTC	2	6	666311	666316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_021172	GCA	2	6	666389	666394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_021172	TC	3	6	666634	666639	0 %	50 %	0 %	50 %	488575699
14029	NC_021172	CCAA	2	8	666660	666667	50 %	0 %	0 %	50 %	488575699
14030	NC_021172	AG	3	6	666702	666707	50 %	0 %	50 %	0 %	488575699
14031	NC_021172	GA	3	6	666791	666796	50 %	0 %	50 %	0 %	488575700
14032	NC_021172	GAA	2	6	666809	666814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575700
14033	NC_021172	GC	3	6	666969	666974	0 %	0 %	50 %	50 %	488575700
14034	NC_021172	GATT	2	8	667011	667018	25 %	50 %	25 %	0 %	488575700
14035	NC_021172	AAT	2	6	667118	667123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575701
14036	NC_021172	GCAG	2	8	667168	667175	25 %	0 %	50 %	25 %	488575701
14037	NC_021172	GCA	2	6	667236	667241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575701
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14039	NC_021172	ACGT	2	8	667251	667258	25 %	25 %	25 %	25 %	488575701
14040	NC_021172	GAG	2	6	667385	667390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_021172	TATC	2	8	667468	667475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14042	NC_021172	TGC	2	6	667477	667482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_021172	CG	3	6	667493	667498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14044	NC_021172	CG	3	6	667507	667512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14045	NC_021172	CGG	2	6	667529	667534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575702
14046	NC_021172	AGT	3	9	667543	667551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575702
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14048	NC_021172	AAGGTC	2	12	667637	667648	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488575702
14049	NC_021172	GAA	3	9	667697	667705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575702
14050	NC_021172	CAG	2	6	667718	667723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575702
14051	NC_021172	GAA	2	6	667799	667804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575702
14052	NC_021172	GAG	2	6	667808	667813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575702
14053	NC_021172	CGA	2	6	667825	667830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575702
14054	NC_021172	CGATG	2	10	667873	667882	20 %	20 %	40 %	20 %	488575702
14055	NC_021172	AGT	2	6	667951	667956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575702
14056	NC_021172	TAG	2	6	667985	667990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575702
14057	NC_021172	GTCC	2	8	668009	668016	0 %	25 %	25 %	50 %	488575702
14058	NC_021172	TGG	2	6	668026	668031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575702
14059	NC_021172	GC	3	6	668032	668037	0 %	0 %	50 %	50 %	488575702
14060	NC_021172	CCAT	2	8	668072	668079	25 %	25 %	0 %	50 %	488575702
14061	NC_021172	CGC	2	6	668083	668088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575702
14062	NC_021172	GAG	2	6	668106	668111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575702
14063	NC_021172	GCCATC	2	12	668115	668126	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	488575702
14064	NC_021172	ATG	2	6	668127	668132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575702
14065	NC_021172	CAT	3	9	668153	668161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575702
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14068	NC_021172	GGC	2	6	668213	668218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575702
14069	NC_021172	TCCA	2	8	668231	668238	25 %	25 %	0 %	50 %	488575702
14070	NC_021172	CGA	2	6	668293	668298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575702
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14072	NC_021172	CAC	2	6	668309	668314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575702
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14074	NC_021172	GCC	2	6	668453	668458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575702
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14083	NC_021172	CTG	2	6	668800	668805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575702
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14087	NC_021172	GCCGC	2	10	669009	669018	0 %	0 %	40 %	60 %	488575702
14088	NC_021172	CGC	2	6	669166	669171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575702
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14091	NC_021172	GCGGG	2	10	669229	669238	0 %	0 %	80 %	20 %	488575702
14092	NC_021172	TCA	2	6	669274	669279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_021172	CTC	2	6	669283	669288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14094	NC_021172	GAG	2	6	669326	669331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_021172	TG	3	6	669374	669379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_021172	TAT	2	6	669395	669400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_021172	AGC	2	6	669407	669412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_021172	A	6	6	669485	669490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_021172	GC	3	6	669552	669557	0 %	0 %	50 %	50 %	488575703
14100	NC_021172	CGG	2	6	669574	669579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575703
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14102	NC_021172	TCA	2	6	669628	669633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575703
14103	NC_021172	GCGGGG	2	12	669678	669689	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	488575703
14104	NC_021172	GAGCA	2	10	669841	669850	40 %	0 %	40 %	20 %	488575703
14105	NC_021172	CGTG	2	8	669860	669867	0 %	25 %	50 %	25 %	488575703
14106	NC_021172	GCT	2	6	669896	669901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575703
14107	NC_021172	CTT	2	6	669938	669943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575703
14108	NC_021172	TCG	2	6	670057	670062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575703
14109	NC_021172	CGT	2	6	670094	670099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575703
14110	NC_021172	ATT	2	6	670146	670151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575703
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14112	NC_021172	GC	4	8	670351	670358	0 %	0 %	50 %	50 %	488575704
14113	NC_021172	TG	3	6	670453	670458	0 %	50 %	50 %	0 %	488575704
