MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 31055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_019563	GGC	2	6	1491463	1491468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425791551
31002	NC_019563	A	6	6	1491555	1491560	100 %	0 %	0 %	0 %	425791551
31003	NC_019563	CAA	2	6	1491589	1491594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791551
31004	NC_019563	CAG	2	6	1491636	1491641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425791551
31005	NC_019563	CAG	2	6	1491680	1491685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425791551
31006	NC_019563	TAC	2	6	1491775	1491780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791551
31007	NC_019563	GCT	2	6	1491862	1491867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425791551
31008	NC_019563	TAA	2	6	1491876	1491881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791551
31009	NC_019563	AAAC	2	8	1491936	1491943	75 %	0 %	0 %	25 %	425791551
31010	NC_019563	TAC	2	6	1491958	1491963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791551
31011	NC_019563	TAA	2	6	1491990	1491995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791551
31012	NC_019563	TCA	2	6	1492064	1492069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791551
31013	NC_019563	AAT	2	6	1492177	1492182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791551
31014	NC_019563	ATT	3	9	1492334	1492342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791551
31015	NC_019563	T	6	6	1492447	1492452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_019563	A	8	8	1492471	1492478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31017	NC_019563	T	6	6	1492482	1492487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31018	NC_019563	A	6	6	1492506	1492511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31019	NC_019563	CT	4	8	1492611	1492618	0 %	50 %	0 %	50 %	425791552
31020	NC_019563	CAA	2	6	1492645	1492650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791552
31021	NC_019563	ACC	2	6	1492693	1492698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425791552
31022	NC_019563	A	6	6	1492705	1492710	100 %	0 %	0 %	0 %	425791552
31023	NC_019563	CG	3	6	1492714	1492719	0 %	0 %	50 %	50 %	425791552
31024	NC_019563	AAT	2	6	1492873	1492878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791552
31025	NC_019563	T	6	6	1492906	1492911	0 %	100 %	0 %	0 %	425791552
31026	NC_019563	CAC	2	6	1492932	1492937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425791552
31027	NC_019563	AAG	2	6	1492947	1492952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791552
31028	NC_019563	CGAG	2	8	1492991	1492998	25 %	0 %	50 %	25 %	425791552
31029	NC_019563	CGG	2	6	1493144	1493149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425791552
31030	NC_019563	AAGGC	2	10	1493244	1493253	40 %	0 %	40 %	20 %	425791552
31031	NC_019563	AGA	2	6	1493283	1493288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791552
31032	NC_019563	CTT	2	6	1493429	1493434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791553
31033	NC_019563	T	8	8	1493437	1493444	0 %	100 %	0 %	0 %	425791553
31034	NC_019563	T	6	6	1493522	1493527	0 %	100 %	0 %	0 %	425791553
31035	NC_019563	TGGC	2	8	1493538	1493545	0 %	25 %	50 %	25 %	425791553
31036	NC_019563	TTGC	2	8	1493548	1493555	0 %	50 %	25 %	25 %	425791553
31037	NC_019563	TTG	2	6	1493557	1493562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791553
31038	NC_019563	T	6	6	1493577	1493582	0 %	100 %	0 %	0 %	425791553
31039	NC_019563	GAA	2	6	1493586	1493591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425791553
31040	NC_019563	A	7	7	1493590	1493596	100 %	0 %	0 %	0 %	425791553
31041	NC_019563	TAA	2	6	1493615	1493620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791553
31042	NC_019563	GAT	2	6	1493625	1493630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791553
31043	NC_019563	TTA	2	6	1493647	1493652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791553
31044	NC_019563	GTT	2	6	1493735	1493740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791553
31045	NC_019563	CATG	2	8	1493765	1493772	25 %	25 %	25 %	25 %	425791553
31046	NC_019563	TAC	2	6	1493796	1493801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791553
31047	NC_019563	CTGCA	2	10	1493835	1493844	20 %	20 %	20 %	40 %	425791553
31048	NC_019563	ATT	2	6	1493902	1493907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791553
31049	NC_019563	A	6	6	1493951	1493956	100 %	0 %	0 %	0 %	425791553
31050	NC_019563	A	6	6	1493988	1493993	100 %	0 %	0 %	0 %	425791553
31051	NC_019563	CGCT	2	8	1494042	1494049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31052	NC_019563	CCA	2	6	1494056	1494061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31053	NC_019563	AGTGA	2	10	1494073	1494082	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31054	NC_019563	CAT	2	6	1494159	1494164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31055	NC_019563	T	6	6	1494164	1494169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.