MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021172	CTG	2	6	567457	567462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575611
12002	NC_021172	TTC	2	6	567470	567475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575611
12003	NC_021172	CGA	2	6	567605	567610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575611
12004	NC_021172	AAT	2	6	567611	567616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575611
12005	NC_021172	GCA	2	6	567673	567678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12006	NC_021172	GC	3	6	567715	567720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12007	NC_021172	GCT	2	6	567758	567763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_021172	CAC	2	6	567850	567855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575612
12009	NC_021172	CGA	3	9	567977	567985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575612
12010	NC_021172	CGC	2	6	567989	567994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575612
12011	NC_021172	CTT	2	6	568028	568033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575612
12012	NC_021172	TC	3	6	568046	568051	0 %	50 %	0 %	50 %	488575612
12013	NC_021172	GC	3	6	568149	568154	0 %	0 %	50 %	50 %	488575612
12014	NC_021172	CGA	2	6	568172	568177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575612
12015	NC_021172	GTGC	2	8	568229	568236	0 %	25 %	50 %	25 %	488575612
12016	NC_021172	AGG	2	6	568288	568293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575612
12017	NC_021172	TGGC	2	8	568324	568331	0 %	25 %	50 %	25 %	488575612
12018	NC_021172	TCA	2	6	568342	568347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575612
12019	NC_021172	CGA	2	6	568457	568462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575612
12020	NC_021172	CG	3	6	568526	568531	0 %	0 %	50 %	50 %	488575612
12021	NC_021172	CGG	2	6	568553	568558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575612
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12023	NC_021172	CT	3	6	568798	568803	0 %	50 %	0 %	50 %	488575612
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12029	NC_021172	CGA	2	6	569113	569118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575613
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12041	NC_021172	GATGCC	2	12	569750	569761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488575613
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12047	NC_021172	GCCG	2	8	569926	569933	0 %	0 %	50 %	50 %	488575613
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12052	NC_021172	CGA	2	6	570253	570258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575613
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12054	NC_021172	CAA	2	6	570341	570346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575613
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12056	NC_021172	AAT	2	6	570374	570379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575613
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12067	NC_021172	GCT	2	6	571012	571017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575613
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12069	NC_021172	GAA	2	6	571076	571081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575613
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12088	NC_021172	GAC	2	6	572002	572007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575615
12089	NC_021172	GA	3	6	572031	572036	50 %	0 %	50 %	0 %	488575615
12090	NC_021172	CGAGTG	2	12	572052	572063	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	488575615
12091	NC_021172	TGAT	2	8	572146	572153	25 %	50 %	25 %	0 %	488575616
12092	NC_021172	CTGG	2	8	572174	572181	0 %	25 %	50 %	25 %	488575616
12093	NC_021172	GCC	2	6	572247	572252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575616
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12102	NC_021172	TGCA	2	8	572799	572806	25 %	25 %	25 %	25 %	488575616
12103	NC_021172	GC	3	6	572816	572821	0 %	0 %	50 %	50 %	488575616
12104	NC_021172	GCT	2	6	572844	572849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575616
12105	NC_021172	ACG	2	6	572935	572940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575616
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12107	NC_021172	GAT	2	6	572978	572983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575616
12108	NC_021172	CTC	2	6	572990	572995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575616
12109	NC_021172	ATG	2	6	573016	573021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575616
12110	NC_021172	GTC	2	6	573081	573086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575616
12111	NC_021172	CAG	2	6	573145	573150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575616
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12113	NC_021172	GGGC	2	8	573220	573227	0 %	0 %	75 %	25 %	488575616
12114	NC_021172	GC	3	6	573240	573245	0 %	0 %	50 %	50 %	488575616
12115	NC_021172	GAA	2	6	573251	573256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575616
