MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 82987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021172	GCTG	2	8	495209	495216	0 %	25 %	50 %	25 %	488575540
10503	NC_021172	GGT	2	6	495255	495260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575540
10504	NC_021172	CGT	2	6	495375	495380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575540
10505	NC_021172	GTC	2	6	495403	495408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575540
10506	NC_021172	AGG	2	6	495488	495493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575540
10507	NC_021172	CGAAA	2	10	495501	495510	60 %	0 %	20 %	20 %	488575540
10508	NC_021172	GTC	3	9	495511	495519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575540
10509	NC_021172	CGT	2	6	495645	495650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575540
10510	NC_021172	ACA	2	6	495668	495673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575540
10511	NC_021172	ATT	2	6	495723	495728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575540
10512	NC_021172	TTCG	2	8	495753	495760	0 %	50 %	25 %	25 %	488575540
10513	NC_021172	TGA	2	6	495782	495787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575540
10514	NC_021172	TCG	2	6	495788	495793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575540
10515	NC_021172	CGT	2	6	495819	495824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575540
10516	NC_021172	TCA	2	6	495830	495835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575540
10517	NC_021172	TCC	2	6	495876	495881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575540
10518	NC_021172	TTCT	2	8	495985	495992	0 %	75 %	0 %	25 %	488575540
10519	NC_021172	GAT	2	6	496023	496028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575540
10520	NC_021172	TCG	2	6	496097	496102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575540
10521	NC_021172	TGG	2	6	496103	496108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575540
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10524	NC_021172	ATC	2	6	496193	496198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575540
10525	NC_021172	TGA	2	6	496239	496244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575540
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10531	NC_021172	GAA	2	6	496584	496589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575540
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10539	NC_021172	CT	3	6	496861	496866	0 %	50 %	0 %	50 %	488575540
10540	NC_021172	CCGG	2	8	496881	496888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10541	NC_021172	CGG	2	6	496897	496902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_021172	CGAT	2	8	496921	496928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10543	NC_021172	TCCG	2	8	496973	496980	0 %	25 %	25 %	50 %	488575541
10544	NC_021172	GAT	2	6	496998	497003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575541
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10550	NC_021172	TGC	2	6	497268	497273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575542
10551	NC_021172	GC	3	6	497283	497288	0 %	0 %	50 %	50 %	488575542
10552	NC_021172	TGG	2	6	497354	497359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575542
10553	NC_021172	GTC	2	6	497464	497469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575542
10554	NC_021172	CGA	2	6	497522	497527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575542
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10557	NC_021172	TCG	2	6	497611	497616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575542
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10565	NC_021172	CGC	2	6	497862	497867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575543
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10573	NC_021172	GCC	2	6	498252	498257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575544
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10576	NC_021172	CGAA	2	8	498410	498417	50 %	0 %	25 %	25 %	488575544
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10579	NC_021172	GCG	2	6	498467	498472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575544
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10592	NC_021172	GCTC	2	8	499166	499173	0 %	25 %	25 %	50 %	488575546
10593	NC_021172	GAA	2	6	499245	499250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575546
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10596	NC_021172	AAAT	2	8	499318	499325	75 %	25 %	0 %	0 %	488575546
10597	NC_021172	CGTC	2	8	499358	499365	0 %	25 %	25 %	50 %	488575546
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10601	NC_021172	CTT	2	6	499592	499597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575546
10602	NC_021172	TGC	2	6	499603	499608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575546
10603	NC_021172	GC	3	6	499622	499627	0 %	0 %	50 %	50 %	488575546
10604	NC_021172	TCG	2	6	499663	499668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575546
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10607	NC_021172	CAT	2	6	499728	499733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575546
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10609	NC_021172	C	6	6	499849	499854	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10610	NC_021172	AAT	2	6	499864	499869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_021172	GC	3	6	499904	499909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10612	NC_021172	AT	3	6	499930	499935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_021172	AGA	2	6	499938	499943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_021172	TTA	2	6	500009	500014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488575547
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10616	NC_021172	TTG	2	6	500112	500117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575547
10617	NC_021172	GCC	2	6	500144	500149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575547
10618	NC_021172	AAG	2	6	500157	500162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575547
10619	NC_021172	TCA	2	6	500239	500244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575547
10620	NC_021172	CAG	2	6	500309	500314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575547
10621	NC_021172	AGC	2	6	500328	500333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575547
10622	NC_021172	ATGCCT	2	12	500367	500378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488575547
