MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 7248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017943	CG	3	6	171408	171413	0 %	0 %	50 %	50 %	389848741
4002	NC_017943	GTA	2	6	171470	171475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848741
4003	NC_017943	GA	3	6	171481	171486	50 %	0 %	50 %	0 %	389848741
4004	NC_017943	AGT	2	6	171573	171578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017943	GGGA	2	8	171709	171716	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017943	GCGT	2	8	171724	171731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_017943	GGT	2	6	171803	171808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848742
4008	NC_017943	G	6	6	171813	171818	0 %	0 %	100 %	0 %	389848742
4009	NC_017943	GCG	2	6	171854	171859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848742
4010	NC_017943	AGT	2	6	171919	171924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848742
4011	NC_017943	GAT	2	6	171936	171941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848742
4012	NC_017943	GTC	2	6	171953	171958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848742
4013	NC_017943	TTC	2	6	171966	171971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848742
4014	NC_017943	ACTA	2	8	172043	172050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_017943	TGA	2	6	172115	172120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017943	TAAA	2	8	172181	172188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017943	TGTC	2	8	172231	172238	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_017943	TG	3	6	172260	172265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017943	GTGC	2	8	172347	172354	0 %	25 %	50 %	25 %	389848743
4020	NC_017943	CGG	2	6	172447	172452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848743
4021	NC_017943	ACG	2	6	172465	172470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848743
4022	NC_017943	ACG	2	6	172492	172497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848743
4023	NC_017943	ACG	3	9	172503	172511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848743
4024	NC_017943	AGC	2	6	172552	172557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848743
4025	NC_017943	GGT	2	6	172638	172643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848743
4026	NC_017943	AAAC	2	8	172718	172725	75 %	0 %	0 %	25 %	389848743
4027	NC_017943	CGA	2	6	172841	172846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848743
4028	NC_017943	GAT	2	6	172989	172994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848743
4029	NC_017943	CACCGA	2	12	173033	173044	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	389848743
4030	NC_017943	GCC	2	6	173100	173105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848743
4031	NC_017943	ACG	2	6	173128	173133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848743
4032	NC_017943	CCA	2	6	173164	173169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848743
4033	NC_017943	GACG	2	8	173256	173263	25 %	0 %	50 %	25 %	389848743
4034	NC_017943	CGG	3	9	173372	173380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848743
4035	NC_017943	AGA	2	6	173487	173492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848743
4036	NC_017943	GA	3	6	173491	173496	50 %	0 %	50 %	0 %	389848743
4037	NC_017943	AG	3	6	173499	173504	50 %	0 %	50 %	0 %	389848743
4038	NC_017943	GGA	2	6	173549	173554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848743
4039	NC_017943	CGA	3	9	173561	173569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848743
4040	NC_017943	TC	3	6	173669	173674	0 %	50 %	0 %	50 %	389848743
4041	NC_017943	CGT	2	6	173693	173698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848743
4042	NC_017943	GAA	2	6	173699	173704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848743
4043	NC_017943	GA	3	6	173719	173724	50 %	0 %	50 %	0 %	389848743
4044	NC_017943	TCA	2	6	173728	173733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848743
4045	NC_017943	GAA	2	6	173775	173780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848743
4046	NC_017943	TCG	2	6	173801	173806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017943	TTG	2	6	173807	173812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017943	GAC	2	6	173813	173818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017943	TGA	2	6	173819	173824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017943	CTA	2	6	173847	173852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017943	GGT	2	6	173876	173881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017943	TAC	2	6	173887	173892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017943	AG	3	6	173965	173970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017943	ACA	2	6	173971	173976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_017943	ACG	2	6	174020	174025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848744
4056	NC_017943	TTC	2	6	174046	174051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848744
4057	NC_017943	CAA	2	6	174172	174177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848744
4058	NC_017943	CGA	2	6	174250	174255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848744
4059	NC_017943	TGG	2	6	174309	174314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848744
4060	NC_017943	AT	3	6	174317	174322	50 %	50 %	0 %	0 %	389848744
4061	NC_017943	CTTC	2	8	174338	174345	0 %	50 %	0 %	50 %	389848744
4062	NC_017943	GGT	2	6	174397	174402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848744