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12117	NC_021172	CAG	2	6	573309	573314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575616
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12119	NC_021172	GAT	2	6	573468	573473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575616
12120	NC_021172	GC	3	6	573515	573520	0 %	0 %	50 %	50 %	488575616
12121	NC_021172	GAT	2	6	573607	573612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12122	NC_021172	GC	3	6	573652	573657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12123	NC_021172	CGA	2	6	573753	573758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575617
12124	NC_021172	CTGC	2	8	573790	573797	0 %	25 %	25 %	50 %	488575617
12125	NC_021172	CG	3	6	573849	573854	0 %	0 %	50 %	50 %	488575617
12126	NC_021172	TCG	2	6	573855	573860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575617
12127	NC_021172	GATC	2	8	573909	573916	25 %	25 %	25 %	25 %	488575617
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12132	NC_021172	GGT	2	6	574222	574227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575617
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12147	NC_021172	TTCT	2	8	574729	574736	0 %	75 %	0 %	25 %	488575618
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12157	NC_021172	GCGG	2	8	575475	575482	0 %	0 %	75 %	25 %	488575619
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12225	NC_021172	AGT	2	6	579037	579042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575623
12226	NC_021172	AAC	2	6	579104	579109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575623
12227	NC_021172	GA	3	6	579131	579136	50 %	0 %	50 %	0 %	488575623
12228	NC_021172	TCT	2	6	579202	579207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575623
12229	NC_021172	CT	3	6	579217	579222	0 %	50 %	0 %	50 %	488575623
12230	NC_021172	GCC	2	6	579240	579245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575623
12231	NC_021172	GAC	2	6	579317	579322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575623
12232	NC_021172	GA	3	6	579344	579349	50 %	0 %	50 %	0 %	488575623
12233	NC_021172	CCG	2	6	579414	579419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12234	NC_021172	TCGA	2	8	579499	579506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12235	NC_021172	CTT	2	6	579508	579513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12236	NC_021172	AGA	2	6	579565	579570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575624
12237	NC_021172	GCA	2	6	579571	579576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575624
12238	NC_021172	ATC	2	6	579597	579602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575624
12239	NC_021172	CCA	2	6	579616	579621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575624
12240	NC_021172	CGA	2	6	579730	579735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575624
12241	NC_021172	CGCCGG	2	12	579799	579810	0 %	0 %	50 %	50 %	488575624
12242	NC_021172	CGC	2	6	579907	579912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575624
12243	NC_021172	GAC	2	6	579914	579919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575624
12244	NC_021172	CGT	2	6	579973	579978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575624
12245	NC_021172	TAGT	2	8	579990	579997	25 %	50 %	25 %	0 %	488575624
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12247	NC_021172	CGT	2	6	580016	580021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575624
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12253	NC_021172	GAGCG	2	10	580301	580310	20 %	0 %	60 %	20 %	488575624
12254	NC_021172	ACCGG	2	10	580317	580326	20 %	0 %	40 %	40 %	488575624
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12265	NC_021172	TAGG	2	8	580778	580785	25 %	25 %	50 %	0 %	488575624
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12270	NC_021172	GC	3	6	580994	580999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12271	NC_021172	GC	3	6	581002	581007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12272	NC_021172	TGT	2	6	581015	581020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12273	NC_021172	GGCG	2	8	581115	581122	0 %	0 %	75 %	25 %	488575625
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12278	NC_021172	TGA	2	6	581342	581347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575625
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12298	NC_021172	TGCT	2	8	582378	582385	0 %	50 %	25 %	25 %	488575627
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12317	NC_021172	TC	3	6	583694	583699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12318	NC_021172	CTAT	2	8	583850	583857	25 %	50 %	0 %	25 %	488575628
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12323	NC_021172	TATT	2	8	584038	584045	25 %	75 %	0 %	0 %	488575628
12324	NC_021172	TGC	2	6	584049	584054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575628
12325	NC_021172	CG	3	6	584158	584163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12326	NC_021172	CGA	2	6	584220	584225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575629
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12331	NC_021172	AGC	2	6	584732	584737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575631
