MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021172	GCGCTC	2	12	518700	518711	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	488575563
11002	NC_021172	GCC	2	6	518763	518768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575563
11003	NC_021172	AAGT	2	8	518805	518812	50 %	25 %	25 %	0 %	488575563
11004	NC_021172	CGC	2	6	518848	518853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11005	NC_021172	AGT	2	6	518930	518935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_021172	GGCAGA	2	12	518943	518954	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11007	NC_021172	GCA	2	6	518959	518964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575564
11008	NC_021172	AAAG	2	8	518967	518974	75 %	0 %	25 %	0 %	488575564
11009	NC_021172	CGA	2	6	518991	518996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575564
11010	NC_021172	CGG	2	6	519004	519009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575564
11011	NC_021172	GCACG	2	10	519029	519038	20 %	0 %	40 %	40 %	488575564
11012	NC_021172	GGC	2	6	519042	519047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575564
11013	NC_021172	CG	3	6	519089	519094	0 %	0 %	50 %	50 %	488575564
11014	NC_021172	GCT	2	6	519189	519194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575564
11015	NC_021172	CGGCA	2	10	519249	519258	20 %	0 %	40 %	40 %	488575564
11016	NC_021172	GTG	2	6	519262	519267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575564
11017	NC_021172	GCGCGA	2	12	519276	519287	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488575564
11018	NC_021172	GCC	2	6	519311	519316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575564
11019	NC_021172	ACG	2	6	519373	519378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575564
11020	NC_021172	CGC	2	6	519440	519445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575564
11021	NC_021172	TCG	2	6	519464	519469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575564
11022	NC_021172	GGA	2	6	519474	519479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575564
11023	NC_021172	AGCA	2	8	519536	519543	50 %	0 %	25 %	25 %	488575564
11024	NC_021172	TCGC	2	8	519617	519624	0 %	25 %	25 %	50 %	488575564
11025	NC_021172	GAA	2	6	519687	519692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575564
11026	NC_021172	GC	3	6	519708	519713	0 %	0 %	50 %	50 %	488575565
11027	NC_021172	CCA	2	6	519803	519808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575565
11028	NC_021172	GCC	2	6	519835	519840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575565
11029	NC_021172	CCG	2	6	519931	519936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575565
11030	NC_021172	CGG	2	6	519979	519984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575565
11031	NC_021172	GGC	2	6	520115	520120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575565
11032	NC_021172	GCGA	2	8	520133	520140	25 %	0 %	50 %	25 %	488575565
11033	NC_021172	GCCG	2	8	520278	520285	0 %	0 %	50 %	50 %	488575565
11034	NC_021172	CCG	3	9	520283	520291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575565
11035	NC_021172	CTG	2	6	520310	520315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575565
11036	NC_021172	GAT	2	6	520390	520395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575565
11037	NC_021172	TTC	2	6	520407	520412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575565
11038	NC_021172	GCTT	2	8	520438	520445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11039	NC_021172	TCG	2	6	520453	520458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_021172	GTC	2	6	520537	520542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575566
11041	NC_021172	GATG	2	8	520545	520552	25 %	25 %	50 %	0 %	488575566
11042	NC_021172	CGT	2	6	520678	520683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575566
11043	NC_021172	TG	3	6	520701	520706	0 %	50 %	50 %	0 %	488575566
11044	NC_021172	GCCA	2	8	520734	520741	25 %	0 %	25 %	50 %	488575566
11045	NC_021172	GGA	2	6	520762	520767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575566
11046	NC_021172	CGACA	2	10	520786	520795	40 %	0 %	20 %	40 %	488575566
11047	NC_021172	TTG	2	6	520817	520822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575566
11048	NC_021172	GA	3	6	520889	520894	50 %	0 %	50 %	0 %	488575566
11049	NC_021172	CGT	2	6	521056	521061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_021172	ATT	2	6	521097	521102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575567
11051	NC_021172	GGA	2	6	521144	521149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575567
11052	NC_021172	TCG	2	6	521174	521179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575567
11053	NC_021172	GGC	2	6	521323	521328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575567
11054	NC_021172	CGA	2	6	521382	521387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575567
11055	NC_021172	ATT	2	6	521503	521508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575567
11056	NC_021172	CG	3	6	521553	521558	0 %	0 %	50 %	50 %	488575567
11057	NC_021172	CTC	2	6	521559	521564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575567
11058	NC_021172	TGA	2	6	521571	521576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575567
11059	NC_021172	TAGCC	2	10	521603	521612	20 %	20 %	20 %	40 %	488575567
11060	NC_021172	T	6	6	521758	521763	0 %	100 %	0 %	0 %	488575567
11061	NC_021172	CGG	2	6	521788	521793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575567
11062	NC_021172	TTCGGC	2	12	521807	521818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575567
11063	NC_021172	GGC	2	6	521842	521847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575567
11064	NC_021172	GGGCGG	2	12	521869	521880	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	488575567
11065	NC_021172	GCG	3	9	521966	521974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575567
11066	NC_021172	CGA	2	6	522003	522008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575567
11067	NC_021172	GAA	2	6	522085	522090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575567
11068	NC_021172	GCT	2	6	522129	522134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575567
11069	NC_021172	GCA	3	9	522156	522164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575567
11070	NC_021172	GAG	2	6	522181	522186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575567
11071	NC_021172	CCG	4	12	522232	522243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575567
11072	NC_021172	CGA	2	6	522246	522251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575567
11073	NC_021172	CCCG	2	8	522281	522288	0 %	0 %	25 %	75 %	488575567
