MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori OK113 DNA

Total Repeats: 33717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020508	TGGTTT	2	12	241322	241333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164636
5002	NC_020508	GCT	2	6	241381	241386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470164636
5003	NC_020508	GTG	3	9	241430	241438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164636
5004	NC_020508	AGGGCC	2	12	241528	241539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470164636
5005	NC_020508	GTG	2	6	241622	241627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164636
5006	NC_020508	GTT	2	6	241744	241749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164636
5007	NC_020508	GA	3	6	241879	241884	50 %	0 %	50 %	0 %	470164636
5008	NC_020508	AG	4	8	241886	241893	50 %	0 %	50 %	0 %	470164636
5009	NC_020508	T	6	6	241903	241908	0 %	100 %	0 %	0 %	470164636
5010	NC_020508	ATTAG	2	10	241931	241940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_020508	TTC	2	6	241945	241950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_020508	ATGAT	2	10	241959	241968	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_020508	A	14	14	242037	242050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_020508	T	6	6	242063	242068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_020508	AT	3	6	242082	242087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_020508	GAAA	2	8	242161	242168	75 %	0 %	25 %	0 %	470164637
5017	NC_020508	TGT	2	6	242221	242226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164637
5018	NC_020508	TGG	2	6	242236	242241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164637
5019	NC_020508	CGGC	2	8	242263	242270	0 %	0 %	50 %	50 %	470164637
5020	NC_020508	TGG	2	6	242281	242286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164637
5021	NC_020508	GGCGT	2	10	242298	242307	0 %	20 %	60 %	20 %	470164637
5022	NC_020508	TTTTG	2	10	242330	242339	0 %	80 %	20 %	0 %	470164637
5023	NC_020508	T	7	7	242342	242348	0 %	100 %	0 %	0 %	470164637
5024	NC_020508	GAT	2	6	242363	242368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164637
5025	NC_020508	CGGC	2	8	242377	242384	0 %	0 %	50 %	50 %	470164637
5026	NC_020508	CTTG	2	8	242615	242622	0 %	50 %	25 %	25 %	470164637
5027	NC_020508	A	7	7	242664	242670	100 %	0 %	0 %	0 %	470164637
5028	NC_020508	ATGC	2	8	242727	242734	25 %	25 %	25 %	25 %	470164637
5029	NC_020508	TTTCA	2	10	242772	242781	20 %	60 %	0 %	20 %	470164637
5030	NC_020508	A	6	6	242792	242797	100 %	0 %	0 %	0 %	470164637
5031	NC_020508	TTG	2	6	242823	242828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164637
5032	NC_020508	CTTT	2	8	242838	242845	0 %	75 %	0 %	25 %	470164637
5033	NC_020508	ATT	2	6	242895	242900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164637
5034	NC_020508	ATC	2	6	242958	242963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164637
5035	NC_020508	T	7	7	243053	243059	0 %	100 %	0 %	0 %	470164637
5036	NC_020508	GGTGAT	2	12	243137	243148	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470164637
5037	NC_020508	TTTC	2	8	243151	243158	0 %	75 %	0 %	25 %	470164637
5038	NC_020508	ATT	2	6	243180	243185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164637
5039	NC_020508	A	7	7	243192	243198	100 %	0 %	0 %	0 %	470164637
5040	NC_020508	TGG	2	6	243277	243282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164637
5041	NC_020508	GCC	2	6	243408	243413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_020508	GT	3	6	243462	243467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_020508	T	6	6	243467	243472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_020508	ATG	2	6	243490	243495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_020508	TTAT	2	8	243499	243506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_020508	A	6	6	243515	243520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_020508	TAA	2	6	243537	243542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_020508	TCAATA	2	12	243554	243565	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470164638
5049	NC_020508	TCT	2	6	243599	243604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164638
5050	NC_020508	TGG	2	6	243649	243654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164638
5051	NC_020508	GTT	2	6	243734	243739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164638
5052	NC_020508	GTG	2	6	243762	243767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164638
5053	NC_020508	TGA	2	6	243871	243876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164638
5054	NC_020508	A	6	6	243968	243973	100 %	0 %	0 %	0 %	470164638
5055	NC_020508	ATA	2	6	243977	243982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164638
5056	NC_020508	A	6	6	243992	243997	100 %	0 %	0 %	0 %	470164638
5057	NC_020508	CACGCC	2	12	244034	244045	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470164638
5058	NC_020508	AATC	2	8	244076	244083	50 %	25 %	0 %	25 %	470164638