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12338	NC_021172	AGCT	2	8	585137	585144	25 %	25 %	25 %	25 %	488575631
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12342	NC_021172	TGT	2	6	585320	585325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12343	NC_021172	GCCT	2	8	585347	585354	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12344	NC_021172	GCG	2	6	585399	585404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12345	NC_021172	TGAG	2	8	585433	585440	25 %	25 %	50 %	0 %	488575632
12346	NC_021172	GGC	2	6	585452	585457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575632
12347	NC_021172	G	6	6	585477	585482	0 %	0 %	100 %	0 %	488575632
12348	NC_021172	T	7	7	585487	585493	0 %	100 %	0 %	0 %	488575632
12349	NC_021172	CAAGCG	2	12	585547	585558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575632
12350	NC_021172	TG	3	6	585596	585601	0 %	50 %	50 %	0 %	488575632
12351	NC_021172	GGC	2	6	585690	585695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575632
12352	NC_021172	GCG	2	6	585754	585759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575632
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12354	NC_021172	GCC	2	6	585863	585868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575632
12355	NC_021172	GAG	2	6	585883	585888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575632
12356	NC_021172	CCAAC	2	10	585907	585916	40 %	0 %	0 %	60 %	488575633
12357	NC_021172	ATC	2	6	585967	585972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575633
12358	NC_021172	TAT	2	6	586105	586110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575633
12359	NC_021172	GAA	2	6	586120	586125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575633
12360	NC_021172	TCT	2	6	586173	586178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575633
12361	NC_021172	GGC	2	6	586194	586199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575633
12362	NC_021172	AGC	2	6	586247	586252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575633
12363	NC_021172	TCG	2	6	586274	586279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575633
12364	NC_021172	ATCT	2	8	586291	586298	25 %	50 %	0 %	25 %	488575633
12365	NC_021172	TGG	2	6	586438	586443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575633
12366	NC_021172	CGT	2	6	586446	586451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575633
12367	NC_021172	TCG	2	6	586565	586570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575633
12368	NC_021172	ATT	2	6	586610	586615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575633
12369	NC_021172	GC	3	6	586625	586630	0 %	0 %	50 %	50 %	488575633
12370	NC_021172	GCA	2	6	586652	586657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575633
12371	NC_021172	TCT	2	6	586658	586663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575633
12372	NC_021172	TTC	2	6	586684	586689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575633
12373	NC_021172	GTC	2	6	586727	586732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575633
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12376	NC_021172	TTC	2	6	586789	586794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575633
12377	NC_021172	GT	3	6	586802	586807	0 %	50 %	50 %	0 %	488575633
12378	NC_021172	CA	3	6	586819	586824	50 %	0 %	0 %	50 %	488575633
12379	NC_021172	CTT	2	6	586887	586892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575633
12380	NC_021172	GAT	2	6	586920	586925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575633
12381	NC_021172	CTG	2	6	587164	587169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575633
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12383	NC_021172	GAT	2	6	587271	587276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12384	NC_021172	CGC	2	6	587300	587305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575634
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12389	NC_021172	GAT	2	6	587484	587489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575634
12390	NC_021172	GGC	2	6	587529	587534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575634
12391	NC_021172	CGA	2	6	587597	587602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575634
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12393	NC_021172	CGA	2	6	587651	587656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575634
12394	NC_021172	TGC	2	6	587692	587697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575634
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12399	NC_021172	TCG	2	6	587950	587955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575634
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12404	NC_021172	GCT	2	6	588220	588225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575635
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12413	NC_021172	GAC	2	6	588520	588525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575635
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12422	NC_021172	ACCG	2	8	588887	588894	25 %	0 %	25 %	50 %	488575635
