MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 7248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017943	TGG	2	6	148303	148308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848717
3502	NC_017943	GTC	2	6	148375	148380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848717
3503	NC_017943	TCG	2	6	148445	148450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848717
3504	NC_017943	CGC	2	6	148454	148459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848717
3505	NC_017943	AAG	2	6	148519	148524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848717
3506	NC_017943	AGA	2	6	148575	148580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848717
3507	NC_017943	CGT	2	6	148581	148586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848717
3508	NC_017943	GAC	2	6	148615	148620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848717
3509	NC_017943	GACG	2	8	148650	148657	25 %	0 %	50 %	25 %	389848718
3510	NC_017943	CATCG	2	10	148698	148707	20 %	20 %	20 %	40 %	389848718
3511	NC_017943	TCGACG	2	12	148742	148753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	389848718
3512	NC_017943	CGA	2	6	148809	148814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848718
3513	NC_017943	GAGG	2	8	148827	148834	25 %	0 %	75 %	0 %	389848718
3514	NC_017943	TGA	2	6	148839	148844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848718
3515	NC_017943	GAA	2	6	148894	148899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848718
3516	NC_017943	CACGT	2	10	148900	148909	20 %	20 %	20 %	40 %	389848718
3517	NC_017943	TCG	2	6	148940	148945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848718
3518	NC_017943	TCG	2	6	148964	148969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848718
3519	NC_017943	TCC	2	6	149033	149038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848718
3520	NC_017943	TCG	3	9	149060	149068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848718
3521	NC_017943	AAG	2	6	149081	149086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848718
3522	NC_017943	GGT	2	6	149180	149185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848719
3523	NC_017943	GACC	2	8	149240	149247	25 %	0 %	25 %	50 %	389848719
3524	NC_017943	TGT	2	6	149248	149253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848719
3525	NC_017943	CTA	2	6	149318	149323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848719
3526	NC_017943	CGT	2	6	149342	149347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848719
3527	NC_017943	TAC	2	6	149352	149357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848719
3528	NC_017943	AGT	2	6	149392	149397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848719
3529	NC_017943	CGG	2	6	149403	149408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_017943	AC	3	6	149535	149540	50 %	0 %	0 %	50 %	389848720
3531	NC_017943	GCC	2	6	149619	149624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848720
3532	NC_017943	GAA	2	6	149628	149633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848720
3533	NC_017943	CGT	2	6	149657	149662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3534	NC_017943	CGT	2	6	149708	149713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3535	NC_017943	CCA	2	6	149789	149794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848720
3536	NC_017943	TCG	3	9	149814	149822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3537	NC_017943	TCG	2	6	149854	149859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3538	NC_017943	GAG	2	6	149943	149948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848720
3539	NC_017943	TCA	2	6	150010	150015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848720
3540	NC_017943	ACG	2	6	150067	150072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3541	NC_017943	CCG	2	6	150099	150104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848720
3542	NC_017943	CGC	2	6	150237	150242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848720
3543	NC_017943	AGGA	2	8	150298	150305	50 %	0 %	50 %	0 %	389848720
3544	NC_017943	AC	3	6	150332	150337	50 %	0 %	0 %	50 %	389848720
3545	NC_017943	AGTC	2	8	150343	150350	25 %	25 %	25 %	25 %	389848720
3546	NC_017943	CTT	2	6	150392	150397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848720
3547	NC_017943	GAC	2	6	150405	150410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3548	NC_017943	TGCCCG	2	12	150469	150480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	389848720
3549	NC_017943	GAC	2	6	150510	150515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3550	NC_017943	TAC	2	6	150618	150623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848720
3551	NC_017943	GAC	2	6	150710	150715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3552	NC_017943	GAC	2	6	150735	150740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3553	NC_017943	TTC	2	6	150744	150749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848720
3554	NC_017943	GAA	2	6	150753	150758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848720
3555	NC_017943	CGA	2	6	150821	150826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3556	NC_017943	TCG	2	6	150835	150840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848720
3557	NC_017943	GC	4	8	150867	150874	0 %	0 %	50 %	50 %	389848720
3558	NC_017943	GAG	2	6	150976	150981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848721
3559	NC_017943	AGCG	2	8	150990	150997	25 %	0 %	50 %	25 %	389848721
