MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 34855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018937	GAAAT	2	10	612271	612280	60 %	20 %	20 %	0 %	410023814
13002	NC_018937	T	6	6	612354	612359	0 %	100 %	0 %	0 %	410023814
13003	NC_018937	C	6	6	612402	612407	0 %	0 %	0 %	100 %	410023814
13004	NC_018937	TAA	2	6	612408	612413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023814
13005	NC_018937	ATC	2	6	612414	612419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023814
13006	NC_018937	AAAGTC	2	12	612442	612453	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410023814
13007	NC_018937	TCAA	2	8	612475	612482	50 %	25 %	0 %	25 %	410023814
13008	NC_018937	CAAA	2	8	612585	612592	75 %	0 %	0 %	25 %	410023814
13009	NC_018937	ATAAA	2	10	612617	612626	80 %	20 %	0 %	0 %	410023814
13010	NC_018937	T	6	6	612662	612667	0 %	100 %	0 %	0 %	410023814
13011	NC_018937	CAA	2	6	612672	612677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023814
13012	NC_018937	TTC	2	6	612765	612770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023814
13013	NC_018937	CAT	2	6	612782	612787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023814
13014	NC_018937	GAA	2	6	612820	612825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023814
13015	NC_018937	TCT	2	6	612838	612843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023814
13016	NC_018937	GGT	2	6	612855	612860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023814
13017	NC_018937	TCAA	2	8	612868	612875	50 %	25 %	0 %	25 %	410023814
13018	NC_018937	GCA	2	6	612904	612909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023814
13019	NC_018937	T	6	6	613007	613012	0 %	100 %	0 %	0 %	410023814
13020	NC_018937	TAA	2	6	613027	613032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023815
13021	NC_018937	TCA	2	6	613114	613119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023815
13022	NC_018937	ATG	2	6	613141	613146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023815
13023	NC_018937	CGTCC	2	10	613200	613209	0 %	20 %	20 %	60 %	410023815
13024	NC_018937	ATT	2	6	613278	613283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023815
13025	NC_018937	TGA	2	6	613286	613291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023815
13026	NC_018937	TTC	2	6	613323	613328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023815
13027	NC_018937	TCA	2	6	613339	613344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023815
13028	NC_018937	TGGTT	2	10	613355	613364	0 %	60 %	40 %	0 %	410023815
13029	NC_018937	TAT	2	6	613376	613381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023815
13030	NC_018937	CTT	2	6	613403	613408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023815
13031	NC_018937	AAGA	2	8	613414	613421	75 %	0 %	25 %	0 %	410023815
13032	NC_018937	T	6	6	613443	613448	0 %	100 %	0 %	0 %	410023815
13033	NC_018937	T	6	6	613455	613460	0 %	100 %	0 %	0 %	410023815
13034	NC_018937	T	7	7	613469	613475	0 %	100 %	0 %	0 %	410023815
13035	NC_018937	T	7	7	613511	613517	0 %	100 %	0 %	0 %	410023815
13036	NC_018937	CTT	2	6	613520	613525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023815
13037	NC_018937	T	6	6	613524	613529	0 %	100 %	0 %	0 %	410023815
13038	NC_018937	CTC	2	6	613530	613535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410023815
13039	NC_018937	TAC	2	6	613536	613541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023815
13040	NC_018937	T	6	6	613542	613547	0 %	100 %	0 %	0 %	410023815
13041	NC_018937	T	6	6	613566	613571	0 %	100 %	0 %	0 %	410023815
13042	NC_018937	AGGCTT	2	12	613632	613643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410023815
13043	NC_018937	GCCA	2	8	613716	613723	25 %	0 %	25 %	50 %	410023815
13044	NC_018937	ATTTA	2	10	613803	613812	40 %	60 %	0 %	0 %	410023815
13045	NC_018937	A	7	7	613833	613839	100 %	0 %	0 %	0 %	410023815
13046	NC_018937	TCT	2	6	613840	613845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023815
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13048	NC_018937	ACAG	2	8	613885	613892	50 %	0 %	25 %	25 %	410023815
13049	NC_018937	GA	3	6	613896	613901	50 %	0 %	50 %	0 %	410023815
13050	NC_018937	A	6	6	613906	613911	100 %	0 %	0 %	0 %	410023815
13051	NC_018937	TAT	2	6	614013	614018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023816
13052	NC_018937	CTT	2	6	614025	614030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023816
13053	NC_018937	TTC	2	6	614038	614043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023816
