MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 7248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017943	GAC	2	6	10	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
2	NC_017943	GGT	2	6	25	30	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848588
3	NC_017943	GTCG	2	8	118	125	0 %	25 %	50 %	25 %	389848588
4	NC_017943	TGA	2	6	126	131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848588
5	NC_017943	GAGC	2	8	246	253	25 %	0 %	50 %	25 %	389848588
6	NC_017943	AC	3	6	321	326	50 %	0 %	0 %	50 %	389848588
7	NC_017943	GTCA	2	8	333	340	25 %	25 %	25 %	25 %	389848588
8	NC_017943	CTCGC	2	10	349	358	0 %	20 %	20 %	60 %	389848588
9	NC_017943	CAA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848588
10	NC_017943	TAC	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848588
11	NC_017943	CGA	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
12	NC_017943	CGA	3	9	501	509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
13	NC_017943	TCC	2	6	512	517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848588
14	NC_017943	CG	3	6	527	532	0 %	0 %	50 %	50 %	389848588
15	NC_017943	TCG	2	6	551	556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848588
16	NC_017943	ATC	2	6	571	576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848588
17	NC_017943	ACG	2	6	641	646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
18	NC_017943	ACG	2	6	665	670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
19	NC_017943	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
20	NC_017943	GC	3	6	755	760	0 %	0 %	50 %	50 %	389848588
21	NC_017943	GCA	2	6	763	768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
22	NC_017943	TCC	2	6	803	808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848588
23	NC_017943	CGA	2	6	855	860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
24	NC_017943	AGC	2	6	870	875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
25	NC_017943	GAAA	2	8	876	883	75 %	0 %	25 %	0 %	389848588
26	NC_017943	CTC	2	6	910	915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848588
27	NC_017943	CTCG	2	8	951	958	0 %	25 %	25 %	50 %	389848588
28	NC_017943	TCC	2	6	959	964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848588
29	NC_017943	GGC	2	6	970	975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848588
30	NC_017943	ACG	2	6	994	999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
31	NC_017943	GCG	2	6	1062	1067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848588
32	NC_017943	CTC	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848588
33	NC_017943	CTT	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848588
34	NC_017943	TGAG	2	8	1227	1234	25 %	25 %	50 %	0 %	389848588
35	NC_017943	CGT	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017943	TGC	3	9	1313	1321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017943	TCT	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017943	GAT	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017943	AAT	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017943	CAA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017943	AAT	2	6	1441	1446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017943	AAT	2	6	1459	1464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017943	ACC	2	6	1482	1487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017943	A	6	6	1570	1575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017943	TTTAC	2	10	1657	1666	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017943	ACT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017943	GTT	2	6	1778	1783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017943	ATT	2	6	1805	1810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017943	ATT	2	6	1814	1819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389848589
50	NC_017943	CAA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848589
51	NC_017943	GAT	2	6	1868	1873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848589
52	NC_017943	GCG	2	6	1891	1896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848589
53	NC_017943	TTC	2	6	1921	1926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848589
54	NC_017943	TCG	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848589
55	NC_017943	TCG	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848589
56	NC_017943	CTT	2	6	2087	2092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848589
57	NC_017943	TC	3	6	2135	2140	0 %	50 %	0 %	50 %	389848589
58	NC_017943	GCG	2	6	2167	2172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848589
59	NC_017943	GTC	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848589
60	NC_017943	GAT	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848590
61	NC_017943	TCG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848590
62	NC_017943	GTC	3	9	2348	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848590
63	NC_017943	GAA	2	6	2381	2386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848590
64	NC_017943	CGATG	2	10	2420	2429	20 %	20 %	40 %	20 %	389848590
65	NC_017943	TTTGG	2	10	2430	2439	0 %	60 %	40 %	0 %	389848590
66	NC_017943	GTC	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848590
67	NC_017943	GTCG	3	12	2466	2477	0 %	25 %	50 %	25 %	389848590
68	NC_017943	GGTC	2	8	2497	2504	0 %	25 %	50 %	25 %	389848590
69	NC_017943	GAC	2	6	2507	2512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848590
70	NC_017943	GCA	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848590
71	NC_017943	ACG	3	9	2679	2687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848590
72	NC_017943	GC	3	6	2735	2740	0 %	0 %	50 %	50 %	389848590
73	NC_017943	CAT	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848590
74	NC_017943	GAG	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848590
75	NC_017943	CTC	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848590
76	NC_017943	CGA	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848590
77	NC_017943	GTC	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848590
78	NC_017943	AGAC	2	8	3036	3043	50 %	0 %	25 %	25 %	389848590