10623	NC_021172	GGCG	2	8	500395	500402	0 %	0 %	75 %	25 %	488575547
10624	NC_021172	TTC	2	6	500448	500453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575547
10625	NC_021172	GCG	2	6	500499	500504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575547
10626	NC_021172	CCTT	2	8	500509	500516	0 %	50 %	0 %	50 %	488575547
10627	NC_021172	AAG	2	6	500552	500557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575547
10628	NC_021172	GC	5	10	500610	500619	0 %	0 %	50 %	50 %	488575547
10629	NC_021172	CAT	2	6	500626	500631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575547
10630	NC_021172	CAT	2	6	500650	500655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575547
10631	NC_021172	CGC	2	6	500665	500670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575547
10632	NC_021172	CGG	2	6	500704	500709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575547
10633	NC_021172	GCG	2	6	500718	500723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575547
10634	NC_021172	GCC	3	9	500727	500735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575547
10635	NC_021172	GC	3	6	500742	500747	0 %	0 %	50 %	50 %	488575547
10636	NC_021172	GT	3	6	500770	500775	0 %	50 %	50 %	0 %	488575547
10637	NC_021172	TC	3	6	500805	500810	0 %	50 %	0 %	50 %	488575547
10638	NC_021172	CGA	2	6	500821	500826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575547
10639	NC_021172	GGC	2	6	500895	500900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575547
10640	NC_021172	CG	3	6	500948	500953	0 %	0 %	50 %	50 %	488575547
10641	NC_021172	AAGT	2	8	501173	501180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10642	NC_021172	TGG	2	6	501203	501208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10643	NC_021172	GGC	2	6	501242	501247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10644	NC_021172	CGG	2	6	501255	501260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10645	NC_021172	GAT	2	6	501352	501357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575548
10646	NC_021172	AC	3	6	501423	501428	50 %	0 %	0 %	50 %	488575548
10647	NC_021172	CAC	2	6	501434	501439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575548
10648	NC_021172	CCCG	2	8	501504	501511	0 %	0 %	25 %	75 %	488575548
10649	NC_021172	CTG	2	6	501634	501639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575548
10650	NC_021172	AAAT	2	8	501641	501648	75 %	25 %	0 %	0 %	488575548
10651	NC_021172	GAC	2	6	501668	501673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575548
10652	NC_021172	TTC	2	6	501763	501768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10653	NC_021172	A	7	7	501774	501780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10654	NC_021172	GCA	2	6	501827	501832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10655	NC_021172	AGGC	2	8	501846	501853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10656	NC_021172	TTG	2	6	501868	501873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575549
10657	NC_021172	GCAAAA	2	12	502000	502011	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488575549
10658	NC_021172	AAGA	2	8	502065	502072	75 %	0 %	25 %	0 %	488575549
10659	NC_021172	CATGGG	2	12	502190	502201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	488575549
10660	NC_021172	GAC	2	6	502325	502330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575549
10661	NC_021172	GC	3	6	502336	502341	0 %	0 %	50 %	50 %	488575549
10662	NC_021172	CGC	2	6	502466	502471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575549
10663	NC_021172	TGA	2	6	502535	502540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575549
10664	NC_021172	CTT	2	6	502550	502555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575549
10665	NC_021172	GAA	2	6	502574	502579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575549
10666	NC_021172	CGA	2	6	502637	502642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575549
10667	NC_021172	TCGGA	2	10	502654	502663	20 %	20 %	40 %	20 %	488575549
10668	NC_021172	GGAGCC	2	12	502712	502723	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488575549
10669	NC_021172	CGAT	2	8	502780	502787	25 %	25 %	25 %	25 %	488575550
10670	NC_021172	CG	3	6	502876	502881	0 %	0 %	50 %	50 %	488575550
10671	NC_021172	GC	3	6	502882	502887	0 %	0 %	50 %	50 %	488575550
10672	NC_021172	CTA	2	6	502946	502951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575550
10673	NC_021172	AACA	2	8	502965	502972	75 %	0 %	0 %	25 %	488575550
10674	NC_021172	GGC	2	6	502973	502978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575550
10675	NC_021172	ATG	2	6	503022	503027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575550
10676	NC_021172	TCA	2	6	503038	503043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575550
10677	NC_021172	CAGT	2	8	503057	503064	25 %	25 %	25 %	25 %	488575550
10678	NC_021172	TCG	2	6	503115	503120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575550
10679	NC_021172	TCG	2	6	503209	503214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575550
10680	NC_021172	GAAA	2	8	503312	503319	75 %	0 %	25 %	0 %	488575550
10681	NC_021172	CTC	2	6	503352	503357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488575550
10682	NC_021172	CGAG	2	8	503386	503393	25 %	0 %	50 %	25 %	488575550
10683	NC_021172	TGA	2	6	503457	503462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575550
10684	NC_021172	CGC	2	6	503484	503489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575551
10685	NC_021172	CGA	2	6	503506	503511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575551
10686	NC_021172	CAA	2	6	503541	503546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575551
10687	NC_021172	GTG	2	6	503565	503570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575551
10688	NC_021172	GAA	2	6	503698	503703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488575551
10689	NC_021172	AGG	2	6	503772	503777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575551
10690	NC_021172	GCGCG	2	10	503785	503794	0 %	0 %	60 %	40 %	488575551
10691	NC_021172	CGA	3	9	503811	503819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575551
10692	NC_021172	CGG	2	6	503827	503832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575551
10693	NC_021172	CGA	2	6	503908	503913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575551
10694	NC_021172	CGG	2	6	503965	503970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575551
10695	NC_021172	GGC	2	6	503972	503977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575551
