MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori OK113 DNA

Total Repeats: 33717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020508	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	470164401
2	NC_020508	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	470164401
3	NC_020508	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164401
4	NC_020508	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	470164401
5	NC_020508	AAGC	2	8	295	302	50 %	0 %	25 %	25 %	470164401
6	NC_020508	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	470164401
7	NC_020508	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	470164401
8	NC_020508	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164401
9	NC_020508	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470164401
10	NC_020508	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164401
11	NC_020508	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	470164401
12	NC_020508	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164402
13	NC_020508	TTA	2	6	493	498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164402
14	NC_020508	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	470164402
15	NC_020508	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164402
16	NC_020508	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470164402
17	NC_020508	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	470164402
18	NC_020508	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164402
19	NC_020508	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	470164402
20	NC_020508	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164402
21	NC_020508	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	470164403
22	NC_020508	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164403
23	NC_020508	CCGCAG	2	12	1043	1054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470164403
24	NC_020508	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164403
25	NC_020508	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470164403
26	NC_020508	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	470164403
27	NC_020508	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	470164403
28	NC_020508	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	470164403
29	NC_020508	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	470164403
30	NC_020508	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470164403
31	NC_020508	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	470164403
32	NC_020508	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	470164403
33	NC_020508	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	470164403
34	NC_020508	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164403
35	NC_020508	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164403
36	NC_020508	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164403
37	NC_020508	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164404
38	NC_020508	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	470164404
39	NC_020508	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	470164404
40	NC_020508	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164404
41	NC_020508	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	470164404
42	NC_020508	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	470164404
43	NC_020508	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164404
44	NC_020508	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	470164404
45	NC_020508	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164404
46	NC_020508	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164404
47	NC_020508	CAT	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164404
48	NC_020508	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	470164404
49	NC_020508	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164404
50	NC_020508	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164404
51	NC_020508	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	470164404
52	NC_020508	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	470164404
53	NC_020508	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	470164404
54	NC_020508	TTTGT	2	10	2424	2433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020508	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020508	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	470164405
57	NC_020508	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	470164405
58	NC_020508	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	470164405
59	NC_020508	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	470164405
60	NC_020508	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470164405
61	NC_020508	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	470164405
62	NC_020508	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	470164405
63	NC_020508	AATTA	2	10	2924	2933	60 %	40 %	0 %	0 %	470164405
64	NC_020508	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	470164405
65	NC_020508	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164405
66	NC_020508	T	6	6	3020	3025	0 %	100 %	0 %	0 %	470164405
67	NC_020508	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164405
68	NC_020508	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164405
69	NC_020508	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470164405
70	NC_020508	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	470164406
71	NC_020508	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	470164406
72	NC_020508	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	470164406
73	NC_020508	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	470164406
74	NC_020508	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164406
75	NC_020508	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164406
76	NC_020508	GCGATA	2	12	3727	3738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470164406
77	NC_020508	GCA	2	6	3774	3779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470164406
78	NC_020508	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	470164406
79	NC_020508	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164406
80	NC_020508	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470164406
