MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 34855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_018937	A	6	6	661597	661602	100 %	0 %	0 %	0 %	410023850
14003	NC_018937	GGGA	2	8	661776	661783	25 %	0 %	75 %	0 %	410023850
14004	NC_018937	TTG	2	6	661785	661790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023850
14005	NC_018937	ATT	2	6	661792	661797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023850
14006	NC_018937	CAA	2	6	661818	661823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023850
14007	NC_018937	AGC	2	6	661941	661946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023850
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14009	NC_018937	AATTT	2	10	662048	662057	40 %	60 %	0 %	0 %	410023850
14010	NC_018937	TTTAA	2	10	662062	662071	40 %	60 %	0 %	0 %	410023850
14011	NC_018937	GTG	2	6	662148	662153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023851
14012	NC_018937	CTAAA	2	10	662333	662342	60 %	20 %	0 %	20 %	410023851
14013	NC_018937	AGA	2	6	662367	662372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023851
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14015	NC_018937	CAA	2	6	662418	662423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023851
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14017	NC_018937	TGG	2	6	662687	662692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023851
14018	NC_018937	G	6	6	662691	662696	0 %	0 %	100 %	0 %	410023851
14019	NC_018937	TGA	2	6	662799	662804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023851
14020	NC_018937	GTG	2	6	662821	662826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023851
14021	NC_018937	TTG	2	6	662833	662838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023851
14022	NC_018937	T	6	6	662999	663004	0 %	100 %	0 %	0 %	410023851
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14028	NC_018937	TGAT	2	8	663329	663336	25 %	50 %	25 %	0 %	410023851
14029	NC_018937	A	6	6	663383	663388	100 %	0 %	0 %	0 %	410023851
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14034	NC_018937	G	6	6	663511	663516	0 %	0 %	100 %	0 %	410023851
14035	NC_018937	AGA	2	6	663534	663539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023851
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14040	NC_018937	TTA	2	6	663607	663612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023851
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14044	NC_018937	CGAG	2	8	663973	663980	25 %	0 %	50 %	25 %	410023852
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14046	NC_018937	AGTG	2	8	664186	664193	25 %	25 %	50 %	0 %	410023852
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14048	NC_018937	G	6	6	664230	664235	0 %	0 %	100 %	0 %	410023852
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14052	NC_018937	GAG	2	6	664348	664353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410023852
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14058	NC_018937	AAAC	2	8	664719	664726	75 %	0 %	0 %	25 %	410023853
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14062	NC_018937	AG	4	8	664876	664883	50 %	0 %	50 %	0 %	410023853
14063	NC_018937	GA	3	6	664902	664907	50 %	0 %	50 %	0 %	410023853
14064	NC_018937	C	13	13	664971	664983	0 %	0 %	0 %	100 %	410023853
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14072	NC_018937	A	7	7	665125	665131	100 %	0 %	0 %	0 %	410023854
14073	NC_018937	ATT	2	6	665235	665240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023854
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14075	NC_018937	CAG	2	6	665351	665356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023854
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14086	NC_018937	TTGG	2	8	665998	666005	0 %	50 %	50 %	0 %	410023855
14087	NC_018937	GATG	2	8	666033	666040	25 %	25 %	50 %	0 %	410023855
14088	NC_018937	GATC	2	8	666069	666076	25 %	25 %	25 %	25 %	410023855
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14091	NC_018937	T	7	7	666141	666147	0 %	100 %	0 %	0 %	410023855
14092	NC_018937	TAA	2	6	666171	666176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023855
14093	NC_018937	AG	3	6	666207	666212	50 %	0 %	50 %	0 %	410023855
14094	NC_018937	T	6	6	666295	666300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_018937	GCC	2	6	666427	666432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023856
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14101	NC_018937	CTT	2	6	666597	666602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023856
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14103	NC_018937	GTT	2	6	666659	666664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023856
14104	NC_018937	T	7	7	666702	666708	0 %	100 %	0 %	0 %	410023856
14105	NC_018937	CAA	2	6	666709	666714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023856
14106	NC_018937	AAT	2	6	666759	666764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023856
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14108	NC_018937	GTTT	2	8	666862	666869	0 %	75 %	25 %	0 %	410023856
14109	NC_018937	TCGC	2	8	666887	666894	0 %	25 %	25 %	50 %	410023856
14110	NC_018937	TTG	2	6	666964	666969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023856
14111	NC_018937	TCCAAT	2	12	666980	666991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023856
14112	NC_018937	T	6	6	666991	666996	0 %	100 %	0 %	0 %	410023856
14113	NC_018937	GC	3	6	667113	667118	0 %	0 %	50 %	50 %	410023856
14114	NC_018937	TCAA	2	8	667127	667134	50 %	25 %	0 %	25 %	410023856
14115	NC_018937	TCAA	2	8	667181	667188	50 %	25 %	0 %	25 %	410023856
14116	NC_018937	A	6	6	667187	667192	100 %	0 %	0 %	0 %	410023856
14117	NC_018937	A	6	6	667253	667258	100 %	0 %	0 %	0 %	410023856
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14120	NC_018937	GTT	2	6	667372	667377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023856
14121	NC_018937	TCA	2	6	667424	667429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023856
14122	NC_018937	TCA	2	6	667451	667456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023856
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