13054	NC_018937	TG	3	6	614210	614215	0 %	50 %	50 %	0 %	410023816
13055	NC_018937	T	10	10	614223	614232	0 %	100 %	0 %	0 %	410023816
13056	NC_018937	GCA	2	6	614258	614263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023816
13057	NC_018937	TTTC	2	8	614385	614392	0 %	75 %	0 %	25 %	410023816
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13059	NC_018937	T	6	6	614497	614502	0 %	100 %	0 %	0 %	410023816
13060	NC_018937	CTT	2	6	614559	614564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023816
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13062	NC_018937	T	6	6	614600	614605	0 %	100 %	0 %	0 %	410023816
13063	NC_018937	GGT	2	6	614699	614704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023816
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13065	NC_018937	T	6	6	614793	614798	0 %	100 %	0 %	0 %	410023816
13066	NC_018937	AGC	2	6	614818	614823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023816
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13068	NC_018937	TTCA	2	8	614895	614902	25 %	50 %	0 %	25 %	410023817
13069	NC_018937	TCACC	2	10	614933	614942	20 %	20 %	0 %	60 %	410023817
13070	NC_018937	CT	3	6	614980	614985	0 %	50 %	0 %	50 %	410023817
13071	NC_018937	CGG	2	6	614987	614992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410023817
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13073	NC_018937	CAA	2	6	615039	615044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023817
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13075	NC_018937	TCTT	2	8	615150	615157	0 %	75 %	0 %	25 %	410023817
13076	NC_018937	TCTTTT	2	12	615169	615180	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410023817
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13079	NC_018937	AGCT	2	8	615311	615318	25 %	25 %	25 %	25 %	410023818
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13081	NC_018937	CGC	2	6	615350	615355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023818
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13085	NC_018937	CAC	2	6	615558	615563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410023818
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13088	NC_018937	TGCT	2	8	615670	615677	0 %	50 %	25 %	25 %	410023818
13089	NC_018937	CTT	2	6	615719	615724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023818
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13093	NC_018937	TTGG	2	8	615873	615880	0 %	50 %	50 %	0 %	410023818
13094	NC_018937	AGC	2	6	615895	615900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023818
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13096	NC_018937	CTTT	2	8	615960	615967	0 %	75 %	0 %	25 %	410023818
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13101	NC_018937	T	8	8	616207	616214	0 %	100 %	0 %	0 %	410023820
13102	NC_018937	GAT	2	6	616227	616232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023820
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13104	NC_018937	GTG	2	6	616345	616350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023820
13105	NC_018937	CCT	2	6	616357	616362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410023820
13106	NC_018937	TTTA	2	8	616395	616402	25 %	75 %	0 %	0 %	410023820
13107	NC_018937	T	6	6	616517	616522	0 %	100 %	0 %	0 %	410023820
13108	NC_018937	ACA	2	6	616555	616560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410023820
13109	NC_018937	TTTGA	2	10	616569	616578	20 %	60 %	20 %	0 %	410023820
13110	NC_018937	GA	3	6	616617	616622	50 %	0 %	50 %	0 %	410023820
13111	NC_018937	TGA	2	6	616634	616639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023820
13112	NC_018937	GGA	2	6	616769	616774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410023820
13113	NC_018937	T	7	7	616928	616934	0 %	100 %	0 %	0 %	410023820
13114	NC_018937	GTT	2	6	617006	617011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023820
13115	NC_018937	CTTTT	2	10	617058	617067	0 %	80 %	0 %	20 %	410023820
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13118	NC_018937	TCA	2	6	617119	617124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023820
13119	NC_018937	TTA	2	6	617140	617145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023820
13120	NC_018937	TTA	2	6	617221	617226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023820
13121	NC_018937	AG	3	6	617241	617246	50 %	0 %	50 %	0 %	410023820
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