79	NC_017943	ACTG	2	8	3044	3051	25 %	25 %	25 %	25 %	389848590
80	NC_017943	TGG	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848590
81	NC_017943	AAT	2	6	3107	3112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017943	CTAC	2	8	3204	3211	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017943	AAT	2	6	3259	3264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017943	AAT	2	6	3268	3273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017943	GTC	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017943	ATG	2	6	3384	3389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017943	AAG	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017943	GTC	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017943	GCA	2	6	3558	3563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017943	GA	3	6	3741	3746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017943	AT	3	6	3769	3774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017943	TTGA	2	8	3803	3810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017943	CGC	2	6	3836	3841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848591
94	NC_017943	AGTC	2	8	3899	3906	25 %	25 %	25 %	25 %	389848591
95	NC_017943	CGT	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848591
96	NC_017943	GGC	2	6	4076	4081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848591
97	NC_017943	CGG	2	6	4159	4164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848591
98	NC_017943	CGA	2	6	4174	4179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848591
99	NC_017943	TGA	2	6	4198	4203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848591
100	NC_017943	GAC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848591
101	NC_017943	CGA	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848591
102	NC_017943	CCG	2	6	4369	4374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848591
103	NC_017943	GGT	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848591
104	NC_017943	CGT	2	6	4402	4407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848591
105	NC_017943	GAG	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848591
106	NC_017943	TCGC	2	8	4578	4585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017943	TCG	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
108	NC_017943	CGG	2	6	4773	4778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848592
109	NC_017943	TCA	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848592
110	NC_017943	TTC	2	6	4816	4821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848592
111	NC_017943	CGA	2	6	4848	4853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
112	NC_017943	CGG	2	6	4872	4877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848592
113	NC_017943	CTT	2	6	4881	4886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848592
114	NC_017943	CGC	4	12	4905	4916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848592
115	NC_017943	TCG	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
116	NC_017943	CGT	4	12	5010	5021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
117	NC_017943	CGA	2	6	5067	5072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
118	NC_017943	CGT	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
119	NC_017943	GCG	2	6	5187	5192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848592
120	NC_017943	CGG	2	6	5229	5234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848592
121	NC_017943	TCG	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
122	NC_017943	CGA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
123	NC_017943	CTG	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
124	NC_017943	GTCA	2	8	5397	5404	25 %	25 %	25 %	25 %	389848592
125	NC_017943	GTC	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
126	NC_017943	CT	3	6	5434	5439	0 %	50 %	0 %	50 %	389848592
127	NC_017943	CTC	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848592
128	NC_017943	GTC	2	6	5467	5472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
129	NC_017943	AAC	2	6	5555	5560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848592
130	NC_017943	CGT	2	6	5601	5606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
131	NC_017943	GAC	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
132	NC_017943	GGACCG	2	12	5657	5668	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389848592
133	NC_017943	TG	3	6	5732	5737	0 %	50 %	50 %	0 %	389848592
134	NC_017943	ATC	2	6	5756	5761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848592
135	NC_017943	TCG	2	6	5768	5773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
136	NC_017943	GTTG	2	8	5787	5794	0 %	50 %	50 %	0 %	389848592
137	NC_017943	CCCGG	2	10	5797	5806	0 %	0 %	40 %	60 %	389848592
138	NC_017943	TCG	3	9	5819	5827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
139	NC_017943	ACC	2	6	5852	5857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848592
140	NC_017943	GCA	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
141	NC_017943	TTC	2	6	5932	5937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848592
142	NC_017943	ACG	3	9	5948	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
143	NC_017943	ACG	3	9	5980	5988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
144	NC_017943	CGGA	2	8	5990	5997	25 %	0 %	50 %	25 %	389848592
145	NC_017943	TTC	2	6	6038	6043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848592
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147	NC_017943	GAC	3	9	6064	6072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
148	NC_017943	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848592
149	NC_017943	TTCGA	2	10	6105	6114	20 %	40 %	20 %	20 %	389848592
150	NC_017943	ACC	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848592
151	NC_017943	TGA	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848592
152	NC_017943	CGT	3	9	6135	6143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
153	NC_017943	GCA	2	6	6174	6179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
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155	NC_017943	CGGT	2	8	6200	6207	0 %	25 %	50 %	25 %	389848592
