MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Rif1 chromosome

Total Repeats: 34855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018937	TGA	3	9	217129	217137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023447
4502	NC_018937	TTG	2	6	217145	217150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023447
4503	NC_018937	A	7	7	217308	217314	100 %	0 %	0 %	0 %	410023447
4504	NC_018937	AAG	2	6	217353	217358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023447
4505	NC_018937	ATTCT	2	10	217408	217417	20 %	60 %	0 %	20 %	410023447
4506	NC_018937	AATT	2	8	217431	217438	50 %	50 %	0 %	0 %	410023447
4507	NC_018937	A	6	6	217476	217481	100 %	0 %	0 %	0 %	410023447
4508	NC_018937	TAC	2	6	217487	217492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023447
4509	NC_018937	TTA	2	6	217514	217519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023447
4510	NC_018937	ATG	2	6	217560	217565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023447
4511	NC_018937	TGAA	2	8	217611	217618	50 %	25 %	25 %	0 %	410023447
4512	NC_018937	GAA	2	6	217679	217684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023447
4513	NC_018937	ATG	2	6	217689	217694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023447
4514	NC_018937	GAA	2	6	217733	217738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023447
4515	NC_018937	GAT	2	6	217822	217827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023447
4516	NC_018937	ATG	2	6	217968	217973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023447
4517	NC_018937	AACG	2	8	218021	218028	50 %	0 %	25 %	25 %	410023447
4518	NC_018937	CTT	2	6	218155	218160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_018937	CTT	2	6	218297	218302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023448
4520	NC_018937	T	6	6	218322	218327	0 %	100 %	0 %	0 %	410023448
4521	NC_018937	GCTT	2	8	218341	218348	0 %	50 %	25 %	25 %	410023448
4522	NC_018937	AACG	2	8	218438	218445	50 %	0 %	25 %	25 %	410023448
4523	NC_018937	CCT	2	6	218450	218455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410023448
4524	NC_018937	TA	5	10	218474	218483	50 %	50 %	0 %	0 %	410023448
4525	NC_018937	AGT	2	6	218639	218644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023448
4526	NC_018937	T	6	6	218655	218660	0 %	100 %	0 %	0 %	410023448
4527	NC_018937	CAT	2	6	218723	218728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023448
4528	NC_018937	T	6	6	218763	218768	0 %	100 %	0 %	0 %	410023448
4529	NC_018937	CTT	2	6	218792	218797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023448
4530	NC_018937	A	7	7	218812	218818	100 %	0 %	0 %	0 %	410023448
4531	NC_018937	T	6	6	218833	218838	0 %	100 %	0 %	0 %	410023448
4532	NC_018937	CTT	2	6	218886	218891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023448
4533	NC_018937	CT	3	6	218896	218901	0 %	50 %	0 %	50 %	410023448
4534	NC_018937	T	7	7	218990	218996	0 %	100 %	0 %	0 %	410023448
4535	NC_018937	A	7	7	219027	219033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_018937	CTTA	2	8	219070	219077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_018937	TGTT	2	8	219079	219086	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_018937	CTCA	2	8	219097	219104	25 %	25 %	0 %	50 %	410023449
4539	NC_018937	TCA	2	6	219167	219172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023449
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4541	NC_018937	CCA	2	6	219207	219212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410023449
4542	NC_018937	A	6	6	219232	219237	100 %	0 %	0 %	0 %	410023449
4543	NC_018937	GCC	2	6	219253	219258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023449
4544	NC_018937	G	6	6	219273	219278	0 %	0 %	100 %	0 %	410023449
4545	NC_018937	TGA	2	6	219342	219347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023449
4546	NC_018937	ATTCTA	2	12	219363	219374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410023449
4547	NC_018937	CT	3	6	219422	219427	0 %	50 %	0 %	50 %	410023449
4548	NC_018937	TGG	2	6	219429	219434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023449
4549	NC_018937	GAT	2	6	219460	219465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023449
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4551	NC_018937	TGCA	2	8	219505	219512	25 %	25 %	25 %	25 %	410023449
4552	NC_018937	TGA	2	6	219519	219524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023449
4553	NC_018937	AGCG	2	8	219595	219602	25 %	0 %	50 %	25 %	410023449
4554	NC_018937	GCA	2	6	219756	219761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410023449
4555	NC_018937	CTT	2	6	219816	219821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023449
4556	NC_018937	A	6	6	219848	219853	100 %	0 %	0 %	0 %	410023449
4557	NC_018937	CCT	2	6	219902	219907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410023449
4558	NC_018937	TAA	2	6	219948	219953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023449
4559	NC_018937	AGG	2	6	219988	219993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410023449