11074	NC_021172	GGC	2	6	522379	522384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_021172	A	6	6	522388	522393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_021172	TCC	2	6	522541	522546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575568
11077	NC_021172	CTTC	2	8	522551	522558	0 %	50 %	0 %	50 %	488575568
11078	NC_021172	GTG	2	6	522595	522600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575568
11079	NC_021172	CG	4	8	522774	522781	0 %	0 %	50 %	50 %	488575569
11080	NC_021172	GAA	2	6	522825	522830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575569
11081	NC_021172	CAG	2	6	522886	522891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575569
11082	NC_021172	CAT	2	6	522926	522931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575569
11083	NC_021172	GTC	2	6	522933	522938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575569
11084	NC_021172	AGC	2	6	523093	523098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575569
11085	NC_021172	GCGTC	2	10	523106	523115	0 %	20 %	40 %	40 %	488575569
11086	NC_021172	GCC	3	9	523120	523128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575569
11087	NC_021172	AGAGG	2	10	523160	523169	40 %	0 %	60 %	0 %	488575569
11088	NC_021172	ACCAA	2	10	523278	523287	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11089	NC_021172	GT	3	6	523340	523345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_021172	AAG	2	6	523393	523398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575570
11091	NC_021172	TTGC	2	8	523434	523441	0 %	50 %	25 %	25 %	488575570
11092	NC_021172	CCA	2	6	523511	523516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575570
11093	NC_021172	CGA	2	6	523666	523671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575570
11094	NC_021172	CG	3	6	523699	523704	0 %	0 %	50 %	50 %	488575570
11095	NC_021172	TCG	2	6	523750	523755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575570
11096	NC_021172	ATC	2	6	523876	523881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575570
11097	NC_021172	GACGGC	2	12	524057	524068	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488575570
11098	NC_021172	AAG	2	6	524091	524096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575570
11099	NC_021172	GAT	2	6	524163	524168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575570
11100	NC_021172	ATCG	2	8	524171	524178	25 %	25 %	25 %	25 %	488575570
11101	NC_021172	GGCC	2	8	524182	524189	0 %	0 %	50 %	50 %	488575570
11102	NC_021172	GAC	2	6	524241	524246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575570
11103	NC_021172	GGC	2	6	524300	524305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575570
11104	NC_021172	CG	3	6	524351	524356	0 %	0 %	50 %	50 %	488575570
11105	NC_021172	GA	3	6	524422	524427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_021172	GCA	2	6	524429	524434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_021172	CT	3	6	524445	524450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11108	NC_021172	TTC	2	6	524456	524461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_021172	CGT	2	6	524585	524590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_021172	TCT	2	6	524661	524666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575571
11111	NC_021172	CG	3	6	524675	524680	0 %	0 %	50 %	50 %	488575571
11112	NC_021172	CAT	2	6	524835	524840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575571
11113	NC_021172	CGC	2	6	524879	524884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575571
11114	NC_021172	ACG	2	6	524909	524914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575571
11115	NC_021172	T	6	6	524975	524980	0 %	100 %	0 %	0 %	488575571
11116	NC_021172	CTTT	2	8	525036	525043	0 %	75 %	0 %	25 %	488575571
11117	NC_021172	GC	3	6	525044	525049	0 %	0 %	50 %	50 %	488575571
11118	NC_021172	TTG	2	6	525108	525113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575571
11119	NC_021172	TTC	2	6	525215	525220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575571
11120	NC_021172	CGG	2	6	525235	525240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575571
11121	NC_021172	GGGGC	2	10	525246	525255	0 %	0 %	80 %	20 %	488575571
11122	NC_021172	TGC	2	6	525258	525263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575571
11123	NC_021172	AAG	2	6	525290	525295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575571
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11132	NC_021172	GAC	2	6	525775	525780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575571
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11139	NC_021172	TCGG	2	8	526274	526281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11140	NC_021172	CGT	2	6	526336	526341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11142	NC_021172	CA	3	6	526349	526354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11143	NC_021172	AATT	2	8	526361	526368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11144	NC_021172	T	7	7	526383	526389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11151	NC_021172	TGGC	2	8	526866	526873	0 %	25 %	50 %	25 %	488575573
11152	NC_021172	AG	3	6	526938	526943	50 %	0 %	50 %	0 %	488575573
11153	NC_021172	CGA	2	6	526944	526949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575573
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11163	NC_021172	TCTT	2	8	527422	527429	0 %	75 %	0 %	25 %	488575573
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11205	NC_021172	AT	3	6	529599	529604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11230	NC_021172	GCC	3	9	530968	530976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575578
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11237	NC_021172	ATT	2	6	531402	531407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11238	NC_021172	TGT	2	6	531556	531561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575579
11239	NC_021172	CGATC	2	10	531567	531576	20 %	20 %	20 %	40 %	488575579
11240	NC_021172	GAT	2	6	531581	531586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575579
11241	NC_021172	GGC	2	6	531683	531688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575579
11242	NC_021172	CTG	2	6	531738	531743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11243	NC_021172	GCT	2	6	531856	531861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11244	NC_021172	GGC	2	6	531865	531870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11245	NC_021172	T	6	6	531882	531887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11246	NC_021172	GTC	2	6	531900	531905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11247	NC_021172	CTG	2	6	531967	531972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11248	NC_021172	CGC	2	6	531973	531978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11249	NC_021172	GCC	2	6	531979	531984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11250	NC_021172	ATG	2	6	531985	531990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11251	NC_021172	GAC	2	6	532007	532012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11252	NC_021172	GAT	2	6	532073	532078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11253	NC_021172	AAG	2	6	532106	532111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11254	NC_021172	CGC	2	6	532213	532218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575580
