MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Aklavik86 chromosome

Total Repeats: 31055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019563	ATT	2	6	240506	240511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_019563	TGG	3	9	240554	240562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_019563	GTG	2	6	240590	240595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_019563	GTG	2	6	240701	240706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_019563	TGG	2	6	240736	240741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_019563	A	6	6	240831	240836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_019563	AATC	2	8	240846	240853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_019563	AAT	2	6	240876	240881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_019563	A	6	6	240931	240936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_019563	GCAT	2	8	240995	241002	25 %	25 %	25 %	25 %	425790431
5011	NC_019563	GTT	2	6	241026	241031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790431
5012	NC_019563	CAA	2	6	241044	241049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790431
5013	NC_019563	G	6	6	241096	241101	0 %	0 %	100 %	0 %	425790431
5014	NC_019563	A	6	6	241115	241120	100 %	0 %	0 %	0 %	425790431
5015	NC_019563	AAG	3	9	241163	241171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790431
5016	NC_019563	TAT	2	6	241200	241205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790431
5017	NC_019563	TAA	2	6	241383	241388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790431
5018	NC_019563	ATC	2	6	241396	241401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790431
5019	NC_019563	TAA	2	6	241488	241493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790431
5020	NC_019563	ATG	2	6	241657	241662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790432
5021	NC_019563	CCT	2	6	241870	241875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	425790432
5022	NC_019563	A	6	6	241912	241917	100 %	0 %	0 %	0 %	425790432
5023	NC_019563	T	7	7	242039	242045	0 %	100 %	0 %	0 %	425790432
5024	NC_019563	TAT	2	6	242081	242086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790432
5025	NC_019563	GGTA	2	8	242111	242118	25 %	25 %	50 %	0 %	425790432
5026	NC_019563	ATA	3	9	242125	242133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790432
5027	NC_019563	T	6	6	242212	242217	0 %	100 %	0 %	0 %	425790432
5028	NC_019563	T	6	6	242267	242272	0 %	100 %	0 %	0 %	425790432
5029	NC_019563	GTA	2	6	242370	242375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790432
5030	NC_019563	CATA	2	8	242423	242430	50 %	25 %	0 %	25 %	425790432
5031	NC_019563	CAA	2	6	242496	242501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790432
5032	NC_019563	ACT	2	6	242536	242541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790432
5033	NC_019563	CTT	2	6	242609	242614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790432
5034	NC_019563	A	6	6	242663	242668	100 %	0 %	0 %	0 %	425790432
5035	NC_019563	T	8	8	242710	242717	0 %	100 %	0 %	0 %	425790432
5036	NC_019563	T	6	6	242733	242738	0 %	100 %	0 %	0 %	425790432
5037	NC_019563	ATC	2	6	242767	242772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790432
5038	NC_019563	A	7	7	242821	242827	100 %	0 %	0 %	0 %	425790432
5039	NC_019563	TTG	2	6	242896	242901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790432
5040	NC_019563	ATA	2	6	242902	242907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790432
5041	NC_019563	A	7	7	242968	242974	100 %	0 %	0 %	0 %	425790432
5042	NC_019563	GTT	2	6	242975	242980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790432
5043	NC_019563	TTGAT	2	10	242983	242992	20 %	60 %	20 %	0 %	425790432
5044	NC_019563	T	6	6	242997	243002	0 %	100 %	0 %	0 %	425790432
5045	NC_019563	AAAT	2	8	243058	243065	75 %	25 %	0 %	0 %	425790432
5046	NC_019563	CCA	2	6	243068	243073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790432
5047	NC_019563	A	6	6	243121	243126	100 %	0 %	0 %	0 %	425790432
5048	NC_019563	AGA	2	6	243228	243233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790432
5049	NC_019563	A	6	6	243233	243238	100 %	0 %	0 %	0 %	425790432
5050	NC_019563	T	6	6	243269	243274	0 %	100 %	0 %	0 %	425790432
5051	NC_019563	TGA	2	6	243284	243289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790432
5052	NC_019563	T	9	9	243345	243353	0 %	100 %	0 %	0 %	425790432
