MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 34855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018939	GAAAT	2	10	612272	612281	60 %	20 %	20 %	0 %	410682101
13002	NC_018939	T	6	6	612355	612360	0 %	100 %	0 %	0 %	410682101
13003	NC_018939	C	6	6	612403	612408	0 %	0 %	0 %	100 %	410682101
13004	NC_018939	TAA	2	6	612409	612414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410682101
13005	NC_018939	ATC	2	6	612415	612420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410682101
13006	NC_018939	AAAGTC	2	12	612443	612454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410682101
13007	NC_018939	TCAA	2	8	612476	612483	50 %	25 %	0 %	25 %	410682101
13008	NC_018939	CAAA	2	8	612586	612593	75 %	0 %	0 %	25 %	410682101
13009	NC_018939	ATAAA	2	10	612618	612627	80 %	20 %	0 %	0 %	410682101
13010	NC_018939	T	6	6	612663	612668	0 %	100 %	0 %	0 %	410682101
13011	NC_018939	CAA	2	6	612673	612678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410682101
13012	NC_018939	TTC	2	6	612766	612771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682101
13013	NC_018939	CAT	2	6	612783	612788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410682101
13014	NC_018939	GAA	2	6	612821	612826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410682101
13015	NC_018939	TCT	2	6	612839	612844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682101
13016	NC_018939	GGT	2	6	612856	612861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410682101
13017	NC_018939	TCAA	2	8	612869	612876	50 %	25 %	0 %	25 %	410682101
13018	NC_018939	GCA	2	6	612905	612910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410682101
13019	NC_018939	T	6	6	613008	613013	0 %	100 %	0 %	0 %	410682101
13020	NC_018939	TAA	2	6	613028	613033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410682102
13021	NC_018939	TCA	2	6	613115	613120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410682102
13022	NC_018939	ATG	2	6	613142	613147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410682102
13023	NC_018939	CGTCC	2	10	613201	613210	0 %	20 %	20 %	60 %	410682102
13024	NC_018939	ATT	2	6	613279	613284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410682102
13025	NC_018939	TGA	2	6	613287	613292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410682102
13026	NC_018939	TTC	2	6	613324	613329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682102
13027	NC_018939	TCA	2	6	613340	613345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410682102
13028	NC_018939	TGGTT	2	10	613356	613365	0 %	60 %	40 %	0 %	410682102
13029	NC_018939	TAT	2	6	613377	613382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410682102
13030	NC_018939	CTT	2	6	613404	613409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682102
13031	NC_018939	AAGA	2	8	613415	613422	75 %	0 %	25 %	0 %	410682102
13032	NC_018939	T	6	6	613444	613449	0 %	100 %	0 %	0 %	410682102
13033	NC_018939	T	6	6	613456	613461	0 %	100 %	0 %	0 %	410682102
13034	NC_018939	T	7	7	613470	613476	0 %	100 %	0 %	0 %	410682102
13035	NC_018939	T	7	7	613512	613518	0 %	100 %	0 %	0 %	410682102
13036	NC_018939	CTT	2	6	613521	613526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682102
13037	NC_018939	T	6	6	613525	613530	0 %	100 %	0 %	0 %	410682102
13038	NC_018939	CTC	2	6	613531	613536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410682102
13039	NC_018939	TAC	2	6	613537	613542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410682102
13040	NC_018939	T	6	6	613543	613548	0 %	100 %	0 %	0 %	410682102
13041	NC_018939	T	6	6	613567	613572	0 %	100 %	0 %	0 %	410682102
13042	NC_018939	AGGCTT	2	12	613633	613644	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410682102
13043	NC_018939	GCCA	2	8	613717	613724	25 %	0 %	25 %	50 %	410682102
13044	NC_018939	ATTTA	2	10	613804	613813	40 %	60 %	0 %	0 %	410682102
13045	NC_018939	A	7	7	613834	613840	100 %	0 %	0 %	0 %	410682102
13046	NC_018939	TCT	2	6	613841	613846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682102
13047	NC_018939	A	6	6	613859	613864	100 %	0 %	0 %	0 %	410682102
13048	NC_018939	ACAG	2	8	613886	613893	50 %	0 %	25 %	25 %	410682102
13049	NC_018939	GA	3	6	613897	613902	50 %	0 %	50 %	0 %	410682102
13050	NC_018939	A	6	6	613907	613912	100 %	0 %	0 %	0 %	410682102
13051	NC_018939	TAT	2	6	614014	614019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410682103
13052	NC_018939	CTT	2	6	614026	614031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682103
13053	NC_018939	TTC	2	6	614039	614044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682103
13054	NC_018939	TG	3	6	614211	614216	0 %	50 %	50 %	0 %	410682103
13055	NC_018939	T	10	10	614224	614233	0 %	100 %	0 %	0 %	410682103
13056	NC_018939	GCA	2	6	614259	614264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410682103
13057	NC_018939	TTTC	2	8	614386	614393	0 %	75 %	0 %	25 %	410682103
13058	NC_018939	T	6	6	614450	614455	0 %	100 %	0 %	0 %	410682103
13059	NC_018939	T	6	6	614498	614503	0 %	100 %	0 %	0 %	410682103
13060	NC_018939	CTT	2	6	614560	614565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682103
13061	NC_018939	T	7	7	614578	614584	0 %	100 %	0 %	0 %	410682103
