MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 83922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_019779	CAA	2	6	499278	499283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428775102
10003	NC_019779	ATA	2	6	499367	499372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428775102
10004	NC_019779	GTG	2	6	499430	499435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428775102
10005	NC_019779	TGT	2	6	499444	499449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775102
10006	NC_019779	TGCT	2	8	499528	499535	0 %	50 %	25 %	25 %	428775102
10007	NC_019779	CA	3	6	499851	499856	50 %	0 %	0 %	50 %	428775102
10008	NC_019779	TAAAT	2	10	499898	499907	60 %	40 %	0 %	0 %	428775102
10009	NC_019779	TAAA	2	8	499920	499927	75 %	25 %	0 %	0 %	428775102
10010	NC_019779	ATC	2	6	499948	499953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428775102
10011	NC_019779	TGAT	2	8	499959	499966	25 %	50 %	25 %	0 %	428775102
10012	NC_019779	TTC	2	6	500033	500038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428775103
10013	NC_019779	TCCT	2	8	500048	500055	0 %	50 %	0 %	50 %	428775103
10014	NC_019779	TCA	2	6	500086	500091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428775103
10015	NC_019779	CAT	2	6	500095	500100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428775103
10016	NC_019779	GTG	2	6	500214	500219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428775103
10017	NC_019779	GTT	2	6	500281	500286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775103
10018	NC_019779	GT	3	6	500340	500345	0 %	50 %	50 %	0 %	428775103
10019	NC_019779	GCT	2	6	500376	500381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775103
10020	NC_019779	CTCTGA	2	12	500520	500531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428775103
10021	NC_019779	ATA	2	6	500562	500567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428775103
10022	NC_019779	CCA	2	6	500596	500601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428775103
10023	NC_019779	GTT	2	6	500613	500618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775103
10024	NC_019779	ATC	2	6	500652	500657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428775103
10025	NC_019779	CCG	2	6	500689	500694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428775103
10026	NC_019779	CTT	3	9	500848	500856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428775103
10027	NC_019779	GAA	2	6	500916	500921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428775103
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10029	NC_019779	TTG	2	6	501131	501136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775103
10030	NC_019779	CCT	2	6	501169	501174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428775103
10031	NC_019779	TTG	2	6	501176	501181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775103
10032	NC_019779	G	7	7	501213	501219	0 %	0 %	100 %	0 %	428775103
10033	NC_019779	CTT	2	6	501262	501267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428775103
10034	NC_019779	CTT	2	6	501280	501285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_019779	T	6	6	501489	501494	0 %	100 %	0 %	0 %	428775104
10036	NC_019779	TTGT	2	8	501528	501535	0 %	75 %	25 %	0 %	428775104
10037	NC_019779	CTG	2	6	501554	501559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775104
10038	NC_019779	C	7	7	501594	501600	0 %	0 %	0 %	100 %	428775104
10039	NC_019779	T	7	7	501607	501613	0 %	100 %	0 %	0 %	428775104
10040	NC_019779	CGT	2	6	501716	501721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775104
10041	NC_019779	TGGGA	2	10	501876	501885	20 %	20 %	60 %	0 %	428775104
10042	NC_019779	T	6	6	501960	501965	0 %	100 %	0 %	0 %	428775104
10043	NC_019779	TCT	2	6	501970	501975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428775104
10044	NC_019779	TGGT	2	8	502009	502016	0 %	50 %	50 %	0 %	428775104
10045	NC_019779	GCA	2	6	502081	502086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428775104
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10047	NC_019779	TTG	2	6	502209	502214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775104
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10050	NC_019779	TGA	2	6	502311	502316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428775104
10051	NC_019779	TTTC	2	8	502360	502367	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10052	NC_019779	A	6	6	502380	502385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_019779	TTA	2	6	502393	502398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_019779	GAC	2	6	502447	502452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10057	NC_019779	CCA	2	6	502682	502687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428775105
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10070	NC_019779	TGA	2	6	503512	503517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428775105
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10077	NC_019779	AGTG	2	8	503717	503724	25 %	25 %	50 %	0 %	428775106
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10081	NC_019779	TCT	2	6	503869	503874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428775106
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10086	NC_019779	ACTC	2	8	504041	504048	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10087	NC_019779	AGG	2	6	504075	504080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10089	NC_019779	AAG	2	6	504181	504186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428775107
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10092	NC_019779	A	7	7	504247	504253	100 %	0 %	0 %	0 %	428775107
10093	NC_019779	GTT	2	6	504261	504266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428775107
10094	NC_019779	GTC	2	6	504283	504288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775107
10095	NC_019779	GTGAA	2	10	504295	504304	40 %	20 %	40 %	0 %	428775107
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10103	NC_019779	TG	3	6	504597	504602	0 %	50 %	50 %	0 %	428775107
10104	NC_019779	TGC	2	6	504671	504676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775107
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10107	NC_019779	ATC	2	6	504750	504755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428775107
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10109	NC_019779	CT	3	6	504809	504814	0 %	50 %	0 %	50 %	428775107
10110	NC_019779	AAGCGA	2	12	504853	504864	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428775107
10111	NC_019779	CCGA	2	8	504891	504898	25 %	0 %	25 %	50 %	428775107
10112	NC_019779	ATT	2	6	504903	504908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428775107
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10118	NC_019779	ATG	2	6	505285	505290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428775107
10119	NC_019779	TGACAT	2	12	505341	505352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10120	NC_019779	CTG	2	6	505368	505373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428775108
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10122	NC_019779	CCAG	2	8	505434	505441	25 %	0 %	25 %	50 %	428775108
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