MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021172	CGA	2	6	592261	592266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575639
12502	NC_021172	CGA	2	6	592285	592290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575639
12503	NC_021172	TCT	2	6	592321	592326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575639
12504	NC_021172	GC	3	6	592327	592332	0 %	0 %	50 %	50 %	488575639
12505	NC_021172	CGC	2	6	592380	592385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575639
12506	NC_021172	GAT	2	6	592411	592416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575639
12507	NC_021172	GCTGG	2	10	592462	592471	0 %	20 %	60 %	20 %	488575639
12508	NC_021172	GCA	2	6	592474	592479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575639
12509	NC_021172	TCGG	2	8	592481	592488	0 %	25 %	50 %	25 %	488575639
12510	NC_021172	CG	3	6	592502	592507	0 %	0 %	50 %	50 %	488575639
12511	NC_021172	CGG	2	6	592549	592554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575639
12512	NC_021172	CTG	2	6	592610	592615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575639
12513	NC_021172	CGA	2	6	592669	592674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575639
12514	NC_021172	AAC	2	6	592796	592801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575639
12515	NC_021172	CAT	2	6	592846	592851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575639
12516	NC_021172	GAT	2	6	592864	592869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575639
12517	NC_021172	GCA	2	6	592915	592920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575639
12518	NC_021172	CCG	2	6	592945	592950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575639
12519	NC_021172	TC	3	6	592954	592959	0 %	50 %	0 %	50 %	488575639
12520	NC_021172	CGA	2	6	593082	593087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575639
12521	NC_021172	AGA	3	9	593098	593106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575639
12522	NC_021172	CT	3	6	593110	593115	0 %	50 %	0 %	50 %	488575639
12523	NC_021172	GC	3	6	593126	593131	0 %	0 %	50 %	50 %	488575639
12524	NC_021172	AGCCG	2	10	593155	593164	20 %	0 %	40 %	40 %	488575639
12525	NC_021172	GGCCA	2	10	593168	593177	20 %	0 %	40 %	40 %	488575639
12526	NC_021172	AAGG	2	8	593234	593241	50 %	0 %	50 %	0 %	488575639
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12528	NC_021172	CCG	2	6	593307	593312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575639
12529	NC_021172	CG	5	10	593336	593345	0 %	0 %	50 %	50 %	488575639
12530	NC_021172	GGCC	2	8	593383	593390	0 %	0 %	50 %	50 %	488575639
12531	NC_021172	CGA	2	6	593419	593424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575639
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12535	NC_021172	CG	3	6	593511	593516	0 %	0 %	50 %	50 %	488575639
12536	NC_021172	GACC	2	8	593679	593686	25 %	0 %	25 %	50 %	488575639
12537	NC_021172	TCA	2	6	593715	593720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575639
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12539	NC_021172	CGA	2	6	593866	593871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575639
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12543	NC_021172	TCCG	3	12	594369	594380	0 %	25 %	25 %	50 %	488575640
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12550	NC_021172	TCG	2	6	594911	594916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575640
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12552	NC_021172	GCAC	2	8	594974	594981	25 %	0 %	25 %	50 %	488575640
12553	NC_021172	TCA	2	6	594996	595001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575640
12554	NC_021172	TGT	2	6	595119	595124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575640
12555	NC_021172	TCC	2	6	595130	595135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575640
12556	NC_021172	TCA	2	6	595142	595147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575640
12557	NC_021172	GAAG	2	8	595179	595186	50 %	0 %	50 %	0 %	488575640
12558	NC_021172	TGC	2	6	595200	595205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575640
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12564	NC_021172	GAT	2	6	595509	595514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575641
12565	NC_021172	CGAT	2	8	595531	595538	25 %	25 %	25 %	25 %	488575641
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12569	NC_021172	TCT	2	6	595609	595614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575641
12570	NC_021172	CTG	2	6	595626	595631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575641
12571	NC_021172	CG	3	6	595707	595712	0 %	0 %	50 %	50 %	488575641
12572	NC_021172	ATC	2	6	595752	595757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575641
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12574	NC_021172	GGC	2	6	595843	595848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575641
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12577	NC_021172	GTGG	2	8	595977	595984	0 %	25 %	75 %	0 %	488575642
12578	NC_021172	TGCC	2	8	596023	596030	0 %	25 %	25 %	50 %	488575642
12579	NC_021172	CGC	2	6	596142	596147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575642
12580	NC_021172	CTGT	2	8	596152	596159	0 %	50 %	25 %	25 %	488575642
12581	NC_021172	AGC	3	9	596183	596191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575642
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12586	NC_021172	GCTGC	2	10	596437	596446	0 %	20 %	40 %	40 %	488575642
12587	NC_021172	CGT	2	6	596471	596476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575642