81	NC_020508	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020508	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020508	TAT	2	6	4143	4148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020508	TGG	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020508	ATGC	2	8	4284	4291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020508	TGG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020508	GTG	2	6	4416	4421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020508	ACC	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_020508	GGT	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020508	T	7	7	4600	4606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020508	AAT	2	6	4621	4626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020508	A	6	6	4695	4700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020508	GTT	2	6	4752	4757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020508	A	6	6	4782	4787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020508	ATT	2	6	4816	4821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020508	T	6	6	4834	4839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020508	A	6	6	4844	4849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020508	A	6	6	4860	4865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020508	TGT	2	6	4899	4904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020508	TTTTA	2	10	4923	4932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020508	TC	3	6	4968	4973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020508	A	6	6	5002	5007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020508	T	7	7	5012	5018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020508	ACTA	2	8	5054	5061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020508	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020508	AGT	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020508	AAAAAG	2	12	5151	5162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020508	C	6	6	5169	5174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_020508	A	7	7	5188	5194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020508	A	6	6	5205	5210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020508	CCATG	2	10	5362	5371	20 %	20 %	20 %	40 %	470164407
112	NC_020508	GCTT	2	8	5387	5394	0 %	50 %	25 %	25 %	470164407
113	NC_020508	T	6	6	5393	5398	0 %	100 %	0 %	0 %	470164407
114	NC_020508	ATTC	2	8	5414	5421	25 %	50 %	0 %	25 %	470164407
115	NC_020508	CATT	2	8	5458	5465	25 %	50 %	0 %	25 %	470164407
116	NC_020508	ATT	2	6	5480	5485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164407
117	NC_020508	TGG	2	6	5578	5583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164407
118	NC_020508	A	6	6	5690	5695	100 %	0 %	0 %	0 %	470164407
119	NC_020508	A	6	6	5732	5737	100 %	0 %	0 %	0 %	470164407
120	NC_020508	TTGT	2	8	5738	5745	0 %	75 %	25 %	0 %	470164407
121	NC_020508	GTT	2	6	5780	5785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
122	NC_020508	TAA	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164407
123	NC_020508	TTGA	2	8	5870	5877	25 %	50 %	25 %	0 %	470164407
124	NC_020508	TTA	2	6	5907	5912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164407
125	NC_020508	GTG	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164407
126	NC_020508	GTT	2	6	5996	6001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
127	NC_020508	GC	3	6	6038	6043	0 %	0 %	50 %	50 %	470164407
128	NC_020508	TGT	2	6	6097	6102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
129	NC_020508	C	6	6	6142	6147	0 %	0 %	0 %	100 %	470164407
130	NC_020508	TTTGA	2	10	6251	6260	20 %	60 %	20 %	0 %	470164407
131	NC_020508	AGA	2	6	6329	6334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164407
132	NC_020508	TCA	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164407
133	NC_020508	T	7	7	6631	6637	0 %	100 %	0 %	0 %	470164407
134	NC_020508	GTT	2	6	6638	6643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
135	NC_020508	TAC	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164407
136	NC_020508	CCG	2	6	6702	6707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470164407
137	NC_020508	CAG	2	6	6715	6720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470164407
138	NC_020508	TTTG	2	8	6721	6728	0 %	75 %	25 %	0 %	470164407
139	NC_020508	TGT	2	6	6766	6771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
140	NC_020508	TTG	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
141	NC_020508	TGGT	2	8	6920	6927	0 %	50 %	50 %	0 %	470164407
142	NC_020508	CAC	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164407
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144	NC_020508	T	6	6	7063	7068	0 %	100 %	0 %	0 %	470164407
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147	NC_020508	CGTT	2	8	7138	7145	0 %	50 %	25 %	25 %	470164407
148	NC_020508	TTGA	2	8	7151	7158	25 %	50 %	25 %	0 %	470164407
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151	NC_020508	T	7	7	7341	7347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020508	T	6	6	7353	7358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020508	TGT	2	6	7470	7475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_020508	T	7	7	7513	7519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020508	GTCTT	2	10	7544	7553	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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176	NC_020508	CAT	2	6	8262	8267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164408
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267	NC_020508	AG	3	6	12637	12642	50 %	0 %	50 %	0 %	470164411
268	NC_020508	AG	3	6	12647	12652	50 %	0 %	50 %	0 %	470164411
269	NC_020508	A	6	6	12717	12722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_020508	T	6	6	12744	12749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_020508	AGG	2	6	12750	12755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_020508	TGCA	2	8	12758	12765	25 %	25 %	25 %	25 %	470164412
273	NC_020508	TGGTG	2	10	12781	12790	0 %	40 %	60 %	0 %	470164412
274	NC_020508	GA	3	6	12822	12827	50 %	0 %	50 %	0 %	470164412
275	NC_020508	TTA	2	6	12837	12842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164412
276	NC_020508	GAA	2	6	12854	12859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164412
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413	NC_020508	CT	3	6	19797	19802	0 %	50 %	0 %	50 %	470164418
414	NC_020508	AGG	2	6	19881	19886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470164418
415	NC_020508	AG	3	6	19889	19894	50 %	0 %	50 %	0 %	470164418
416	NC_020508	TGG	2	6	20029	20034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164418
417	NC_020508	G	6	6	20033	20038	0 %	0 %	100 %	0 %	470164418
418	NC_020508	CAT	2	6	20039	20044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164418
419	NC_020508	ATG	2	6	20061	20066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164418
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421	NC_020508	CTT	2	6	20226	20231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164418
422	NC_020508	ATG	2	6	20301	20306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164418
423	NC_020508	GGC	2	6	20363	20368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470164418
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438	NC_020508	TGAT	2	8	21280	21287	25 %	50 %	25 %	0 %	470164420
439	NC_020508	ATG	2	6	21304	21309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164420
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452	NC_020508	GTG	2	6	22003	22008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164420
453	NC_020508	T	6	6	22011	22016	0 %	100 %	0 %	0 %	470164420
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470	NC_020508	TTG	2	6	22839	22844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
471	NC_020508	TGT	2	6	22864	22869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
472	NC_020508	TTTCTT	2	12	22979	22990	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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474	NC_020508	A	6	6	23029	23034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_020508	A	6	6	23071	23076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_020508	CTCTT	2	10	23269	23278	0 %	60 %	0 %	40 %	470164421
479	NC_020508	ATT	2	6	23357	23362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164421
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