4560	NC_018937	GCAAA	2	10	220013	220022	60 %	0 %	20 %	20 %	410023449
4561	NC_018937	TCT	2	6	220058	220063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023449
4562	NC_018937	G	7	7	220075	220081	0 %	0 %	100 %	0 %	410023449
4563	NC_018937	A	7	7	220097	220103	100 %	0 %	0 %	0 %	410023449
4564	NC_018937	TGG	2	6	220197	220202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023449
4565	NC_018937	TGA	2	6	220209	220214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023449
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4567	NC_018937	T	6	6	220560	220565	0 %	100 %	0 %	0 %	410023450
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4569	NC_018937	CTT	2	6	220656	220661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023450
4570	NC_018937	T	7	7	220723	220729	0 %	100 %	0 %	0 %	410023450
4571	NC_018937	TCT	2	6	220802	220807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023450
4572	NC_018937	AAGC	2	8	220813	220820	50 %	0 %	25 %	25 %	410023450
4573	NC_018937	TCGGC	2	10	220826	220835	0 %	20 %	40 %	40 %	410023450
4574	NC_018937	ATC	2	6	220879	220884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023450
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4577	NC_018937	T	7	7	221043	221049	0 %	100 %	0 %	0 %	410023450
4578	NC_018937	CATAGC	2	12	221103	221114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410023450
4579	NC_018937	TGA	2	6	221118	221123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023450
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4581	NC_018937	ATGG	2	8	221218	221225	25 %	25 %	50 %	0 %	410023450
4582	NC_018937	TGG	2	6	221246	221251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023450
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4584	NC_018937	TGG	2	6	221369	221374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023450
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4586	NC_018937	AGGG	2	8	221448	221455	25 %	0 %	75 %	0 %	410023450
4587	NC_018937	GTTTTG	2	12	221608	221619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023450
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4592	NC_018937	GTT	2	6	221692	221697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023450
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4594	NC_018937	CCG	2	6	221850	221855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023450
4595	NC_018937	AC	3	6	221874	221879	50 %	0 %	0 %	50 %	410023450
4596	NC_018937	TAA	2	6	221904	221909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410023450
4597	NC_018937	C	7	7	221919	221925	0 %	0 %	0 %	100 %	410023450
4598	NC_018937	CTT	2	6	221937	221942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023450
4599	NC_018937	C	6	6	222079	222084	0 %	0 %	0 %	100 %	410023450
4600	NC_018937	ACCA	2	8	222085	222092	50 %	0 %	0 %	50 %	410023450
4601	NC_018937	CTTT	2	8	222104	222111	0 %	75 %	0 %	25 %	410023450
4602	NC_018937	TAAAA	2	10	222204	222213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_018937	GAT	2	6	222258	222263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023451
4604	NC_018937	TTG	2	6	222285	222290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023451
4605	NC_018937	CTA	2	6	222326	222331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023451
4606	NC_018937	AGA	2	6	222362	222367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023451
4607	NC_018937	TGT	2	6	222407	222412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410023451
4608	NC_018937	TGG	2	6	222441	222446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023451
4609	NC_018937	CTT	2	6	222538	222543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410023451
4610	NC_018937	ATC	2	6	222555	222560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023451
4611	NC_018937	ATT	2	6	222636	222641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023451
4612	NC_018937	TTA	2	6	222642	222647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023451
4613	NC_018937	AGG	2	6	222663	222668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410023451
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4615	NC_018937	CGG	2	6	222730	222735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410023451
4616	NC_018937	TGA	2	6	222736	222741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410023451
4617	NC_018937	TGG	2	6	222784	222789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410023451
4618	NC_018937	AGA	2	6	222794	222799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023451
4619	NC_018937	AGA	2	6	222824	222829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410023451
4620	NC_018937	TAT	2	6	222851	222856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410023451
4621	NC_018937	ACT	2	6	222909	222914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410023451
4622	NC_018937	CGC	2	6	223000	223005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410023451
4623	NC_018937	A	7	7	223196	223202	100 %	0 %	0 %	0 %	410023451
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