MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 7248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017943	ACA	2	6	241860	241865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_017943	TAT	2	6	241868	241873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017943	GCA	2	6	241987	241992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848808
5504	NC_017943	CATCA	2	10	242038	242047	40 %	20 %	0 %	40 %	389848808
5505	NC_017943	CAGA	2	8	242062	242069	50 %	0 %	25 %	25 %	389848808
5506	NC_017943	CGA	2	6	242139	242144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848808
5507	NC_017943	TCG	2	6	242171	242176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848808
5508	NC_017943	CGAC	2	8	242196	242203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_017943	TAGT	2	8	242233	242240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017943	CTT	2	6	242319	242324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848809
5511	NC_017943	ACAG	2	8	242477	242484	50 %	0 %	25 %	25 %	389848809
5512	NC_017943	CGAC	2	8	242516	242523	25 %	0 %	25 %	50 %	389848809
5513	NC_017943	ACC	2	6	242527	242532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848809
5514	NC_017943	GC	3	6	242564	242569	0 %	0 %	50 %	50 %	389848809
5515	NC_017943	T	6	6	242697	242702	0 %	100 %	0 %	0 %	389848809
5516	NC_017943	TGC	2	6	242706	242711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848809
5517	NC_017943	CCG	2	6	242771	242776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848809
5518	NC_017943	CTG	3	9	242850	242858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848809
5519	NC_017943	CCG	2	6	242868	242873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848809
5520	NC_017943	CGAA	2	8	242880	242887	50 %	0 %	25 %	25 %	389848809
5521	NC_017943	CAG	2	6	242892	242897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848809
5522	NC_017943	TCA	2	6	242901	242906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848809
5523	NC_017943	CTG	2	6	242916	242921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848809
5524	NC_017943	GCC	2	6	242944	242949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848809
5525	NC_017943	CGACC	2	10	243024	243033	20 %	0 %	20 %	60 %	389848809
5526	NC_017943	CATC	2	8	243039	243046	25 %	25 %	0 %	50 %	389848809
5527	NC_017943	ACC	2	6	243076	243081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848809
5528	NC_017943	CTT	2	6	243198	243203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848809
5529	NC_017943	CGC	2	6	243280	243285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848809
5530	NC_017943	ATT	2	6	243350	243355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017943	TAT	2	6	243365	243370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017943	AT	3	6	243369	243374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_017943	ACA	2	6	243380	243385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_017943	ACCAG	2	10	243434	243443	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5535	NC_017943	ACG	2	6	243476	243481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017943	ACAA	2	8	243557	243564	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5537	NC_017943	ACAG	2	8	243636	243643	50 %	0 %	25 %	25 %	389848810
5538	NC_017943	GGC	2	6	243739	243744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848810
5539	NC_017943	GAA	2	6	243788	243793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848810
5540	NC_017943	GAG	2	6	243894	243899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848810
5541	NC_017943	AGG	2	6	243922	243927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848810
5542	NC_017943	CG	4	8	243935	243942	0 %	0 %	50 %	50 %	389848810
5543	NC_017943	GTC	2	6	243996	244001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848810
5544	NC_017943	TCG	2	6	244003	244008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848810
5545	NC_017943	TCG	2	6	244081	244086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848810
5546	NC_017943	CCA	2	6	244101	244106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848810
5547	NC_017943	CA	3	6	244105	244110	50 %	0 %	0 %	50 %	389848810
5548	NC_017943	CGA	2	6	244136	244141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848810
5549	NC_017943	GTC	2	6	244143	244148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848810
5550	NC_017943	TGAC	2	8	244210	244217	25 %	25 %	25 %	25 %	389848810
5551	NC_017943	CTG	2	6	244319	244324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848811
5552	NC_017943	CTG	2	6	244389	244394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848811
5553	NC_017943	CTG	2	6	244398	244403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848811
5554	NC_017943	CA	3	6	244421	244426	50 %	0 %	0 %	50 %	389848811
5555	NC_017943	GACC	2	8	244481	244488	25 %	0 %	25 %	50 %	389848812
5556	NC_017943	GC	3	6	244495	244500	0 %	0 %	50 %	50 %	389848812
5557	NC_017943	GTT	2	6	244658	244663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848812
5558	NC_017943	GAG	2	6	244699	244704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848812
5559	NC_017943	CGA	2	6	244707	244712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848812
