MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 73186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017941	TCG	2	6	431998	432003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845950
11003	NC_017941	TCA	2	6	432067	432072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845950
11004	NC_017941	TCA	2	6	432115	432120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845950
11005	NC_017941	CCGG	2	8	432136	432143	0 %	0 %	50 %	50 %	389845950
11006	NC_017941	GTC	2	6	432171	432176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845950
11007	NC_017941	GTC	2	6	432180	432185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845950
11008	NC_017941	GTC	2	6	432267	432272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845950
11009	NC_017941	TGA	3	9	432280	432288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389845950
11010	NC_017941	ACG	2	6	432327	432332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845950
11011	NC_017941	TCG	2	6	432340	432345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845950
11012	NC_017941	GCC	2	6	432476	432481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845951
11013	NC_017941	TCG	2	6	432483	432488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845951
11014	NC_017941	CGT	2	6	432498	432503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845951
11015	NC_017941	TGGA	2	8	432511	432518	25 %	25 %	50 %	0 %	389845951
11016	NC_017941	CCCAC	2	10	432672	432681	20 %	0 %	0 %	80 %	389845951
11017	NC_017941	CGT	2	6	432732	432737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845951
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11019	NC_017941	CGA	2	6	432798	432803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845951
11020	NC_017941	ACG	2	6	432804	432809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845951
11021	NC_017941	GTTCG	2	10	432839	432848	0 %	40 %	40 %	20 %	389845951
11022	NC_017941	GGAC	2	8	432858	432865	25 %	0 %	50 %	25 %	389845951
11023	NC_017941	GAACGG	2	12	432892	432903	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	389845951
11024	NC_017941	ACG	2	6	432918	432923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845951
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11026	NC_017941	GGAC	2	8	433033	433040	25 %	0 %	50 %	25 %	389845951
11027	NC_017941	C	6	6	433200	433205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11028	NC_017941	CTC	2	6	433284	433289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11029	NC_017941	TGGA	2	8	433431	433438	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_017941	GATA	2	8	433487	433494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_017941	TCC	2	6	433516	433521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11032	NC_017941	A	7	7	433574	433580	100 %	0 %	0 %	0 %	389845952
11033	NC_017941	CAT	2	6	433607	433612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845952
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11035	NC_017941	AGG	2	6	433660	433665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845952
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11040	NC_017941	GAC	3	9	433983	433991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845952
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11042	NC_017941	GTC	2	6	434049	434054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845952
11043	NC_017941	GAC	2	6	434100	434105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845952
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11050	NC_017941	CGA	2	6	434335	434340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845952
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11055	NC_017941	CGG	2	6	434429	434434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845952
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11057	NC_017941	TCG	2	6	434593	434598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845952
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11060	NC_017941	TGGCGG	2	12	434630	434641	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	389845952
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11062	NC_017941	CAG	2	6	434678	434683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845952
11063	NC_017941	GA	3	6	434689	434694	50 %	0 %	50 %	0 %	389845952
11064	NC_017941	CCG	2	6	434743	434748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845952
11065	NC_017941	CGA	3	9	434791	434799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845952
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11092	NC_017941	T	6	6	435937	435942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11094	NC_017941	GGTT	2	8	436087	436094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_017941	AG	3	6	436095	436100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11101	NC_017941	GACG	2	8	436243	436250	25 %	0 %	50 %	25 %	389845953
11102	NC_017941	TCG	2	6	436254	436259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845953
11103	NC_017941	CCGTCA	2	12	436275	436286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	389845953
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11108	NC_017941	CGG	2	6	436528	436533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845953
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11117	NC_017941	CAG	2	6	437117	437122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845953
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11119	NC_017941	TTA	2	6	437199	437204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389845953
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11140	NC_017941	TCAG	2	8	438276	438283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11243	NC_017941	GCT	2	6	443147	443152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845960
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11357	NC_017941	CGA	2	6	447134	447139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845965
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