MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 73186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017941	GTGC	2	8	511190	511197	0 %	25 %	50 %	25 %	389846018
13002	NC_017941	CCG	2	6	511223	511228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846018
13003	NC_017941	TCC	2	6	511270	511275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389846018
13004	NC_017941	TCG	2	6	511342	511347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846018
13005	NC_017941	CGA	2	6	511385	511390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846018
13006	NC_017941	CGT	2	6	511439	511444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846018
13007	NC_017941	TCG	4	12	511513	511524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846018
13008	NC_017941	TCGTT	2	10	511670	511679	0 %	60 %	20 %	20 %	389846019
13009	NC_017941	GTTC	2	8	511745	511752	0 %	50 %	25 %	25 %	389846019
13010	NC_017941	TCG	2	6	511934	511939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846019
13011	NC_017941	TTC	2	6	511961	511966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846019
13012	NC_017941	CGT	2	6	512133	512138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846019
13013	NC_017941	CT	3	6	512155	512160	0 %	50 %	0 %	50 %	389846019
13014	NC_017941	TGC	2	6	512231	512236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846019
13015	NC_017941	TCT	2	6	512392	512397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_017941	GTTC	2	8	512416	512423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13017	NC_017941	GGAA	2	8	512528	512535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_017941	ACAA	2	8	512558	512565	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13019	NC_017941	ACG	2	6	512624	512629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_017941	ACG	2	6	512648	512653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_017941	TTCG	2	8	512691	512698	0 %	50 %	25 %	25 %	389846020
13022	NC_017941	CCGTT	2	10	512900	512909	0 %	40 %	20 %	40 %	389846020
13023	NC_017941	GTT	2	6	512941	512946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389846020
13024	NC_017941	TC	4	8	512950	512957	0 %	50 %	0 %	50 %	389846020
13025	NC_017941	GTC	2	6	512971	512976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846020
13026	NC_017941	CGTCT	2	10	512979	512988	0 %	40 %	20 %	40 %	389846020
13027	NC_017941	GGA	3	9	512999	513007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389846020
13028	NC_017941	GTC	2	6	513045	513050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846020
13029	NC_017941	GT	4	8	513056	513063	0 %	50 %	50 %	0 %	389846020
13030	NC_017941	GAC	2	6	513096	513101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846020
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13032	NC_017941	TCG	2	6	513319	513324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846020
13033	NC_017941	CGTCT	2	10	513369	513378	0 %	40 %	20 %	40 %	389846020
13034	NC_017941	GTTC	2	8	513448	513455	0 %	50 %	25 %	25 %	389846020
13035	NC_017941	GAC	2	6	513556	513561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_017941	CTG	3	9	513590	513598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_017941	GAT	2	6	513652	513657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_017941	ACC	2	6	513776	513781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13039	NC_017941	GGA	2	6	513838	513843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_017941	CGT	2	6	513977	513982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846021
13041	NC_017941	CG	4	8	514037	514044	0 %	0 %	50 %	50 %	389846021
13042	NC_017941	GGTC	2	8	514067	514074	0 %	25 %	50 %	25 %	389846021
13043	NC_017941	TCG	2	6	514183	514188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846021
13044	NC_017941	TGGCG	2	10	514274	514283	0 %	20 %	60 %	20 %	389846021
13045	NC_017941	GCC	2	6	514354	514359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846021
13046	NC_017941	GCGG	2	8	514362	514369	0 %	0 %	75 %	25 %	389846021
13047	NC_017941	GTG	2	6	514386	514391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389846021
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13049	NC_017941	CGT	2	6	514577	514582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846021
13050	NC_017941	CGA	2	6	514631	514636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846021
13051	NC_017941	CTT	2	6	514673	514678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846021
13052	NC_017941	TTC	2	6	514696	514701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846021
13053	NC_017941	GAG	2	6	514758	514763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389846021
13054	NC_017941	TC	3	6	514822	514827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_017941	GC	3	6	514867	514872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13056	NC_017941	GCA	2	6	514906	514911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_017941	CGG	2	6	515014	515019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_017941	CAC	2	6	515024	515029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13059	NC_017941	CGT	2	6	515055	515060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846022
13060	NC_017941	CCT	2	6	515097	515102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389846022
13061	NC_017941	GC	4	8	515109	515116	0 %	0 %	50 %	50 %	389846022
13062	NC_017941	GAA	2	6	515122	515127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389846022
13063	NC_017941	CGC	2	6	515130	515135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846022