5560	NC_017943	GAG	2	6	244719	244724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848812
5561	NC_017943	GTC	2	6	244742	244747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848812
5562	NC_017943	GCA	2	6	244814	244819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848812
5563	NC_017943	GTCG	2	8	244840	244847	0 %	25 %	50 %	25 %	389848812
5564	NC_017943	CGA	3	9	244848	244856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848812
5565	NC_017943	CGT	2	6	244857	244862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848812
5566	NC_017943	CCCGT	2	10	244959	244968	0 %	20 %	20 %	60 %	389848812
5567	NC_017943	CAT	2	6	245005	245010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848812
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5569	NC_017943	CTG	2	6	245122	245127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848812
5570	NC_017943	CCCG	2	8	245136	245143	0 %	0 %	25 %	75 %	389848812
5571	NC_017943	CGC	2	6	245144	245149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848812
5572	NC_017943	AGT	2	6	245154	245159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848812
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5574	NC_017943	CGA	2	6	245214	245219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848812
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5576	NC_017943	CCAT	2	8	245300	245307	25 %	25 %	0 %	50 %	389848812
5577	NC_017943	TCG	2	6	245321	245326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848812
5578	NC_017943	GT	3	6	245392	245397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_017943	CTTC	2	8	245438	245445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_017943	TGG	2	6	245498	245503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017943	TA	3	6	245543	245548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017943	AAC	2	6	245637	245642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848813
5583	NC_017943	TCG	4	12	245652	245663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848813
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5585	NC_017943	CAT	2	6	245755	245760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848813
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5587	NC_017943	GAC	2	6	245855	245860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848813
5588	NC_017943	TCG	2	6	245871	245876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848813
5589	NC_017943	CGA	2	6	245890	245895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848813
5590	NC_017943	GTC	2	6	245897	245902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848813
5591	NC_017943	ACG	2	6	245906	245911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848813
5592	NC_017943	GACT	2	8	245975	245982	25 %	25 %	25 %	25 %	389848813
5593	NC_017943	TCG	2	6	246011	246016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_017943	ACCC	2	8	246130	246137	25 %	0 %	0 %	75 %	389848814
5595	NC_017943	TGT	2	6	246208	246213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848814
5596	NC_017943	CAG	2	6	246287	246292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848814
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5599	NC_017943	CAGC	2	8	246355	246362	25 %	0 %	25 %	50 %	389848814
5600	NC_017943	C	6	6	246411	246416	0 %	0 %	0 %	100 %	389848814
5601	NC_017943	GCA	2	6	246421	246426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848814
5602	NC_017943	AG	3	6	246476	246481	50 %	0 %	50 %	0 %	389848814
5603	NC_017943	CA	3	6	246482	246487	50 %	0 %	0 %	50 %	389848814
5604	NC_017943	CCG	3	9	246516	246524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848814
5605	NC_017943	TC	3	6	246543	246548	0 %	50 %	0 %	50 %	389848814
5606	NC_017943	TTC	2	6	246562	246567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848814
5607	NC_017943	ATTC	2	8	246573	246580	25 %	50 %	0 %	25 %	389848814
5608	NC_017943	GTTCC	2	10	246670	246679	0 %	40 %	20 %	40 %	389848814
5609	NC_017943	CGGA	2	8	246691	246698	25 %	0 %	50 %	25 %	389848814
5610	NC_017943	GAT	3	9	246720	246728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848814
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5613	NC_017943	TGGA	2	8	246850	246857	25 %	25 %	50 %	0 %	389848814
5614	NC_017943	CGA	2	6	246891	246896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848814
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5617	NC_017943	CTC	2	6	247047	247052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848814
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5619	NC_017943	GAG	2	6	247174	247179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848814
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5623	NC_017943	CGCA	2	8	247385	247392	25 %	0 %	25 %	50 %	389848814
5624	NC_017943	CTG	2	6	247436	247441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848814
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5989	NC_017943	CGA	2	6	264309	264314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848832
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5991	NC_017943	CCG	2	6	264349	264354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848832
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