13062	NC_018939	T	6	6	614601	614606	0 %	100 %	0 %	0 %	410682103
13063	NC_018939	GGT	2	6	614700	614705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410682103
13064	NC_018939	CTT	2	6	614734	614739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682103
13065	NC_018939	T	6	6	614794	614799	0 %	100 %	0 %	0 %	410682103
13066	NC_018939	AGC	2	6	614819	614824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410682103
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13068	NC_018939	TTCA	2	8	614896	614903	25 %	50 %	0 %	25 %	410682104
13069	NC_018939	TCACC	2	10	614934	614943	20 %	20 %	0 %	60 %	410682104
13070	NC_018939	CT	3	6	614981	614986	0 %	50 %	0 %	50 %	410682104
13071	NC_018939	CGG	2	6	614988	614993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410682104
13072	NC_018939	ATCA	2	8	615004	615011	50 %	25 %	0 %	25 %	410682104
13073	NC_018939	CAA	2	6	615040	615045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410682104
13074	NC_018939	TTC	2	6	615121	615126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682104
13075	NC_018939	TCTT	2	8	615151	615158	0 %	75 %	0 %	25 %	410682104
13076	NC_018939	TCTTTT	2	12	615170	615181	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410682104
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13078	NC_018939	ACTCT	2	10	615223	615232	20 %	40 %	0 %	40 %	410682104
13079	NC_018939	AGCT	2	8	615312	615319	25 %	25 %	25 %	25 %	410682105
13080	NC_018939	A	6	6	615341	615346	100 %	0 %	0 %	0 %	410682105
13081	NC_018939	CGC	2	6	615351	615356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410682105
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13083	NC_018939	TTC	3	9	615448	615456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682105
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13085	NC_018939	CAC	2	6	615559	615564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410682105
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13087	NC_018939	TCA	2	6	615597	615602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410682105
13088	NC_018939	TGCT	2	8	615671	615678	0 %	50 %	25 %	25 %	410682105
13089	NC_018939	CTT	2	6	615720	615725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410682105
13090	NC_018939	AAG	2	6	615729	615734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410682105
13091	NC_018939	CCA	2	6	615831	615836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410682105
13092	NC_018939	GGT	2	6	615868	615873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410682105
13093	NC_018939	TTGG	2	8	615874	615881	0 %	50 %	50 %	0 %	410682105
13094	NC_018939	AGC	2	6	615896	615901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410682105
13095	NC_018939	TTG	2	6	615910	615915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410682105
13096	NC_018939	CTTT	2	8	615961	615968	0 %	75 %	0 %	25 %	410682105
13097	NC_018939	T	6	6	616041	616046	0 %	100 %	0 %	0 %	410682106
13098	NC_018939	AAT	2	6	616052	616057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410682106
13099	NC_018939	AG	3	6	616095	616100	50 %	0 %	50 %	0 %	410682106
13100	NC_018939	T	6	6	616107	616112	0 %	100 %	0 %	0 %	410682106
13101	NC_018939	T	8	8	616208	616215	0 %	100 %	0 %	0 %	410682107
13102	NC_018939	GAT	2	6	616228	616233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410682107
13103	NC_018939	ATA	2	6	616280	616285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410682107
13104	NC_018939	GTG	2	6	616346	616351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410682107
13105	NC_018939	CCT	2	6	616358	616363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410682107
13106	NC_018939	TTTA	2	8	616396	616403	25 %	75 %	0 %	0 %	410682107
13107	NC_018939	T	6	6	616518	616523	0 %	100 %	0 %	0 %	410682107
13108	NC_018939	ACA	2	6	616556	616561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410682107
13109	NC_018939	TTTGA	2	10	616570	616579	20 %	60 %	20 %	0 %	410682107
13110	NC_018939	GA	3	6	616618	616623	50 %	0 %	50 %	0 %	410682107
13111	NC_018939	TGA	2	6	616635	616640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410682107
13112	NC_018939	GGA	2	6	616770	616775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410682107
13113	NC_018939	T	7	7	616929	616935	0 %	100 %	0 %	0 %	410682107
13114	NC_018939	GTT	2	6	617007	617012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410682107
13115	NC_018939	CTTTT	2	10	617059	617068	0 %	80 %	0 %	20 %	410682107
13116	NC_018939	AAT	2	6	617081	617086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410682107
13117	NC_018939	A	6	6	617114	617119	100 %	0 %	0 %	0 %	410682107
13118	NC_018939	TCA	2	6	617120	617125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410682107
13119	NC_018939	TTA	2	6	617141	617146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410682107
13120	NC_018939	TTA	2	6	617222	617227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410682107
13121	NC_018939	AG	3	6	617242	617247	50 %	0 %	50 %	0 %	410682107
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13252	NC_018939	A	6	6	623024	623029	100 %	0 %	0 %	0 %	410682112
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