MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 chromosome

Total Repeats: 73186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_017941	TCG	2	6	2622656	2622661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848121
65002	NC_017941	CGG	2	6	2622680	2622685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848121
65003	NC_017941	ATCT	2	8	2622718	2622725	25 %	50 %	0 %	25 %	389848121
65004	NC_017941	CGGAA	2	10	2622726	2622735	40 %	0 %	40 %	20 %	389848121
65005	NC_017941	CGA	2	6	2622756	2622761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848121
65006	NC_017941	TCG	2	6	2622791	2622796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848121
65007	NC_017941	TCG	2	6	2622815	2622820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848121
65008	NC_017941	ACT	2	6	2622839	2622844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848121
65009	NC_017941	CCG	3	9	2622846	2622854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848121
65010	NC_017941	GGA	2	6	2622915	2622920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848121
65011	NC_017941	CGA	2	6	2622959	2622964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65012	NC_017941	TCG	2	6	2623051	2623056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848122
65013	NC_017941	ACT	2	6	2623097	2623102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848122
65014	NC_017941	TCC	2	6	2623152	2623157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848122
65015	NC_017941	GCG	2	6	2623158	2623163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848122
65016	NC_017941	TGG	3	9	2623227	2623235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848122
65017	NC_017941	CACG	2	8	2623244	2623251	25 %	0 %	25 %	50 %	389848122
65018	NC_017941	GTC	2	6	2623256	2623261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848122
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65020	NC_017941	CGC	3	9	2623271	2623279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848122
65021	NC_017941	CG	3	6	2623296	2623301	0 %	0 %	50 %	50 %	389848122
65022	NC_017941	CGA	2	6	2623304	2623309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848122
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65026	NC_017941	AC	3	6	2623471	2623476	50 %	0 %	0 %	50 %	389848122
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65031	NC_017941	ATT	2	6	2623718	2623723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65032	NC_017941	ACG	2	6	2623733	2623738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65033	NC_017941	TCGG	2	8	2623778	2623785	0 %	25 %	50 %	25 %	389848123
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65041	NC_017941	CAC	2	6	2624006	2624011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65042	NC_017941	TTC	2	6	2624024	2624029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65043	NC_017941	CGT	2	6	2624050	2624055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65044	NC_017941	CTT	2	6	2624069	2624074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65045	NC_017941	TCC	2	6	2624116	2624121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848124
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65082	NC_017941	CCGGT	2	10	2625620	2625629	0 %	20 %	40 %	40 %	389848125
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65343	NC_017941	GC	3	6	2636180	2636185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65344	NC_017941	ATGG	2	8	2636229	2636236	25 %	25 %	50 %	0 %	389848136
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65349	NC_017941	CGGCG	2	10	2636465	2636474	0 %	0 %	60 %	40 %	389848136
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65351	NC_017941	ACC	2	6	2636530	2636535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848136
65352	NC_017941	GAC	2	6	2636555	2636560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848136
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65357	NC_017941	CCACGT	2	12	2636678	2636689	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	389848136
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65424	NC_017941	CAG	2	6	2639171	2639176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65464	NC_017941	ATC	2	6	2640870	2640875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848139
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65492	NC_017941	ACGG	2	8	2642092	2642099	25 %	0 %	50 %	25 %	389848141
65493	NC_017941	GCG	2	6	2642164	2642169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848141
65494	NC_017941	CGA	2	6	2642255	2642260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848141
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