MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 plasmid p2HPAKL86

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019565	ATT	2	6	2	7	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019565	T	6	6	6	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019565	AAT	2	6	29	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019565	A	6	6	41	46	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019565	ATT	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019565	TGA	2	6	127	132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019565	AAAC	2	8	177	184	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019565	CAA	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019565	A	6	6	355	360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019565	A	6	6	378	383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019565	A	6	6	407	412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019565	G	6	6	416	421	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019565	A	7	7	425	431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019565	GAT	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019565	ATT	3	9	463	471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019565	AGCA	2	8	479	486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019565	T	6	6	517	522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019565	TGA	2	6	534	539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019565	T	6	6	540	545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019565	A	6	6	561	566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019565	TAA	2	6	654	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791568
22	NC_019565	A	7	7	692	698	100 %	0 %	0 %	0 %	425791568
23	NC_019565	A	6	6	735	740	100 %	0 %	0 %	0 %	425791568
24	NC_019565	T	6	6	783	788	0 %	100 %	0 %	0 %	425791568
25	NC_019565	GTT	2	6	906	911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791568
26	NC_019565	GTAA	2	8	915	922	50 %	25 %	25 %	0 %	425791568
27	NC_019565	T	6	6	926	931	0 %	100 %	0 %	0 %	425791568
28	NC_019565	CAA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791568
29	NC_019565	CTT	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791568
30	NC_019565	GTG	2	6	1058	1063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425791568
31	NC_019565	CAA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791568
32	NC_019565	GAT	2	6	1134	1139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791568
33	NC_019565	T	7	7	1218	1224	0 %	100 %	0 %	0 %	425791568
34	NC_019565	T	8	8	1248	1255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019565	GAACT	2	10	1265	1274	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019565	ACA	2	6	1297	1302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019565	C	6	6	1305	1310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_019565	T	7	7	1312	1318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019565	TTA	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019565	AAC	2	6	1376	1381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019565	A	6	6	1410	1415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019565	A	6	6	1513	1518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019565	A	8	8	1521	1528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019565	G	6	6	1553	1558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019565	T	6	6	1575	1580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019565	CTA	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019565	C	6	6	1606	1611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.