MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 73186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
70501	NC_017941	AAC	2	6	2839390	2839395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70502	NC_017941	CTTT	2	8	2839568	2839575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70503	NC_017941	CTA	2	6	2839584	2839589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70504	NC_017941	CGTC	2	8	2839708	2839715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70505	NC_017941	CGAGC	2	10	2839725	2839734	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70506	NC_017941	CCA	2	6	2839738	2839743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70507	NC_017941	AC	3	6	2839817	2839822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70508	NC_017941	TCA	2	6	2839827	2839832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70509	NC_017941	GTC	2	6	2839903	2839908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70510	NC_017941	TTC	2	6	2839917	2839922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70511	NC_017941	GGAGT	2	10	2839961	2839970	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
70512	NC_017941	TCC	2	6	2840011	2840016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70513	NC_017941	AGG	2	6	2840023	2840028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70514	NC_017941	TAG	2	6	2840064	2840069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70515	NC_017941	TG	3	6	2840096	2840101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70516	NC_017941	GGT	2	6	2840135	2840140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70517	NC_017941	AGG	2	6	2840151	2840156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70518	NC_017941	ACC	2	6	2840226	2840231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70519	NC_017941	GTG	2	6	2840234	2840239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70520	NC_017941	GT	3	6	2840277	2840282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70521	NC_017941	TAC	2	6	2840327	2840332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70522	NC_017941	TTCC	2	8	2840492	2840499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70523	NC_017941	AGC	2	6	2840508	2840513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70524	NC_017941	CGG	2	6	2840620	2840625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70525	NC_017941	CCT	2	6	2840633	2840638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70526	NC_017941	CT	3	6	2840637	2840642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70527	NC_017941	CGT	2	6	2840647	2840652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70528	NC_017941	TCA	2	6	2840660	2840665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70529	NC_017941	CTC	2	6	2840733	2840738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70530	NC_017941	GGC	2	6	2840798	2840803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70531	NC_017941	GCACA	2	10	2840825	2840834	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70532	NC_017941	TCT	2	6	2840941	2840946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70533	NC_017941	GGT	2	6	2840965	2840970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70534	NC_017941	CGCC	2	8	2841054	2841061	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70535	NC_017941	AAT	2	6	2841121	2841126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70536	NC_017941	TCA	2	6	2841132	2841137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70537	NC_017941	CGG	2	6	2841159	2841164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70538	NC_017941	CTG	2	6	2841288	2841293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70539	NC_017941	ATT	2	6	2841362	2841367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70540	NC_017941	ACT	2	6	2841740	2841745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70541	NC_017941	GCG	2	6	2841770	2841775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70542	NC_017941	GT	3	6	2841902	2841907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70543	NC_017941	ATT	2	6	2841915	2841920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70544	NC_017941	CGT	2	6	2841947	2841952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70545	NC_017941	GT	3	6	2841974	2841979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70546	NC_017941	GAC	2	6	2841997	2842002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70547	NC_017941	G	6	6	2842037	2842042	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70548	NC_017941	CTT	2	6	2842057	2842062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70549	NC_017941	A	6	6	2842146	2842151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70550	NC_017941	CGA	2	6	2842152	2842157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70551	NC_017941	TC	3	6	2842160	2842165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70552	NC_017941	CG	3	6	2842178	2842183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70553	NC_017941	GGCC	2	8	2842190	2842197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70554	NC_017941	GTAC	2	8	2842214	2842221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70555	NC_017941	CGT	2	6	2842264	2842269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70556	NC_017941	AAG	2	6	2842322	2842327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70557	NC_017941	TGAACG	2	12	2842329	2842340	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70558	NC_017941	TCG	2	6	2842354	2842359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848346
70559	NC_017941	TCCA	2	8	2842408	2842415	25 %	25 %	0 %	50 %	389848346
70560	NC_017941	CCACGC	2	12	2842446	2842457	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	389848346
70561	NC_017941	TC	3	6	2842487	2842492	0 %	50 %	0 %	50 %	389848346
70562	NC_017941	TGC	2	6	2842557	2842562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848346
70563	NC_017941	TCC	2	6	2842618	2842623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848346
70564	NC_017941	AT	3	6	2842708	2842713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70565	NC_017941	CGAC	2	8	2842723	2842730	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70566	NC_017941	TA	3	6	2842745	2842750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70567	NC_017941	A	7	7	2842771	2842777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70568	NC_017941	GA	3	6	2842805	2842810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70569	NC_017941	TAA	3	9	2842812	2842820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70570	NC_017941	ACA	2	6	2842853	2842858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70571	NC_017941	GCG	2	6	2842873	2842878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70572	NC_017941	AAG	2	6	2842912	2842917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848347
70573	NC_017941	CGA	2	6	2843016	2843021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848347
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70575	NC_017941	ATC	3	9	2843050	2843058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848347
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70577	NC_017941	CTTCT	2	10	2843187	2843196	0 %	60 %	0 %	40 %	389848348
70578	NC_017941	CCG	2	6	2843202	2843207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848348
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70580	NC_017941	CGA	2	6	2843294	2843299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848348
70581	NC_017941	ACG	2	6	2843310	2843315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848348
70582	NC_017941	CGGT	2	8	2843344	2843351	0 %	25 %	50 %	25 %	389848348
70583	NC_017941	GGC	2	6	2843427	2843432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848348
70584	NC_017941	TCA	2	6	2843500	2843505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848348
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70587	NC_017941	GAA	2	6	2843622	2843627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848348
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70591	NC_017941	CGT	2	6	2843846	2843851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848348
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70598	NC_017941	TCCC	2	8	2844296	2844303	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70599	NC_017941	CGGT	2	8	2844352	2844359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70600	NC_017941	TCG	2	6	2844380	2844385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848349
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70605	NC_017941	GTC	2	6	2844646	2844651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848350
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70607	NC_017941	GC	3	6	2844669	2844674	0 %	0 %	50 %	50 %	389848350
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70622	NC_017941	GTC	2	6	2845279	2845284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848350
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