MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM500

Total Repeats: 11531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017944	GAG	2	6	69454	69459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848939
1503	NC_017944	TGA	2	6	69566	69571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848939
1504	NC_017944	AGG	2	6	69588	69593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848939
1505	NC_017944	CAT	2	6	69636	69641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848939
1506	NC_017944	GAC	2	6	69649	69654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848939
1507	NC_017944	ACG	2	6	69712	69717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848939
1508	NC_017944	GCA	2	6	69805	69810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848939
1509	NC_017944	GCA	2	6	69840	69845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_017944	TAG	2	6	69866	69871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017944	CTA	2	6	69940	69945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017944	GC	3	6	69971	69976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_017944	AGT	2	6	70052	70057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017944	TCG	2	6	70094	70099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848940
1515	NC_017944	CGA	2	6	70110	70115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848940
1516	NC_017944	CCG	2	6	70199	70204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848940
1517	NC_017944	GGC	2	6	70207	70212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848940
1518	NC_017944	GAGGTA	2	12	70216	70227	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	389848940
1519	NC_017944	CGA	2	6	70243	70248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848940
1520	NC_017944	GTTCT	2	10	70303	70312	0 %	60 %	20 %	20 %	389848940
1521	NC_017944	CATGTT	2	12	70333	70344	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	389848940
1522	NC_017944	CA	3	6	70401	70406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_017944	TC	3	6	70451	70456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_017944	TA	3	6	70463	70468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017944	ATA	2	6	70493	70498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017944	GTA	2	6	70503	70508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017944	GAGT	2	8	70571	70578	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017944	GAAC	2	8	70660	70667	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_017944	CCA	2	6	70675	70680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_017944	GGT	2	6	70720	70725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017944	CG	3	6	70730	70735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_017944	ATT	2	6	70776	70781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017944	GTT	2	6	70813	70818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017944	TCA	2	6	70860	70865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_017944	CCG	2	6	71027	71032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_017944	CAA	2	6	71150	71155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_017944	TGAG	2	8	71167	71174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017944	ACG	2	6	71233	71238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_017944	CCCAC	2	10	71255	71264	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1540	NC_017944	GAA	2	6	71272	71277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017944	GAG	2	6	71288	71293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017944	AGC	2	6	71345	71350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017944	CT	3	6	71400	71405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_017944	CAC	2	6	71520	71525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_017944	GAG	2	6	71571	71576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017944	AGT	2	6	71682	71687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017944	ACC	2	6	71701	71706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_017944	AACCCC	2	12	71745	71756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_017944	AACG	2	8	71802	71809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_017944	AG	3	6	71835	71840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017944	GAT	2	6	71841	71846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017944	CAA	2	6	71920	71925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017944	TCT	2	6	71929	71934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017944	AGT	2	6	71996	72001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017944	CGA	2	6	72024	72029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_017944	CAGT	2	8	72077	72084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_017944	CCA	2	6	72110	72115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_017944	AAT	2	6	72127	72132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017944	TGG	2	6	72165	72170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017944	TCT	2	6	72230	72235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017944	G	6	6	72247	72252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017944	AGC	3	9	72253	72261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_017944	GCTT	2	8	72299	72306	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_017944	TG	3	6	72323	72328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017944	GTT	2	6	72374	72379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017944	CTG	2	6	72382	72387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017944	T	6	6	72408	72413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017944	GATTC	2	10	72431	72440	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1569	NC_017944	TGC	2	6	72538	72543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1572	NC_017944	TAG	2	6	72763	72768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017944	GTTG	2	8	72811	72818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017944	ATTTA	2	10	72842	72851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1578	NC_017944	TCT	2	6	72963	72968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_017944	ATA	2	6	73006	73011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017944	ATT	2	6	73032	73037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017944	ATTTG	2	10	73050	73059	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1584	NC_017944	GT	3	6	73124	73129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017944	AT	3	6	73146	73151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017944	TA	3	6	73162	73167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017944	AAC	2	6	73294	73299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848941
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1601	NC_017944	GTG	2	6	73948	73953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848941
1602	NC_017944	CTA	2	6	73958	73963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017944	CCTG	2	8	73995	74002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_017944	TCG	2	6	74192	74197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1607	NC_017944	ATG	2	6	74297	74302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017944	TCT	2	6	74351	74356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_017944	TCG	2	6	74374	74379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_017944	CAAA	2	8	74412	74419	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_017944	CGG	2	6	74439	74444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_017944	GTC	2	6	74464	74469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_017944	GTCG	2	8	74476	74483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_017944	ATCAC	2	10	74592	74601	40 %	20 %	0 %	40 %	389848942
1615	NC_017944	GTCGG	2	10	74606	74615	0 %	20 %	60 %	20 %	389848942
1616	NC_017944	CGA	2	6	74639	74644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848942
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1622	NC_017944	CGAC	2	8	74723	74730	25 %	0 %	25 %	50 %	389848942
1623	NC_017944	GGT	2	6	74770	74775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848942
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1629	NC_017944	GCGAT	2	10	74900	74909	20 %	20 %	40 %	20 %	389848942
1630	NC_017944	GCC	2	6	74933	74938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848942
1631	NC_017944	GAG	2	6	74962	74967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848942
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