14114	NC_021172	CCG	2	6	670466	670471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575704
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14119	NC_021172	ACA	2	6	670721	670726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575704
14120	NC_021172	CGC	2	6	670764	670769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575704
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14122	NC_021172	GGC	2	6	670844	670849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575704
14123	NC_021172	AAAT	2	8	670864	670871	75 %	25 %	0 %	0 %	488575704
14124	NC_021172	AGC	2	6	671026	671031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575704
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14127	NC_021172	CGT	2	6	671190	671195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575704
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14131	NC_021172	CGT	2	6	671463	671468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575704
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14133	NC_021172	GACG	2	8	671515	671522	25 %	0 %	50 %	25 %	488575704
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14227	NC_021172	CGTG	2	8	676165	676172	0 %	25 %	50 %	25 %	488575709
14228	NC_021172	GC	3	6	676203	676208	0 %	0 %	50 %	50 %	488575709
14229	NC_021172	CGT	2	6	676306	676311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575709
14230	NC_021172	CGT	2	6	676318	676323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575709
14231	NC_021172	ATG	2	6	676341	676346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575709
14232	NC_021172	AACGT	2	10	676522	676531	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14233	NC_021172	GC	3	6	676542	676547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14234	NC_021172	TTG	2	6	676582	676587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14235	NC_021172	TGC	2	6	676593	676598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575710
14236	NC_021172	AGCG	2	8	676637	676644	25 %	0 %	50 %	25 %	488575710
14237	NC_021172	GCG	2	6	676681	676686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575710
14238	NC_021172	TCA	2	6	676726	676731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575710
14239	NC_021172	GTC	2	6	676827	676832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14240	NC_021172	AGA	2	6	676880	676885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14241	NC_021172	CGA	2	6	676891	676896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14242	NC_021172	TCG	2	6	676957	676962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14243	NC_021172	CGG	2	6	677067	677072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575711
14244	NC_021172	CGGC	2	8	677129	677136	0 %	0 %	50 %	50 %	488575711
14245	NC_021172	CTT	2	6	677250	677255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575711
14246	NC_021172	GC	3	6	677266	677271	0 %	0 %	50 %	50 %	488575711
14247	NC_021172	CTT	2	6	677274	677279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575711
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14249	NC_021172	GTCG	2	8	677349	677356	0 %	25 %	50 %	25 %	488575711
14250	NC_021172	ATCG	2	8	677382	677389	25 %	25 %	25 %	25 %	488575711
14251	NC_021172	TGA	2	6	677444	677449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575711
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14254	NC_021172	GCT	2	6	677541	677546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575711
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14259	NC_021172	CG	3	6	677887	677892	0 %	0 %	50 %	50 %	488575711
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14324	NC_021172	GA	3	6	681009	681014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14325	NC_021172	T	7	7	681038	681044	0 %	100 %	0 %	0 %	488575713
14326	NC_021172	TCG	2	6	681134	681139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575713
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14333	NC_021172	CGT	2	6	682008	682013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575714
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14337	NC_021172	GCAG	2	8	682075	682082	25 %	0 %	50 %	25 %	488575715
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14345	NC_021172	CGG	2	6	682434	682439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575715
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14350	NC_021172	AGC	2	6	682592	682597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575715
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14353	NC_021172	GAA	2	6	682714	682719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575715
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14355	NC_021172	TCG	2	6	682865	682870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575715
14356	NC_021172	TGCC	2	8	682956	682963	0 %	25 %	25 %	50 %	488575715
14357	NC_021172	CG	3	6	682966	682971	0 %	0 %	50 %	50 %	488575715
14358	NC_021172	CGG	2	6	682991	682996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575715
14359	NC_021172	AGGCT	2	10	683028	683037	20 %	20 %	40 %	20 %	488575715
14360	NC_021172	TGTC	2	8	683052	683059	0 %	50 %	25 %	25 %	488575715
14361	NC_021172	GCG	2	6	683138	683143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575715
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14363	NC_021172	CT	3	6	683199	683204	0 %	50 %	0 %	50 %	488575715
14364	NC_021172	AAC	2	6	683219	683224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575715
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14376	NC_021172	CTTC	2	8	683824	683831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14377	NC_021172	A	6	6	683835	683840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14482	NC_021172	GCA	2	6	689357	689362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575720
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14484	NC_021172	TGG	2	6	689431	689436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14485	NC_021172	CCG	2	6	689441	689446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14486	NC_021172	CGA	2	6	689516	689521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14487	NC_021172	A	6	6	689545	689550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14488	NC_021172	GGC	2	6	689587	689592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575721
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