MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 73186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017941	GCC	2	6	254933	254938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6502	NC_017941	TTA	2	6	254992	254997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_017941	TCA	2	6	255124	255129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389845760
6504	NC_017941	CGG	2	6	255194	255199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845760
6505	NC_017941	TCC	3	9	255229	255237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845760
6506	NC_017941	CTCG	2	8	255251	255258	0 %	25 %	25 %	50 %	389845760
6507	NC_017941	CGG	2	6	255308	255313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845760
6508	NC_017941	GGA	2	6	255338	255343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845760
6509	NC_017941	GTCTC	2	10	255400	255409	0 %	40 %	20 %	40 %	389845760
6510	NC_017941	TCC	3	9	255421	255429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845760
6511	NC_017941	CGC	2	6	255494	255499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845760
6512	NC_017941	CGG	2	6	255530	255535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845760
6513	NC_017941	TCC	2	6	255541	255546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845760
6514	NC_017941	GCC	2	6	255565	255570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845760
6515	NC_017941	GCC	2	6	255594	255599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389845760
6516	NC_017941	TCC	2	6	255622	255627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845760
6517	NC_017941	TTC	2	6	255645	255650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845760
6518	NC_017941	TCG	2	6	255661	255666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845760
6519	NC_017941	CTT	2	6	255674	255679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845760
6520	NC_017941	CGTG	2	8	255746	255753	0 %	25 %	50 %	25 %	389845760
6521	NC_017941	AG	4	8	255768	255775	50 %	0 %	50 %	0 %	389845760
6522	NC_017941	GAC	2	6	255794	255799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845760
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6524	NC_017941	TCG	2	6	255829	255834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845760
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6526	NC_017941	TCG	2	6	255874	255879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845760
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6529	NC_017941	CGA	2	6	255941	255946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845760
6530	NC_017941	GAC	2	6	255965	255970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845760
6531	NC_017941	CGACGC	2	12	255980	255991	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	389845760
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6533	NC_017941	GTCG	2	8	256026	256033	0 %	25 %	50 %	25 %	389845760
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6541	NC_017941	CT	3	6	256306	256311	0 %	50 %	0 %	50 %	389845761
6542	NC_017941	TTC	2	6	256312	256317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389845761
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6549	NC_017941	CCACG	2	10	256707	256716	20 %	0 %	20 %	60 %	389845761
6550	NC_017941	CGT	2	6	256741	256746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845761
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6553	NC_017941	GAC	2	6	256797	256802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845761
6554	NC_017941	CGG	2	6	256820	256825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389845761
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6557	NC_017941	GAC	2	6	256911	256916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389845761
6558	NC_017941	GTC	2	6	256935	256940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845761
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6560	NC_017941	GAG	2	6	257031	257036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389845761
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6562	NC_017941	CCT	2	6	257104	257109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6565	NC_017941	GTT	2	6	257222	257227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389845762
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6570	NC_017941	CACG	2	8	257508	257515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_017941	TTCG	2	8	257562	257569	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6980	NC_017941	CGAAT	2	10	273582	273591	40 %	20 %	20 %	20 %	389845780
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6985	NC_017941	GCCGA	2	10	273921	273930	20 %	0 %	40 %	40 %	389845780
6986	NC_017941	CGT	2	6	273962	273967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845780
6987	NC_017941	GTC	2	6	273975	273980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845780
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6998	NC_017941	CTT	2	6	274682	274687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6999	NC_017941	TCG	2	6	274758	274763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389845781
7000	NC_017941	TCC	2	6	274770	274775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389845781

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