12423	NC_021172	TGC	2	6	588918	588923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575635
12424	NC_021172	GAT	2	6	588955	588960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575635
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12426	NC_021172	GAT	2	6	588986	588991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575635
12427	NC_021172	GC	3	6	588999	589004	0 %	0 %	50 %	50 %	488575635
12428	NC_021172	TCGACC	2	12	589077	589088	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	488575635
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12430	NC_021172	GGA	2	6	589207	589212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575635
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12432	NC_021172	GCCGC	2	10	589288	589297	0 %	0 %	40 %	60 %	488575635
12433	NC_021172	CGA	2	6	589324	589329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575635
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12447	NC_021172	CTGC	2	8	589970	589977	0 %	25 %	25 %	50 %	488575635
12448	NC_021172	CATG	2	8	590050	590057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12449	NC_021172	T	6	6	590077	590082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12450	NC_021172	GCA	2	6	590084	590089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12451	NC_021172	G	6	6	590128	590133	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12452	NC_021172	TGT	2	6	590183	590188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575636
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12461	NC_021172	CTGA	2	8	590521	590528	25 %	25 %	25 %	25 %	488575636
12462	NC_021172	A	6	6	590631	590636	100 %	0 %	0 %	0 %	488575637
12463	NC_021172	GCT	2	6	590682	590687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575637
12464	NC_021172	TC	3	6	590707	590712	0 %	50 %	0 %	50 %	488575637
12465	NC_021172	GGAAT	2	10	590769	590778	40 %	20 %	40 %	0 %	488575637
12466	NC_021172	TGCC	2	8	590855	590862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12467	NC_021172	GC	4	8	590871	590878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12468	NC_021172	TCA	2	6	590884	590889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12469	NC_021172	TCT	2	6	590910	590915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12470	NC_021172	GTTAG	2	10	590947	590956	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12471	NC_021172	AAC	2	6	590958	590963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12472	NC_021172	TTTGC	2	10	590993	591002	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12473	NC_021172	CGT	2	6	591049	591054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12474	NC_021172	CGC	2	6	591072	591077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12475	NC_021172	ATT	2	6	591124	591129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12476	NC_021172	TGT	2	6	591172	591177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12477	NC_021172	CGC	2	6	591242	591247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575638
12478	NC_021172	T	6	6	591305	591310	0 %	100 %	0 %	0 %	488575638
12479	NC_021172	GGC	2	6	591328	591333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575638
12480	NC_021172	TCCG	3	12	591335	591346	0 %	25 %	25 %	50 %	488575638
12481	NC_021172	GCT	2	6	591356	591361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575638
12482	NC_021172	CG	3	6	591445	591450	0 %	0 %	50 %	50 %	488575638
12483	NC_021172	CAT	2	6	591457	591462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575638
12484	NC_021172	ATC	2	6	591483	591488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575638
12485	NC_021172	CTC	2	6	591527	591532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575638
12486	NC_021172	CG	3	6	591575	591580	0 %	0 %	50 %	50 %	488575638
12487	NC_021172	G	6	6	591583	591588	0 %	0 %	100 %	0 %	488575638
12488	NC_021172	GATCG	2	10	591626	591635	20 %	20 %	40 %	20 %	488575638
12489	NC_021172	CG	3	6	591634	591639	0 %	0 %	50 %	50 %	488575638
12490	NC_021172	TGA	2	6	591642	591647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575638
12491	NC_021172	GAC	2	6	591650	591655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575638
12492	NC_021172	ACG	2	6	591692	591697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575638
12493	NC_021172	GGC	2	6	591727	591732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575638
12494	NC_021172	TCG	2	6	591740	591745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575638
12495	NC_021172	CGT	2	6	591753	591758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575638
12496	NC_021172	CGC	2	6	591931	591936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575639
12497	NC_021172	GTC	2	6	591965	591970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575639
12498	NC_021172	TCG	4	12	591999	592010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575639
12499	NC_021172	CCGG	2	8	592060	592067	0 %	0 %	50 %	50 %	488575639
12500	NC_021172	GC	3	6	592141	592146	0 %	0 %	50 %	50 %	488575639

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