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13065	NC_017941	CGT	2	6	515304	515309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846022
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13068	NC_017941	GAG	2	6	515389	515394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389846022
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13070	NC_017941	CT	3	6	515581	515586	0 %	50 %	0 %	50 %	389846023
13071	NC_017941	CGA	3	9	515619	515627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846023
13072	NC_017941	CGA	2	6	515646	515651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846023
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13074	NC_017941	GTC	2	6	515710	515715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846023
13075	NC_017941	CGC	2	6	515760	515765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846023
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13077	NC_017941	GATGTC	2	12	515911	515922	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389846023
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13082	NC_017941	CGA	2	6	516363	516368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846024
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13085	NC_017941	CTCG	2	8	516441	516448	0 %	25 %	25 %	50 %	389846024
13086	NC_017941	CCGA	2	8	516516	516523	25 %	0 %	25 %	50 %	389846024
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13089	NC_017941	CCT	2	6	516624	516629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389846024
13090	NC_017941	TCGG	2	8	516658	516665	0 %	25 %	50 %	25 %	389846024
13091	NC_017941	TCG	2	6	516680	516685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846024
13092	NC_017941	ACG	2	6	516686	516691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846024
13093	NC_017941	CGT	2	6	516807	516812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846024
13094	NC_017941	ACG	2	6	516866	516871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846024
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13101	NC_017941	GTT	2	6	517105	517110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_017941	GCC	2	6	517144	517149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_017941	TTG	2	6	517170	517175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_017941	CGG	2	6	517265	517270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389846025
13105	NC_017941	CGA	2	6	517328	517333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846025
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13107	NC_017941	GAAG	2	8	517463	517470	50 %	0 %	50 %	0 %	389846025
13108	NC_017941	CGC	2	6	517475	517480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846025
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13112	NC_017941	CAA	2	6	517853	517858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389846025
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13115	NC_017941	TCA	2	6	517915	517920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389846025
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13117	NC_017941	ACG	2	6	517942	517947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846025
13118	NC_017941	AT	3	6	518050	518055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_017941	AAC	2	6	518058	518063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_017941	ACTC	2	8	518115	518122	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13121	NC_017941	TCC	2	6	518143	518148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13122	NC_017941	TGC	2	6	518153	518158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_017941	CCG	3	9	518173	518181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13124	NC_017941	GTC	2	6	518204	518209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_017941	CG	3	6	518216	518221	0 %	0 %	50 %	50 %	389846026
13126	NC_017941	TCTA	2	8	518267	518274	25 %	50 %	0 %	25 %	389846026
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13149	NC_017941	GTC	2	6	519105	519110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846026
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13154	NC_017941	CAC	2	6	519330	519335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13155	NC_017941	GAC	2	6	519425	519430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846027
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13221	NC_017941	GTTC	2	8	521933	521940	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13222	NC_017941	CG	3	6	521965	521970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13226	NC_017941	GGGAT	2	10	522086	522095	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13227	NC_017941	CCG	2	6	522108	522113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13228	NC_017941	GGTC	2	8	522215	522222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13229	NC_017941	AGCG	2	8	522246	522253	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13230	NC_017941	CCGA	2	8	522314	522321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13231	NC_017941	GTCGCC	2	12	522322	522333	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13232	NC_017941	TGA	2	6	522344	522349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_017941	CTA	2	6	522350	522355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389846031
13234	NC_017941	GAC	2	6	522356	522361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846031
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13237	NC_017941	TCG	2	6	522432	522437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846031
13238	NC_017941	GC	3	6	522460	522465	0 %	0 %	50 %	50 %	389846031
