MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 73186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017941	GGACGA	2	12	3	14	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	389845494
2	NC_017941	GTGGC	2	10	83	92	0 %	20 %	60 %	20 %	389845494
3	NC_017941	CCG	2	6	110	115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845494
4	NC_017941	CGA	2	6	162	167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
5	NC_017941	GTC	2	6	211	216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845494
6	NC_017941	ACG	4	12	221	232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
7	NC_017941	GTT	2	6	243	248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845494
8	NC_017941	CGA	2	6	249	254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
9	NC_017941	AGG	2	6	287	292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845494
10	NC_017941	TTC	2	6	293	298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845494
11	NC_017941	CGT	2	6	302	307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845494
12	NC_017941	CGC	2	6	311	316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845494
13	NC_017941	CGA	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
14	NC_017941	GACCGG	2	12	417	428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389845494
15	NC_017941	GTCA	2	8	451	458	25 %	25 %	25 %	25 %	389845494
16	NC_017941	ACG	2	6	485	490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
17	NC_017941	AC	3	6	530	535	50 %	0 %	0 %	50 %	389845494
18	NC_017941	GAA	2	6	576	581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845494
19	NC_017941	CGAA	2	8	585	592	50 %	0 %	25 %	25 %	389845494
20	NC_017941	CGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
21	NC_017941	AGA	2	6	639	644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845494
22	NC_017941	GAG	2	6	700	705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845494
23	NC_017941	CGA	2	6	723	728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
24	NC_017941	ACG	2	6	775	780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
25	NC_017941	TTC	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845494
26	NC_017941	GTC	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845494
27	NC_017941	CGA	2	6	828	833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
28	NC_017941	TCG	2	6	845	850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845494
29	NC_017941	CGA	2	6	861	866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
30	NC_017941	TC	3	6	879	884	0 %	50 %	0 %	50 %	389845494
31	NC_017941	GAG	2	6	991	996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845494
32	NC_017941	ACG	2	6	1016	1021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
33	NC_017941	CCAA	2	8	1022	1029	50 %	0 %	0 %	50 %	389845494
34	NC_017941	GACG	2	8	1083	1090	25 %	0 %	50 %	25 %	389845494
35	NC_017941	GCC	2	6	1108	1113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845494
36	NC_017941	CG	3	6	1137	1142	0 %	0 %	50 %	50 %	389845494
37	NC_017941	CG	3	6	1144	1149	0 %	0 %	50 %	50 %	389845494
38	NC_017941	GAA	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845494
39	NC_017941	CGT	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845494
40	NC_017941	ATC	2	6	1309	1314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845494
41	NC_017941	CTC	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845494
42	NC_017941	GAG	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845494
43	NC_017941	CA	3	6	1407	1412	50 %	0 %	0 %	50 %	389845494
44	NC_017941	CGT	3	9	1467	1475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845494
45	NC_017941	CT	3	6	1513	1518	0 %	50 %	0 %	50 %	389845494
46	NC_017941	CGA	2	6	1527	1532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845494
47	NC_017941	TCC	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845494
48	NC_017941	ACT	2	6	1654	1659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017941	CTG	2	6	1749	1754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017941	CTGT	2	8	1804	1811	0 %	50 %	25 %	25 %	389845495
51	NC_017941	GCT	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845495
52	NC_017941	CGACT	2	10	1945	1954	20 %	20 %	20 %	40 %	389845495
53	NC_017941	TGA	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845495
54	NC_017941	AGCG	2	8	2136	2143	25 %	0 %	50 %	25 %	389845495
55	NC_017941	CCG	2	6	2172	2177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845495
56	NC_017941	GAT	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845495
57	NC_017941	ACG	3	9	2282	2290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845495
58	NC_017941	GAC	2	6	2344	2349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845495
59	NC_017941	CGGTC	2	10	2384	2393	0 %	20 %	40 %	40 %	389845495
60	NC_017941	CA	3	6	2468	2473	50 %	0 %	0 %	50 %	389845495
61	NC_017941	TCG	2	6	2558	2563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845495
62	NC_017941	GCG	2	6	2610	2615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845495
63	NC_017941	GGGC	2	8	2626	2633	0 %	0 %	75 %	25 %	389845495
64	NC_017941	CGT	2	6	2637	2642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845495
65	NC_017941	TCA	2	6	2649	2654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845495
66	NC_017941	CGG	2	6	2725	2730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017941	GC	3	6	2750	2755	0 %	0 %	50 %	50 %	389845496
68	NC_017941	TCG	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845496
69	NC_017941	GAC	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845496
70	NC_017941	GTC	2	6	2852	2857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845496
71	NC_017941	GCC	2	6	2960	2965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845496