5053	NC_019563	TAT	2	6	243383	243388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_019563	GTG	2	6	243402	243407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_019563	AAT	2	6	243467	243472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_019563	TTG	2	6	243547	243552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_019563	AGC	2	6	243574	243579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_019563	AGC	2	6	243589	243594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_019563	CTG	2	6	243695	243700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_019563	CAC	2	6	243732	243737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_019563	T	6	6	243853	243858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_019563	CGG	2	6	243910	243915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_019563	A	6	6	244059	244064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_019563	AAAAG	2	10	244086	244095	80 %	0 %	20 %	0 %	425790433
5065	NC_019563	CTTT	2	8	244186	244193	0 %	75 %	0 %	25 %	425790433
5066	NC_019563	ATA	2	6	244223	244228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790433
5067	NC_019563	GAA	2	6	244243	244248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790433
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5069	NC_019563	A	6	6	244347	244352	100 %	0 %	0 %	0 %	425790433
5070	NC_019563	GCG	2	6	244366	244371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	425790433
5071	NC_019563	GTT	2	6	244393	244398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790433
5072	NC_019563	GTT	2	6	244474	244479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790433
5073	NC_019563	AAAC	2	8	244485	244492	75 %	0 %	0 %	25 %	425790433
5074	NC_019563	TTG	2	6	244549	244554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790433
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5076	NC_019563	A	6	6	244718	244723	100 %	0 %	0 %	0 %	425790433
5077	NC_019563	CAGG	2	8	244781	244788	25 %	0 %	50 %	25 %	425790433
5078	NC_019563	TTG	2	6	244829	244834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790433
5079	NC_019563	A	6	6	244850	244855	100 %	0 %	0 %	0 %	425790433
5080	NC_019563	A	6	6	244942	244947	100 %	0 %	0 %	0 %	425790433
5081	NC_019563	GAA	2	6	244948	244953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790433
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5083	NC_019563	AC	3	6	245052	245057	50 %	0 %	0 %	50 %	425790433
5084	NC_019563	TTC	2	6	245062	245067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	425790433
5085	NC_019563	CCGC	2	8	245076	245083	0 %	0 %	25 %	75 %	425790433
5086	NC_019563	ATT	2	6	245269	245274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790433
5087	NC_019563	AAT	2	6	245276	245281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790433
5088	NC_019563	AGCT	2	8	245467	245474	25 %	25 %	25 %	25 %	425790434
5089	NC_019563	AGGG	2	8	245498	245505	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_019563	GTT	2	6	245554	245559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_019563	CCT	2	6	245573	245578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_019563	GTT	2	6	245620	245625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_019563	T	6	6	245631	245636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_019563	TTTAA	2	10	245640	245649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_019563	AGA	2	6	245753	245758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790435
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5097	NC_019563	TTG	2	6	245853	245858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790435
5098	NC_019563	GT	3	6	245887	245892	0 %	50 %	50 %	0 %	425790435
5099	NC_019563	AAT	3	9	245920	245928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790436
5100	NC_019563	GAGC	2	8	245959	245966	25 %	0 %	50 %	25 %	425790436
5101	NC_019563	ATA	2	6	246006	246011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790436
5102	NC_019563	A	7	7	246068	246074	100 %	0 %	0 %	0 %	425790436
5103	NC_019563	TTA	2	6	246120	246125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	425790436
5104	NC_019563	A	6	6	246246	246251	100 %	0 %	0 %	0 %	425790436
5105	NC_019563	AGC	2	6	246262	246267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790436
5106	NC_019563	T	6	6	246284	246289	0 %	100 %	0 %	0 %	425790436
5107	NC_019563	GTG	2	6	246302	246307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790436
5108	NC_019563	GTG	2	6	246311	246316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790436
5109	NC_019563	ATG	2	6	246357	246362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790436
5110	NC_019563	CAAGCT	2	12	246373	246384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	425790436
5111	NC_019563	A	6	6	246441	246446	100 %	0 %	0 %	0 %	425790436
5112	NC_019563	TA	3	6	246448	246453	50 %	50 %	0 %	0 %	425790436
5113	NC_019563	A	6	6	246478	246483	100 %	0 %	0 %	0 %	425790437
5114	NC_019563	A	6	6	246682	246687	100 %	0 %	0 %	0 %	425790437
5115	NC_019563	A	6	6	246709	246714	100 %	0 %	0 %	0 %	425790437
5116	NC_019563	CAAG	2	8	246777	246784	50 %	0 %	25 %	25 %	425790437
5117	NC_019563	A	7	7	246844	246850	100 %	0 %	0 %	0 %	425790437
5118	NC_019563	GATT	2	8	246892	246899	25 %	50 %	25 %	0 %	425790437