156	NC_017943	GCC	2	6	6208	6213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848592
157	NC_017943	C	6	6	6483	6488	0 %	0 %	0 %	100 %	389848593
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171	NC_017943	CGA	2	6	7426	7431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848594
172	NC_017943	GCA	2	6	7442	7447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848594
173	NC_017943	TCG	2	6	7587	7592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848594
174	NC_017943	ACG	2	6	7602	7607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848594
175	NC_017943	TCG	2	6	7647	7652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848594
176	NC_017943	ACA	2	6	7659	7664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848594
177	NC_017943	TTC	2	6	7907	7912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848594
178	NC_017943	CG	3	6	7957	7962	0 %	0 %	50 %	50 %	389848594
179	NC_017943	ACG	2	6	8017	8022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848594
180	NC_017943	GTC	2	6	8041	8046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_017943	AT	4	8	8052	8059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017943	GACG	2	8	8296	8303	25 %	0 %	50 %	25 %	389848595
183	NC_017943	ACG	2	6	8315	8320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848595
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187	NC_017943	CA	3	6	8578	8583	50 %	0 %	0 %	50 %	389848596
188	NC_017943	ACTCAA	2	12	8632	8643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	389848596
189	NC_017943	GAC	2	6	8701	8706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848596
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203	NC_017943	GAC	2	6	9161	9166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848596
204	NC_017943	CG	3	6	9289	9294	0 %	0 %	50 %	50 %	389848596
205	NC_017943	TC	3	6	9334	9339	0 %	50 %	0 %	50 %	389848596
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212	NC_017943	GAC	2	6	9658	9663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848596
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214	NC_017943	ACC	2	6	9933	9938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848596
215	NC_017943	GAACG	2	10	9950	9959	40 %	0 %	40 %	20 %	389848596
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233	NC_017943	TAA	2	6	10556	10561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389848596
234	NC_017943	T	6	6	10578	10583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_017943	CGA	2	6	10588	10593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
236	NC_017943	GACG	2	8	10598	10605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
237	NC_017943	ACT	2	6	10662	10667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_017943	CCGAA	2	10	10674	10683	40 %	0 %	20 %	40 %	389848597
239	NC_017943	CTCG	2	8	10708	10715	0 %	25 %	25 %	50 %	389848597
240	NC_017943	GCAG	2	8	10760	10767	25 %	0 %	50 %	25 %	389848597
241	NC_017943	GCAA	2	8	10855	10862	50 %	0 %	25 %	25 %	389848597
242	NC_017943	TGG	2	6	10909	10914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848597
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244	NC_017943	TCG	2	6	11028	11033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848597
245	NC_017943	ATCGA	2	10	11043	11052	40 %	20 %	20 %	20 %	389848597
246	NC_017943	GTC	2	6	11095	11100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848597
247	NC_017943	CGA	2	6	11116	11121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848597
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249	NC_017943	ACC	2	6	11188	11193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848597
250	NC_017943	CTA	2	6	11263	11268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848597
251	NC_017943	GC	3	6	11291	11296	0 %	0 %	50 %	50 %	389848597
252	NC_017943	GAC	2	6	11326	11331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848597
253	NC_017943	GGA	2	6	11410	11415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_017943	CCT	2	6	11438	11443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_017943	TAC	2	6	11526	11531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848598
256	NC_017943	CGA	2	6	11540	11545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848598
257	NC_017943	TTCA	2	8	11625	11632	25 %	50 %	0 %	25 %	389848598
258	NC_017943	CAAC	2	8	11719	11726	50 %	0 %	0 %	50 %	389848598
259	NC_017943	CT	3	6	11763	11768	0 %	50 %	0 %	50 %	389848598
260	NC_017943	TCG	2	6	11785	11790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848598
261	NC_017943	CGC	2	6	11795	11800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848598
262	NC_017943	CGC	2	6	11813	11818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848598
263	NC_017943	CGA	2	6	11854	11859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848598
264	NC_017943	TCG	2	6	11908	11913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848598
265	NC_017943	CGAC	2	8	11918	11925	25 %	0 %	25 %	50 %	389848598
266	NC_017943	ATC	2	6	11949	11954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848598
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269	NC_017943	CGC	2	6	12106	12111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848598
270	NC_017943	ACTT	2	8	12239	12246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
271	NC_017943	TC	3	6	12258	12263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
272	NC_017943	TAA	2	6	12289	12294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017943	AC	4	8	12306	12313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
274	NC_017943	GAA	2	6	12339	12344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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387	NC_017943	GCG	2	6	17332	17337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848603
388	NC_017943	GACT	2	8	17391	17398	25 %	25 %	25 %	25 %	389848603
389	NC_017943	GGA	2	6	17407	17412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848603
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