MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 31055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_019563	CT	3	6	1005647	1005652	0 %	50 %	0 %	50 %	425791107
21003	NC_019563	TGA	2	6	1005714	1005719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791107
21004	NC_019563	ACC	2	6	1005752	1005757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425791107
21005	NC_019563	TTGT	2	8	1005814	1005821	0 %	75 %	25 %	0 %	425791107
21006	NC_019563	TTTTC	2	10	1006016	1006025	0 %	80 %	0 %	20 %	425791108
21007	NC_019563	ATAG	2	8	1006038	1006045	50 %	25 %	25 %	0 %	425791108
21008	NC_019563	CTT	2	6	1006064	1006069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791108
21009	NC_019563	CAATGC	2	12	1006121	1006132	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425791108
21010	NC_019563	CG	3	6	1006209	1006214	0 %	0 %	50 %	50 %	425791108
21011	NC_019563	CCT	2	6	1006285	1006290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	425791108
21012	NC_019563	TTGA	2	8	1006341	1006348	25 %	50 %	25 %	0 %	425791108
21013	NC_019563	ATA	2	6	1006384	1006389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791108
21014	NC_019563	TTCA	2	8	1006422	1006429	25 %	50 %	0 %	25 %	425791108
21015	NC_019563	CTGAG	2	10	1006445	1006454	20 %	20 %	40 %	20 %	425791108
21016	NC_019563	AG	3	6	1006479	1006484	50 %	0 %	50 %	0 %	425791108
21017	NC_019563	CACT	2	8	1006511	1006518	25 %	25 %	0 %	50 %	425791108
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21019	NC_019563	CTT	2	6	1006589	1006594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791108
21020	NC_019563	TTTTC	2	10	1006598	1006607	0 %	80 %	0 %	20 %	425791108
21021	NC_019563	GCC	2	6	1006659	1006664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	425791108
21022	NC_019563	CT	3	6	1006674	1006679	0 %	50 %	0 %	50 %	425791108
21023	NC_019563	TGG	2	6	1006922	1006927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425791108
21024	NC_019563	TTCA	2	8	1007019	1007026	25 %	50 %	0 %	25 %	425791108
21025	NC_019563	C	7	7	1007051	1007057	0 %	0 %	0 %	100 %	425791108
21026	NC_019563	ATCA	2	8	1007097	1007104	50 %	25 %	0 %	25 %	425791108
21027	NC_019563	CGCA	2	8	1007111	1007118	25 %	0 %	25 %	50 %	425791108
21028	NC_019563	AATCTT	2	12	1007130	1007141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	425791108
21029	NC_019563	TCA	2	6	1007143	1007148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791108
21030	NC_019563	AGC	2	6	1007175	1007180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425791108
21031	NC_019563	T	6	6	1007184	1007189	0 %	100 %	0 %	0 %	425791108
21032	NC_019563	TGA	2	6	1007243	1007248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791108
21033	NC_019563	A	6	6	1007248	1007253	100 %	0 %	0 %	0 %	425791108
21034	NC_019563	ATA	2	6	1007283	1007288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791108
21035	NC_019563	TAA	2	6	1007354	1007359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21036	NC_019563	ATT	2	6	1007396	1007401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425791109
21037	NC_019563	TC	3	6	1007454	1007459	0 %	50 %	0 %	50 %	425791109
21038	NC_019563	CTCG	2	8	1007646	1007653	0 %	25 %	25 %	50 %	425791109
21039	NC_019563	CATG	2	8	1007654	1007661	25 %	25 %	25 %	25 %	425791109
21040	NC_019563	GTG	2	6	1007770	1007775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425791109
21041	NC_019563	T	6	6	1007793	1007798	0 %	100 %	0 %	0 %	425791109
21042	NC_019563	GAT	2	6	1007889	1007894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791109
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21044	NC_019563	TTTAAA	2	12	1007983	1007994	50 %	50 %	0 %	0 %	425791109
21045	NC_019563	C	6	6	1008008	1008013	0 %	0 %	0 %	100 %	425791109
21046	NC_019563	GCT	2	6	1008027	1008032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	425791109
21047	NC_019563	C	7	7	1008053	1008059	0 %	0 %	0 %	100 %	425791109
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21051	NC_019563	CACC	2	8	1008316	1008323	25 %	0 %	0 %	75 %	425791109
21052	NC_019563	CTAAAA	2	12	1008368	1008379	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	425791109
21053	NC_019563	GC	3	6	1008385	1008390	0 %	0 %	50 %	50 %	425791109
21054	NC_019563	GTG	2	6	1008423	1008428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425791109
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21061	NC_019563	TCTTTA	2	12	1008834	1008845	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	425791110