5119	NC_019563	TTG	2	6	246905	246910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_019563	GAAA	2	8	246916	246923	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_019563	A	7	7	246947	246953	100 %	0 %	0 %	0 %	425790438
5122	NC_019563	T	6	6	246976	246981	0 %	100 %	0 %	0 %	425790438
5123	NC_019563	TC	3	6	247038	247043	0 %	50 %	0 %	50 %	425790438
5124	NC_019563	TGA	2	6	247058	247063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790438
5125	NC_019563	GCGGT	2	10	247123	247132	0 %	20 %	60 %	20 %	425790438
5126	NC_019563	A	7	7	247154	247160	100 %	0 %	0 %	0 %	425790438
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5128	NC_019563	ATG	2	6	247302	247307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790438
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5254	NC_019563	AGA	2	6	253649	253654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790441
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5256	NC_019563	GAT	2	6	253751	253756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790441
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5258	NC_019563	TCA	2	6	253858	253863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790441
5259	NC_019563	A	6	6	253927	253932	100 %	0 %	0 %	0 %	425790441
5260	NC_019563	AAG	2	6	253942	253947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790441
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5267	NC_019563	TCCA	2	8	254353	254360	25 %	25 %	0 %	50 %	425790441
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5270	NC_019563	CTTT	2	8	254580	254587	0 %	75 %	0 %	25 %	425790441
5271	NC_019563	T	6	6	254620	254625	0 %	100 %	0 %	0 %	425790441
5272	NC_019563	TGAA	2	8	254632	254639	50 %	25 %	25 %	0 %	425790441
5273	NC_019563	ATC	2	6	254640	254645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790441
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5279	NC_019563	A	6	6	254956	254961	100 %	0 %	0 %	0 %	425790441
5280	NC_019563	TGG	2	6	254962	254967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	425790441
5281	NC_019563	A	7	7	254988	254994	100 %	0 %	0 %	0 %	425790441
5282	NC_019563	CAA	2	6	255000	255005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	425790441
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5285	NC_019563	ATG	2	6	255141	255146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790441
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5323	NC_019563	AGA	2	6	257438	257443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790441
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5326	NC_019563	A	7	7	257551	257557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5327	NC_019563	CTA	2	6	257641	257646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790442
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5331	NC_019563	AGA	2	6	257724	257729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790442
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5352	NC_019563	TGGAT	2	10	258670	258679	20 %	40 %	40 %	0 %	425790444
5353	NC_019563	AAGAAA	2	12	258685	258696	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	425790444
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5355	NC_019563	GCA	2	6	258717	258722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	425790444
5356	NC_019563	TTGA	2	8	258756	258763	25 %	50 %	25 %	0 %	425790444
5357	NC_019563	AAAT	2	8	258890	258897	75 %	25 %	0 %	0 %	425790444
5358	NC_019563	TGAT	2	8	259045	259052	25 %	50 %	25 %	0 %	425790444
5359	NC_019563	AAT	2	6	259080	259085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790444
5360	NC_019563	GAA	2	6	259113	259118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790444
5361	NC_019563	A	6	6	259245	259250	100 %	0 %	0 %	0 %	425790444
5362	NC_019563	GTT	2	6	259264	259269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790444
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5365	NC_019563	ACT	2	6	259351	259356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	425790444
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5367	NC_019563	GAT	2	6	259434	259439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	425790444
5368	NC_019563	CCA	2	6	259552	259557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	425790444
5369	NC_019563	A	6	6	259563	259568	100 %	0 %	0 %	0 %	425790444
5370	NC_019563	TAA	2	6	259601	259606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	425790444
5371	NC_019563	GA	3	6	259607	259612	50 %	0 %	50 %	0 %	425790444
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5373	NC_019563	GTT	2	6	259707	259712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	425790444
5374	NC_019563	AG	3	6	259715	259720	50 %	0 %	50 %	0 %	425790444
5375	NC_019563	A	6	6	259783	259788	100 %	0 %	0 %	0 %	425790444
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5377	NC_019563	AAG	2	6	259846	259851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	425790444
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