10696	NC_021172	TGC	2	6	503979	503984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575551
10697	NC_021172	A	6	6	503991	503996	100 %	0 %	0 %	0 %	488575551
10698	NC_021172	GCC	2	6	504057	504062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575551
10699	NC_021172	CGA	2	6	504082	504087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575551
10700	NC_021172	AAATCA	2	12	504093	504104	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	488575551
10701	NC_021172	TGG	2	6	504154	504159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575551
10702	NC_021172	TGCA	2	8	504289	504296	25 %	25 %	25 %	25 %	488575551
10703	NC_021172	GCT	2	6	504434	504439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575551
10704	NC_021172	TGG	2	6	504441	504446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575551
10705	NC_021172	ATG	2	6	504513	504518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575551
10706	NC_021172	CAC	2	6	504550	504555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488575551
10707	NC_021172	GCG	2	6	504601	504606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575551
10708	NC_021172	TGA	2	6	504627	504632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575551
10709	NC_021172	CGC	2	6	504658	504663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575551
10710	NC_021172	ATA	2	6	504669	504674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488575551
10711	NC_021172	GGA	2	6	504694	504699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488575551
10712	NC_021172	GCG	3	9	504722	504730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575551
10713	NC_021172	GGC	2	6	504785	504790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575551
10714	NC_021172	GCC	2	6	504797	504802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10715	NC_021172	GATCTC	2	12	504883	504894	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488575552
10716	NC_021172	ATCG	2	8	504897	504904	25 %	25 %	25 %	25 %	488575552
10717	NC_021172	GC	3	6	504963	504968	0 %	0 %	50 %	50 %	488575552
10718	NC_021172	GAT	2	6	505153	505158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488575552
10719	NC_021172	CG	3	6	505178	505183	0 %	0 %	50 %	50 %	488575552
10720	NC_021172	GCT	2	6	505210	505215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575552
10721	NC_021172	TGC	2	6	505305	505310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575552
10722	NC_021172	CAG	2	6	505327	505332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575552
10723	NC_021172	CGA	2	6	505455	505460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575552
10724	NC_021172	CTG	2	6	505465	505470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575552
10725	NC_021172	TTC	2	6	505489	505494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575552
10726	NC_021172	CG	4	8	505505	505512	0 %	0 %	50 %	50 %	488575552
10727	NC_021172	GC	3	6	505533	505538	0 %	0 %	50 %	50 %	488575552
10728	NC_021172	TCG	2	6	505639	505644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575552
10729	NC_021172	TGC	2	6	505713	505718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575552
10730	NC_021172	CGC	2	6	505760	505765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575552
10731	NC_021172	CAA	2	6	505815	505820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488575552
10732	NC_021172	GCC	2	6	505882	505887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575552
10733	NC_021172	CTG	2	6	505897	505902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575552
10734	NC_021172	TGC	2	6	505917	505922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575552
10735	NC_021172	AAGATG	2	12	506110	506121	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	488575552
10736	NC_021172	TCC	2	6	506218	506223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10737	NC_021172	TTCC	2	8	506235	506242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10738	NC_021172	ACG	2	6	506264	506269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10739	NC_021172	GCTT	2	8	506286	506293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10740	NC_021172	GCA	2	6	506388	506393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575553
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10742	NC_021172	GGC	2	6	506524	506529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575553
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10746	NC_021172	GCTG	2	8	506649	506656	0 %	25 %	50 %	25 %	488575553
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10980	NC_021172	GCT	2	6	517492	517497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575562
10981	NC_021172	GATG	2	8	517514	517521	25 %	25 %	50 %	0 %	488575562
10982	NC_021172	TCA	2	6	517571	517576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488575562
10983	NC_021172	GC	3	6	517589	517594	0 %	0 %	50 %	50 %	488575562
10984	NC_021172	CGT	2	6	517704	517709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575562
10985	NC_021172	GCGCC	2	10	517741	517750	0 %	0 %	40 %	60 %	488575562
10986	NC_021172	GCA	2	6	517815	517820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575562
10987	NC_021172	CGA	2	6	517875	517880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488575562
10988	NC_021172	CGT	2	6	517955	517960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575562
10989	NC_021172	CGT	2	6	518010	518015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488575562
10990	NC_021172	TCCGC	2	10	518061	518070	0 %	20 %	20 %	60 %	488575562
10991	NC_021172	GCC	2	6	518077	518082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575562
10992	NC_021172	TTC	2	6	518187	518192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488575562
10993	NC_021172	TGG	2	6	518261	518266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488575562
10994	NC_021172	TTG	2	6	518294	518299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488575562
10995	NC_021172	CGG	2	6	518327	518332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575562
10996	NC_021172	CGGA	2	8	518340	518347	25 %	0 %	50 %	25 %	488575562
10997	NC_021172	GC	3	6	518419	518424	0 %	0 %	50 %	50 %	488575562
10998	NC_021172	ATTGCG	2	12	518482	518493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	488575562
10999	NC_021172	CGC	2	6	518504	518509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488575562
11000	NC_021172	GGC	2	6	518578	518583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488575562

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