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11344	NC_021172	GCG	2	6	536937	536942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11345	NC_021172	CATT	2	8	536948	536955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11346	NC_021172	GCA	2	6	536977	536982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11348	NC_021172	ACG	2	6	537038	537043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575583
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11351	NC_021172	GC	3	6	537128	537133	0 %	0 %	50 %	50 %	488575583
11352	NC_021172	CGT	2	6	537172	537177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575583
11353	NC_021172	TCGCA	2	10	537200	537209	20 %	20 %	20 %	40 %	488575583
11354	NC_021172	CGA	2	6	537285	537290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575583
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11356	NC_021172	CTG	3	9	537374	537382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575583
11357	NC_021172	CGC	2	6	537431	537436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575583
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11359	NC_021172	ATC	2	6	537554	537559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575583
11360	NC_021172	TCG	2	6	537597	537602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575583
11361	NC_021172	GCG	2	6	537617	537622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575583
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11364	NC_021172	TGG	2	6	537710	537715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575583
11365	NC_021172	GCG	2	6	537782	537787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575583
11366	NC_021172	CAA	2	6	537808	537813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575583
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11368	NC_021172	TGC	2	6	537900	537905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575583
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11370	NC_021172	CG	3	6	537981	537986	0 %	0 %	50 %	50 %	488575583
11371	NC_021172	ACG	2	6	538014	538019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575583
11372	NC_021172	CGG	2	6	538057	538062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575583
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11374	NC_021172	CGT	2	6	538143	538148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575583
11375	NC_021172	TGC	2	6	538200	538205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575583
11376	NC_021172	ATC	2	6	538214	538219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575583
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11410	NC_021172	A	6	6	539577	539582	100 %	0 %	0 %	0 %	488575583
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11412	NC_021172	GGCGAT	2	12	539615	539626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	488575583
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11414	NC_021172	GGA	2	6	539752	539757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575583
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11420	NC_021172	GGC	2	6	539915	539920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575583
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11423	NC_021172	TCG	4	12	540033	540044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575583
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11430	NC_021172	CGT	3	9	540300	540308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575584
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11450	NC_021172	GGCT	2	8	540922	540929	0 %	25 %	50 %	25 %	488575584
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11453	NC_021172	ACCT	2	8	541169	541176	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11454	NC_021172	ATTG	2	8	541273	541280	25 %	50 %	25 %	0 %	488575585
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11462	NC_021172	GCT	2	6	541579	541584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575585
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11479	NC_021172	ACT	2	6	542202	542207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575585
11480	NC_021172	CTT	2	6	542215	542220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575585
11481	NC_021172	TGG	2	6	542324	542329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575585
11482	NC_021172	ATG	3	9	542362	542370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575585
11483	NC_021172	GAC	2	6	542397	542402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575585
11484	NC_021172	ACC	2	6	542477	542482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575585
11485	NC_021172	CGA	2	6	542492	542497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575585
11486	NC_021172	CTG	2	6	542533	542538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575585
11487	NC_021172	TGC	2	6	542556	542561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575585
11488	NC_021172	CTT	3	9	542565	542573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575585
11489	NC_021172	CAT	2	6	542601	542606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575585
11490	NC_021172	CCTGAA	2	12	542616	542627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488575585
11491	NC_021172	GGGTGC	2	12	542739	542750	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	488575585
11492	NC_021172	AGC	2	6	542899	542904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575585
11493	NC_021172	AGGC	2	8	542912	542919	25 %	0 %	50 %	25 %	488575585
11494	NC_021172	GCT	2	6	542937	542942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575585
11495	NC_021172	CGGAC	2	10	543023	543032	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11496	NC_021172	TCG	2	6	543113	543118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11497	NC_021172	ATG	2	6	543260	543265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575586
11498	NC_021172	CGT	2	6	543298	543303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575586
11499	NC_021172	TTG	2	6	543305	543310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575586
11500	NC_021172	CGTC	2	8	543354	543361	0 %	25 %	25 %	50 %	488575586

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