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21069	NC_019563	ATA	2	6	1009102	1009107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791111
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21093	NC_019563	TAA	3	9	1010428	1010436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425791112
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21101	NC_019563	T	7	7	1010723	1010729	0 %	100 %	0 %	0 %	425791112
21102	NC_019563	A	6	6	1010753	1010758	100 %	0 %	0 %	0 %	425791112
21103	NC_019563	ATC	2	6	1010778	1010783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425791112
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21105	NC_019563	A	6	6	1010868	1010873	100 %	0 %	0 %	0 %	425791112
21106	NC_019563	T	7	7	1011043	1011049	0 %	100 %	0 %	0 %	425791112
21107	NC_019563	GC	3	6	1011071	1011076	0 %	0 %	50 %	50 %	425791112
21108	NC_019563	TAAA	2	8	1011098	1011105	75 %	25 %	0 %	0 %	425791112
21109	NC_019563	TTC	2	6	1011141	1011146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791112
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21112	NC_019563	TCT	2	6	1011277	1011282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425791112
21113	NC_019563	AATA	2	8	1011311	1011318	75 %	25 %	0 %	0 %	425791112
21114	NC_019563	T	6	6	1011344	1011349	0 %	100 %	0 %	0 %	425791112
21115	NC_019563	TTATTT	2	12	1011394	1011405	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	425791112
21116	NC_019563	T	6	6	1011423	1011428	0 %	100 %	0 %	0 %	425791112
21117	NC_019563	T	7	7	1011446	1011452	0 %	100 %	0 %	0 %	425791112
21118	NC_019563	ATAA	2	8	1011470	1011477	75 %	25 %	0 %	0 %	425791112
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21120	NC_019563	T	7	7	1011502	1011508	0 %	100 %	0 %	0 %	425791112
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21203	NC_019563	T	7	7	1015207	1015213	0 %	100 %	0 %	0 %	425791116
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21212	NC_019563	TCTT	2	8	1015500	1015507	0 %	75 %	0 %	25 %	425791117
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21215	NC_019563	TTGGCG	2	12	1015750	1015761	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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21220	NC_019563	TGTT	2	8	1015952	1015959	0 %	75 %	25 %	0 %	425791118
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21222	NC_019563	TGA	2	6	1015978	1015983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791118
21223	NC_019563	T	8	8	1015997	1016004	0 %	100 %	0 %	0 %	425791118
21224	NC_019563	T	6	6	1016030	1016035	0 %	100 %	0 %	0 %	425791118
21225	NC_019563	T	6	6	1016057	1016062	0 %	100 %	0 %	0 %	425791118
21226	NC_019563	AAAAC	2	10	1016091	1016100	80 %	0 %	0 %	20 %	425791118
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21230	NC_019563	A	7	7	1016303	1016309	100 %	0 %	0 %	0 %	425791118
21231	NC_019563	TC	3	6	1016427	1016432	0 %	50 %	0 %	50 %	425791118
21232	NC_019563	CAA	2	6	1016467	1016472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791118
21233	NC_019563	TC	3	6	1016604	1016609	0 %	50 %	0 %	50 %	425791118
21234	NC_019563	TTG	2	6	1016618	1016623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425791118
21235	NC_019563	T	7	7	1016627	1016633	0 %	100 %	0 %	0 %	425791118
21236	NC_019563	ACA	2	6	1016655	1016660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425791118
21237	NC_019563	T	7	7	1016674	1016680	0 %	100 %	0 %	0 %	425791118
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21353	NC_019563	CTCA	2	8	1022912	1022919	25 %	25 %	0 %	50 %	425791123
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21480	NC_019563	CAAG	2	8	1029008	1029015	50 %	0 %	25 %	25 %	425791130
21481	NC_019563	GAT	2	6	1029018	1029023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425791130
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21483	NC_019563	TCA	2	6	1029197	1029202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21484	NC_019563	T	6	6	1029212	1029217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21485	NC_019563	CCA	2	6	1029269	1029274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21487	NC_019563	CAA	2	6	1029330	1029335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21491	NC_019563	AGCG	2	8	1029469	1029476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21492	NC_019563	TATC	2	8	1029552	1029559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21493	NC_019563	CTTG	2	8	1029572	1029579	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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