3560	NC_017943	GCC	2	6	151018	151023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848721
3561	NC_017943	CGG	2	6	151028	151033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848721
3562	NC_017943	GTGCT	2	10	151162	151171	0 %	40 %	40 %	20 %	389848721
3563	NC_017943	CGT	2	6	151285	151290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_017943	TCGC	2	8	151365	151372	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_017943	AGG	2	6	151426	151431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017943	CCGC	2	8	151437	151444	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3567	NC_017943	GTCG	2	8	151481	151488	0 %	25 %	50 %	25 %	389848722
3568	NC_017943	CGGTGA	2	12	151507	151518	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389848722
3569	NC_017943	CGTC	2	8	151561	151568	0 %	25 %	25 %	50 %	389848722
3570	NC_017943	CGC	2	6	151582	151587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848722
3571	NC_017943	GTCG	2	8	151592	151599	0 %	25 %	50 %	25 %	389848722
3572	NC_017943	TCG	2	6	151620	151625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3573	NC_017943	CGT	2	6	151627	151632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3574	NC_017943	CGA	2	6	151633	151638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3575	NC_017943	CT	3	6	151773	151778	0 %	50 %	0 %	50 %	389848722
3576	NC_017943	TCCG	2	8	151808	151815	0 %	25 %	25 %	50 %	389848722
3577	NC_017943	CGT	2	6	151858	151863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3578	NC_017943	CGA	2	6	151873	151878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3579	NC_017943	GTG	2	6	151884	151889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848722
3580	NC_017943	CCG	2	6	152083	152088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848722
3581	NC_017943	TCT	2	6	152094	152099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848722
3582	NC_017943	CGA	2	6	152200	152205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3583	NC_017943	GTG	2	6	152211	152216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848722
3584	NC_017943	CACTCA	2	12	152233	152244	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	389848722
3585	NC_017943	ATC	2	6	152255	152260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848722
3586	NC_017943	GGA	2	6	152284	152289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848722
3587	NC_017943	GCC	2	6	152421	152426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848722
3588	NC_017943	GTTC	2	8	152452	152459	0 %	50 %	25 %	25 %	389848722
3589	NC_017943	TCC	2	6	152475	152480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848722
3590	NC_017943	GAGTT	2	10	152487	152496	20 %	40 %	40 %	0 %	389848722
3591	NC_017943	CGC	2	6	152543	152548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848722
3592	NC_017943	ATC	2	6	152597	152602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848722
3593	NC_017943	GCA	2	6	152637	152642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3594	NC_017943	TTC	2	6	152688	152693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848722
3595	NC_017943	CAG	2	6	152725	152730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3596	NC_017943	CAGT	2	8	152745	152752	25 %	25 %	25 %	25 %	389848722
3597	NC_017943	AC	3	6	152788	152793	50 %	0 %	0 %	50 %	389848722
3598	NC_017943	TGCC	2	8	152896	152903	0 %	25 %	25 %	50 %	389848722
3599	NC_017943	CGC	2	6	152963	152968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848722
3600	NC_017943	CGA	2	6	152980	152985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3601	NC_017943	GTC	2	6	152999	153004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3602	NC_017943	GTC	3	9	153044	153052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3603	NC_017943	CA	3	6	153064	153069	50 %	0 %	0 %	50 %	389848722
3604	NC_017943	CGA	2	6	153091	153096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3605	NC_017943	CTTTGC	2	12	153100	153111	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	389848722
3606	NC_017943	C	6	6	153177	153182	0 %	0 %	0 %	100 %	389848722
3607	NC_017943	TGT	2	6	153193	153198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848722
3608	NC_017943	T	6	6	153367	153372	0 %	100 %	0 %	0 %	389848722
3609	NC_017943	GAC	2	6	153395	153400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848722
3610	NC_017943	TGT	2	6	153454	153459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848722
3611	NC_017943	T	6	6	153465	153470	0 %	100 %	0 %	0 %	389848722
3612	NC_017943	CGG	2	6	153481	153486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848722
3613	NC_017943	CGG	2	6	153517	153522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848722
3614	NC_017943	TGT	2	6	153571	153576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848722
3615	NC_017943	AT	3	6	153628	153633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017943	TGAGT	2	10	153680	153689	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017943	CTGT	3	12	153700	153711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_017943	TAG	2	6	153721	153726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017943	CGAG	2	8	153767	153774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_017943	CTA	2	6	153795	153800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3622	NC_017943	ACA	2	6	153866	153871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3989	NC_017943	TCG	2	6	170816	170821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848739
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