72	NC_017941	C	7	7	2977	2983	0 %	0 %	0 %	100 %	389845496
73	NC_017941	GTC	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845496
74	NC_017941	CGGA	2	8	3061	3068	25 %	0 %	50 %	25 %	389845496
75	NC_017941	ACG	2	6	3141	3146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845496
76	NC_017941	ACC	2	6	3210	3215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845496
77	NC_017941	CGG	2	6	3244	3249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845496
78	NC_017941	GAC	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845496
79	NC_017941	TGA	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845496
80	NC_017941	CGA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845496
81	NC_017941	CCT	2	6	3391	3396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845496
82	NC_017941	TCG	2	6	3453	3458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845496
83	NC_017941	GAA	2	6	3608	3613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845496
84	NC_017941	GCG	2	6	3614	3619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845496
85	NC_017941	GGCGTC	2	12	3659	3670	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	389845496
86	NC_017941	GAA	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845496
87	NC_017941	TGA	2	6	3771	3776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845496
88	NC_017941	ACG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845496
89	NC_017941	CGA	3	9	3826	3834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845496
90	NC_017941	ACG	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845496
91	NC_017941	CGA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845496
92	NC_017941	ACG	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845496
93	NC_017941	GAA	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845496
94	NC_017941	GGA	2	6	4087	4092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845496
95	NC_017941	TCG	2	6	4242	4247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845496
96	NC_017941	TCT	2	6	4297	4302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017941	CGCCC	2	10	4341	4350	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
98	NC_017941	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017941	GGT	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017941	GAC	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845497
101	NC_017941	CGA	2	6	4423	4428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845497
102	NC_017941	CCG	2	6	4492	4497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845497
103	NC_017941	CGGG	2	8	4499	4506	0 %	0 %	75 %	25 %	389845497
104	NC_017941	GC	3	6	4521	4526	0 %	0 %	50 %	50 %	389845497
105	NC_017941	TAC	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845497
106	NC_017941	CGA	2	6	4586	4591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845497
107	NC_017941	CGA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845497
108	NC_017941	CGG	2	6	4774	4779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845497
109	NC_017941	CGG	2	6	4811	4816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845497
110	NC_017941	CGA	2	6	4853	4858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845497
111	NC_017941	TCG	2	6	4882	4887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845497
112	NC_017941	CGA	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845497
113	NC_017941	CGG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845497
114	NC_017941	CGG	2	6	5003	5008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845497
115	NC_017941	GTC	2	6	5043	5048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845497
116	NC_017941	CGA	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845497
117	NC_017941	TCG	3	9	5080	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845497
118	NC_017941	CGA	2	6	5117	5122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845497
119	NC_017941	TCT	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845497
120	NC_017941	GCC	2	6	5181	5186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845497
121	NC_017941	TGC	2	6	5219	5224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845497
122	NC_017941	CGA	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845497
123	NC_017941	GTC	2	6	5295	5300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845497
124	NC_017941	GGT	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389845497
125	NC_017941	GC	4	8	5334	5341	0 %	0 %	50 %	50 %	389845497
126	NC_017941	GGC	2	6	5417	5422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845497
127	NC_017941	CCGA	2	8	5496	5503	25 %	0 %	25 %	50 %	389845497
128	NC_017941	GAC	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845497
129	NC_017941	CTC	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017941	ATC	2	6	5646	5651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845498
131	NC_017941	TGCG	2	8	5684	5691	0 %	25 %	50 %	25 %	389845498
132	NC_017941	TCG	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845498
133	NC_017941	AAC	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389845498
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263	NC_017941	TCG	2	6	10726	10731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845502
264	NC_017941	CGG	2	6	10734	10739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845502
265	NC_017941	ACT	2	6	10877	10882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845503
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284	NC_017941	TCTGT	2	10	11499	11508	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_017941	TGG	2	6	11709	11714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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