5059	NC_020508	GTT	2	6	244100	244105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164638
5060	NC_020508	TGG	2	6	244117	244122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164638
5061	NC_020508	GA	3	6	244154	244159	50 %	0 %	50 %	0 %	470164638
5062	NC_020508	T	6	6	244213	244218	0 %	100 %	0 %	0 %	470164638
5063	NC_020508	TAA	2	6	244276	244281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164638
5064	NC_020508	TTGG	2	8	244333	244340	0 %	50 %	50 %	0 %	470164638
5065	NC_020508	TTC	2	6	244360	244365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164638
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5067	NC_020508	ATCA	2	8	244394	244401	50 %	25 %	0 %	25 %	470164638
5068	NC_020508	TAA	2	6	244519	244524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164638
5069	NC_020508	ATT	2	6	244574	244579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164638
5070	NC_020508	CT	3	6	244764	244769	0 %	50 %	0 %	50 %	470164638
5071	NC_020508	GTTT	2	8	244818	244825	0 %	75 %	25 %	0 %	470164638
5072	NC_020508	T	7	7	245002	245008	0 %	100 %	0 %	0 %	470164638
5073	NC_020508	TTTA	2	8	245064	245071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_020508	TAA	2	6	245110	245115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_020508	T	8	8	245143	245150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_020508	T	7	7	245302	245308	0 %	100 %	0 %	0 %	470164639
5077	NC_020508	ATA	2	6	245310	245315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164639
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5080	NC_020508	GTT	2	6	245499	245504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164639
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5090	NC_020508	TCA	2	6	245791	245796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164639
5091	NC_020508	TCT	2	6	245872	245877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164639
5092	NC_020508	ATC	2	6	245926	245931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164639
5093	NC_020508	TAT	2	6	245975	245980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5095	NC_020508	CTT	2	6	246076	246081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164640
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5097	NC_020508	CCAG	2	8	246212	246219	25 %	0 %	25 %	50 %	470164640
5098	NC_020508	T	6	6	246319	246324	0 %	100 %	0 %	0 %	470164640
5099	NC_020508	GAT	2	6	246337	246342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164640
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5102	NC_020508	TGG	2	6	246587	246592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164640
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5104	NC_020508	AAG	2	6	246635	246640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164640
5105	NC_020508	GCTAGG	2	12	246652	246663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470164640
5106	NC_020508	GAGC	2	8	246665	246672	25 %	0 %	50 %	25 %	470164640
5107	NC_020508	A	6	6	246859	246864	100 %	0 %	0 %	0 %	470164641
5108	NC_020508	GTGG	2	8	246895	246902	0 %	25 %	75 %	0 %	470164641
5109	NC_020508	CT	3	6	246975	246980	0 %	50 %	0 %	50 %	470164641
5110	NC_020508	AGA	2	6	247017	247022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164641
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5112	NC_020508	GAA	2	6	247051	247056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164641
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5115	NC_020508	TAA	2	6	247194	247199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164641
5116	NC_020508	GGAG	2	8	247201	247208	25 %	0 %	75 %	0 %	470164641
5117	NC_020508	GGAG	2	8	247210	247217	25 %	0 %	75 %	0 %	470164641
5118	NC_020508	T	7	7	247443	247449	0 %	100 %	0 %	0 %	470164641
5119	NC_020508	TAG	2	6	247455	247460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164641
5120	NC_020508	CTA	2	6	247463	247468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164641
5121	NC_020508	TAATT	2	10	247510	247519	40 %	60 %	0 %	0 %	470164641
5122	NC_020508	A	6	6	247530	247535	100 %	0 %	0 %	0 %	470164642
5123	NC_020508	AGA	2	6	247576	247581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164642
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5127	NC_020508	AAG	2	6	247656	247661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164642
5128	NC_020508	TTA	2	6	247669	247674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164642
5129	NC_020508	GAA	2	6	247718	247723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164642
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5140	NC_020508	GCT	2	6	248129	248134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470164642
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5167	NC_020508	TGG	2	6	249149	249154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164643
