MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halothece sp. PCC 7418 chromosome

Total Repeats: 83922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70001	NC_019779	GAT	2	6	3500958	3500963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70002	NC_019779	CTT	2	6	3501004	3501009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70003	NC_019779	TTGGG	2	10	3501061	3501070	0 %	40 %	60 %	0 %	428777793
70004	NC_019779	GCT	2	6	3501101	3501106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428777793
70005	NC_019779	AGTA	2	8	3501242	3501249	50 %	25 %	25 %	0 %	428777793
70006	NC_019779	CTT	2	6	3501315	3501320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428777793
70007	NC_019779	ACTG	2	8	3501391	3501398	25 %	25 %	25 %	25 %	428777793
70008	NC_019779	TAA	2	6	3501486	3501491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428777793
70009	NC_019779	GAG	2	6	3501544	3501549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428777793
70010	NC_019779	CAT	2	6	3501588	3501593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428777793
70011	NC_019779	AGC	2	6	3501640	3501645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428777793
70012	NC_019779	AAT	2	6	3501706	3501711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428777793
70013	NC_019779	AACT	2	8	3501736	3501743	50 %	25 %	0 %	25 %	428777793
70014	NC_019779	AGC	3	9	3501766	3501774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428777793
70015	NC_019779	TGC	2	6	3501850	3501855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428777793
70016	NC_019779	TTAA	2	8	3501922	3501929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70017	NC_019779	TCCC	2	8	3501944	3501951	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70018	NC_019779	TTA	2	6	3501954	3501959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70019	NC_019779	ATG	2	6	3501994	3501999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70020	NC_019779	AGC	2	6	3502041	3502046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70021	NC_019779	A	8	8	3502047	3502054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70022	NC_019779	TAA	2	6	3502164	3502169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70023	NC_019779	TAAAA	2	10	3502173	3502182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70024	NC_019779	ATT	2	6	3502213	3502218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70025	NC_019779	ACT	2	6	3502260	3502265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70026	NC_019779	ATTAA	2	10	3502266	3502275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70027	NC_019779	GTT	2	6	3502382	3502387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428777794
70028	NC_019779	GTG	2	6	3502496	3502501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428777794
70029	NC_019779	GTAA	2	8	3502507	3502514	50 %	25 %	25 %	0 %	428777794
70030	NC_019779	CCG	2	6	3502577	3502582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428777794
70031	NC_019779	TTCC	2	8	3502689	3502696	0 %	50 %	0 %	50 %	428777794
70032	NC_019779	AAC	2	6	3502751	3502756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428777794
70033	NC_019779	TTTC	2	8	3502833	3502840	0 %	75 %	0 %	25 %	428777794
70034	NC_019779	ATT	2	6	3502982	3502987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70035	NC_019779	GATT	2	8	3503059	3503066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70036	NC_019779	AAT	2	6	3503101	3503106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70037	NC_019779	T	6	6	3503157	3503162	0 %	100 %	0 %	0 %	428777795
70038	NC_019779	CTG	3	9	3503182	3503190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428777795
70039	NC_019779	TGC	2	6	3503414	3503419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428777795
70040	NC_019779	GGCG	2	8	3503428	3503435	0 %	0 %	75 %	25 %	428777795
70041	NC_019779	GAA	2	6	3503436	3503441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428777795
70042	NC_019779	T	6	6	3503449	3503454	0 %	100 %	0 %	0 %	428777795
70043	NC_019779	TCT	2	6	3503463	3503468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428777795
70044	NC_019779	CCG	2	6	3503490	3503495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428777795
70045	NC_019779	GTC	2	6	3503642	3503647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428777795
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70047	NC_019779	GAA	2	6	3503700	3503705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428777795
70048	NC_019779	GATCA	2	10	3503772	3503781	40 %	20 %	20 %	20 %	428777795
70049	NC_019779	GCT	3	9	3503784	3503792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428777795
70050	NC_019779	TAT	2	6	3503826	3503831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428777795
70051	NC_019779	GCGGTG	2	12	3503938	3503949	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428777795
70052	NC_019779	TCC	2	6	3504008	3504013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428777795
70053	NC_019779	AGA	2	6	3504107	3504112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428777795
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70055	NC_019779	GGGCT	2	10	3504176	3504185	0 %	20 %	60 %	20 %	428777795
70056	NC_019779	C	6	6	3504248	3504253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70057	NC_019779	CCTT	2	8	3504257	3504264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70058	NC_019779	G	6	6	3504270	3504275	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70059	NC_019779	GCTTT	2	10	3504289	3504298	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70060	NC_019779	T	7	7	3504296	3504302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70061	NC_019779	CAA	2	6	3504357	3504362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70062	NC_019779	TAT	2	6	3504369	3504374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70063	NC_019779	AGT	2	6	3504381	3504386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70064	NC_019779	CGAT	2	8	3504397	3504404	25 %	25 %	25 %	25 %	428777796
70065	NC_019779	AAGA	2	8	3504494	3504501	75 %	0 %	25 %	0 %	428777796
70066	NC_019779	GCA	2	6	3504586	3504591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428777796
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70070	NC_019779	TGC	2	6	3504724	3504729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428777797
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70077	NC_019779	TTTA	2	8	3504931	3504938	25 %	75 %	0 %	0 %	428777797
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70081	NC_019779	ATGA	2	8	3505093	3505100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70082	NC_019779	TA	3	6	3505112	3505117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70083	NC_019779	CGAG	2	8	3505135	3505142	25 %	0 %	50 %	25 %	428777798
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70094	NC_019779	TTC	2	6	3505498	3505503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428777798
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70108	NC_019779	TGAC	2	8	3506006	3506013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70109	NC_019779	TGC	2	6	3506138	3506143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428777800
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70111	NC_019779	T	6	6	3506323	3506328	0 %	100 %	0 %	0 %	428777800
70112	NC_019779	GTT	2	6	3506342	3506347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428777800
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70115	NC_019779	CGATCG	2	12	3506490	3506501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428777800
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70118	NC_019779	CAC	2	6	3506592	3506597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428777800
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