MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 83922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_019779	ACC	2	6	649426	649431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428775231
13003	NC_019779	TG	3	6	649442	649447	0 %	50 %	50 %	0 %	428775231
13004	NC_019779	TC	3	6	649473	649478	0 %	50 %	0 %	50 %	428775231
13005	NC_019779	GAC	2	6	649513	649518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428775231
13006	NC_019779	ATA	2	6	649550	649555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428775231
13007	NC_019779	AT	3	6	649591	649596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_019779	AGA	2	6	649604	649609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_019779	ATC	2	6	649634	649639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_019779	AG	3	6	649648	649653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_019779	CT	3	6	649666	649671	0 %	50 %	0 %	50 %	428775232
13012	NC_019779	TGGTT	2	10	649695	649704	0 %	60 %	40 %	0 %	428775232
13013	NC_019779	CTTC	2	8	649799	649806	0 %	50 %	0 %	50 %	428775232
13014	NC_019779	GATT	2	8	649815	649822	25 %	50 %	25 %	0 %	428775232
13015	NC_019779	AGC	2	6	649867	649872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428775232
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13018	NC_019779	TTC	2	6	650074	650079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428775232
13019	NC_019779	TTG	2	6	650114	650119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775232
13020	NC_019779	GAT	2	6	650180	650185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428775232
13021	NC_019779	TTC	2	6	650200	650205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428775232
13022	NC_019779	GA	3	6	650262	650267	50 %	0 %	50 %	0 %	428775232
13023	NC_019779	AT	3	6	650321	650326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_019779	T	6	6	650336	650341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_019779	ATA	2	6	650389	650394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_019779	TTC	2	6	650425	650430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_019779	ATTTT	2	10	650432	650441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_019779	TTC	2	6	650454	650459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_019779	CAG	2	6	650501	650506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13031	NC_019779	TGAT	2	8	650578	650585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_019779	GAATG	2	10	650716	650725	40 %	20 %	40 %	0 %	428775233
13033	NC_019779	A	8	8	650736	650743	100 %	0 %	0 %	0 %	428775233
13034	NC_019779	ACAT	2	8	650800	650807	50 %	25 %	0 %	25 %	428775233
13035	NC_019779	AGG	2	6	650823	650828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428775233
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13038	NC_019779	CATA	2	8	650948	650955	50 %	25 %	0 %	25 %	428775233
13039	NC_019779	TAT	2	6	650998	651003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_019779	GAT	2	6	651018	651023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_019779	T	6	6	651028	651033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_019779	AATT	2	8	651037	651044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_019779	AG	3	6	651082	651087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_019779	GTT	2	6	651088	651093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_019779	TGC	2	6	651170	651175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775234
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13049	NC_019779	T	6	6	651290	651295	0 %	100 %	0 %	0 %	428775234
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13056	NC_019779	TGC	3	9	651674	651682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775234
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13067	NC_019779	TTC	3	9	652289	652297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428775234
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13069	NC_019779	CAAG	2	8	652413	652420	50 %	0 %	25 %	25 %	428775234
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13072	NC_019779	GCGG	2	8	652538	652545	0 %	0 %	75 %	25 %	428775234
13073	NC_019779	T	6	6	652617	652622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13076	NC_019779	TCTAT	2	10	652688	652697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13077	NC_019779	TTA	2	6	652721	652726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_019779	TTGCCG	2	12	652951	652962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775235
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13098	NC_019779	CGT	2	6	654414	654419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775237
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13106	NC_019779	GCT	2	6	654666	654671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775237
13107	NC_019779	TATT	2	8	654755	654762	25 %	75 %	0 %	0 %	428775237
13108	NC_019779	A	6	6	654837	654842	100 %	0 %	0 %	0 %	428775237
13109	NC_019779	ATTTT	2	10	654874	654883	20 %	80 %	0 %	0 %	428775237
13110	NC_019779	CAG	2	6	654907	654912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428775237
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13113	NC_019779	TTG	2	6	655072	655077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775237
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13239	NC_019779	TGC	2	6	661576	661581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775244
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13241	NC_019779	A	6	6	661644	661649	100 %	0 %	0 %	0 %	428775244
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13490	NC_019779	GAC	2	6	675158	675163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428775259
13491	NC_019779	ATC	2	6	675263	675268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428775259
13492	NC_019779	CAA	2	6	675286	675291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428775259
13493	NC_019779	CTG	2	6	675325	675330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775259
13494	NC_019779	TAC	2	6	675376	675381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428775259
13495	NC_019779	TTGA	2	8	675386	675393	25 %	50 %	25 %	0 %	428775259
13496	NC_019779	CG	3	6	675523	675528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13497	NC_019779	ATT	2	6	675566	675571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13498	NC_019779	AT	4	8	675576	675583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_019779	T	7	7	675583	675589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_019779	TCG	2	6	675595	675600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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