MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 73186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017941	CGGG	2	8	533253	533260	0 %	0 %	75 %	25 %	389846041
13502	NC_017941	CGA	2	6	533262	533267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846041
13503	NC_017941	CGT	3	9	533280	533288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846041
13504	NC_017941	AC	3	6	533293	533298	50 %	0 %	0 %	50 %	389846041
13505	NC_017941	TCG	2	6	533309	533314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846041
13506	NC_017941	CGT	2	6	533315	533320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846041
13507	NC_017941	CGT	2	6	533355	533360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846041
13508	NC_017941	ACTG	2	8	533385	533392	25 %	25 %	25 %	25 %	389846041
13509	NC_017941	GCC	2	6	533424	533429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846041
13510	NC_017941	AGTC	2	8	533442	533449	25 %	25 %	25 %	25 %	389846041
13511	NC_017941	CCCG	2	8	533466	533473	0 %	0 %	25 %	75 %	389846041
13512	NC_017941	CGA	3	9	533474	533482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846041
13513	NC_017941	CAG	2	6	533525	533530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_017941	ATCG	2	8	533540	533547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13515	NC_017941	CGA	3	9	533585	533593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846042
13516	NC_017941	CTC	2	6	533625	533630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389846042
13517	NC_017941	TCGTGT	2	12	533641	533652	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	389846042
13518	NC_017941	CTT	2	6	533694	533699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846042
13519	NC_017941	GTC	2	6	533718	533723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846042
13520	NC_017941	GTC	2	6	533799	533804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846042
13521	NC_017941	CAC	2	6	533900	533905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389846042
13522	NC_017941	GAA	2	6	534009	534014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389846042
13523	NC_017941	AGC	2	6	534048	534053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846042
13524	NC_017941	CTT	2	6	534072	534077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846042
13525	NC_017941	CTG	2	6	534099	534104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846042
13526	NC_017941	CG	3	6	534117	534122	0 %	0 %	50 %	50 %	389846042
13527	NC_017941	CG	3	6	534184	534189	0 %	0 %	50 %	50 %	389846042
13528	NC_017941	GTC	2	6	534220	534225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846042
13529	NC_017941	CT	3	6	534279	534284	0 %	50 %	0 %	50 %	389846042
13530	NC_017941	GTC	2	6	534285	534290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846042
13531	NC_017941	GAC	3	9	534317	534325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846042
13532	NC_017941	TTC	2	6	534327	534332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846042
13533	NC_017941	CAC	2	6	534387	534392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13534	NC_017941	TCAC	2	8	534408	534415	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13535	NC_017941	GA	3	6	534425	534430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_017941	ACC	2	6	534446	534451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13537	NC_017941	CAC	2	6	534529	534534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389846043
13538	NC_017941	TAG	2	6	534543	534548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389846043
13539	NC_017941	GGC	2	6	534585	534590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389846043
13540	NC_017941	GTT	2	6	534612	534617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389846043
13541	NC_017941	CGA	2	6	534639	534644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846043
13542	NC_017941	AC	3	6	534689	534694	50 %	0 %	0 %	50 %	389846043
13543	NC_017941	TCC	2	6	534729	534734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389846043
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13545	NC_017941	CGT	2	6	534830	534835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846043
13546	NC_017941	GTC	2	6	534893	534898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846043
13547	NC_017941	GGCG	2	8	534923	534930	0 %	0 %	75 %	25 %	389846043
13548	NC_017941	TCC	2	6	534984	534989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389846043
13549	NC_017941	AAG	2	6	535002	535007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389846043
13550	NC_017941	ACT	2	6	535131	535136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389846043
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13552	NC_017941	CTT	3	9	535156	535164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846043
13553	NC_017941	TGTC	2	8	535231	535238	0 %	50 %	25 %	25 %	389846043
13554	NC_017941	GTCA	2	8	535250	535257	25 %	25 %	25 %	25 %	389846043
13555	NC_017941	GT	3	6	535258	535263	0 %	50 %	50 %	0 %	389846043
13556	NC_017941	TGT	2	6	535391	535396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389846043
13557	NC_017941	TCGC	2	8	535402	535409	0 %	25 %	25 %	50 %	389846043
13558	NC_017941	CTG	2	6	535432	535437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846043
13559	NC_017941	GAG	2	6	535457	535462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389846043
13560	NC_017941	CACT	2	8	535481	535488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13561	NC_017941	ATAC	2	8	535522	535529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13562	NC_017941	GC	3	6	535549	535554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13563	NC_017941	GGT	2	6	535626	535631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389846044
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13565	NC_017941	ACG	2	6	535670	535675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846044
13566	NC_017941	ACTGT	2	10	535723	535732	20 %	40 %	20 %	20 %	389846044
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13569	NC_017941	CGT	2	6	535845	535850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846044
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13572	NC_017941	GAC	2	6	535933	535938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846044
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13575	NC_017941	TCG	2	6	536185	536190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846045
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13590	NC_017941	CGA	2	6	536731	536736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846045
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13592	NC_017941	GCT	2	6	536813	536818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846046
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13600	NC_017941	CGA	2	6	537048	537053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846046
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13604	NC_017941	CCGC	2	8	537126	537133	0 %	0 %	25 %	75 %	389846046
13605	NC_017941	CT	3	6	537173	537178	0 %	50 %	0 %	50 %	389846046
13606	NC_017941	GCC	2	6	537197	537202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846046
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13611	NC_017941	TC	3	6	537415	537420	0 %	50 %	0 %	50 %	389846046
13612	NC_017941	GC	3	6	537456	537461	0 %	0 %	50 %	50 %	389846046
13613	NC_017941	CGCT	2	8	537477	537484	0 %	25 %	25 %	50 %	389846046
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13617	NC_017941	CGTT	2	8	537654	537661	0 %	50 %	25 %	25 %	389846046
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