4063	NC_017943	GTCA	2	8	174504	174511	25 %	25 %	25 %	25 %	389848744
4064	NC_017943	CGT	2	6	174563	174568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848744
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4066	NC_017943	ATC	2	6	174778	174783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848744
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4068	NC_017943	CGT	3	9	174870	174878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848744
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4071	NC_017943	ATC	2	6	174987	174992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848744
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4074	NC_017943	CGTCAG	2	12	175050	175061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389848744
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4081	NC_017943	CGT	2	6	175296	175301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848745
4082	NC_017943	TCG	2	6	175376	175381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848745
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4086	NC_017943	CGA	2	6	175668	175673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848745
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4093	NC_017943	GGA	2	6	176124	176129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848746
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4095	NC_017943	CGT	2	6	176185	176190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848746
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4101	NC_017943	GA	3	6	176424	176429	50 %	0 %	50 %	0 %	389848746
4102	NC_017943	CGT	2	6	176521	176526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848746
4103	NC_017943	TTCC	2	8	176608	176615	0 %	50 %	0 %	50 %	389848746
4104	NC_017943	CCGTG	2	10	176668	176677	0 %	20 %	40 %	40 %	389848746
4105	NC_017943	ACGG	2	8	176740	176747	25 %	0 %	50 %	25 %	389848746
4106	NC_017943	CGG	2	6	176798	176803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848746
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4111	NC_017943	CCT	3	9	177013	177021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848746
4112	NC_017943	CTC	2	6	177104	177109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848746
4113	NC_017943	CATCGG	2	12	177151	177162	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389848746
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4245	NC_017943	CGA	2	6	182853	182858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848750
4246	NC_017943	CGA	2	6	182895	182900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848750
4247	NC_017943	GAA	2	6	182940	182945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848750
4248	NC_017943	TCG	2	6	182987	182992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848750
4249	NC_017943	CGA	3	9	182994	183002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848750
4250	NC_017943	CGAG	2	8	183060	183067	25 %	0 %	50 %	25 %	389848750
4251	NC_017943	ACC	2	6	183080	183085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848750
4252	NC_017943	ACC	2	6	183314	183319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848751
4253	NC_017943	GCAT	2	8	183357	183364	25 %	25 %	25 %	25 %	389848751
4254	NC_017943	CGA	2	6	183372	183377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848751
4255	NC_017943	CGA	2	6	183390	183395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848751
4256	NC_017943	GTTC	2	8	183483	183490	0 %	50 %	25 %	25 %	389848751
4257	NC_017943	GAC	2	6	183502	183507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848751
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4259	NC_017943	CTG	2	6	183607	183612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848751
4260	NC_017943	TTG	2	6	183619	183624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848751
4261	NC_017943	TTC	2	6	183640	183645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848751
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4263	NC_017943	ATCAT	2	10	183734	183743	40 %	40 %	0 %	20 %	389848751
4264	NC_017943	CGA	2	6	183777	183782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848751
4265	NC_017943	CG	3	6	183795	183800	0 %	0 %	50 %	50 %	389848751
4266	NC_017943	CTC	2	6	183805	183810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848751
4267	NC_017943	CCG	2	6	183863	183868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848751
4268	NC_017943	CGT	2	6	183882	183887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848751
4269	NC_017943	ATC	2	6	183905	183910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848751
4270	NC_017943	CCA	2	6	183947	183952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848751
4271	NC_017943	CG	3	6	184008	184013	0 %	0 %	50 %	50 %	389848751
4272	NC_017943	GTA	2	6	184027	184032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848751
4273	NC_017943	CTCG	2	8	184077	184084	0 %	25 %	25 %	50 %	389848751
4274	NC_017943	GGTC	2	8	184106	184113	0 %	25 %	50 %	25 %	389848751
4275	NC_017943	CGG	2	6	184187	184192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4276	NC_017943	GAG	2	6	184202	184207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848752
4277	NC_017943	GTC	2	6	184217	184222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848752
4278	NC_017943	CGG	2	6	184269	184274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848752
4279	NC_017943	GGC	2	6	184292	184297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848752
