MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 83922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_019779	CAA	2	6	548188	548193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428775148
11003	NC_019779	GAA	2	6	548215	548220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428775148
11004	NC_019779	GAAA	2	8	548259	548266	75 %	0 %	25 %	0 %	428775148
11005	NC_019779	TTTA	2	8	548279	548286	25 %	75 %	0 %	0 %	428775148
11006	NC_019779	ATA	2	6	548424	548429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_019779	TGG	2	6	548546	548551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428775149
11008	NC_019779	CA	3	6	548590	548595	50 %	0 %	0 %	50 %	428775149
11009	NC_019779	TCC	2	6	548617	548622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428775149
11010	NC_019779	AGA	2	6	548644	548649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428775149
11011	NC_019779	T	6	6	548710	548715	0 %	100 %	0 %	0 %	428775149
11012	NC_019779	GAA	2	6	548741	548746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428775149
11013	NC_019779	CT	3	6	548793	548798	0 %	50 %	0 %	50 %	428775149
11014	NC_019779	TAT	2	6	548818	548823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428775150
11015	NC_019779	GCA	2	6	548974	548979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428775150
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11017	NC_019779	CCG	2	6	549001	549006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428775150
11018	NC_019779	AGT	2	6	549013	549018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428775150
11019	NC_019779	CTG	2	6	549041	549046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775150
11020	NC_019779	T	6	6	549074	549079	0 %	100 %	0 %	0 %	428775150
11021	NC_019779	TGC	3	9	549096	549104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775150
11022	NC_019779	GCT	3	9	549115	549123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775150
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11025	NC_019779	CCT	2	6	549349	549354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428775150
11026	NC_019779	CTG	2	6	549518	549523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775150
11027	NC_019779	TGG	2	6	549739	549744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428775150
11028	NC_019779	TGCT	2	8	549762	549769	0 %	50 %	25 %	25 %	428775150
11029	NC_019779	TGT	2	6	549873	549878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775151
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11033	NC_019779	CTG	2	6	549995	550000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775151
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11040	NC_019779	TTG	2	6	550368	550373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775151
11041	NC_019779	TCT	2	6	550381	550386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428775151
11042	NC_019779	TTGT	2	8	550475	550482	0 %	75 %	25 %	0 %	428775151
11043	NC_019779	A	6	6	550504	550509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_019779	AAT	2	6	550560	550565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_019779	TTC	2	6	550572	550577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_019779	CAA	2	6	550605	550610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_019779	A	6	6	550621	550626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_019779	CCAGA	2	10	550650	550659	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11049	NC_019779	TTA	2	6	550737	550742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_019779	A	7	7	550771	550777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_019779	TGA	2	6	550834	550839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428775152
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11053	NC_019779	TTA	2	6	550871	550876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428775152
11054	NC_019779	GAA	2	6	550877	550882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428775152
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11056	NC_019779	TAA	2	6	550936	550941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428775152
11057	NC_019779	ACCC	2	8	550944	550951	25 %	0 %	0 %	75 %	428775152
11058	NC_019779	ATT	2	6	551045	551050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428775152
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11062	NC_019779	CAA	2	6	551177	551182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428775152
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11065	NC_019779	AAG	2	6	551463	551468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428775152
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11068	NC_019779	AATT	2	8	551745	551752	50 %	50 %	0 %	0 %	428775152
11069	NC_019779	ATG	2	6	551850	551855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428775152
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11077	NC_019779	CAGT	2	8	552198	552205	25 %	25 %	25 %	25 %	428775152
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11082	NC_019779	AGA	2	6	552352	552357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428775152
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11084	NC_019779	AAG	2	6	552375	552380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428775152
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11090	NC_019779	TGA	2	6	552541	552546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428775153
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11095	NC_019779	AG	3	6	552782	552787	50 %	0 %	50 %	0 %	428775153
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11106	NC_019779	GTG	2	6	553405	553410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_019779	AGG	2	6	553416	553421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_019779	CTTA	2	8	553430	553437	25 %	50 %	0 %	25 %	428775154
11109	NC_019779	CTG	2	6	553619	553624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775154
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11115	NC_019779	TAA	2	6	553794	553799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428775154
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11119	NC_019779	TGC	2	6	553934	553939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775155
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