MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 11531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017944	GAT	2	6	43	48	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848880
2	NC_017944	CGA	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848880
3	NC_017944	GA	3	6	200	205	50 %	0 %	50 %	0 %	389848880
4	NC_017944	ACA	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848880
5	NC_017944	GCGG	2	8	289	296	0 %	0 %	75 %	25 %	389848880
6	NC_017944	CGG	2	6	309	314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848880
7	NC_017944	CGT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
8	NC_017944	GTC	2	6	425	430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
9	NC_017944	CG	3	6	448	453	0 %	0 %	50 %	50 %	389848880
10	NC_017944	TCG	2	6	490	495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
11	NC_017944	CAC	2	6	501	506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848880
12	NC_017944	GGA	2	6	623	628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848880
13	NC_017944	GAC	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848880
14	NC_017944	GTT	2	6	742	747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848880
15	NC_017944	CG	4	8	751	758	0 %	0 %	50 %	50 %	389848880
16	NC_017944	GTC	2	6	778	783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
17	NC_017944	TCG	2	6	800	805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
18	NC_017944	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848880
19	NC_017944	AG	3	6	826	831	50 %	0 %	50 %	0 %	389848880
20	NC_017944	GATGT	2	10	892	901	20 %	40 %	40 %	0 %	389848880
21	NC_017944	GA	3	6	983	988	50 %	0 %	50 %	0 %	389848880
22	NC_017944	CCG	2	6	1005	1010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848880
23	NC_017944	TGA	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848880
24	NC_017944	GCT	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
25	NC_017944	CTC	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848880
26	NC_017944	GTC	2	6	1162	1167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848880
27	NC_017944	GAG	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848880
28	NC_017944	TGT	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848880
29	NC_017944	ACC	2	6	1281	1286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017944	ACC	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017944	GTT	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017944	GTT	2	6	1383	1388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017944	GA	3	6	1425	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017944	ACG	2	6	1465	1470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017944	CCA	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017944	TA	3	6	1576	1581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017944	AC	3	6	1588	1593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017944	AAT	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017944	TA	3	6	1750	1755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017944	GGT	2	6	1803	1808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017944	TC	3	6	1853	1858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017944	G	6	6	1877	1882	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017944	GGAT	2	8	1983	1990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017944	GATA	2	8	1996	2003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017944	GAC	2	6	2060	2065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017944	TCC	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017944	GA	3	6	2145	2150	50 %	0 %	50 %	0 %	389848881
48	NC_017944	GTC	2	6	2165	2170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848881
49	NC_017944	CCCA	2	8	2189	2196	25 %	0 %	0 %	75 %	389848881
50	NC_017944	GTAG	2	8	2210	2217	25 %	25 %	50 %	0 %	389848881
51	NC_017944	ACC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
52	NC_017944	GAG	2	6	2249	2254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848881
53	NC_017944	ACT	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848881
54	NC_017944	CGTTT	2	10	2410	2419	0 %	60 %	20 %	20 %	389848881
55	NC_017944	GAT	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848881
56	NC_017944	AGT	2	6	2473	2478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848881
57	NC_017944	CCA	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
58	NC_017944	GAC	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848881
59	NC_017944	GT	3	6	2690	2695	0 %	50 %	50 %	0 %	389848881
60	NC_017944	CGA	2	6	2719	2724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848881
61	NC_017944	TTC	2	6	2825	2830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848881
62	NC_017944	CTT	2	6	2908	2913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848881
63	NC_017944	ACCG	2	8	2973	2980	25 %	0 %	25 %	50 %	389848881
64	NC_017944	CAGC	2	8	3001	3008	25 %	0 %	25 %	50 %	389848881
65	NC_017944	CCA	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
66	NC_017944	CCG	2	6	3127	3132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848881
67	NC_017944	GTC	2	6	3137	3142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848881
68	NC_017944	CAC	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848881
69	NC_017944	CGCC	2	8	3172	3179	0 %	0 %	25 %	75 %	389848881
70	NC_017944	GAA	2	6	3181	3186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848881