4280	NC_017943	GTC	2	6	184361	184366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848752
4281	NC_017943	TTC	2	6	184451	184456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848752
4282	NC_017943	TCC	2	6	184497	184502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848752
4283	NC_017943	GC	5	10	184511	184520	0 %	0 %	50 %	50 %	389848752
4284	NC_017943	GCT	2	6	184557	184562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848752
4285	NC_017943	CCA	2	6	184629	184634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848752
4286	NC_017943	TTC	2	6	184706	184711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848752
4287	NC_017943	GAT	2	6	184721	184726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848752
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4290	NC_017943	ACG	2	6	184798	184803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848752
4291	NC_017943	GAT	2	6	184832	184837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848752
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4294	NC_017943	GCC	2	6	184964	184969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848752
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4301	NC_017943	CCT	2	6	185374	185379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848752
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4305	NC_017943	TCG	2	6	185529	185534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848752
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4307	NC_017943	CA	3	6	185549	185554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4308	NC_017943	CAG	2	6	185563	185568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4309	NC_017943	ATG	2	6	185691	185696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4310	NC_017943	GACA	2	8	185721	185728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4311	NC_017943	TGT	2	6	185786	185791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4312	NC_017943	CTGCC	2	10	185818	185827	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4313	NC_017943	GAGG	2	8	185899	185906	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4314	NC_017943	CGA	2	6	185943	185948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848753
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4317	NC_017943	GCG	2	6	186090	186095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848753
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4319	NC_017943	ACC	2	6	186214	186219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4320	NC_017943	ACC	2	6	186258	186263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4321	NC_017943	TG	3	6	186284	186289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4322	NC_017943	CCG	2	6	186290	186295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4323	NC_017943	CGT	2	6	186358	186363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4324	NC_017943	CGT	2	6	186396	186401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848754
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4331	NC_017943	TTC	2	6	186928	186933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848754
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4334	NC_017943	ATA	2	6	187118	187123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389848754
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4337	NC_017943	TCG	2	6	187200	187205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848754
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4342	NC_017943	ACGG	2	8	187487	187494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4343	NC_017943	AG	3	6	187524	187529	50 %	0 %	50 %	0 %	389848755
4344	NC_017943	CTC	2	6	187635	187640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848755
4345	NC_017943	TG	3	6	187742	187747	0 %	50 %	50 %	0 %	389848755
4346	NC_017943	GACGG	2	10	187847	187856	20 %	0 %	60 %	20 %	389848755
4347	NC_017943	CTG	2	6	187890	187895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848755
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4350	NC_017943	GTC	2	6	188020	188025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848755
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4353	NC_017943	GTC	2	6	188103	188108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848755
4354	NC_017943	CT	3	6	188185	188190	0 %	50 %	0 %	50 %	389848755
4355	NC_017943	CAG	2	6	188408	188413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848755
4356	NC_017943	TCG	2	6	188482	188487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848755
4357	NC_017943	CTC	2	6	188565	188570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848755
4358	NC_017943	GAC	2	6	188598	188603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848755
4359	NC_017943	TCGTAC	2	12	188623	188634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	389848755
4360	NC_017943	GT	3	6	188686	188691	0 %	50 %	50 %	0 %	389848755
4361	NC_017943	CGA	2	6	188699	188704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848755
4362	NC_017943	CGT	2	6	188713	188718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848755
4363	NC_017943	CGA	2	6	188726	188731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848755
4364	NC_017943	CTT	2	6	188732	188737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848755
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4490	NC_017943	CAAG	2	8	194424	194431	50 %	0 %	25 %	25 %	389848761
4491	NC_017943	CGAA	2	8	194445	194452	50 %	0 %	25 %	25 %	389848761
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