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5172	NC_020508	TTAG	2	8	249544	249551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_020508	TAAAA	2	10	249588	249597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5174	NC_020508	G	6	6	249657	249662	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5236	NC_020508	CT	3	6	252687	252692	0 %	50 %	0 %	50 %	470164648
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5243	NC_020508	A	6	6	252989	252994	100 %	0 %	0 %	0 %	470164648
5244	NC_020508	CT	3	6	253128	253133	0 %	50 %	0 %	50 %	470164648
5245	NC_020508	TCA	2	6	253251	253256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164648
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5247	NC_020508	GTT	2	6	253322	253327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164648
5248	NC_020508	TCT	2	6	253332	253337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164648
5249	NC_020508	CT	3	6	253346	253351	0 %	50 %	0 %	50 %	470164648
5250	NC_020508	A	6	6	253430	253435	100 %	0 %	0 %	0 %	470164648
5251	NC_020508	TCTTTA	2	12	253449	253460	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470164648
5252	NC_020508	A	6	6	253511	253516	100 %	0 %	0 %	0 %	470164648
5253	NC_020508	TGG	2	6	253537	253542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164648
5254	NC_020508	AC	3	6	253649	253654	50 %	0 %	0 %	50 %	470164648
5255	NC_020508	C	6	6	253709	253714	0 %	0 %	0 %	100 %	470164648
5256	NC_020508	TCA	2	6	253896	253901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164648
5257	NC_020508	TCT	2	6	253986	253991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164648
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5259	NC_020508	T	6	6	254177	254182	0 %	100 %	0 %	0 %	470164648
5260	NC_020508	A	6	6	254193	254198	100 %	0 %	0 %	0 %	470164648
5261	NC_020508	AT	3	6	254226	254231	50 %	50 %	0 %	0 %	470164648
5262	NC_020508	GCAT	2	8	254317	254324	25 %	25 %	25 %	25 %	470164648
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5267	NC_020508	CT	3	6	254694	254699	0 %	50 %	0 %	50 %	470164649
5268	NC_020508	ATC	2	6	254738	254743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164649
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5276	NC_020508	CTTT	2	8	255096	255103	0 %	75 %	0 %	25 %	470164649
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5279	NC_020508	GCG	2	6	255189	255194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470164649
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5313	NC_020508	TCAT	2	8	256994	257001	25 %	50 %	0 %	25 %	470164651
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5321	NC_020508	T	6	6	257183	257188	0 %	100 %	0 %	0 %	470164652
5322	NC_020508	AAT	2	6	257213	257218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164652
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5324	NC_020508	CTT	2	6	257284	257289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5361	NC_020508	T	7	7	258988	258994	0 %	100 %	0 %	0 %	470164654
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5365	NC_020508	GTTTTT	2	12	259085	259096	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470164655
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5371	NC_020508	T	8	8	259429	259436	0 %	100 %	0 %	0 %	470164656
5372	NC_020508	T	6	6	259480	259485	0 %	100 %	0 %	0 %	470164656
5373	NC_020508	ACC	2	6	259497	259502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164656
5374	NC_020508	TGT	3	9	259564	259572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164656
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5376	NC_020508	TAAT	2	8	259728	259735	50 %	50 %	0 %	0 %	470164656
5377	NC_020508	CCA	2	6	259765	259770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164656
5378	NC_020508	T	6	6	259890	259895	0 %	100 %	0 %	0 %	470164656
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5381	NC_020508	CCT	2	6	260073	260078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470164656
5382	NC_020508	AGA	2	6	260102	260107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164656
5383	NC_020508	G	6	6	260144	260149	0 %	0 %	100 %	0 %	470164656
5384	NC_020508	AGG	2	6	260152	260157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470164656
5385	NC_020508	ATC	2	6	260163	260168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164656
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5389	NC_020508	TCAA	2	8	260419	260426	50 %	25 %	0 %	25 %	470164656
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5402	NC_020508	TGA	2	6	261029	261034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164657
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5405	NC_020508	A	6	6	261409	261414	100 %	0 %	0 %	0 %	470164657
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5420	NC_020508	A	6	6	262136	262141	100 %	0 %	0 %	0 %	470164658
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5464	NC_020508	TTC	2	6	264373	264378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164660
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5500	NC_020508	AG	3	6	266316	266321	50 %	0 %	50 %	0 %	470164661

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