MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 73186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017941	CGC	2	6	453549	453554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845973
11502	NC_017941	CGA	2	6	453606	453611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845973
11503	NC_017941	TCC	2	6	453642	453647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845973
11504	NC_017941	CCA	2	6	453651	453656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845973
11505	NC_017941	GAC	2	6	453667	453672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845973
11506	NC_017941	CAA	2	6	453693	453698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389845973
11507	NC_017941	CGC	2	6	453699	453704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845973
11508	NC_017941	CGC	2	6	453708	453713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845973
11509	NC_017941	CGA	2	6	453726	453731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845973
11510	NC_017941	CAC	2	6	453772	453777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389845973
11511	NC_017941	CA	3	6	453786	453791	50 %	0 %	0 %	50 %	389845973
11512	NC_017941	TCT	2	6	453797	453802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845973
11513	NC_017941	CGA	2	6	453810	453815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845973
11514	NC_017941	GAA	2	6	453838	453843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389845973
11515	NC_017941	GAG	2	6	453961	453966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845973
11516	NC_017941	AGG	2	6	454149	454154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845973
11517	NC_017941	CGA	2	6	454230	454235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845973
11518	NC_017941	GAG	2	6	454246	454251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845973
11519	NC_017941	CGA	2	6	454266	454271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845973
11520	NC_017941	TCG	2	6	454348	454353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11521	NC_017941	CGA	2	6	454355	454360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11522	NC_017941	CGT	2	6	454364	454369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11523	NC_017941	TCG	2	6	454445	454450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11524	NC_017941	CTCG	2	8	454469	454476	0 %	25 %	25 %	50 %	389845974
11525	NC_017941	ACG	2	6	454477	454482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11526	NC_017941	GTA	2	6	454509	454514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845974
11527	NC_017941	GCCGTT	2	12	454515	454526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11528	NC_017941	CGAC	2	8	454610	454617	25 %	0 %	25 %	50 %	389845974
11529	NC_017941	CGT	3	9	454637	454645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11530	NC_017941	CGG	2	6	454646	454651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845974
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11532	NC_017941	GTC	2	6	454743	454748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11533	NC_017941	GAC	2	6	454770	454775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11534	NC_017941	GCT	2	6	454777	454782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11535	NC_017941	CGT	2	6	454785	454790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
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11539	NC_017941	CG	3	6	454865	454870	0 %	0 %	50 %	50 %	389845974
11540	NC_017941	CAG	2	6	454878	454883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845974
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11542	NC_017941	TGC	2	6	454917	454922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11543	NC_017941	ACG	2	6	454969	454974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845974
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11545	NC_017941	CGT	2	6	455069	455074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11546	NC_017941	CGAGCA	2	12	455078	455089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11547	NC_017941	GTC	3	9	455190	455198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
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11549	NC_017941	CGT	2	6	455306	455311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
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11553	NC_017941	CGAA	2	8	455428	455435	50 %	0 %	25 %	25 %	389845974
11554	NC_017941	TGC	2	6	455480	455485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11555	NC_017941	CGT	2	6	455528	455533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11556	NC_017941	CCG	3	9	455552	455560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845974
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11558	NC_017941	TCG	2	6	455587	455592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845974
11559	NC_017941	GCG	2	6	455614	455619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845974
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11561	NC_017941	GAA	2	6	455750	455755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_017941	GCC	2	6	455785	455790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11563	NC_017941	GGT	2	6	455857	455862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_017941	GGC	3	9	455879	455887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_017941	TC	3	6	455891	455896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_017941	GCC	2	6	456016	456021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11567	NC_017941	GGT	2	6	456088	456093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_017941	GGC	3	9	456110	456118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_017941	TGT	2	6	456124	456129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_017941	CGCC	2	8	456159	456166	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11571	NC_017941	GGT	2	6	456262	456267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_017941	AGC	2	6	456352	456357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_017941	TGT	2	6	456526	456531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_017941	CTC	2	6	456641	456646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11597	NC_017941	GA	3	6	457956	457961	50 %	0 %	50 %	0 %	389845975
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11602	NC_017941	CGT	2	6	458097	458102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845975
11603	NC_017941	GCC	2	6	458104	458109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845975
11604	NC_017941	GGC	2	6	458143	458148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845975
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11608	NC_017941	TCG	2	6	458232	458237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845975
11609	NC_017941	GAT	2	6	458292	458297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845975
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11611	NC_017941	AGC	2	6	458386	458391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11614	NC_017941	CGA	2	6	458527	458532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845976
11615	NC_017941	TCG	2	6	458577	458582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845976
11616	NC_017941	TCACGT	2	12	458593	458604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	389845976
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11739	NC_017941	CAT	2	6	464142	464147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845982
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11767	NC_017941	TCG	2	6	464921	464926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845983
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11976	NC_017941	GAT	2	6	472841	472846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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