13239	NC_017941	AGAC	2	8	522543	522550	50 %	0 %	25 %	25 %	389846031
13240	NC_017941	AGG	2	6	522628	522633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389846031
13241	NC_017941	TCG	3	9	522660	522668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846031
13242	NC_017941	GCG	2	6	522684	522689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389846031
13243	NC_017941	GCG	2	6	522705	522710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389846031
13244	NC_017941	CGTTCG	2	12	522715	522726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846031
13245	NC_017941	CG	3	6	522725	522730	0 %	0 %	50 %	50 %	389846031
13246	NC_017941	CTC	2	6	522809	522814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389846031
13247	NC_017941	AGG	2	6	522837	522842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389846031
13248	NC_017941	GTCG	2	8	522868	522875	0 %	25 %	50 %	25 %	389846031
13249	NC_017941	CGGGA	2	10	522926	522935	20 %	0 %	60 %	20 %	389846031
13250	NC_017941	TTC	2	6	522965	522970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846031
13251	NC_017941	GCG	2	6	522984	522989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389846031
13252	NC_017941	CAAG	2	8	523097	523104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13253	NC_017941	CGC	2	6	523219	523224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846032
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13273	NC_017941	CTCGA	2	10	524174	524183	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13274	NC_017941	TATC	2	8	524242	524249	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13275	NC_017941	CGC	3	9	524290	524298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13276	NC_017941	CAT	2	6	524388	524393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389846033
13277	NC_017941	GCTG	2	8	524396	524403	0 %	25 %	50 %	25 %	389846033
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13347	NC_017941	CTG	2	6	526659	526664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846034
13348	NC_017941	CGT	2	6	526722	526727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846034
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13350	NC_017941	CGG	2	6	526829	526834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389846034
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13352	NC_017941	GCC	2	6	526896	526901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846034
13353	NC_017941	ACC	2	6	526917	526922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389846034
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13355	NC_017941	GTGG	2	8	526952	526959	0 %	25 %	75 %	0 %	389846034
13356	NC_017941	CGT	2	6	526967	526972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846034
13357	NC_017941	CTT	2	6	526979	526984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846034
13358	NC_017941	TC	3	6	527006	527011	0 %	50 %	0 %	50 %	389846034
13359	NC_017941	CGA	2	6	527012	527017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846034
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13361	NC_017941	TCG	2	6	527048	527053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846034
13362	NC_017941	TGA	2	6	527075	527080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389846034
13363	NC_017941	GAG	2	6	527184	527189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389846034
13364	NC_017941	GTT	2	6	527193	527198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389846034
13365	NC_017941	GAT	2	6	527208	527213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389846034
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13368	NC_017941	CGA	3	9	527303	527311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846034
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13379	NC_017941	TGC	2	6	527901	527906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13382	NC_017941	GGATA	2	10	528076	528085	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13383	NC_017941	TCT	2	6	528258	528263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389846036
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13393	NC_017941	TCG	2	6	528725	528730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846036
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13397	NC_017941	GCGA	2	8	529078	529085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13398	NC_017941	GAT	2	6	529116	529121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13399	NC_017941	ATACC	2	10	529177	529186	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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13401	NC_017941	CTG	2	6	529214	529219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13403	NC_017941	GTC	2	6	529343	529348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846037
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13481	NC_017941	CATC	2	8	532536	532543	25 %	25 %	0 %	50 %	389846041
13482	NC_017941	GCC	2	6	532568	532573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389846041
13483	NC_017941	CGAC	3	12	532592	532603	25 %	0 %	25 %	50 %	389846041
13484	NC_017941	G	7	7	532672	532678	0 %	0 %	100 %	0 %	389846041
13485	NC_017941	CTG	2	6	532679	532684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389846041
13486	NC_017941	CGA	2	6	532725	532730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846041
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13490	NC_017941	GAC	2	6	532954	532959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389846041
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