MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 31055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019563	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	425790180
2	NC_019563	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	425790180
3	NC_019563	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790180
4	NC_019563	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	425790180
5	NC_019563	AAAGCA	2	12	288	299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	425790180
6	NC_019563	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790180
7	NC_019563	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	425790180
8	NC_019563	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	425790180
9	NC_019563	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790180
10	NC_019563	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790180
11	NC_019563	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790180
12	NC_019563	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	425790180
13	NC_019563	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790181
14	NC_019563	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	425790181
15	NC_019563	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790181
16	NC_019563	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790181
17	NC_019563	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	425790181
18	NC_019563	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790181
19	NC_019563	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	425790181
20	NC_019563	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790181
21	NC_019563	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	425790182
22	NC_019563	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790182
23	NC_019563	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790182
24	NC_019563	CCG	4	12	1043	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425790182
25	NC_019563	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790182
26	NC_019563	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790182
27	NC_019563	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	425790182
28	NC_019563	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	425790182
29	NC_019563	GCT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790182
30	NC_019563	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790182
31	NC_019563	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	425790182
32	NC_019563	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	425790182
33	NC_019563	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425790182
34	NC_019563	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	425790182
35	NC_019563	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	425790182
36	NC_019563	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	425790182
37	NC_019563	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790182
38	NC_019563	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790183
39	NC_019563	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	425790183
40	NC_019563	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	425790183
41	NC_019563	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	425790183
42	NC_019563	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	425790183
43	NC_019563	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790183
44	NC_019563	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	425790183
45	NC_019563	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790183
46	NC_019563	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790183
47	NC_019563	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790183
48	NC_019563	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	425790183
49	NC_019563	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790183
50	NC_019563	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790183
51	NC_019563	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	425790183
52	NC_019563	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	425790183
53	NC_019563	CA	3	6	2275	2280	50 %	0 %	0 %	50 %	425790183
54	NC_019563	TTTTA	2	10	2427	2436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019563	A	8	8	2540	2547	100 %	0 %	0 %	0 %	425790184
56	NC_019563	TCTT	2	8	2556	2563	0 %	75 %	0 %	25 %	425790184
57	NC_019563	T	7	7	2636	2642	0 %	100 %	0 %	0 %	425790184
58	NC_019563	T	7	7	2678	2684	0 %	100 %	0 %	0 %	425790184
59	NC_019563	AGC	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790184
60	NC_019563	GC	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	425790184
61	NC_019563	A	6	6	2827	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	425790184
62	NC_019563	ATTAA	2	10	2923	2932	60 %	40 %	0 %	0 %	425790184
63	NC_019563	AG	3	6	2946	2951	50 %	0 %	50 %	0 %	425790184
64	NC_019563	GTG	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790184
65	NC_019563	AGA	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790184
66	NC_019563	CAAA	2	8	3099	3106	75 %	0 %	0 %	25 %	425790184
67	NC_019563	GTG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790184
68	NC_019563	GCC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425790184
69	NC_019563	GAAA	2	8	3246	3253	75 %	0 %	25 %	0 %	425790185
70	NC_019563	GAAA	2	8	3321	3328	75 %	0 %	25 %	0 %	425790185
71	NC_019563	TG	3	6	3428	3433	0 %	50 %	50 %	0 %	425790185
72	NC_019563	GTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790185
73	NC_019563	CAAG	2	8	3822	3829	50 %	0 %	25 %	25 %	425790185
74	NC_019563	A	6	6	3865	3870	100 %	0 %	0 %	0 %	425790185
75	NC_019563	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790185
76	NC_019563	GGC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425790185
77	NC_019563	GGT	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019563	TAT	2	6	4132	4137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019563	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019563	ATGC	2	8	4273	4280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019563	TGG	2	6	4289	4294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019563	GTG	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019563	ACC	2	6	4438	4443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_019563	GGT	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019563	A	7	7	4572	4578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019563	T	8	8	4592	4599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019563	AAT	2	6	4613	4618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019563	GAAAC	2	10	4642	4651	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019563	TAAA	2	8	4683	4690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019563	AAT	2	6	4723	4728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019563	T	6	6	4728	4733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019563	TTC	2	6	4763	4768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019563	A	7	7	4808	4814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019563	A	8	8	4823	4830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019563	CCT	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_019563	CAA	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019563	TAG	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019563	CA	3	6	4953	4958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019563	TG	3	6	5002	5007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019563	A	6	6	5037	5042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019563	T	6	6	5107	5112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019563	A	6	6	5148	5153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019563	GGT	2	6	5165	5170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019563	ATA	2	6	5209	5214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790186