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12589	NC_021172	TTG	2	6	596497	596502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575642
12590	NC_021172	TGC	2	6	596524	596529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575642
12591	NC_021172	GAG	2	6	596673	596678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575642
12592	NC_021172	CGA	2	6	596718	596723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575642
12593	NC_021172	ATG	2	6	596812	596817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575642
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12602	NC_021172	ACGATA	2	12	597207	597218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	488575643
12603	NC_021172	CGAA	2	8	597246	597253	50 %	0 %	25 %	25 %	488575643
12604	NC_021172	CGG	2	6	597340	597345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575643
12605	NC_021172	CCT	2	6	597346	597351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575643
12606	NC_021172	GCG	2	6	597507	597512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575643
12607	NC_021172	CGA	2	6	597541	597546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575643
12608	NC_021172	GCA	2	6	597560	597565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575643
12609	NC_021172	CAT	2	6	597572	597577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575643
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12612	NC_021172	CGG	2	6	597652	597657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575643
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12614	NC_021172	GCGG	2	8	597765	597772	0 %	0 %	75 %	25 %	488575643
12615	NC_021172	GCC	2	6	597819	597824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575643
12616	NC_021172	CGA	2	6	597826	597831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575643
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12619	NC_021172	TGC	2	6	597965	597970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12740	NC_021172	AGC	2	6	603167	603172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575647
12741	NC_021172	G	7	7	603193	603199	0 %	0 %	100 %	0 %	488575648
12742	NC_021172	GC	3	6	603218	603223	0 %	0 %	50 %	50 %	488575648
12743	NC_021172	GC	3	6	603282	603287	0 %	0 %	50 %	50 %	488575648
12744	NC_021172	CGCT	2	8	603298	603305	0 %	25 %	25 %	50 %	488575648
12745	NC_021172	ATC	2	6	603318	603323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575648
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12747	NC_021172	GTC	2	6	603456	603461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12748	NC_021172	AGG	2	6	603501	603506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12749	NC_021172	GTC	2	6	603542	603547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12750	NC_021172	AAT	2	6	603590	603595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12751	NC_021172	AAG	2	6	603603	603608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12752	NC_021172	TC	3	6	603615	603620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12753	NC_021172	ATG	2	6	603769	603774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575649
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12755	NC_021172	GC	5	10	603850	603859	0 %	0 %	50 %	50 %	488575649
12756	NC_021172	TCG	2	6	603870	603875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575649
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12763	NC_021172	GTC	2	6	604117	604122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575649
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12765	NC_021172	GCT	2	6	604152	604157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575649
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12784	NC_021172	CAT	2	6	604916	604921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12851	NC_021172	CCGG	2	8	608613	608620	0 %	0 %	50 %	50 %	488575654
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12856	NC_021172	TTGTGG	2	12	608808	608819	0 %	50 %	50 %	0 %	488575654
12857	NC_021172	CG	3	6	608841	608846	0 %	0 %	50 %	50 %	488575654
12858	NC_021172	CCGT	2	8	608890	608897	0 %	25 %	25 %	50 %	488575654
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12981	NC_021172	ATCAGG	2	12	614789	614800	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488575657
12982	NC_021172	GCG	2	6	614858	614863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575657
12983	NC_021172	CCG	2	6	614874	614879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575657
12984	NC_021172	GA	3	6	614943	614948	50 %	0 %	50 %	0 %	488575657
12985	NC_021172	CCCG	2	8	614974	614981	0 %	0 %	25 %	75 %	488575657
12986	NC_021172	AAG	2	6	615004	615009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575657
12987	NC_021172	TCG	2	6	615057	615062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575657
12988	NC_021172	CAT	2	6	615067	615072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575657
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12992	NC_021172	A	6	6	615225	615230	100 %	0 %	0 %	0 %	488575657
12993	NC_021172	A	7	7	615364	615370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12994	NC_021172	GCC	2	6	615371	615376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12995	NC_021172	CGG	2	6	615412	615417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12996	NC_021172	TGA	2	6	615425	615430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12997	NC_021172	CGT	2	6	615436	615441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13000	NC_021172	GTC	2	6	615531	615536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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