71	NC_017944	TGCC	2	8	3315	3322	0 %	25 %	25 %	50 %	389848881
72	NC_017944	GTA	2	6	3495	3500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848881
73	NC_017944	TCG	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848881
74	NC_017944	CGAG	2	8	3544	3551	25 %	0 %	50 %	25 %	389848881
75	NC_017944	A	6	6	3737	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017944	GAC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017944	GAGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017944	TAC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848882
79	NC_017944	GACT	2	8	3811	3818	25 %	25 %	25 %	25 %	389848882
80	NC_017944	TTC	2	6	3855	3860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848882
81	NC_017944	GTC	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848882
82	NC_017944	GGT	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848882
83	NC_017944	GC	3	6	3920	3925	0 %	0 %	50 %	50 %	389848882
84	NC_017944	CGA	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848882
85	NC_017944	CGG	2	6	3987	3992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017944	GAGT	2	8	4003	4010	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017944	CGGTC	2	10	4028	4037	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017944	CAC	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017944	ATG	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
90	NC_017944	TGA	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
91	NC_017944	GCC	2	6	4184	4189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
92	NC_017944	CAGTG	2	10	4202	4211	20 %	20 %	40 %	20 %	389848883
93	NC_017944	CGA	2	6	4243	4248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848883
94	NC_017944	CGC	2	6	4279	4284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
95	NC_017944	GCC	2	6	4340	4345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
96	NC_017944	GGA	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848883
97	NC_017944	ATC	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
98	NC_017944	GCTT	2	8	4500	4507	0 %	50 %	25 %	25 %	389848883
99	NC_017944	CGA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848883
100	NC_017944	CGC	2	6	4522	4527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
101	NC_017944	TCA	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
102	NC_017944	GAC	2	6	4556	4561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848883
103	NC_017944	GT	4	8	4562	4569	0 %	50 %	50 %	0 %	389848883
104	NC_017944	GCC	2	6	4577	4582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
105	NC_017944	TCG	2	6	4605	4610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848883
106	NC_017944	TTC	2	6	4628	4633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848883
107	NC_017944	CAT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
108	NC_017944	CGC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848883
109	NC_017944	CCGT	2	8	4659	4666	0 %	25 %	25 %	50 %	389848883
110	NC_017944	GAT	2	6	4703	4708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
111	NC_017944	CTC	2	6	4892	4897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848883
112	NC_017944	TGGG	2	8	4898	4905	0 %	25 %	75 %	0 %	389848883
113	NC_017944	AGG	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848883
114	NC_017944	GAT	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848883
115	NC_017944	TCT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848883
116	NC_017944	TCA	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848883
117	NC_017944	GTTG	2	8	5324	5331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017944	AT	3	6	5365	5370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017944	ATC	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017944	AAC	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848884
121	NC_017944	GGGA	2	8	5738	5745	25 %	0 %	75 %	0 %	389848884
122	NC_017944	TCC	2	6	5750	5755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848884
123	NC_017944	ACGA	2	8	5897	5904	50 %	0 %	25 %	25 %	389848884
124	NC_017944	CGA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848884
125	NC_017944	TGAC	2	8	6003	6010	25 %	25 %	25 %	25 %	389848884
126	NC_017944	CTG	2	6	6013	6018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017944	CGA	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017944	GAT	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017944	CGA	3	9	6075	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017944	TC	4	8	6121	6128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017944	GT	3	6	6215	6220	0 %	50 %	50 %	0 %	389848885
132	NC_017944	GGC	4	12	6300	6311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848885
133	NC_017944	CG	3	6	6351	6356	0 %	0 %	50 %	50 %	389848885
134	NC_017944	GTC	2	6	6445	6450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
135	NC_017944	GCC	3	9	6496	6504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848885
136	NC_017944	CGG	2	6	6544	6549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848885
137	NC_017944	GGTG	2	8	6555	6562	0 %	25 %	75 %	0 %	389848885
138	NC_017944	GCT	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848885
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500	NC_017944	TTTC	2	8	22800	22807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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