105	NC_019563	CTT	2	6	5223	5228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790186
106	NC_019563	TGC	2	6	5300	5305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425790186
107	NC_019563	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790186
108	NC_019563	TC	3	6	5492	5497	0 %	50 %	0 %	50 %	425790186
109	NC_019563	T	6	6	5537	5542	0 %	100 %	0 %	0 %	425790186
110	NC_019563	T	6	6	5592	5597	0 %	100 %	0 %	0 %	425790186
111	NC_019563	A	6	6	5649	5654	100 %	0 %	0 %	0 %	425790186
112	NC_019563	TCA	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790186
113	NC_019563	AG	3	6	5695	5700	50 %	0 %	50 %	0 %	425790186
114	NC_019563	CT	3	6	5756	5761	0 %	50 %	0 %	50 %	425790186
115	NC_019563	T	6	6	5818	5823	0 %	100 %	0 %	0 %	425790186
116	NC_019563	A	6	6	5847	5852	100 %	0 %	0 %	0 %	425790186
117	NC_019563	C	6	6	5918	5923	0 %	0 %	0 %	100 %	425790186
118	NC_019563	AATA	2	8	5996	6003	75 %	25 %	0 %	0 %	425790186
119	NC_019563	T	8	8	6047	6054	0 %	100 %	0 %	0 %	425790186
120	NC_019563	CCA	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790186
121	NC_019563	TCAT	2	8	6113	6120	25 %	50 %	0 %	25 %	425790186
122	NC_019563	CAC	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790187
123	NC_019563	T	6	6	6373	6378	0 %	100 %	0 %	0 %	425790187
124	NC_019563	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790187
125	NC_019563	TTACT	2	10	6679	6688	20 %	60 %	0 %	20 %	425790187
126	NC_019563	CT	3	6	6734	6739	0 %	50 %	0 %	50 %	425790187
127	NC_019563	TTTTC	2	10	6877	6886	0 %	80 %	0 %	20 %	425790187
128	NC_019563	AAG	2	6	7074	7079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790187
129	NC_019563	GAT	2	6	7117	7122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790187
130	NC_019563	AGA	2	6	7145	7150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790187
131	NC_019563	T	6	6	7246	7251	0 %	100 %	0 %	0 %	425790187
132	NC_019563	ATT	2	6	7257	7262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790187
133	NC_019563	TCA	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790188
134	NC_019563	CAC	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790188
135	NC_019563	GCTC	2	8	7510	7517	0 %	25 %	25 %	50 %	425790188
136	NC_019563	AAAG	2	8	7536	7543	75 %	0 %	25 %	0 %	425790188
137	NC_019563	AAC	2	6	7582	7587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790188
138	NC_019563	CAA	2	6	7646	7651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790188
139	NC_019563	GTT	2	6	7658	7663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790188
140	NC_019563	ATT	2	6	7799	7804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790188
141	NC_019563	CT	3	6	7809	7814	0 %	50 %	0 %	50 %	425790188
142	NC_019563	CTT	2	6	7870	7875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790188
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278	NC_019563	T	6	6	13718	13723	0 %	100 %	0 %	0 %	425790194
279	NC_019563	A	7	7	13724	13730	100 %	0 %	0 %	0 %	425790194
280	NC_019563	A	7	7	13770	13776	100 %	0 %	0 %	0 %	425790194
281	NC_019563	TCT	2	6	13859	13864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790195
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283	NC_019563	CTT	2	6	13914	13919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790195
284	NC_019563	TCT	2	6	13922	13927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790195
285	NC_019563	TCA	2	6	13937	13942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790195
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288	NC_019563	TTCTT	2	10	14030	14039	0 %	80 %	0 %	20 %	425790195
289	NC_019563	T	6	6	14056	14061	0 %	100 %	0 %	0 %	425790195
290	NC_019563	TAA	2	6	14071	14076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790195
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293	NC_019563	CAC	2	6	14210	14215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790196
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299	NC_019563	GC	4	8	14477	14484	0 %	0 %	50 %	50 %	425790197
300	NC_019563	T	7	7	14509	14515	0 %	100 %	0 %	0 %	425790197
301	NC_019563	AGCA	2	8	14518	14525	50 %	0 %	25 %	25 %	425790197
302	NC_019563	T	6	6	14541	14546	0 %	100 %	0 %	0 %	425790197
303	NC_019563	T	7	7	14603	14609	0 %	100 %	0 %	0 %	425790197
304	NC_019563	T	6	6	14642	14647	0 %	100 %	0 %	0 %	425790197
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316	NC_019563	T	6	6	15259	15264	0 %	100 %	0 %	0 %	425790197
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352	NC_019563	CT	3	6	16712	16717	0 %	50 %	0 %	50 %	425790198
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370	NC_019563	TCT	3	9	17208	17216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790199
371	NC_019563	CAT	2	6	17240	17245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790199
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373	NC_019563	AAATA	2	10	17375	17384	80 %	20 %	0 %	0 %	425790199
374	NC_019563	AACC	2	8	17393	17400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
375	NC_019563	A	8	8	17482	17489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
376	NC_019563	A	6	6	17491	17496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
377	NC_019563	TGCT	2	8	17522	17529	0 %	50 %	25 %	25 %	425790200
378	NC_019563	ATA	2	6	17588	17593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790200
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382	NC_019563	CAAC	2	8	17918	17925	50 %	0 %	0 %	50 %	425790201
383	NC_019563	CAA	2	6	18040	18045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790201
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392	NC_019563	TAAA	2	8	18438	18445	75 %	25 %	0 %	0 %	425790201
393	NC_019563	A	6	6	18469	18474	100 %	0 %	0 %	0 %	425790202
394	NC_019563	CT	3	6	18533	18538	0 %	50 %	0 %	50 %	425790202
395	NC_019563	A	7	7	18551	18557	100 %	0 %	0 %	0 %	425790202
396	NC_019563	GTA	2	6	18598	18603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790202
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398	NC_019563	TGTT	2	8	18725	18732	0 %	75 %	25 %	0 %	425790202
399	NC_019563	TTCA	2	8	18802	18809	25 %	50 %	0 %	25 %	425790202
400	NC_019563	AAC	2	6	18908	18913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790202
401	NC_019563	T	7	7	18965	18971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_019563	A	6	6	18998	19003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_019563	ATC	2	6	19024	19029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790203
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405	NC_019563	AATCA	2	10	19134	19143	60 %	20 %	0 %	20 %	425790203
406	NC_019563	CAT	2	6	19173	19178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790203
407	NC_019563	ATA	2	6	19192	19197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790203
408	NC_019563	C	6	6	19306	19311	0 %	0 %	0 %	100 %	425790203
409	NC_019563	CGC	2	6	19317	19322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425790203
410	NC_019563	TTG	2	6	19398	19403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790203
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463	NC_019563	GTG	2	6	21992	21997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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